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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 1641 - 1660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1641 | 2026-05-28 |
Skin fibroblasts in health and disease: From extracellular matrix remodeling to immune regulation
2026-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.002
PMID:41493297
|
综述 | 回顾了皮肤成纤维细胞在健康和疾病中的功能，重点关注其从细胞外基质重塑到免疫调节的转变 | 将成纤维细胞重新定义为动态的免疫调节细胞，并利用单细胞和空间转录组学揭示其异质性和疾病特异性表型 | 关于皮肤成纤维细胞的谱系特性、功能可塑性和表型驱动基因调控网络仍存在知识空白 | 综合当前对皮肤成纤维细胞异质性、可塑性及其在炎症性皮肤病中多样功能的理解 | 皮肤成纤维细胞在自身免疫性、过敏性、纤维化和肿瘤性皮肤病中的功能 | 数字病理学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞转录组学， 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium， 10x Visium | 用于单细胞和空间转录组学分析的平台 |
| 1642 | 2026-05-28 |
A human endometrium-on-chip platform for functional assessment of luminal epithelial receptivity
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117349
PMID:42068548
|
研究论文 | 建立人子宫内膜芯片模型，用于评估腔上皮细胞接收功能 | 首次构建可受控激素调控的人子宫内膜芯片模型，实现对患者来源腔上皮的囊胚附着定量测量，并揭示单细胞层面持续成熟轨迹与功能黏附的解耦关系 | 文章未明确提及局限性 | 探究子宫内膜腔上皮细胞在胚胎着床中的功能机制，挑战基于标记物的传统接收性定义 | 人子宫内膜腔上皮细胞和囊胚样结构 | 组织工程与微流控 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | 芯片上器官模型 | 基因表达数据 | 患者来源腔上皮样本（具体数量未提及） | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 1643 | 2026-05-28 |
HOXD11-NMDAR signaling drives neuroendocrine prostate cancer and enables potential therapeutic intervention as a target of memantine
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117330
PMID:42126948
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TRAMP小鼠的前列腺癌进展阶段，发现HOXD11-NMDAR信号驱动神经内分泌前列腺癌，并揭示美金刚作为潜在治疗干预手段 | 首次发现HOXD11作为神经内分泌转化的关键驱动因子，并揭示其通过激活FOXA2和NMDAR亚基的机制，同时提出美金刚作为NEPC候选治疗策略的临床前和初步临床证据 | 临床观察仅基于一名可评估患者，缺乏更大规模的临床验证 | 探究神经内分泌前列腺癌的驱动机制并寻找潜在治疗靶点 | TRAMP小鼠（从早期腺癌到晚期NEPC的病理阶段）以及人类NEPC样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | TRAMP小鼠跨病理阶段样本及一名化疗失败的NEPC患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1644 | 2026-05-28 |
Cooperative response loops enhanced by histamine signaling during tumor-neutrophil crosstalk in pleural mesothelioma
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117361
PMID:42139053
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和患者来源异种移植模型，揭示胸膜间皮瘤中肿瘤与中性粒细胞互作中组胺信号增强的协同反馈环 | 首次鉴定中性粒细胞来源的组胺作为肿瘤运动性和炎症信号的关键介质，揭示BAP1突变状态与中性粒细胞富集的临床关联，并建立可重现肿瘤内异质性的PDX模型 | 主要基于体外和PDX模型，临床验证尚不充分；组胺靶向干预的具体机制和转化潜力需进一步验证 | 阐明胸膜间皮瘤中中性粒细胞浸润的分子机制及可靶向通路 | 胸膜间皮瘤患者肿瘤组织、中性粒细胞及PDX模型 | 数字病理学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 胸膜间皮瘤患者样本及匹配PDX模型（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1645 | 2026-05-28 |
Oxygen Vacancy-Enriched Platinum Single-Atom Nanozyme Wrapped in Nanoislands: Unlocking Catalytic Activity and Reprogramming Redox Microenvironment for Osteonecrosis Repair
2026-May-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75840
PMID:42189037
|
研究论文 | 本研究开发了一种富氧空位的铂单原子纳米酶（CeO₂/Pt SANI），通过“岛-海”协同效应增强催化活性，用于治疗激素性股骨头坏死 | 首次利用“岛-海”协同效应将单原子铂嵌入二氧化铈纳米岛，通过增强电子转移和调控d带中心优化催化活性，并证明其在重新编程氧化还原微环境中的治疗潜力 | 目前研究可能未详述纳米酶在体内的长期稳定性和生物安全性，且临床转化仍需进一步验证 | 开发高效抗氧化纳米酶以治疗激素性股骨头坏死中的氧化应激损伤 | 激素性股骨头坏死模型中的活性氧积累和骨再生障碍 | 数字病理学 | 股骨头坏死 | 单细胞测序 | 密度泛函理论计算 | 转录组数据 | 未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 1646 | 2026-05-28 |
Integrating single-cell analysis and digital pathology for risk stratification in pancreatic cancer
2026-May-26, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10410-4
PMID:42189258
|
研究论文 | 整合单细胞分析与数字病理学用于胰腺癌风险分层 | 首次将单细胞RNA测序衍生的转移相关特征与常规H&E病理图像特征关联，建立基因型到表型的整合分析流程 | 病理模型在内部验证中判别能力低于训练集；外部验证样本量有限，且缺乏独立大规模验证和机制实验 | 探索利用常规病理图像反映胰腺癌转移相关生物学特征，实现风险分层 | 原发性和转移性胰腺导管腺癌（PDAC）组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | 图像, 转录组数据 | GSE154778数据集、TCGA队列、6个GEO亚组、CPTAC子集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1647 | 2026-05-28 |
Integrative analysis and experimental validation of dioxin-interacting genes reveal diagnostic and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2026-May-26, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02187-3
PMID:42189270
|
研究论文 | 整合分析二恶英相互作用基因并实验验证其在肺腺癌中的诊断和预后生物标志物作用 | 首次通过外泌体-基因组整合分析，结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，系统鉴定二恶英相关基因在肺腺癌中的诊断和预后标志物，并实验验证SLC15A2的肿瘤抑制功能 | 未说明 | 探索二恶英与肺腺癌的分子机制，鉴定诊断和预后生物标志物 | 肺腺癌患者的肿瘤组织和外周血样本 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个队列的肿瘤组织和外周血数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1648 | 2026-05-28 |
NEFL⁺NEFM⁺ myeloid-reprogrammed cells promote ccRCC progression through CX3CL1-CX3CR1-mediated Tregs chemotaxis
2026-May-26, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05582-2
PMID:42189461
|
研究论文 | 本研究揭示了肾透明细胞癌中NEFL⁺NEFM⁺髓系重编程细胞通过CX3CL1-CX3CR1轴招募调节性T细胞促进肿瘤进展的机制 | 首次鉴定出ccRCC中表达神经元结构基因NEFL和NEFM的髓系重编程细胞亚群，并阐明其通过CX3CL1-CX3CR1轴招募Tregs的免疫逃逸新机制 | 研究主要基于公共单细胞数据集和体外功能实验，缺乏体内动物模型验证及临床样本的多中心验证 | 探究ccRCC中肿瘤相关髓系细胞的重编程状态及其通过趋化因子信号促进免疫逃逸和肿瘤进展的机制 | 肾透明细胞癌中的NEFL⁺NEFM⁺神经元样髓系细胞及THP-1细胞模型 | 单细胞转录组学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开的人类ccRCC单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1649 | 2026-05-28 |
AF9-KLF2 gene regulatory circuit links histone lactylation to metabolic reprogramming and breast cancer progression
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117429
PMID:42189684
|
研究论文 | 揭示AF9-KLF2基因调控回路通过组蛋白乳酰化连接代谢重编程与乳腺癌进展 | 首次发现AF9作为H3K9la的读取器，并与KLF2形成正反馈回路，放大了乳酰化依赖效应，驱动乳腺肿瘤发生 | 未明确说明具体局限性 | 研究组蛋白乳酰化与代谢重编程在乳腺癌进展中的调控机制 | 人类乳腺肿瘤细胞及肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1650 | 2026-05-28 |
Protocol for isolating cells from a single cryopreserved gastrointestinal endoscopic biopsy for single-cell RNA sequencing
2026-May-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104574
PMID:42166331
|
protocol | 提出从单一冷冻保存的胃肠内镜活检组织中分离细胞用于单细胞RNA测序的实验方案 | 首次建立从冷冻保存的十二指肠和结肠标本中回收活性细胞的标准化流程，填补了新鲜肠道组织分离技术之外的方法空白 | 未明确说明该方案在不同组织类型或不同冷冻保存条件下的通用性验证 | 开发从冷冻保存胃肠内镜活检组织中分离活性细胞并应用于单细胞RNA测序的可靠方法 | 冷冻保存的十二指肠和结肠内镜活检组织样本 | 数字病理学 | 消化道疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 单一冷冻保存的胃肠内镜活检组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Gel Bead-in-Emulsion (GEM) 生成和文库制备 |
| 1651 | 2026-05-28 |
Protocol for spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2026-May-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104584
PMID:42160174
|
研究方案 | 提供了一种利用最优传输在空间转录组数据上量化病理学评分的方案 | 首次利用最优传输方法将疾病与健康组织的空间转录组点对应，从而生成每个点的病理学评分 | 未明确提及限制，可能需要依赖健康组织参考数据 | 开发一种量化空间转录组数据中病理学评分的新协议 | 人类和小鼠的空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 支持向量回归 | 空间转录组数据 | 多个人类和小鼠数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1652 | 2026-05-28 |
A Counterfactual Framework for Directional Cell-Cell Interaction Analysis in Spatial Transcriptomics
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716510
PMID:42005861
|
研究论文 | 提出一个基于反事实推理的框架，用于空间转录组学中定向细胞-细胞相互作用分析，无需配体-受体先验知识 | 首次将反事实干预框架引入空间转录组学，用于量化细胞间的定向影响，无需依赖配体-受体对先验信息 | 依赖核心级引导决策和模型假设，在极其复杂的组织微环境中可能忽略更细微的相互作用 | 开发一种统计严谨且可扩展的模型化方法，用于空间转录组学中基于反事实的定向依赖分析 | Xenium胆管癌组织微阵列（38个核心）中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 邻域条件图模型 | 空间转录组学数据（Xenium平台） | 38个核心（Xenium胆管癌组织微阵列） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium组织微阵列（TMA） |
| 1653 | 2026-05-28 |
Turkey oviduct epithelial organoids express region-associated markers and avian influenza virus receptors†
2026-05-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf274
PMID:41369270
|
研究论文 | 利用火鸡输卵管上皮类器官研究禽流感病毒受体表达和区域特异性分子特征 | 首次建立火鸡生殖道的单细胞图谱，并验证输卵管上皮类器官保留区域相关分子身份和禽流感病毒受体表达，为体外模型研究提供基础 | 样本量有限（仅两只性成熟母鸡），且类器官模型未能完全覆盖所有输卵管区域 | 验证火鸡输卵管上皮类器官模型的可靠性，并建立生殖道单细胞图谱以支持禽流感病毒感染性研究 | 火鸡（Meleagris gallopavo）的输卵管上皮类器官和生殖道组织 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序，免疫荧光染色 | 类器官（organoids） | 基因表达数据（scRNA-seq和bulk RNA-seq），图像数据（免疫荧光染色） | scRNA-seq来自两只性成熟母鸡的六个输卵管区域；bulk RNA-seq使用两份类器官样本；免疫荧光染色使用四份类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1654 | 2026-05-28 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among povertyexposed children with B-cell acute lymphoblastic leukemia
2026-May-07, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.289187
PMID:42095251
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析贫困暴露儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中白血病母细胞及其微环境的转录特征，发现贫困暴露患者表现出类固醇耐药性转录信号及免疫反应改变 | 首次通过单细胞RNA测序揭示贫困暴露的B-ALL患儿在诊断时即存在类固醇耐药性转录信号，并观察到髓系细胞炎症信号上调及CD8+ T细胞效应信号下调 | NA | 探究贫困暴露对B细胞急性淋巴细胞白血病患儿治疗反应和免疫相关基因表达的影响机制 | 贫困暴露的标准风险B-ALL患儿的白血病母细胞及其微环境 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1655 | 2026-05-28 |
Identifying batch-integrated domains from spatial transcriptomics via graph autoencoder with contrastive learning based on cross-modality and data augmentation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag248
PMID:42184117
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研究论文 | 提出一种名为GCAST的图对比自编码器框架，通过跨模态对比学习和数据增强来整合空间转录组学数据，从而识别批次整合的组织域 | 首次将基于组织学图像与基因表达数据的跨模态对比学习引入空间转录组学分析，并采用块对角图构建自动对齐多个数据集以实现批次校正，无需人工干预 | 依赖组织学图像的可用性，在无图像数据时可能限制部分对比学习优势，且未探讨高噪声或低分辨率数据下的性能 | 开发一种统一、生物信息丰富的分析框架，解决空间转录组学中组织学信息利用不足和跨模态对比策略缺失的问题 | 空间转录组学多模态数据（基因表达和组织学图像），以及多个数据集整合分析中的组织域识别 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图对比自编码器（GCAST） | 空间基因表达数据和组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1656 | 2026-05-28 |
Single Cell RNA Transcriptomics of Mantle Cell Lymphoma Reveals the Presence of Treatment-Resistant Subclones at the Time of Diagnosis
2026-05, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70270
PMID:41802856
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研究论文 | 对套细胞淋巴瘤（MCL）进行单细胞RNA测序，揭示了诊断时即存在治疗耐药亚克隆，以及这些亚克隆在复发中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序证实MCL诊断时已存在治疗耐药亚克隆，并发现细胞周期控制通路的失调是患者间共享特征，同时发现惰性MCL（iMCL）的疾病进展可由空间限制性克隆进化驱动 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量较小（仅6对样本）及缺乏功能验证实验 | 研究套细胞淋巴瘤（MCL）早期复发背后的克隆动态机制，特别是治疗耐药亚克隆的起源和演化 | 套细胞淋巴瘤（MCL）患者的配对肿瘤样本（诊断时和首次复发时），包括一例SOX11阴性惰性MCL（iMCL）的骨髓、外周血和肠道样本 | 数字病理学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6对（6名患者的诊断和首次复发配对样本），另加一例iMCL的骨髓、外周血和肠道样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1657 | 2026-05-28 |
Systems Biology Identifies TARS2 as a Cardiomyocyte Regulator of Mitochondrial Oxidative Stress in Dilated Cardiomyopathy
2026-May, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2026.101535
PMID:42048853
|
研究论文 | 通过系统生物学方法鉴定TARS2为扩张型心肌病中心肌细胞线粒体氧化应激的关键调控因子 | 首次通过整合批量、单细胞和空间转录组学与机器学习，鉴定TARS2为心肌细胞富集的线粒体氧化应激调控因子，并揭示其在扩张型心肌病中的病理作用 | 未提及具体局限性 | 阐明扩张型心肌病中线粒体氧化应激的分子驱动因子 | 扩张型心肌病患者心脏组织及心肌细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学, Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 1658 | 2026-05-28 |
Random Projection Methods Outperform Principal Component Analysis for Dimensionality Reduction in Single Cell RNA-Seq
2026 May-Jun, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261436821
PMID:42041160
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研究论文 | 系统地比较了主成分分析和随机投影方法在单细胞RNA测序数据降维中的性能 | 引入了一种匹配稀疏随机投影算法，可根据输入数据稀疏模式自适应调整投影矩阵密度，并在多个scRNA-seq数据集上综合评估了多种RP方法相比PCA在计算速度和聚类质量方面的优势 | 未提及具体限制 | 为下游分析中平衡计算需求、可扩展性和分析质量的降维策略选择提供关键指导 | 多个公开可用的scRNA-seq数据集，包括有标签和无标签场景 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析、随机投影、稀疏随机投影、高斯随机投影、匹配稀疏随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1659 | 2026-05-28 |
Glial multicellular programs reveal distinct patient stratification in Parkinson's disease
2026-Apr-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9520754/v1
PMID:42094040
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研究论文 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学，揭示帕金森病中胶质细胞的多细胞程序，并实现患者分层 | 首次发现帕金森病中胶质细胞存在两种互斥的多细胞程序（炎症相关和内质网应激相关），且这些程序能覆盖传统帕金森病分子变化的不同方面，重新定义了疾病为全脑范围内的系统性胶质细胞多细胞状态 | 未明确提及 | 解析帕金森病背侧纹状体中胶质细胞协调的多细胞反应及其对患者分层的意义 | 56名捐赠者的背侧纹状体样本（涉及不同Lewy小体疾病阶段） | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 56名捐赠者 | 10x Genomics | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序，10x Visium空间转录组学 |
| 1660 | 2026-05-28 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
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研究论文 | 本研究探讨了不同高脂饮食对宿主和肠道微生物组的多组学重编程影响，以及这些变化在饮食逆转后的持久性 | 首次系统揭示了高脂饮食来源、基线微生物组结构和饮食历史如何共同塑造宿主-微生物组相互作用，并发现饮食逆转后部分微生物和宿主基因表达的改变持续存在，形成“微生物组记忆”效应 | 研究仅在动物模型中进行，对人类影响的直接推断需谨慎；饮食逆转观察时间窗口有限，未能完全捕捉所有改变的恢复过程 | 定义高脂饮食中不同脂肪来源对宿主和微生物组的长期影响，并评估这些影响在饮食逆转后的可逆性 | 小鼠及肠道微生物组 | 数字病理学 | NA | 多组学技术，包括粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学、脂质组学和肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（宏基因组、代谢组、脂质组、单细胞转录组） | 小鼠多个队列，包括一年饲养和饮食逆转实验，具体样本量文中未明述 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠道单细胞RNA测序 |