单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16601 - 16620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16601 | 2024-08-05 |
A novel signature constructed by differential genes of muscle-invasive and non-muscle-invasive bladder cancer for the prediction of prognosis in bladder cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1187286
PMID:37691944
|
研究论文 | 本研究构建了一种基于肌肉侵袭性和非肌肉侵袭性膀胱癌差异基因的预后模型 | 提出了一种新的预后模型，并发现S100A9可能成为新的预后标志物和治疗靶点 | 研究的样本数据主要来源于公共数据库，可能限制了结果的广泛适用性 | 构建膀胱癌患者的预后模型并研究其预后情况 | 膀胱癌患者的差异表达基因及其在肌肉侵袭性和非肌肉侵袭性膀胱癌中的作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，微阵列 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌患者数据，以及GSE135337数据库的三名患者的单细胞测序数据 |
| 16602 | 2024-08-05 |
Target-Captured mRNA from Murine Olfactory Bulb
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3425-7_12
PMID:37688731
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研究论文 | 本文描述了一种从小鼠嗅球富集低丰度嗅觉受体mRNA的方法，以进行空间转录组学。 | 提出了一种通过序列切割和靶向捕获富集测序的结合方法，以克服低丰度目标表达的挑战。 | 本文未详细讨论该方法在其他物种中的适用性 | 研究嗅觉系统中受体组织和功能策略的基本原理 | 小鼠的嗅球及其中的嗅觉受体mRNA | 数字病理学 | NA | 靶向捕获富集测序 | NA | RNA | NA |
| 16603 | 2024-08-05 |
Identification of CHMP7 as a promising immunobiomarker for immunotherapy and chemotherapy and impact on prognosis of colorectal cancer patients
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1211843
PMID:37711849
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研究论文 | 本研究探讨了CHMP7作为结直肠癌患者免疫治疗和化疗的潜在免疫生物标志物及其对预后的影响 | CHMP7在肿瘤免疫中的作用和作为化疗及免疫治疗预后标志物的潜力是这项研究的创新点 | 肿瘤学对CHMP7的研究相对有限 | 旨在探讨CHMP7在结直肠癌中的表达及其对治疗效果和预后的影响 | 研究对象为结直肠癌组织样本和公共数据库中的多种肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 分析了多个肿瘤组织和临床收集的结直肠癌组织样本 |
| 16604 | 2024-08-05 |
Genome-Wide RNA Tomography in the Mouse Whole Olfactory Mucosa
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3425-7_2
PMID:37688721
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研究论文 | 本研究描述了一种从新鲜冷冻小鼠整个嗅粘膜生成高质量RNA-seq文库的方法 | 开发了一种能够扩展到几乎任何脊椎动物器官或组织样本的空间转录组学方法 | 未提及具体的样本数量和不同类型的组织样本的应用限制 | 研究空间转录组学在组织内基因表达模式的整体轮廓 | 新鲜冷冻的小鼠整个嗅粘膜 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |
| 16605 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals zinc and copper ions homeostasis in epicardial adipose tissue of heart failure
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82844
PMID:37705737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心力衰竭患者心外膜脂肪组织中的锌铜离子稳态 | 第一次使用伪时间重建技术绘制了心外膜脂肪组织中各种主要细胞类型的细胞轨迹 | 对心力衰竭患者心外膜脂肪组织的非免疫细胞的特征研究仍然有限 | 研究心力衰竭患者心外膜脂肪组织的免疫特征 | 包括一名新生儿、一名婴儿、一名儿童、两名成人心力衰竭患者及两名成人心脏移植供体的心外膜脂肪组织样本 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 七个样本，包括一名新生儿、一名婴儿、一名儿童、两名成人心力衰竭患者和两名成人非心力衰竭供体 |
| 16606 | 2024-08-05 |
The core role of macrophages in hepatocellular carcinoma: the definition of molecular subtypes and the prognostic risk system
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1228052
PMID:37693905
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在肝细胞癌中的核心作用，定义了分子亚型及预后风险系统 | 创新点在于通过分析巨噬细胞特异性高表达基因建立了肝细胞癌的分类和预后评估系统 | 本研究的限制在于未能探讨其他免疫细胞在肝细胞癌中的作用 | 研究巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的功能及其对患者预后的影响 | 研究对象为不同亚型的肝细胞癌患者，重点关注巨噬细胞的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | GSE149614数据集中包含的样本数量未具体说明，但涉及肝细胞癌的单细胞RNA-seq数据 |
| 16607 | 2024-08-07 |
Exploring the relationship between lactate metabolism and immunological function in colorectal cancer through genes identification and analysis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1173803
PMID:37691826
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研究论文 | 本研究通过综合分析乳酸代谢相关基因，利用单变量Cox回归分析和随机森林算法，识别与结直肠癌代谢相关的关键基因，并探讨这些基因与免疫微环境的关系 | 本研究首次揭示了MPC1、COQ2和ADAMTS13这三个乳酸代谢关键基因在结直肠癌中的预后价值，并验证了它们与CD4 T细胞的相关性 | NA | 探索乳酸代谢与结直肠癌免疫功能之间的关系，并识别相关的关键基因 | 结直肠癌患者的乳酸代谢相关基因及免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光多重免疫组化 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | NA |
| 16608 | 2024-08-07 |
ANGPTL2+cancer-associated fibroblasts and SPP1+macrophages are metastasis accelerators of colorectal cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1185208
PMID:37691929
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌肝转移的机制，并识别了ANGPTL2+癌症相关成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞作为转移促进因子。 | 本研究首次识别了ANGPTL2+癌症相关成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞作为结直肠癌肝转移的促进因子，并提供了潜在的治疗靶点。 | NA | 深入探索结直肠癌肝转移的新型促进因子和治疗靶点。 | 结直肠癌患者的RNA测序数据和临床病理信息。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数百个差异表达基因在肝转移结直肠癌与原发性结直肠癌中被筛选出。 |
| 16609 | 2024-08-07 |
Pan-glioma analyses reveal species- and tumor-specific regulation of neuron-glioma synapse genes by lncRNAs
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1218408
PMID:37693314
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研究论文 | 本文通过跨物种的胶质瘤分析，揭示了长链非编码RNAs（lncRNAs）在神经-胶质瘤突触基因表达调控中的物种和肿瘤特异性 | 发现非人灵长类特异性的lncRNAs在神经-胶质瘤突触基因调控中比哺乳动物保守的lncRNAs更为重要，为肿瘤特异性胶质瘤治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 探讨神经-胶质瘤突触基因表达及其调控的物种和肿瘤特异性 | 胶质瘤中的神经-胶质瘤突触结构及其基因表达调控 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 九个来自人和小鼠的scRNA-seq数据集 |
| 16610 | 2024-08-05 |
Spatial whole transcriptome profiling of primary tumor from patients with metastatic prostate cancer
2023-12-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34708
PMID:37655984
|
研究论文 | 本研究首次利用空间转录组学探索了转移性前列腺癌患者原发肿瘤内的空间基因表达异质性 | 揭示了肿瘤微环境对疾病进展的影响，并确定了潜在的预后生物标志物 | 研究仅包含三个患者样本，样本量较小 | 探讨转移性前列腺癌患者原发肿瘤中基因表达的空间异质性 | 来自三名前列腺癌患者的5459个组织点样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 三名患者，5459个组织点 |
| 16611 | 2024-08-05 |
Bacterial single-cell transcriptomics: Recent technical advances and future applications in dentistry
2023-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2023.08.001
PMID:37674900
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研究论文 | 本文探讨了细菌单细胞转录组学的最新技术进展及其在牙科的未来应用 | 介绍了单细胞RNA测序在细菌研究中的应用，并突出其在细胞间多样性和宿主-细菌相互作用研究中的重要性 | 目前的研究仍面临捕获单细胞RNA的技术障碍 | 探索细菌在口腔健康中的作用和单细胞研究的未来应用 | 细菌及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 16612 | 2024-08-05 |
Abomasal RNA-seq reveals a strong local cellular response in suckling lambs with resistance against Haemonchus contortus
2023-Nov, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2023.06.008
PMID:37673202
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研究论文 | 本研究揭示了与Haemonchus contortus感染相关的不同羊种之间的粘膜特异性转录变化 | 首次使用RNA-seq分析比较了抗性与敏感性羊羔的胃肠道组织中的转录组变化 | 样本数量较少，可能影响结果的普适性 | 探索与Haemonchus contortus感染抗性相关的分子机制 | Santa Ines和Ile de France羊羔 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 8只羊羔（Santa Ines 4只，Ile de France 4只） |
| 16613 | 2024-08-07 |
scGAMNN: Graph Antoencoder-Based Single-Cell RNA Sequencing Data Integration Algorithm Using Mutual Nearest Neighbors
2023-11, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3311340
PMID:37656653
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研究论文 | 本文提出了一种基于图自编码器的深度学习模型scGAMNN，用于同时实现批量校正和拓扑保留的维度降低，以正确组装高维单细胞RNA测序数据集 | scGAMNN模型能够在消除数据集间的批次效应的同时，保持细胞间的拓扑关系 | NA | 开发一种新的算法，用于高维单细胞RNA测序数据集的集成和降维 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图自编码器 | 数据集 | NA |
| 16614 | 2024-08-07 |
Unravelling the imbalanced Th17-like cell differentiation by single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110852
PMID:37657245
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤患者和健康个体骨髓样本中CD4 T细胞的转录组特征，揭示了Th17样细胞分化的不平衡现象及其与多发性骨髓瘤的关联。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡现象，并探讨了相关的分子机制和细胞间相互作用。 | 研究样本量较小，仅包括3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者，可能影响结果的普遍性。 | 揭示多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡模式及其与免疫抑制特征的关联。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本中的CD4 T细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 |
| 16615 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the heterogeneity of NK cells during anti-PD-1 therapy in non-small-cell lung cancer
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110743
PMID:37657247
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了非小细胞肺癌中自然杀伤细胞在抗PD-1治疗期间的异质性 | 首次详细描述了非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间，自然杀伤细胞的不同亚群及其与治疗反应的关系 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及其他类型的生物标志物或临床数据 | 探讨自然杀伤细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗中的作用及其对治疗效果的影响 | 非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的活检样本 |
| 16616 | 2024-08-07 |
VDR is an essential regulator of hair follicle regression through the progression of cell death
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302014
PMID:37673445
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研究论文 | 研究探讨了维生素D受体（VDR）在调控毛囊退化过程中的作用 | 首次揭示了VDR在毛囊退化阶段的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了其机制 | NA | 探究VDR在毛囊退化过程中的作用机制 | VDR缺陷小鼠的毛囊退化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | VDR缺陷小鼠的毛囊样本 |
| 16617 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic atlas characterizes age-related changes of murine cranial stem cell niches
2023-11, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13980
PMID:37681346
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠颅骨干细胞微环境随年龄变化的情况 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了两种不同的颅骨干细胞微环境，并揭示了与年龄相关的变化 | NA | 研究颅骨干细胞微环境随年龄的变化，以加深对颅骨和缝合生物学的理解，并为抗衰老和再生医学提供治疗靶点 | 小鼠颅骨干细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16618 | 2024-08-07 |
Metabolic and functional remodeling of colonic macrophages in response to high-fat diet-induced obesity
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107719
PMID:37674984
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研究论文 | 本文研究了高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞功能和代谢的影响 | 通过单细胞RNA测序识别出在高脂饮食中增加的负责脂质相关巨噬细胞特征的亚群 | NA | 探究高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞的影响 | 结肠固有层巨噬细胞的功能和代谢 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 16619 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of a lycophyte root sheds light on root evolution
2023-10-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.08.030
PMID:37683643
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学探讨了蕨类植物根部的进化及相关基因的表达模式 | 首次揭示了在蕨类植物根冠形成中WOX基因的新潜在作用 | 主要集中于一种蕨类植物，缺乏对其他种类蕨类植物的比较研究 | 研究蕨类植物根部的进化及其分子机制 | 蕨类植物Selaginella moellendorffii的根部 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 根部相关的97个基因 |
| 16620 | 2024-08-05 |
Noninvasive radiomics model reveals macrophage infiltration in glioma
2023-10-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216380
PMID:37660885
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研究论文 | 本研究评估了放射组学生物标志物在胶质瘤中的预后作用，并探讨其与肿瘤微环境和巨噬细胞浸润的关系 | 文章创新性地开发了放射组学生存生物标志物RadSurv，显示出其在胶质瘤风险分层中的高效性 | 研究中使用的样本仅限于三个独立的数据集，可能存在外部验证不足的局限性 | 旨在评估胶质瘤的放射组学生物标志物的预后方面 | 研究对象为664名胶质瘤患者的术前MRI数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | MRI | NA | 影像 | 664名胶质瘤患者的术前MRI |