单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 16481 - 16500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16481 | 2024-08-05 |
Construction of multiplexed transcriptome NGS libraries of microdissected tissue samples based on combinational DNA barcode microbeads
2024-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300294
PMID:37818700
|
研究论文 | 本文提出了一种基于组合DNA条形码的中通量转录组分析方法 | 文章首次介绍了组合DNA条形码（CDB）测序的应用，结合了Smart-3SEQ和CDB磁微珠以提高转录组分析的通量 | 文中没有明确提及CDB-seq方法在其他类型组织样本中的适用性 | 研究旨在开发一种成本效益高的中通量转录组分析方法 | 研究对象为微切割的组织样本，包括小鼠脑组织样本 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | RNA提取物 | 数十个微切割样本 |
| 16482 | 2024-08-05 |
Peroxisome proliferator-activated receptors signature reveal the head and neck squamous cell carcinoma energy metabolism phenotype and clinical outcome
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3605
PMID:37932968
|
研究论文 | 本研究揭示了过氧化物酶体增殖物激活受体在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与能量代谢表型和临床结果的关系 | 研究发现PPAR相关基因在HNSC中的能量代谢和免疫功能的重要性，构建了高准确度的预后模型 | 研究可能受限于数据集的多样性以及样本量的大小 | 全面分析头颈部鳞状细胞癌中PPAR相关基因的功能和临床意义 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | LASSO和Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多种数据集，包括TCGA-HNSC等多个研究的样本 |
| 16483 | 2024-08-05 |
Cross-talk of pyroptosis-based subtypes, the development of a risk classifier and immune responses in cervical cancer
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3566
PMID:37469224
|
研究论文 | 该文章探讨了基于炎性坏死的亚型、风险分类器的开发以及宫颈癌中的免疫响应 | 提出了一个基于52个与炎性坏死相关基因的风险分类器，并发现CDH3在宫颈癌中的作用 | 未提及具体限制，可能包括样本量或特定基因的局限性 | 评估宫颈癌的预后和免疫代谢状态 | 宫颈癌患者的不同亚型和相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序分析 | 风险分类模型 | 基因表达数据 | 结合了两个独立的宫颈癌队列，样本规模为501（259和242） |
| 16484 | 2024-08-07 |
COL3A1-positive endothelial cells influence LUAD prognosis and regulate LUAD carcinogenesis by NCL-PI3K-AKT axis
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3573
PMID:37547956
|
研究论文 | 本文研究了COL3A1阳性内皮细胞对肺腺癌（LUAD）预后和致癌过程的影响，并探讨了NCL-PI3K-AKT轴的作用。 | 首次揭示了COL3A1阳性内皮细胞在LUAD发展中的重要作用，并识别了关键目标基因NCL及其通过PI3K-AKT途径影响细胞凋亡和增殖的机制。 | NA | 探讨COL3A1阳性内皮细胞对LUAD预后和致癌过程的影响，并研究NCL-PI3K-AKT轴的作用。 | 肺腺癌（LUAD）中的内皮细胞和恶性细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 16个LUAD样本 |
| 16485 | 2024-08-07 |
Cytotoxic T-lymphocytes in acute myeloid leukemia: Monitoring prognosis and guiding treatment choice
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3587
PMID:37697474
|
研究论文 | 本研究强调了细胞毒性T淋巴细胞（CTL）在急性髓系白血病（AML）中的作用，并探讨了CTL的细胞遗传学标记在监测AML预后和临床治疗反应中的作用。 | 本研究建立了基于CTL细胞遗传学标记的随机森林回归模型，有助于AML的预后分层，并可能指导AML患者的治疗选择。 | NA | 研究CTL在急性髓系白血病中的作用及其在监测预后和指导治疗选择中的应用。 | 急性髓系白血病（AML）患者的细胞毒性T淋巴细胞（CTL）及其细胞遗传学标记。 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 单细胞RNA测序数据 | GSE116256数据集中包含的AML细胞类型 |
| 16486 | 2024-08-07 |
Machine learning reveals PANoptosis as a potential reporter and prognostic revealer of tumour microenvironment in lung adenocarcinoma
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3599
PMID:37800684
|
研究论文 | 本研究通过整合多种细胞死亡模式构建PANoptosis基因集，并利用单细胞RNA测序数据分析其在肺腺癌中的作用 | 首次将PANoptosis作为肿瘤微环境的潜在报告和预后标志物进行研究 | 研究样本量较小，需要进一步在大规模样本中验证 | 探索PANoptosis在肺腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境和免疫调控的关系 | 肺腺癌及其相关的PANoptosis基因集 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 11个肺腺癌样本 |
| 16487 | 2024-08-07 |
Immune infiltration and clinical significance analyses of the cancer-associated fibroblast-related signature in skin cutaneous melanoma
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3614
PMID:37847069
|
研究论文 | 本研究旨在建立与皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征，以提供新的视角来指示SKCM患者的预后和指导治疗方案 | 构建了一个包含10个基因的CAF相关模型，该模型能够预测患者的生存预后、肿瘤免疫景观及对化疗/免疫治疗的反应 | NA | 建立CAF相关特征以指示SKCM患者的预后和指导治疗方案 | 皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）患者的CAF相关基因和治疗反应 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因共表达分析 | 基因表达数据 | TCGA-SKCM队列中的SKCM样本 |
| 16488 | 2024-08-07 |
Macrophage heterogeneity in atherosclerosis: A matter of context
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350464
PMID:37943053
|
综述 | 本文综述了在动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性和功能特化，探讨了其在疾病发展中的多样性来源和作用 | 强调了巨噬细胞在动脉粥样硬化中的异质性和功能特化，以及局部微环境对其表型和功能的影响 | 主要集中在综述现有研究，未涉及具体实验数据或新发现 | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的异质性和功能特化，以及局部微环境对其的影响 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的异质性和功能特化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 16489 | 2024-08-07 |
Exploring the mechanism underlying the therapeutic effects of butein in colorectal cancer using network pharmacology and single-cell RNA sequencing data
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3628
PMID:37963584
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞RNA测序数据探索了白藜芦醇在结直肠癌中的治疗机制，并识别了潜在的生物标志物。 | 本研究结合网络药理学和单细胞分析，揭示了白藜芦醇在结直肠癌中的作用机制，并发现UBE2C作为一个有前景的生物标志物。 | NA | 揭示白藜芦醇在结直肠癌中的精确作用机制，并识别潜在的生物标志物。 | 白藜芦醇在结直肠癌中的作用机制及潜在生物标志物。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 232个白藜芦醇的目标基因，520个疾病相关基因，727个疾病-药物-基因网络中的目标，56个关键基因。 |
| 16490 | 2024-08-07 |
Prognosis and therapy in thyroid cancer by gene signatures related to natural killer cells
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3657
PMID:38282150
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了与自然杀伤细胞相关的基因风险特征，用于预测甲状腺癌的预后和治疗 | 首次利用自然杀伤细胞相关的基因KLF2、OSTF1和TAPBP构建了甲状腺癌的新型预后风险特征 | NA | 开发与自然杀伤细胞相关的基因风险特征，用于预测甲状腺癌的预后 | 甲状腺癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox分析 | RNA测序数据 | 7个甲状腺癌样本和502名甲状腺癌患者 |
| 16491 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the underlying mechanism of folliculotropism in folliculotropic mycosis fungoides
2024-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14992
PMID:38284188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16492 | 2024-08-07 |
Large-scale analysis of cell-cell communication reveals angiogenin-dependent tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108367
PMID:38025776
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，深入分析了透明细胞肾细胞癌中的细胞间通信网络，并揭示了血管生成素依赖的肿瘤进展机制 | 本研究首次识别了50个癌细胞与其他细胞间特定的通信通道，并发现了两个新的血管生成素介导的相互作用 | NA | 揭示透明细胞肾细胞癌中细胞间通信的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌中的细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 16493 | 2024-08-05 |
Hierarchical and automated cell-type annotation and inference of cancer cell of origin with Census
2023-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad714
PMID:38011649
|
研究论文 | 本研究开发了Census，一种自动化的细胞类型定位和癌细胞源推断方法 | Census提供了对正常细胞的深度注释并能够识别恶性细胞及其最可能的来源细胞，克服了现有方法的多项局限 | 现有的自动注释方法需要大量参考数据集，并且存在高计算时间和浅层注释解析的问题 | 旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释效率和准确性 | 研究对象为来自哺乳动物组织的正常细胞和癌细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 梯度增强决策树 | 文本 | 在44个正常和癌症的人类及小鼠组织数据集中进行了基准测试 |
| 16494 | 2024-08-05 |
A rat liver cell atlas reveals intrahepatic myeloid heterogeneity
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108213
PMID:38026201
|
研究论文 | 这项研究使用单细胞转录组学来了解大鼠肝脏的复杂细胞网络 | 该文章揭示了不同大鼠品系之间的肝脏转录组差异 | 没有提及关于样本的长期跟踪研究和功能验证的局限性 | 的本研究旨在解开大鼠肝脏中细胞和分子来源的变异 | 该研究对象为健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系的肝脏样本 |
| 16495 | 2024-08-05 |
DNA-GPS: A theoretical framework for optics-free spatial genomics and synthesis of current methods
2023-10-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.08.005
PMID:37751737
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-GPS的理论框架，用于无光学的空间基因组学 | 提出DNA-GPS这一新框架，结合数学制图和位置索引的思路，实现了大规模的无光学空间基因组学 | 讨论了当前空间基因组学技术在分辨率和规模上的权衡及其局限性 | 旨在为大规模无光学空间基因组学提供理论基础 | 对现有空间基因组学技术进行分类并进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | 数学制图 | 分子特征数据 | NA |
| 16496 | 2024-08-07 |
Landscape of mast cell populations across organs in mice and humans
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230570
PMID:37462672
|
research paper | 本文通过结合全组织成像和单细胞RNA测序数据，对小鼠和人类在稳态下的MCs进行了跨器官分析 | 首次在全器官水平上分析了小鼠和人类的MCs亚型，并揭示了不同亚型的转录组核心特征 | NA | 研究小鼠和人类不同器官中肥大细胞（MCs）的分布和特征 | 小鼠和人类的肥大细胞（MCs）及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的多个器官 |
| 16497 | 2024-08-07 |
Proteomic and transcriptomic screening demonstrates increased mast cell-derived CCL23 in systemic mastocytosis
2023-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.01.033
PMID:36813186
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学筛选和单细胞转录组分析，鉴定了系统性肥大细胞增多症（SM）中由肥大细胞衍生的CCL23蛋白，可能作为血液生物标志物。 | 首次发现CCL23在SM中的表达与疾病严重程度正相关，并可能作为SM的特异性生物标志物。 | NA | 旨在识别肥大细胞衍生的蛋白质，作为SM的血液生物标志物。 | 系统性肥大细胞增多症（SM）患者和健康个体的血浆蛋白质和单细胞转录组。 | NA | 系统性肥大细胞增多症 | 血浆蛋白质组学筛选，单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质，RNA | SM患者和健康个体的血浆样本 |
| 16498 | 2024-08-07 |
Type 2 inflammation reduces SARS-CoV-2 replication in the airway epithelium in allergic asthma through functional alteration of ciliated epithelial cells
2023-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.03.021
PMID:37001649
|
研究论文 | 本文研究了过敏性哮喘患者气道中2型炎症如何通过改变纤毛上皮细胞的功能来减少SARS-CoV-2的复制 | 发现了过敏性哮喘患者对SARS-CoV-2的固有保护机制，这种机制与纤毛上皮细胞的功能下调有关 | NA | 旨在识别2型炎症在气道中保护免受严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的机制 | 从过敏原敏感的哮喘儿童和健康非敏感儿童中获取的支气管气道上皮细胞（AECs） | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | RNA测序 | NA | 细胞样本 | 来自过敏性哮喘儿童和健康非敏感儿童的支气管气道上皮细胞样本 |
| 16499 | 2024-08-05 |
Unraveling the timeline of gene expression: A pseudotemporal trajectory analysis of single-cell RNA sequencing data
2023, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.134078.2
PMID:37994351
|
研究论文 | 本研究展示了一种对小鼠乳腺单细胞RNA测序数据进行伪时间轨迹分析的全面工作流程 | 提出了一种新的分析方法，利用伪时间轨迹推断细胞分化和发育过程 | 主要集中在小鼠乳腺样本上，可能对其他生物体的适用性有限 | 旨在通过单细胞RNA测序分析细胞的发育和分化轨迹 | 小鼠乳腺中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠乳腺样本 |
| 16500 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胆管癌进展过程中肿瘤微环境中癌症干细胞样细胞的转录特征和动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中通过单细胞RNA测序揭示了胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞及其微环境的动态变化 | NA | 深入理解胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞和肿瘤微环境的转录特征 | 胆管癌中的癌症干细胞样细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从YAP/AKT小鼠模型的三个不同肿瘤发生时间点收集的细胞样本 |