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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1641 | 2026-02-22 |
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag070
PMID:41712686
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研究论文 | 提出了一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,用于处理不同分辨率和通量的ST数据 | 首次将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成,通过混合编码器结合多头注意力和残差连接,同时捕获局部表达模式和全局信息 | 未明确说明方法对特定组织类型或实验条件的适用性限制 | 开发鲁棒的空间转录组数据分析框架 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 对抗自编码器, 图卷积网络 | 基因表达空间数据 | 多个ST数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1642 | 2026-02-22 |
A cycling, progenitor-like cell population at the base of atypical teratoid rhabdoid tumor subtype differentiation trajectories
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf179
PMID:40726147
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了非典型畸胎样横纹肌样瘤(ATRT)的亚型特异性分化轨迹及其共同的循环前体细胞群 | 首次构建了ATRT的单核转录组图谱,整合了单核ATAC-seq和空间转录组数据,并发现所有ATRT亚型中均存在共享的循环中间前体细胞群 | 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型进行验证,仍需在更多临床样本和体内模型中进一步证实 | 深入理解ATRT的细胞异质性和发育起源,为开发亚型特异性治疗策略提供依据 | 非典型畸胎样横纹肌样瘤(ATRT)肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 儿科中枢神经系统肿瘤 | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | 多个ATRT患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1643 | 2026-02-22 |
Phase IB study of Avelumab and whole brain radiotherapy in patients with leptomeningeal disease from solid tumors: Results and molecular analyses
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf183
PMID:40888040
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研究论文 | 本研究评估了Avelumab联合全脑放疗在实体瘤软脑膜转移患者中的安全性和疗效,并进行了分子分析 | 首次在软脑膜转移患者中评估Avelumab联合全脑放疗的联合疗法,并利用单细胞RNA测序分析治疗前后脑脊液中的免疫细胞变化 | 样本量较小(15例患者),且为单臂研究,缺乏对照组 | 评估Avelumab联合全脑放疗在软脑膜转移患者中的安全性和疗效,并探索免疫反应机制 | 实体瘤软脑膜转移患者,包括乳腺癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌和胰腺癌患者 | 临床肿瘤学 | 实体瘤软脑膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1644 | 2026-02-22 |
Intratumour ploidy heterogeneity and clonal evolution in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-24, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.11.015
PMID:41297676
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研究论文 | 本研究开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法,用于评估肝细胞癌(HCC)中的核倍性,并评估其预后相关性 | 开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法,用于评估HCC中的核倍性,并首次通过空间转录组学直接证明超倍体肿瘤肝细胞通过二倍体细胞的全基因组加倍产生 | 研究样本量相对较小(111例HCC样本),且主要基于回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证 | 评估肝细胞癌中核倍性的预后价值,并探索超倍体克隆在肿瘤内的克隆进化 | 111例人类肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序, 批量RNA测序, 3' mRNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据, 基因组数据 | 111例人类肝细胞癌样本 | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1645 | 2026-02-22 |
MAP3K4 signaling regulates HDAC6 and TRAF4 coexpression and stabilization in trophoblast stem cells
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108116
PMID:39710325
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研究论文 | 本研究揭示了MAP3K4信号通过调控HDAC6和TRAF4的共表达与稳定性,在滋养层干细胞中影响胎盘发育的机制 | 首次发现MAP3K4、TRAF4和HDAC6在滋养层干细胞中的共调控机制,以及它们在胎盘迷路分化过程中的表达转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类胎盘中的具体机制尚需进一步验证 | 探究MAP3K4信号在胎盘发育中的作用及其与TRAF4和HDAC6的调控关系 | 小鼠滋养层干细胞和胎盘组织 | 发育生物学 | 胎盘功能不全 | 单细胞RNA测序,shRNA敲低,蛋白质复合物分析 | NA | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1646 | 2026-02-22 |
Laser-capture microdissection for spatial transcriptomics of immunohistochemically detected neurons
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108150
PMID:39736395
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研究论文 | 本文开发了一种名为IHC/LCM-Seq的空间转录组学方法,用于对免疫组化检测的神经元进行转录组分析 | 开发了一种创新的IHC/LCM-Seq方法,结合了免疫组化、激光捕获显微切割和RNA测序技术,首次实现了对免疫组化检测的神经元进行高灵敏度空间转录组分析 | 方法基于4%甲醛固定脑组织的游离切片,可能不适用于其他固定条件或组织类型 | 开发并验证一种用于免疫组化检测神经元空间转录组分析的新方法 | 纹状体胆碱能中间神经元和促性腺激素释放激素(GnRH)神经元 | 空间转录组学 | 不孕症 | 激光捕获显微切割,RNA测序,免疫组化 | NA | RNA测序数据 | 成年雄性大鼠和小鼠的GnRH神经元 | Illumina | bulk RNA-seq | NextSeq | Illumina NextSeq平台进行批量测序 |
| 1647 | 2026-02-22 |
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02301-6
PMID:33663567
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研究论文 | 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据,揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加,并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 | 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加,并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 | 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 | 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞,以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1648 | 2026-02-21 |
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2635179
PMID:41714845
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研究论文 | 本研究通过整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,识别了共享的生物标志物和致病机制 | 首次系统整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,利用多组学分析和机器学习方法识别出ITGB2、CD74和KLK1等共享诊断标志物,并构建了转录因子-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认这些标志物的功能和临床适用性 | 揭示IgA肾病和乳糜泻的共病分子机制,并寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | IgA肾病和乳糜泻患者 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 加权基因共表达网络分析,机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1649 | 2026-02-21 |
Aberrant epithelial differentiation may contribute to endometrial polyp formation: insights from single-cell analysis
2026-Dec, Systems biology in reproductive medicine
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/19396368.2026.2628916
PMID:41712676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析子宫内膜息肉与邻近子宫内膜的转录组差异,探讨息肉形成的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示子宫内膜息肉中上皮细胞分化异常和血管重塑缺陷,通过伪时间分析发现上皮细胞成熟受阻 | 单细胞RNA测序仅局限于增殖期样本,可能限制结果的普适性 | 探究子宫内膜息肉形成和复发的分子机制 | 子宫内膜息肉及邻近子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 伪时间分析 | RNA测序数据 | 12名女性的配对子宫内膜息肉和邻近子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1650 | 2026-02-21 |
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组学数据,构建了首个基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,用于牙周炎诊断,并揭示了细胞类型特异性的乳酸化重塑机制 | 首次建立了基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,并整合批量与单细胞转录组学数据解析了牙周炎中乳酸化修饰的细胞异质性 | 未明确提及样本量限制或模型在更广泛人群中的验证情况 | 探索外泌体相关乳酸化基因作为牙周炎潜在诊断生物标志物 | 牙周炎患者与健康组织的基因表达数据 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及训练队列和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1651 | 2026-02-21 |
ROS-responsive, brain- and M1 microglia-targeting modified ginkgetin-loaded smart liposomes ameliorate cerebral ischemia by HIF-1α-mediated negative regulation of microglia pyroptosis
2026-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.102870
PMID:41716338
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研究论文 | 本研究设计了一种ROS响应、靶向大脑和M1小胶质细胞的银杏双黄酮智能脂质体,通过抑制HIF-1α通路减轻小胶质细胞焦亡,从而改善脑缺血损伤 | 开发了具有ROS响应性和双重靶向功能(RVG29靶向大脑,MG1靶向小胶质细胞)的智能脂质体递送系统,用于精准递送银杏双黄酮至缺血病灶,并揭示了其通过HIF-1α/c-Myc/NLRP3轴抑制小胶质细胞焦亡的新机制 | 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;长期安全性和免疫原性有待进一步评估;具体靶向效率和脱靶效应在复杂人体环境中的表现仍需验证 | 开发一种能够克服血脑屏障、精准靶向缺血病灶的纳米治疗策略,以改善脑缺血后的神经功能恢复 | 大脑、小胶质细胞、神经元、脑缺血损伤区域 | 神经科学、纳米医学、药物递送 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、共培养实验、动物模型(大脑中动脉闭塞/再灌注模型) | NA | 基因表达数据、组织病理学数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1652 | 2026-02-21 |
An atlas of cGAS-STING signaling in pathophysiological angiogenesis and retinal vascular homeostasis across species
2026-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102847
PMID:41717290
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研究论文 | 本研究通过分析跨物种的单细胞RNA测序数据,揭示了cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成和稳态中的保守作用,并发现其通过调控VEGFA-VEGFR2信号通路影响血管生成 | 首次在跨物种(小鼠、人类、狨猴)水平上系统描绘了cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成中的时空表达模式,并证实了该通路通过调控VEGFA-VEGFR2信号影响血管生成的分子机制 | 研究主要基于单细胞测序数据和细胞实验,缺乏在大型动物模型或临床样本中的进一步验证 | 探究cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成和稳态调控中的作用机制 | 小鼠视网膜、人类视网膜血管内皮细胞、狨猴视网膜、视网膜前纤维血管膜 | 单细胞组学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 多个物种的视网膜样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1653 | 2026-02-21 |
Single-cell transcriptomics of multi-site cell therapy in osteoarthritis: Tissue-specific treatment correlations
2026-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102839
PMID:41717289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了骨关节炎自体细胞疗法临床试验中骨髓抽吸浓缩物和基质血管组分样本的转录组特征 | 首次在骨关节炎细胞疗法临床试验中应用单细胞转录组学,揭示了治疗部位特异性的变异模式,并识别了与临床反应相关的关键分子通路 | 患者异质性可能掩盖了差异表达基因的显著性发现,且基因组分析目前尚不能直接用于指导个体化治疗 | 评估骨关节炎自体细胞疗法的分子机制和临床反应相关性 | 接受骨髓抽吸浓缩物和基质血管组分自体细胞治疗的膝骨关节炎患者 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 方差分解、张量分解、差异表达基因分析、细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 临床试验中的BMAC和SVF样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1654 | 2026-02-21 |
Applications of single-cell transcriptomics: updated insights in endometrial cancer
2026-Mar, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04032-7
PMID:40903692
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在子宫内膜癌研究中的应用,重点分析了肿瘤微环境的细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术全面解析子宫内膜癌肿瘤微环境的细胞组成和相互作用,为个性化治疗和预后预测提供新见解 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结 | 总结单细胞转录组学在子宫内膜癌研究中的最新应用进展 | 子宫内膜癌及其肿瘤微环境中的细胞(上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞) | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1655 | 2026-02-21 |
IGSF9 promotes immunotherapy resistance in colon cancer by orchestrating an immunosuppressive tumor microenvironment and enables combinatorial targeting strategies
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102478
PMID:41717080
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析、单细胞测序和临床前模型,探讨了IGSF9在结肠癌中的作用及其与免疫治疗耐药性的关联 | 首次将IGSF9确立为结肠癌免疫治疗耐药的预后和预测生物标志物,并提出了靶向IGSF9相关KRAS/MAPK通路与抗PD-1疗法联合的新策略 | 研究主要基于临床前模型和临床数据集分析,需要进一步的临床试验验证 | 探索IGSF9在结肠癌免疫治疗耐药中的作用机制,并寻找克服耐药性的联合治疗策略 | 结肠癌肿瘤组织、恶性上皮细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多组学分析、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 临床数据集和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1656 | 2026-02-21 |
CAMK1D and PI3 in low-density neutrophils are associated with the anti-hypertensive effects of valsartan
2026-Feb-28, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.178613
PMID:41628662
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探讨了缬沙坦对高血压患者低密度中性粒细胞的影响及其分子机制 | 首次在高血压治疗背景下,利用单细胞RNA测序识别了低密度中性粒细胞的四个亚型(CAMK1D、PI3、ISG15、S100A12),并发现CAMK1D和PI3基因表达变化与缬沙坦疗效相关 | 样本量较小,研究仅观察了一个月的治疗效果,且未进行功能验证实验 | 探究缬沙坦对高血压患者低密度中性粒细胞的影响及其分子机制 | 新诊断的高血压患者 | 单细胞组学 | 高血压 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 新诊断高血压患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1657 | 2026-02-21 |
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09742-4
PMID:41714782
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了肝癌中不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的免疫代谢特征 | 首次整合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和飞行时间质谱流式技术,对IRE诱导的炎症边缘进行精确空间定位,并发现其特有的免疫抑制微环境和脂质代谢重编程 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的普适性有待验证 | 探究不可逆电穿孔治疗后肝癌炎症边缘的免疫和代谢变化 | 雄性C57BL/6小鼠原位肝癌模型 | 空间多组学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式 | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱流式数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 1658 | 2026-02-21 |
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07857-0
PMID:41715136
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习,识别出ATAD3A作为稳定线粒体-内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 | 首次将线粒体相关内质网膜(MAM)与膀胱癌化疗耐药性联系起来,并利用机器学习识别ATAD3A作为关键预测基因 | NA | 探讨MAM在膀胱癌中的作用及其与化疗耐药性的关联 | 膀胱癌患者样本及细胞和动物模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 随机森林, LASSO-Cox回归 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1659 | 2026-02-21 |
A muscle-centered hierarchical breakdown underlies flight loss during silkworm domestication
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114846
PMID:41716997
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了家蚕在驯化过程中飞行能力丧失的分子机制,发现其核心在于飞行肌细胞的协调性崩溃 | 首次通过整合单细胞与空间转录组学解析昆虫飞行能力退化的多层次遗传模块,并发现该肌肉中心模块在迁徙性害虫中具有保守性 | 研究主要聚焦于家蚕与飞蛾两种物种,其他昆虫飞行能力退化的普适性机制仍需进一步验证 | 探究昆虫在驯化过程中复杂性状(飞行能力)退化的进化回归机制 | 家蚕及其飞行能力祖先飞蛾的发育期飞行器官,以及迁徙性害虫飞蛾 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及家蚕、飞蛾及迁徙性害虫飞蛾的飞行器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1660 | 2026-02-21 |
Mathematical analysis of G1/S sub-networks in hematopoietic proliferation: Sequential and lineage-specific activation
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114291
PMID:41717016
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研究论文 | 本文通过计算分析和数学建模,研究了造血细胞中G1/S亚网络的激活模式,揭示了不同细胞类型在相同微环境中具有独特增殖特性的机制 | 首次将68种造血细胞类型映射到特定模型参数,并识别它们通过G1/S的个体化路径,为造血增殖提供了新的机制见解 | 研究基于已发表的单细胞转录组数据,可能受数据质量和样本异质性限制,且为理论工作需实验验证 | 探究造血细胞中G1/S网络与发育阶段的协调机制,以理解增殖与分化的平衡 | 人类骨髓中的造血干细胞和谱系祖细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 数学模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |