单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 16521 - 16540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16521 | 2024-08-07 |
223Ra Induces Transient Functional Bone Marrow Toxicity
2022-10, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.121.263310
PMID:35177425
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研究论文 | 本研究探讨了223Ra治疗对骨髓生物学的影响，通过结合流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜和骨髓移植分析 | 本研究首次全面解释了223Ra对骨髓细胞的可逆效应，并排除了长期骨髓毒性 | NA | 研究223Ra治疗对骨髓功能的影响及其安全性 | 骨髓生物学和骨髓细胞 | NA | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 16522 | 2024-08-07 |
Inference on spatial heterogeneity in tumor microenvironment using spatial transcriptomics data
2022-Sep, Computational and systems oncology
DOI:10.1002/cso2.1043
PMID:36035873
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络图的空间统计模型框架，用于分析空间转录组数据，以揭示肿瘤微环境中的模块性和空间异质性 | 首次提出使用网络图的空间统计模型来量化肿瘤微环境中的空间异质性 | 研究仅限于胰腺导管腺癌样本，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究肿瘤微环境中的空间异质性及其对肿瘤生长和癌症特征的影响 | 肿瘤微环境中的细胞类型和通路特征的空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 网络图 | 分子数据 | 胰腺导管腺癌样本 |
| 16523 | 2024-08-07 |
PANoptosis signaling enables broad immune response in psoriasis: From pathogenesis to new therapeutic strategies
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.049
PMID:38125299
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研究论文 | 本文探讨了PANoptosis信号在银屑病中的作用及其作为潜在治疗策略的可能性 | 首次揭示了PANoptosis在银屑病中的作用，并通过多转录组分析和实验验证确定了PANoptosis信号及其相关基因 | NA | 揭示PANoptosis在银屑病中的作用，探索新的治疗策略 | 银屑病患者中的PANoptosis信号及其对免疫细胞浸润的影响 | NA | 银屑病 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16524 | 2024-08-07 |
SCInter: A comprehensive single-cell transcriptome integration database for human and mouse
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.024
PMID:38125297
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研究论文 | 本文开发了一个全面的单细胞转录组整合数据库SCInter，用于人类和小鼠的基因表达数据 | SCInter数据库提供了手动 curated 的基因表达数据，支持跨不同细胞类型的样本级别分析，并包含多种分析工具 | NA | 旨在支持单细胞RNA测序数据的综合和有效注释与分析 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 115个整合数据集和1016个样本，覆盖近150个组织/细胞系，包含8016,646个细胞标记 |
| 16525 | 2024-08-05 |
Translatome Profiling of Tissue-Resident Macrophages Using the RiboTag Approach
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_17
PMID:37639128
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研究论文 | 本文讨论了一种新的方法RiboTag，用于从粗糙的组织提取物中获取组织驻留巨噬细胞的转录组。 | 提出了RiboTag方法，可以避免传统细胞分离中的偏差和伪影 | 只集中于脑巨噬细胞的研究，没有涉及其他类型的组织巨噬细胞 | 探索RiboTag方法在组织驻留巨噬细胞研究中的应用 | 脑巨噬细胞，包括小胶质细胞和边界相关细胞 | 数字病理学 | NA | RiboTag | NA | 转录组 | NA |
| 16526 | 2024-08-07 |
Hemocyte Nuclei Isolation from Adult Drosophila melanogaster for snRNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_4
PMID:37639115
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研究论文 | 本文提供了一种从成年果蝇中分离血细胞核用于单核RNA测序（snRNA-seq）的详细方案 | 首次提供了从成年果蝇血细胞中分离核用于snRNA-seq的具体方法 | NA | 研究果蝇血细胞在不同实验条件下的功能和特性 | 成年果蝇的血细胞核 | NA | NA | snRNA-seq | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 16527 | 2024-08-05 |
Autophagy of OTUD5 destabilizes GPX4 to confer ferroptosis-dependent kidney injury
2023-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44228-5
PMID:38110369
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研究论文 | 本文研究了OTUD5通过降解GPX4来介导铁死亡导致的肾损伤 | 发现OTUD5作为GPX4结合蛋白，通过稳定GPX4抵抗铁死亡，揭示了缺血-再灌注期间的分子机制 | 研究主要集中在肾脏的铁死亡机制，其他器官的影响未被探讨 | 探讨OTUD5在缺血-再灌注相关肾损伤中的作用及其机制 | 研究主要对象为肾脏细胞和铁死亡相关的分子机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 16528 | 2024-08-07 |
Association of WHSC1/NSD2 and T-cell infiltration with prostate cancer metastasis and prognosis
2023-12-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48906-8
PMID:38062230
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研究论文 | 本研究评估了NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性，并通过免疫组织化学、单细胞RNA测序和基因集富集分析等方法探讨了NSD2与T细胞浸润的关系及其在前列腺癌转移和预后中的作用。 | 首次基于NSD2表达和CD4及CD8 TILs成功对前列腺癌患者进行免疫分类，并发现NSD2在定义前列腺癌免疫浸润中的新作用。 | NA | 评估NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性。 | NSD2在前列腺癌中的表达模式及其与T细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | NA | 组织样本 | 34例良性前列腺增生、36例前列腺上皮内瘤变、57例前列腺癌（包括19例转移性去势抵抗性前列腺癌） |
| 16529 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a T cell marker gene-based signature to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2023-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48930-8
PMID:38049463
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研究论文 | 本研究通过分析GSE183904数据集中的单细胞RNA测序数据，使用R包“Seurat”的“FindAllMarkers”方法识别了322个T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于T细胞标记基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究旨在识别和验证基于T细胞标记基因的签名，以预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA数据库中的STAD患者 |
| 16530 | 2024-08-05 |
POSTN Secretion by Extracellular Matrix Cancer-Associated Fibroblasts (eCAFs) Correlates with Poor ICB Response via Macrophage Chemotaxis Activation of Akt Signaling Pathway in Gastric Cancer
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0503
PMID:37199594
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌中eCAFs分泌的POSTN与免疫检查点抑制（ICB）反应的关系 | 揭示了CAFs分泌的POSTN通过激活巨噬细胞的Akt信号通路来促进巨噬细胞的趋化作用，从而导致ICB抵抗 | 研究仅依赖于TCGA-STAD和真实世界队列的分析，可能存在样本选择偏倚 | 期望阐明eCAFs与胃癌ICB反应之间的关系及其机制 | 主要研究对象为胃癌患者中的POSTN+FAP+外基质癌相关成纤维细胞（eCAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA-STAD和真实世界胃癌队列的患者样本 |
| 16531 | 2024-08-05 |
IFNγ Transcribed by IRF1 in CD4+ Effector Memory T Cells Promotes Senescence-Associated Pulmonary Fibrosis
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0320
PMID:37199578
|
研究论文 | 本研究探讨了生理老化肺部中CD4+效应记忆T细胞转录的IFNγ如何促进与衰老相关的肺纤维化的机制 | 揭示了老化T细胞通过IFNγ信号通路促进AT2细胞衰老和肺纤维化的作用机制 | 未提及样本的具体来源及种类，可能影响研究结果的广泛适用性 | 确定影响肺泡II型上皮细胞的老化T细胞机制和亚型 | 年轻和老年小鼠的肺部单细胞转录组分析，重点是CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 衰老相关肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的肺部细胞，具体样本数量未提及 |
| 16532 | 2024-08-07 |
Microglia Exhibit Distinct Heterogeneity Rather than M1/M2 Polarization within the Early Stage of Acute Ischemic Stroke
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0505
PMID:37199734
|
研究论文 | 本研究通过建立小鼠中大脑动脉闭塞模型，利用单细胞RNA测序技术分析了缺血性中风急性期微胶质细胞的基因表达、细胞亚型和功能变化，揭示了微胶质细胞在急性期的异质性。 | 本研究首次将微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性进行了详细分类，并发现了多个具有独特功能特征的亚群。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 阐明缺血性中风急性期微胶质细胞的异质性，以促进早期有效的神经保护策略的开发。 | 微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性和功能变化。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,614个微胶质细胞 |
| 16533 | 2024-08-07 |
Synovial Tissue Heterogeneity in Japanese Patients With Rheumatoid Arthritis Elucidated Using a Cell-Type Deconvolution Approach
2023-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42642
PMID:37390361
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研究论文 | 本研究使用细胞类型反卷积方法，阐明了日本类风湿性关节炎患者滑膜组织的异质性 | 首次基于免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并揭示了不同滑膜表型的炎症驱动因素 | 样本仅来自日本的东亚患者，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在通过免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并深入了解每种滑膜表型的炎症驱动因素 | 日本类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 41例 |
| 16534 | 2024-08-07 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-Dec, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究在木薯基因组中鉴定了225个MeHsp基因，并分析了它们的遗传结构、染色体分布、复制事件以及在不同组织和细胞亚群中的表达模式 | 首次在木薯中系统地鉴定和分析了热休克蛋白基因家族，揭示了MeHsp基因在植物适应环境中的重要作用 | NA | 旨在理解木薯中热休克蛋白基因的功能特性和进化关系 | 木薯中的热休克蛋白基因家族 | NA | NA | 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 转录组数据 | 225个MeHsp基因 |
| 16535 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data identifies B cell marker genes signature that predicts prognosis and analysis of immune checkpoints expression in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Dec, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22656
PMID:38125461
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出B细胞标记基因签名，该签名能预测头颈鳞状细胞癌的预后及免疫检查点表达 | 首次通过单细胞RNA测序数据筛选出B细胞标记基因，并验证其在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的潜在影响 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且免疫检查点表达与预后的统计学差异不显著 | 探索B细胞标记基因签名在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的B细胞标记基因及免疫检查点表达 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 145个B细胞标记基因，TCGA数据集及四个独立数据集 |
| 16536 | 2024-08-05 |
Multiparity increases the risk of diabetes by impairing the proliferative capacity of pancreatic β cells
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01100-2
PMID:37903900
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研究论文 | 本研究评估了多次怀孕对母体产后糖尿病风险的影响 | 揭示了多次怀孕如何通过损害胰腺β细胞的增殖能力来增加糖尿病风险 | 缺乏长期跟踪研究数据以验证结果 | 探讨多次怀孕对母体代谢和胰腺β细胞功能的影响 | 人类和小鼠模型中的多次妊娠对代谢的影响 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本和血浆数据 | 人类样本未具体说明，小鼠样本涉及多次妊娠组和对照组 |
| 16537 | 2024-08-07 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
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研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1基因内含子1中的一个同源突变，该突变导致WNT1表达减少，并在人源化大鼠模型中观察到ASD样行为和多巴胺能神经元的丢失。 | 首次证明中脑多巴胺能神经元的发育损失是ASD发病机制的一部分，异常的前体细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元损失的细胞基础。 | NA | 探讨自闭症谱系障碍的遗传机制及其潜在的治疗方法。 | Wnt1基因突变对大鼠行为和神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16538 | 2024-08-07 |
Elevated Galectin-3 Is Associated with Aging, Multiple Sclerosis, and Oxidized Phosphatidylcholine-Induced Neurodegeneration
2023-06-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2312-22.2023
PMID:37208177
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老与多发性硬化症（MS）中Galectin-3（Gal3）的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 首次揭示了Gal3在衰老相关微胶质细胞功能障碍中的作用，并探讨了其在MS病变中的潜在危害。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证Gal3的作用。 | 探讨Gal3在衰老和多发性硬化症中的作用及其对中枢神经系统（CNS）损伤的影响。 | Galectin-3（Gal3）在衰老和多发性硬化症中的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 包括年轻和中年小鼠的脊髓白质病变样本，以及来自两名男性和一名女性的MS脑病变样本。 |
| 16539 | 2024-08-05 |
Endothelial cell clonality, heterogeneity and dysfunction in pulmonary arterial hypertension
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1304766
PMID:38126077
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综述 | 本文总结了内皮细胞亚群及其在肺动脉高压中发展的异常生理表型的机制 | 探讨了内皮细胞的克隆扩展、免疫失调和遗传突变在肺动脉高压发病机制中的作用 | NA | 提供理解参与肺动脉高压发展的独特肺内皮细胞生物学和病理生理学的框架 | 肺动脉高压相关的内皮细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 文献 | NA |
| 16540 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Sequencing Revealed Pivotal Genes Related to Prognosis of Myocardial Infarction Patients
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9895238
PMID:38124937
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撤回 | 该文章被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA |