单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 16541 - 16560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16541 | 2024-08-07 |
Arl4c is involved in tooth germ development through osteoblastic/ameloblastic differentiation
2023-10-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.09.014
PMID:37703759
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能丧失实验，探讨了Arl4c在小鼠牙胚发育中的作用及其通过成骨细胞/成釉细胞分化的机制 | 首次揭示了Arl4c在牙胚发育中的具体作用，并通过RNA测序和基因本体分析验证了其在成骨细胞/成釉细胞分化中的关键作用 | 实验主要集中在小鼠模型上，未来研究需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探究Arl4c在牙胚发育中的作用及其分子机制 | 小鼠牙胚发育过程中的成骨细胞/成釉细胞分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | 涉及P1和P7小鼠磨牙和切牙的成牙本质细胞和成釉上皮细胞 |
| 16542 | 2024-08-07 |
Gut bacteria induce IgA expression in pituitary hormone-secreting cells during aging
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107747
PMID:37692284
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老过程中垂体细胞群的变化和全局转录变化，发现免疫球蛋白A（IgA）在衰老的垂体中表达增加，并且这种表达受肠道微生物的调控。 | 首次发现垂体激素分泌细胞在衰老过程中能够产生IgA，并且这一过程受肠道细菌的影响。 | NA | 研究衰老过程中垂体激素分泌的基因调控机制。 | 衰老过程中的垂体细胞和肠道微生物。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 16543 | 2024-08-05 |
Single-cell characterization of neovascularization using hiPSC-derived endothelial cells in a 3D microenvironment
2023-10-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.08.008
PMID:37714147
|
研究论文 | 这篇文章研究了利用人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞在 3D 微环境中进行新血管生成的单细胞特征。 | 文章提出了一种全面的单细胞转录组学研究，探讨了内皮细胞和共演化的壁细胞的发展与塑性，并发现了新的血管生成信号。 | 文章未详细说明在不同微环境中内皮细胞的具体生长条件和限制因素。 | 本研究的目的是为未来组织工程中的血管化提供体外的指导。 | 研究对象为人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞及其与其他细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16544 | 2024-08-05 |
Constructing heterogeneous single-cell landscape and identifying microenvironment molecular characteristics of primary and lymphatic metastatic head and neck squamous cell carcinoma
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107459
PMID:37713790
|
研究论文 | 本研究聚焦于利用单细胞和批量转录组数据构建原发性和淋巴转移头颈鳞状细胞癌的异质性微环境图谱 | 该文章通过单细胞转录组技术揭示了不同疾病状态下细胞群体的特征以及癌症和免疫细胞发育轨迹的差异 | 样本量可能限制了结果的普遍性，尤其是在特定亚型的外推 | 研究头颈鳞状细胞癌的微环境分子特征以揭示其异质性 | 研究了23个HNSCC样本和546个TCGA的HNSCC样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 23个HNSCC样本和546个TCGA HNSCC样本 |
| 16545 | 2024-08-07 |
Recovery of missing single-cell RNA-sequencing data with optimized transcriptomic references
2023-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02003-w
PMID:37697162
|
研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中基因表达数据的缺失问题，并提出通过优化参考转录组来恢复这些数据 | 提出了一种优化参考转录组的方法，通过恢复假间基因读取、实施混合前mRNA映射策略和解决基因重叠来恢复缺失的基因表达数据 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的细胞表征分辨率，揭示缺失的细胞类型和标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达数据缺失问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠和人类组织数据 |
| 16546 | 2024-08-07 |
Physiological and immune profiling of tilapia Oreochromis niloticus gills by high-throughput single-cell transcriptome sequencing
2023-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109070
PMID:37709178
|
研究论文 | 本文通过高通量单细胞转录组测序技术，对罗非鱼鳃部的生理和免疫功能进行了深入研究 | 首次报道了罗非鱼鳃部在单细胞水平上的功能异质性 | NA | 探究罗非鱼鳃部的生理和免疫功能 | 罗非鱼鳃部的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12种细胞群体 |
| 16547 | 2024-08-07 |
A paradigm shift in the prevention and diagnosis of oral squamous cell carcinoma
2023-Oct, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13484
PMID:37710407
|
研究论文 | 本文探讨了通过非侵入性刷取活检和深度学习技术来提高口腔鳞状细胞癌（OSCC）的预防和诊断效率 | 引入了非侵入性刷取活检和深度学习技术进行细胞学诊断，以及单细胞RNA测序技术来分析口腔角质细胞 | NA | 提高口腔鳞状细胞癌的早期诊断和治疗效果 | 口腔鳞状细胞癌及其前驱病变 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 细胞学样本 | 多中心前瞻性研究中的大量口腔角质细胞样本 |
| 16548 | 2024-08-07 |
Nutrient-driven dedifferentiation of enteroendocrine cells promotes adaptive intestinal growth in Drosophila
2023-09-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.022
PMID:37689060
|
研究论文 | 本文研究了果蝇成虫中肠在营养波动下通过内分泌细胞去分化促进适应性肠道生长的机制 | 首次发现内分泌细胞在营养条件下可以转化为功能性肠道干细胞，并通过JAK-STAT途径激活 | NA | 探讨营养波动如何通过内分泌细胞去分化影响果蝇肠道生长 | 果蝇成虫中肠的内分泌细胞和肠道干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 16549 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals light-induced chlorenchyma cells involved in promoting shoot regeneration in tomato callus
2023-09-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310163120
PMID:37703282
|
研究论文 | 该研究探讨了番茄愈伤组织中与光诱导相关的氯羧细胞在促进芽再生中的作用 | 首次探索了番茄愈伤组织在芽再生过程中的空间转录组，揭示了细胞群体的异质性和特定因素的作用 | 研究主要集中在番茄愈伤组织，结果是否能推广至其他植物未明 | 揭示番茄愈伤组织中芽再生的细胞和分子机制 | 番茄愈伤组织中的芽原基和周围细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16550 | 2024-08-05 |
A cancer-associated fibroblast subtypes-based signature enables the evaluation of immunotherapy response and prognosis in bladder cancer
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107722
PMID:37694141
|
研究论文 | 该研究识别了膀胱癌中的三种癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了相关风险评分 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了癌症相关成纤维细胞风险评分（CRRS），并评估其在膀胱癌免疫疗法反应和预后的价值 | 该研究的样本来自公开数据集，可能存在选择偏倚 | 探讨癌症相关成纤维细胞在膀胱癌肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌患者的癌症相关成纤维细胞亚型和基因特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 2042名患者，来自9个公共数据集和湘雅真实世界队列 |
| 16551 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk tissue sequencing unravels the heterogeneity of synovial microenvironment in arthrofibrosis
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107379
PMID:37705954
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量组织测序技术，揭示了关节纤维化中滑膜微环境的异质性 | 本研究首次揭示了Engrailed-1 (EN1)作为与疾病严重程度和临床预后密切相关的关键转录因子，并发现了在关节纤维化发展中起关键作用的特定类型滑膜成纤维细胞DKK3-SLF | NA | 旨在揭示关节纤维化的潜在机制 | 关节纤维化患者的滑膜样本及动物模型 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量组织RNA测序 (bulk-seq) | NA | RNA | 141名患者 |
| 16552 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq reveal SLC7A11, a key regulatory molecule of ferroptosis, is a prognostic-related biomarker and highly related to the immune system in lung adenocarcinoma
2023-Sep-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034876
PMID:37713821
|
研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，揭示SLC7A11在肺腺癌中的表达及其与免疫系统和预后的关系 | 首次探讨SLC7A11作为肺腺癌预后相关生物标志物及其与免疫治疗效果的关系 | NA | 研究SLC7A11在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | SLC7A11在肺腺癌中的表达及其与免疫系统和预后的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | NA | RNA | 来自The Cancer Genome Altas和Gene Expression Omnibus数据库的数据 |
| 16553 | 2024-08-07 |
Time space and single-cell resolved tissue lineage trajectories and laterality of body plan at gastrulation
2023-09-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41482-5
PMID:37709743
|
研究论文 | 本文通过计算建模，构建了小鼠胚胎原肠胚阶段单细胞分辨率的时空转录组图谱，揭示了细胞谱系在发育过程中的动态分子轨迹和不对称性。 | 本文首次在单细胞分辨率下构建了原肠胚阶段小鼠胚胎的时空转录组图谱，并揭示了BMP信号通路在胚胎发育中的不对称活动。 | NA | 研究原肠胚发育过程中细胞谱系分化的分子驱动因素和组织模式。 | 小鼠胚胎原肠胚阶段的细胞谱系和组织模式。 | 生物信息学 | NA | 计算建模 | NA | 转录组 | 小鼠胚胎原肠胚阶段的细胞群体 |
| 16554 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and single-cell sequencing data for colorectal cancer: a 10-gene prognostic risk assessment model
2023-Sep-13, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00789-x
PMID:37702857
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于10基因的预后风险评估模型，用于结直肠癌的临床预测 | 结合了单细胞测序数据与TCGA数据的创新型10基因签名模型用于结直肠癌的预后预测 | 研究可能受到样本大小和数据来源的限制，需在更大和多样化的样本上验证 | 通过分析单细胞测序数据和TCGA数据，建立结直肠癌的预后评估模型 | 结直肠癌的细胞亚群和差异表达基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 研究基于TCGA数据集和GSE178318单细胞测序数据集的分析，具体样本数未明确提及 |
| 16555 | 2024-08-05 |
Deep spatial-omics analysis of Head & Neck carcinomas provides alternative therapeutic targets and rationale for treatment failure
2023-Sep-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00444-2
PMID:37704757
|
研究论文 | 本文通过深度空间组学分析头颈癌，为替代治疗靶点和治疗失败的原因提供了依据 | 本研究创新性地结合了空间转录组学和空间蛋白组学，提出了新的治疗靶点并揭示了治疗失败的关联因素 | 样本数量较少，仅为单一患者的病例分析，可能影响结果的普遍性 | 探讨肿瘤的空间特征对癌症治疗结果的影响 | 一名诊断为p16 OPSCC并患有广泛肺转移的男性患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间转录组学，空间蛋白组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 1名患者的肿瘤样本分析 |
| 16556 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of West African lungfish respiratory system reveals evolutionary adaptations to terrestrialization
2023-09-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41309-3
PMID:37699889
|
研究论文 | 本文报道了西非肺鱼（Protopterus annectens）呼吸系统的单细胞转录组图谱，揭示了其陆地化的进化适应性 | 首次提供了西非肺鱼呼吸系统的单细胞转录组图谱，并比较了其与陆生四足动物和辐鳍鱼的细胞类型多样性 | NA | 探索脊椎动物呼吸系统进化及肺鱼陆地化的多样性 | 西非肺鱼的呼吸系统及其与陆生四足动物和辐鳍鱼的比较 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16557 | 2024-08-07 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of the skeletal muscle
2023-09-13, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00324-0
PMID:37705115
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉卫星细胞中的表达及其对骨骼肌发育和再生的影响 | 发现Sox11在肌肉卫星细胞中特异性富集，但在肌肉发育和再生中并非必需 | Sox11在肌肉生成中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉卫星细胞分化和骨骼肌再生中的作用 | 肌肉卫星细胞和骨骼肌的发育与再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 |
| 16558 | 2024-08-05 |
Identification and validation of core genes for type 2 diabetes mellitus by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2023-Sep-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01321-1
PMID:37700362
|
研究论文 | 本文通过单细胞和大规模RNA测序的整合分析，鉴定和验证了与2型糖尿病进展相关的核心基因。 | 首次结合单细胞RNA测序与常规转录组测序数据，探讨了2型糖尿病的关键基因及其作用机制。 | 只分析了有限的数据集，可能不全面代表所有T2DM患者的基因表达特征。 | 研究2型糖尿病的潜在机制和相关核心基因。 | 主要关注CDKN1C和DLK1这两个与2型糖尿病进展显著相关的基因。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两个独立的数据集，总体样本量未具体列出 |
| 16559 | 2024-08-05 |
GREM1, LRPPRC and SLC39A4 as potential biomarkers of intervertebral disc degeneration: a bioinformatics analysis based on multiple microarray and single-cell sequencing data
2023-Sep-12, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-023-06854-4
PMID:37700277
|
研究论文 | 本研究分析了与椎间盘退化相关的潜在生物标志物GREM1、LRPPRC和SLC39A4 | 提出了通过生物信息学方法识别IVDD中可靠和有效的基因治疗靶点的新视角 | IVDD的机制基础仍不清晰，可能影响研究结果的一致性 | 识别椎间盘退化的潜在生物标志物以指导基因治疗 | 分析IVDD患者和对照组的基因表达谱以识别差异表达基因 | 生物信息学 | 椎间盘退化 | 基因表达分析 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 涉及多个数据集，具体样本数量未给出 |
| 16560 | 2024-08-07 |
Oit3, a promising hallmark gene for targeting liver sinusoidal endothelial cells
2023-09-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01621-2
PMID:37696816
|
研究论文 | 本研究通过比较肝脏内皮细胞和肝窦内皮细胞的标记基因，识别并验证了Oit3作为肝窦内皮细胞的标志性基因，并构建了Oit3-CreERT2转基因小鼠模型 | 首次引入肝窦内皮细胞特异性标志基因Oit3，并成功构建了Oit3-CreERT2-tdTomato转基因小鼠模型 | NA | 探索肝窦内皮细胞特异性标志基因，并为研究肝脏疾病中的血管紊乱提供模型 | 肝窦内皮细胞及其在肝脏疾病中的作用 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CreERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型和转基因小鼠模型 |