单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 16581 - 16600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16581 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200185
PMID:38100739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的基因表达谱，揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 | 首次揭示了脑膜异位淋巴组织（mELT）在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的促炎作用，并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类多发性硬化症患者中验证 | 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 | 脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16582 | 2024-08-07 |
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02982-9
PMID:38082266
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研究论文 | 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净（EMPA）在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果，发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 | 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达，来恢复线粒体动态平衡，从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 | NA | 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 | 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型，体外实验使用BV2小胶质细胞 |
| 16583 | 2024-08-07 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-Dec-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
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研究论文 | 本文通过全面的单细胞转录组测序分析了毒素诱导的肝肿瘤发生模型和肝细胞癌患者的细胞特征，揭示了GPNMB Gal-3阳性肝实质细胞在肝细胞癌发展中的免疫抑制和恶性转化作用。 | 首次揭示了GPNMB Gal-3阳性肝实质细胞在肝细胞癌中的免疫抑制和恶性转化作用，并发现了SOX18在这一过程中的关键作用。 | NA | 揭示肝细胞癌发展过程中特定细胞群体的作用及其对肿瘤微环境的影响。 | 肝细胞癌患者和毒素诱导的肝肿瘤发生模型。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肝细胞癌患者和毒素诱导的肝肿瘤发生模型的单细胞样本。 |
| 16584 | 2024-08-05 |
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05590-9
PMID:38062357
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源，以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 | 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程，并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 | 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 | 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 | 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 16585 | 2024-08-05 |
Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance
2023-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01570-0
PMID:37985817
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研究论文 | 此研究通过多组学分析揭示了宫颈鳞状细胞癌的细胞生态系统及其生物学和临床相关性 | 首次系统开发了宫颈鳞状细胞癌中肿瘤内部表达异质性的高分辨率空间图谱 | 临床试验样本分析的初步结果限制了该研究的广泛适用性和深入结论 | 深入理解宫颈鳞状细胞癌中细胞状态的多样性 | 宫颈鳞状细胞癌（CSCC），包括不同的肿瘤状态和免疫微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学 | NA | 样本数据 | 临床试验样本（NCT04516616） |
| 16586 | 2024-08-07 |
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05483-7
PMID:37955686
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研究论文 | 本研究通过整合乳酸化（LAC）和肿瘤微环境（TME）特征，开发了一种新的预测皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）预后和治疗的生物标志物。 | 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征结合，用于SKCM的预后预测和治疗指导。 | NA | 探索乳酸化和肿瘤微环境在SKCM中的作用，以提供新的治疗方案和研究SKCM发病机制。 | 皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | RNA测序、LASSO回归分析、CIBERSORT算法 | NA | RNA测序数据 | 涉及TCGA和GTEx数据库中的RNA测序数据集，以及A375和A2058细胞系。 |
| 16587 | 2024-08-07 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
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研究论文 | 本研究分析了皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）中G蛋白偶联受体（GPCRs）相关基因（GPRGs）和肿瘤微环境（TME），构建了一个预测模型，以帮助SKCM患者获得准确的临床治疗策略 | 本研究首次结合GPCRs和肿瘤微环境构建了一个新的预测模型，并验证了关键基因GPR19的功能 | NA | 探索GPCRs和肿瘤微环境在皮肤皮肤黑色素瘤发展中的作用，并构建预测模型 | 皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）患者 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | LASSO算法，多元和单变量Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未提及 |
| 16588 | 2024-08-07 |
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01569-7
PMID:38036781
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研究论文 | 本研究通过大规模跨祖先的元分析，结合日本和欧洲的基因组关联研究，探讨了消化性溃疡病的遗传机制 | 发现了25个新的高度一致的遗传位点，并揭示了胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 | NA | 探究消化性溃疡病的遗传机制 | 消化性溃疡病，包括胃溃疡和十二指肠溃疡 | 遗传学 | 消化性溃疡病 | 基因组关联研究 | NA | 基因组数据 | 52,032例病例和905,344例对照 |
| 16589 | 2024-08-07 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-Dec, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究从公共单细胞转录组数据中鉴定了16个新的家族A DNA聚合酶序列，并讨论了其在Euglenozoa门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了Euglenozoa门中深层分支物种的家族A DNA聚合酶数据的空白 | NA | 探讨Euglenozoa门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化 | Euglenozoa门中的家族A DNA聚合酶 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性Euglenozoa和2个共生体 |
| 16590 | 2024-08-07 |
A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
PMID:38048317
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研究论文 | 本文通过蜜蜂（Apis mellifera）雄性3天和14天龄的睾丸单细胞RNA测序数据，揭示了蜜蜂精子发生过程中转录图谱的后减数分裂分支现象 | 发现了蜜蜂精子发生中后减数分裂的转录分支，以及小精子细胞（sSPT）中表达的膜翅目特异性基因和较高的突变负荷 | NA | 探究蜜蜂精子发生过程中后减数分裂的分子特征 | 蜜蜂的精子发生过程及其分子机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3天和14天龄的蜜蜂雄性睾丸样本 |
| 16591 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
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病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式，有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 |
| 16592 | 2024-08-05 |
Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants
2023-Nov-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242316892
PMID:38069215
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综述 | 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 | 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 | 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 | 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 | 研究原生质体及其在植物中的应用 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离和瞬时表达系统 | NA | NA | NA |
| 16593 | 2024-08-07 |
Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy
2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237704
PMID:38067435
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因，结合三种机器学习算法识别中风特征基因，并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中风中的小胶质细胞亚群，利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析（GSEA）研究小胶质细胞亚群的关系，并通过连接图（CMap）分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 | 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟，构建了用于中风诊断的诺模图模型，并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 | NA | 研究中风的诊断和治疗方法 | 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 | 机器学习 | 中风 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 诺模图模型 | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | NA |
| 16594 | 2024-08-05 |
Multiplex Immunohistochemistry Staining for Paraffin-embedded Lung Cancer Tissue
2023-Nov-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65850
PMID:38078595
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研究论文 | 该文章介绍了多重免疫组化染色技术在肺癌组织样本中的应用 | 提出了一种优化的实验方案，通过多重免疫组化染色解决了肺组织中的自发荧光和通道串扰问题 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞间关系的有效方法以帮助临床诊断 | 临床来源的肺鳞癌石蜡包埋组织切片 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化（mIHC） | NA | 组织样本 | 临床来源的肺鳞癌组织切片 |
| 16595 | 2024-08-05 |
The murine meninges acquire lymphoid tissue properties and harbour autoreactive B cells during chronic Trypanosoma brucei infection
2023-Nov, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002389
PMID:37983289
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性锥虫感染对小鼠脑膜免疫环境的影响。 | 文章首次揭示了慢性Trypanosoma brucei感染导致小鼠脑膜内异位淋巴聚合体的形成。 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床相关性需要进一步验证。 | 研究慢性感染中脑膜免疫反应的动态变化。 | 小鼠模型和第二阶段人类非洲锥虫病患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 锥虫病 | 单细胞转录组学和时间飞行质谱细胞术（CyTOF） | NA | 细胞样本和脑脊液样本 | 小鼠样本和人类患者脑脊液样本 |
| 16596 | 2024-08-07 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾病患者的肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的基因表达谱，以探索肾病的细胞异质性 | 首次发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在，并提出这些细胞可能作为非侵入性诊断肾病的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括四名肾炎患者 | 探索肾病的病理机制并开发非侵入性诊断方法 | 肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名肾炎患者 |
| 16597 | 2024-08-07 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了PD-1阻断疗法对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中调节性T细胞（Tregs）的影响 | 研究发现Nivolumab治疗后Treg数量和抑制活性增加，并揭示了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴和KRAS信号通路的变化可能与Treg数量的增加有关 | 需要进一步研究以深入理解患者对免疫疗法反应的限制 | 旨在探讨Nivolumab如何影响HNSCC肿瘤微环境中浸润的Tregs | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤微环境和调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从四名HNSCC供体中分离的八份组织样本，治疗前后各四份 |
| 16598 | 2024-08-07 |
Mapping and Validation of scRNA-Seq-Derived Cell-Cell Communication Networks in the Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.885267
PMID:35572582
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术推断细胞间通信网络的方法，并讨论了这些方法如何促进肿瘤微环境（TME）中免疫治疗干预的研究 | 介绍了将scRNA-seq衍生的交互网络与现有实验和计算方法整合的策略，以增强对TME中免疫抑制和免疫治疗改变信号的研究 | 验证假设的细胞间交互作用仍是一个中心挑战 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤微环境中细胞间通信网络的推断及其在免疫治疗中的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在肿瘤微环境中细胞间通信的推断 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 转录组 | NA |
| 16599 | 2024-08-05 |
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34711
PMID:37688376
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研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状，并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结，探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面，尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16600 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |