单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16561 - 16580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16561 | 2024-08-07 |
Nutrient-driven dedifferentiation of enteroendocrine cells promotes adaptive intestinal growth in Drosophila
2023-09-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.022
PMID:37689060
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研究论文 | 本文研究了果蝇成虫中肠在营养波动下通过内分泌细胞去分化促进适应性肠道生长的机制 | 首次发现内分泌细胞在营养条件下可以转化为功能性肠道干细胞，并通过JAK-STAT途径激活 | NA | 探讨营养波动如何通过内分泌细胞去分化影响果蝇肠道生长 | 果蝇成虫中肠的内分泌细胞和肠道干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 16562 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals light-induced chlorenchyma cells involved in promoting shoot regeneration in tomato callus
2023-09-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310163120
PMID:37703282
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研究论文 | 该研究探讨了番茄愈伤组织中与光诱导相关的氯羧细胞在促进芽再生中的作用 | 首次探索了番茄愈伤组织在芽再生过程中的空间转录组，揭示了细胞群体的异质性和特定因素的作用 | 研究主要集中在番茄愈伤组织，结果是否能推广至其他植物未明 | 揭示番茄愈伤组织中芽再生的细胞和分子机制 | 番茄愈伤组织中的芽原基和周围细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16563 | 2024-08-05 |
A cancer-associated fibroblast subtypes-based signature enables the evaluation of immunotherapy response and prognosis in bladder cancer
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107722
PMID:37694141
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研究论文 | 该研究识别了膀胱癌中的三种癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了相关风险评分 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了癌症相关成纤维细胞风险评分（CRRS），并评估其在膀胱癌免疫疗法反应和预后的价值 | 该研究的样本来自公开数据集，可能存在选择偏倚 | 探讨癌症相关成纤维细胞在膀胱癌肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌患者的癌症相关成纤维细胞亚型和基因特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 2042名患者，来自9个公共数据集和湘雅真实世界队列 |
| 16564 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk tissue sequencing unravels the heterogeneity of synovial microenvironment in arthrofibrosis
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107379
PMID:37705954
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量组织测序技术，揭示了关节纤维化中滑膜微环境的异质性 | 本研究首次揭示了Engrailed-1 (EN1)作为与疾病严重程度和临床预后密切相关的关键转录因子，并发现了在关节纤维化发展中起关键作用的特定类型滑膜成纤维细胞DKK3-SLF | NA | 旨在揭示关节纤维化的潜在机制 | 关节纤维化患者的滑膜样本及动物模型 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量组织RNA测序 (bulk-seq) | NA | RNA | 141名患者 |
| 16565 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq reveal SLC7A11, a key regulatory molecule of ferroptosis, is a prognostic-related biomarker and highly related to the immune system in lung adenocarcinoma
2023-Sep-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034876
PMID:37713821
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，揭示SLC7A11在肺腺癌中的表达及其与免疫系统和预后的关系 | 首次探讨SLC7A11作为肺腺癌预后相关生物标志物及其与免疫治疗效果的关系 | NA | 研究SLC7A11在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | SLC7A11在肺腺癌中的表达及其与免疫系统和预后的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | NA | RNA | 来自The Cancer Genome Altas和Gene Expression Omnibus数据库的数据 |
| 16566 | 2024-08-07 |
Time space and single-cell resolved tissue lineage trajectories and laterality of body plan at gastrulation
2023-09-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41482-5
PMID:37709743
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研究论文 | 本文通过计算建模，构建了小鼠胚胎原肠胚阶段单细胞分辨率的时空转录组图谱，揭示了细胞谱系在发育过程中的动态分子轨迹和不对称性。 | 本文首次在单细胞分辨率下构建了原肠胚阶段小鼠胚胎的时空转录组图谱，并揭示了BMP信号通路在胚胎发育中的不对称活动。 | NA | 研究原肠胚发育过程中细胞谱系分化的分子驱动因素和组织模式。 | 小鼠胚胎原肠胚阶段的细胞谱系和组织模式。 | 生物信息学 | NA | 计算建模 | NA | 转录组 | 小鼠胚胎原肠胚阶段的细胞群体 |
| 16567 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and single-cell sequencing data for colorectal cancer: a 10-gene prognostic risk assessment model
2023-Sep-13, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00789-x
PMID:37702857
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研究论文 | 本研究提出了一种基于10基因的预后风险评估模型，用于结直肠癌的临床预测 | 结合了单细胞测序数据与TCGA数据的创新型10基因签名模型用于结直肠癌的预后预测 | 研究可能受到样本大小和数据来源的限制，需在更大和多样化的样本上验证 | 通过分析单细胞测序数据和TCGA数据，建立结直肠癌的预后评估模型 | 结直肠癌的细胞亚群和差异表达基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 研究基于TCGA数据集和GSE178318单细胞测序数据集的分析，具体样本数未明确提及 |
| 16568 | 2024-08-05 |
Deep spatial-omics analysis of Head & Neck carcinomas provides alternative therapeutic targets and rationale for treatment failure
2023-Sep-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00444-2
PMID:37704757
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研究论文 | 本文通过深度空间组学分析头颈癌，为替代治疗靶点和治疗失败的原因提供了依据 | 本研究创新性地结合了空间转录组学和空间蛋白组学，提出了新的治疗靶点并揭示了治疗失败的关联因素 | 样本数量较少，仅为单一患者的病例分析，可能影响结果的普遍性 | 探讨肿瘤的空间特征对癌症治疗结果的影响 | 一名诊断为p16 OPSCC并患有广泛肺转移的男性患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间转录组学，空间蛋白组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 1名患者的肿瘤样本分析 |
| 16569 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of West African lungfish respiratory system reveals evolutionary adaptations to terrestrialization
2023-09-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41309-3
PMID:37699889
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研究论文 | 本文报道了西非肺鱼（Protopterus annectens）呼吸系统的单细胞转录组图谱，揭示了其陆地化的进化适应性 | 首次提供了西非肺鱼呼吸系统的单细胞转录组图谱，并比较了其与陆生四足动物和辐鳍鱼的细胞类型多样性 | NA | 探索脊椎动物呼吸系统进化及肺鱼陆地化的多样性 | 西非肺鱼的呼吸系统及其与陆生四足动物和辐鳍鱼的比较 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16570 | 2024-08-07 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of the skeletal muscle
2023-09-13, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00324-0
PMID:37705115
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉卫星细胞中的表达及其对骨骼肌发育和再生的影响 | 发现Sox11在肌肉卫星细胞中特异性富集，但在肌肉发育和再生中并非必需 | Sox11在肌肉生成中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉卫星细胞分化和骨骼肌再生中的作用 | 肌肉卫星细胞和骨骼肌的发育与再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 |
| 16571 | 2024-08-05 |
Identification and validation of core genes for type 2 diabetes mellitus by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2023-Sep-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01321-1
PMID:37700362
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研究论文 | 本文通过单细胞和大规模RNA测序的整合分析，鉴定和验证了与2型糖尿病进展相关的核心基因。 | 首次结合单细胞RNA测序与常规转录组测序数据，探讨了2型糖尿病的关键基因及其作用机制。 | 只分析了有限的数据集，可能不全面代表所有T2DM患者的基因表达特征。 | 研究2型糖尿病的潜在机制和相关核心基因。 | 主要关注CDKN1C和DLK1这两个与2型糖尿病进展显著相关的基因。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两个独立的数据集，总体样本量未具体列出 |
| 16572 | 2024-08-05 |
GREM1, LRPPRC and SLC39A4 as potential biomarkers of intervertebral disc degeneration: a bioinformatics analysis based on multiple microarray and single-cell sequencing data
2023-Sep-12, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-023-06854-4
PMID:37700277
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研究论文 | 本研究分析了与椎间盘退化相关的潜在生物标志物GREM1、LRPPRC和SLC39A4 | 提出了通过生物信息学方法识别IVDD中可靠和有效的基因治疗靶点的新视角 | IVDD的机制基础仍不清晰，可能影响研究结果的一致性 | 识别椎间盘退化的潜在生物标志物以指导基因治疗 | 分析IVDD患者和对照组的基因表达谱以识别差异表达基因 | 生物信息学 | 椎间盘退化 | 基因表达分析 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 涉及多个数据集，具体样本数量未给出 |
| 16573 | 2024-08-07 |
Oit3, a promising hallmark gene for targeting liver sinusoidal endothelial cells
2023-09-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01621-2
PMID:37696816
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研究论文 | 本研究通过比较肝脏内皮细胞和肝窦内皮细胞的标记基因，识别并验证了Oit3作为肝窦内皮细胞的标志性基因，并构建了Oit3-CreERT2转基因小鼠模型 | 首次引入肝窦内皮细胞特异性标志基因Oit3，并成功构建了Oit3-CreERT2-tdTomato转基因小鼠模型 | NA | 探索肝窦内皮细胞特异性标志基因，并为研究肝脏疾病中的血管紊乱提供模型 | 肝窦内皮细胞及其在肝脏疾病中的作用 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CreERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型和转基因小鼠模型 |
| 16574 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular heterogeneity in fibrocartilaginous enthesis formation
2023-09-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85873
PMID:37698466
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肩袖附着点的纤维软骨异生过程中的细胞和分子异质性 | 首次应用单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，详细描绘了肩袖附着点从出生后第一天到第八周的生长发育过程和分子动态变化 | 研究仅限于小鼠模型和特定的时间点，可能需要进一步的研究来验证和扩展这些发现 | 揭示肩袖附着点纤维软骨异生过程中的细胞异质性和分子动态变化 | 肩袖附着点的纤维软骨异生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个样本 |
| 16575 | 2024-08-05 |
High risk clear cell renal cell carcinoma microenvironments contain protumour immunophenotypes lacking specific immune checkpoints
2023-Sep-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00441-5
PMID:37696903
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研究论文 | 本研究探讨了高风险透明细胞肾细胞癌微环境中缺乏特定免疫检查点的促肿瘤免疫表型 | 首次定义了透明细胞肾细胞癌微环境中的免疫细胞类型和状态，为预测ICI治疗的有利免疫表型提供了基础 | 样本量相对较小，限制了研究结果的普遍适用性 | 识别透明细胞肾细胞癌微环境中的免疫表型，以帮助确定适合免疫检查点抑制剂治疗的表型 | 来自六名高风险透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤及其周围组织样本 | 数字病理 | 肾癌 | 空间转录组测序 (ST-seq) | NA | 组织样本 | 共涉及6名患者，样本包括2个肿瘤旁组织样本、4个低级别组织样本和4个高级别组织样本 |
| 16576 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis indicates fatty acid metabolism-mediated metastasis and immunosuppression in male breast cancer
2023-09-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41318-2
PMID:37696831
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了男性乳腺癌（MBC）中的脂肪酸代谢与肿瘤转移及免疫抑制的关系 | 首次揭示了MBC中脂肪酸代谢与肿瘤转移及免疫抑制的关联，并识别了MBC中癌细胞与T细胞之间的抑制性相互作用 | 研究样本仅包括六名MBC和十三名FBC患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在理解男性乳腺癌的肿瘤免疫学和代谢特征 | 男性乳腺癌（MBC）及其与女性乳腺癌（FBC）的比较 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 111,038个单细胞来自六名MBC和十三名FBC患者的肿瘤组织 |
| 16577 | 2024-08-07 |
ZINBMM: a general mixture model for simultaneous clustering and gene selection using single-cell transcriptomic data
2023-09-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03046-0
PMID:37697330
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研究论文 | 本文提出了一种零膨胀负二项混合模型（ZINBMM），用于同时进行单细胞转录组数据的聚类和基因选择 | ZINBMM能够同时有效地进行scRNA-seq数据的聚类和基因选择，并能处理批次效应和丢失事件 | NA | 研究旨在开发一种新的方法，以揭示细胞类型和推断细胞谱系，并促进对细胞异质性的生物学理解 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 混合模型 | 转录组数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 16578 | 2024-08-07 |
Impact of chemotherapeutic agents on liver microenvironment: oxaliplatin create a pro-metastatic landscape
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02804-z
PMID:37697332
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研究论文 | 研究化疗药物奥沙利铂对肝脏微环境的影响，发现其促进了结直肠癌的肝转移 | 首次揭示奥沙利铂通过改变肝脏免疫微环境，促进结直肠癌肝转移的现象 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在临床样本中验证 | 探讨化疗药物奥沙利铂对肝脏微环境的影响及其与结直肠癌肝转移的关系 | 奥沙利铂对肝脏微环境的影响及结直肠癌肝转移 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用CT26细胞在BALB/c和BALB/c-nude小鼠中建立肝转移模型，并在结直肠癌患者中进行观察 |
| 16579 | 2024-08-07 |
The relationship between regulatory changes in cis and trans and the evolution of gene expression in humans and chimpanzees
2023-09-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03019-3
PMID:37697401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类和黑猩猩胚胎体中的基因表达调控变化，并探讨了cis和trans元素在物种间调控差异中的作用 | 首次使用人类-黑猩猩融合细胞系的胚胎体进行单细胞RNA测序，全面分析了物种间基因表达调控的差异 | 研究仅限于胚胎体样本，可能无法完全代表所有组织类型的基因表达调控 | 探讨人类和黑猩猩基因表达调控的进化关系 | 人类和黑猩猩的基因表达调控 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个人的胚胎体和三个黑猩猩的胚胎体，共70种细胞类型 |
| 16580 | 2024-08-07 |
Prognostic and immunological roles of IL18RAP in human cancers
2023-09-11, Aging
DOI:10.18632/aging.205017
PMID:37698530
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研究论文 | 本研究探讨了IL18RAP在多种癌症中的表达异常及其与肿瘤免疫和临床结果的关系 | 首次揭示了IL18RAP与肿瘤微环境的关系，及其在免疫细胞浸润和免疫治疗反应预测中的作用 | NA | 探索IL18RAP在癌症中的预后和免疫学作用 | IL18RAP在人类癌症中的表达及其对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 | NA | NA | 生物信息学分析、多重免疫荧光染色、共培养迁移分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种人类癌细胞系（MDA-MB-231、U251和HepG2）以及人类和小鼠的癌症队列 |