单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
16461	2024-08-07	The immune checkpoint adenosine 2A receptor is associated with aggressive clinical outcomes and reflects an immunosuppressive tumor microenvironment in human breast cancer 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1201632 PMID:37753093	研究论文	本研究探讨了免疫检查点腺苷2A受体（A2AR）在人乳腺癌中的临床和免疫学意义，发现A2AR的高表达与乳腺癌的侵袭性临床结果和免疫抑制性肿瘤微环境相关。	首次阐明了A2AR在乳腺癌患者中的临床和免疫学相关性，揭示了A2AR作为克服乳腺癌免疫逃逸的治疗靶点的潜力。	NA	研究A2AR在人乳腺癌中的临床和免疫学意义。	人乳腺癌中的A2AR表达及其与肿瘤微环境的关系。	数字病理学	乳腺癌	RT-qPCR, 免疫组织化学, 数字细胞计量术, ESTIMATE计算方法, GSEA分析, scRNA-seq	NA	mRNA表达, 蛋白质分析, 微阵列数据, 单细胞数据库	使用大规模微阵列数据（METABRIC）进行分析
16462	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing atlas of peripheral blood mononuclear cells from subjects with coronary artery disease 2024-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2023.119593 PMID:37730128	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了冠状动脉疾病患者和对照组的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型和基因表达的差异	首次在单细胞水平上详细描述了冠状动脉疾病患者外周血单个核细胞的转录组特征	样本量较小，仅包括3名冠状动脉疾病患者和3名对照组	探索冠状动脉疾病发生发展过程中外周循环免疫细胞亚群的单细胞水平特征	冠状动脉疾病患者和对照组的外周血单个核细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	6名受试者（3名冠状动脉疾病患者和3名对照组）
16463	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing and UPHLC-MS/MS targeted metabolomics offer new insights into the etiological basis for male cattle-yak sterility 2023-Dec-31, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.126831 PMID:37716658	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和UPHLC-MS/MS靶向代谢组学方法，对比分析了4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代睾丸组织的差异，以探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础。	首次系统地对牛牦杂交后代雄性不育现象进行了细胞层面的分析，提供了全面的见解。	NA	探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础	4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织	NA	雄性不育	单细胞RNA测序，UPHLC-MS/MS靶向代谢组学	NA	细胞类型数据	4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织样本
16464	2024-08-05	Functional enrichment analysis of LYSET and identification of related hub gene signatures as novel biomarkers to predict prognosis and immune infiltration status of clear cell renal cell carcinoma 2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-023-05280-2 PMID:37740762	研究论文	本研究探讨了LYSET在透明细胞肾细胞癌中的潜在途径，并基于这些途径中的核心基因建立相关预测模型	文章首次识别了与LYSET相关的核心基因签名，作为透明细胞肾细胞癌的预后和免疫浸润状态的新生物标志物	研究结果需要更多的实验验证以确认其有效性	旨在探索TMEM251在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其相关的预测模型	研究对象为透明细胞肾细胞癌样本及其相关临床信息	数字病理学	肾癌	mRNA表达数据分析、单细胞测序、免疫组化	LASSO回归、Cox回归模型	文本、基因表达数据	使用了来自TCGA、E-MATE-1980和免疫治疗队列的透明细胞肾细胞癌样本
16465	2024-08-07	Machine-learning based integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals the SLC38A5-CCL5 signaling as a promising target for clear cell renal cell carcinoma treatment 2023-Dec, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2023.101790 PMID:37722291	研究论文	本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了SLC38A5-CCL5信号通路作为透明细胞肾细胞癌治疗的有前景靶点	本研究首次建立了基于ETS1和MEF2C的高激活 regulons 的CAF衍生通信签名，并据此将ccRCC的肿瘤微环境分为两种分子亚型，该模型在预测预后和ICI治疗反应方面表现出高准确性和鲁棒性	NA	揭示癌症相关成纤维细胞在透明细胞肾细胞癌中的机制，并寻找新的治疗靶点	透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和恶性细胞	机器学习	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	NA
16466	2024-08-07	Post-ovulatory aging affects mitochondria, spindle and protein metabolism in mouse oocytes 2023-12-01, Reproduction (Cambridge, England) DOI:10.1530/REP-23-0130 PMID:37732584	研究论文	本研究首次提供了新鲜和老化卵母细胞的全面mRNA表达谱，并探讨了卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的影响。	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了老化卵母细胞中差异表达基因的富集情况，特别是在线粒体功能、纺锤体功能和蛋白质代谢方面。	研究主要集中在小鼠卵母细胞上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。	探讨卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的分子机制。	新鲜和老化的小鼠卵母细胞。	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	mRNA表达谱	921个差异表达基因，其中569个基因下调，356个基因上调
16467	2024-08-07	Integrated analysis of tumor microenvironment features to establish a diagnostic model for papillary thyroid cancer using bulk and single-cell RNA sequencing technology 2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-023-05420-8 PMID:37733241	research paper	本研究通过整合肿瘤微环境特征，利用批量和单细胞RNA测序技术，建立了一个用于诊断乳头状甲状腺癌的模型	本研究首次通过单细胞RNA测序技术探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并识别出潜在的诊断生物标志物	NA	探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并建立诊断模型	乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征及诊断生物标志物	digital pathology	甲状腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
16468	2024-08-07	A Novel Scoring Model of Deubiquitination Patterns Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Hepatocellular Carcinoma 2023-Dec, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2023.101789 PMID:37734237	研究论文	本研究通过全面分析肝细胞癌中与总生存期相关的26种去泛素化酶的转录和遗传改变，利用共识聚类算法识别不同的去泛素化模式，并建立DUBscore模型来量化个体肝细胞癌患者的去泛素化模式，进一步通过加权基因共表达网络分析确定关键去泛素化酶，揭示了去泛素化模式在塑造肿瘤微环境复杂性和多样性中的重要作用。	本研究首次建立了DUBscore模型，用于量化肝细胞癌患者的去泛素化模式，并发现其可作为独立的预后因素和预测免疫治疗反应的指标。此外，研究还确定了BRCC3作为潜在的治疗靶点和预测免疫治疗反应的标志物。	NA	研究去泛素化模式在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。	肝细胞癌患者的去泛素化模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	主成分分析(PCA)	转录组数据	26种与总生存期相关的去泛素化酶
16469	2024-08-07	A single-cell atlas of CD19 chimeric antigen receptor T cells 2023-11-13, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.015 PMID:37738975	研究论文	Li等人通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，分析了复发或难治性大B细胞淋巴瘤（rrLBCL）患者接受标准治疗axicabtagene ciloleucel后的CD19嵌合抗原受体T细胞，并识别了在3个月随访期间通过PET/CT评估的应答者和非应答者之间显著不同的特征。	该研究利用单细胞RNA测序技术，首次详细描述了CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征，并区分了应答者和非应答者的差异。	NA	研究CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征及其对应答者和非应答者的区分。	复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞。	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	来自复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞样本
16470	2024-08-05	Biomarkers for immunotherapy of hepatocellular carcinoma 2023-11, Nature reviews. Clinical oncology DOI:10.1038/s41571-023-00816-4 PMID:37726418	评论	这篇综述总结了肝细胞癌免疫治疗中的生物标志物数据	提出了新的生物标志物开发概念，包括生物标志物驱动的试验和空间转录组学	没有明确说明生物标志物的临床应用限制	旨在识别最有可能从免疫检查点抑制剂中受益的患者	探讨了肝细胞癌患者在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫学和结果	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序、放射组学、微生物组分析	NA	NA	NA
16471	2024-08-05	MAIT cells confer resistance to Lenvatinib plus anti-PD1 antibodies in hepatocellular carcinoma through TNF-TNFRSF1B pathway 2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2023.109770 PMID:37717672	研究论文	本文探讨了MAIT细胞通过TNF-TNFRSF1B通路，在肝细胞癌中对Lenvatinib及抗PD1抗体的耐药性提供的抵抗力	研究揭示了MAIT细胞分泌TNF对调节性T细胞的作用，提供了Lenvatinib联合抗PD1治疗的潜在机制	研究样本数量较少，仅涉及六名肝细胞癌患者	探索Lenvatinib与抗PD1抗体联合治疗的耐药机制	肝细胞癌患者的单细胞样本	数字病理学	肝癌	单细胞测序	NA	细胞样本	六名肝细胞癌患者的样本
16472	2024-08-05	Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance 2023-Nov-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081 PMID:37717621	研究论文	本研究定义了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型，并探讨了WASF2在铜死亡抗性中的作用	首次将铜死亡相关特征应用于卵巢癌的预后模型中，并识别出WASF2与铜死亡抗性相关	未能全面探讨其他可能影响铜死亡的因子，实验样本量可能不足以完全代表卵巢癌患者群体	目标是建立一个能够准确预测卵巢癌患者预后的铜死亡相关预后模型	研究对象为卵巢癌患者，主要包括378名来自TCGA数据库的患者及其他多个数据集的患者	数字病理学	卵巢癌	RNA-seq	随机森林	基因组数据，单细胞测序	共涉及379名卵巢癌患者和173名卵巢肿瘤患者的临床数据
16473	2024-08-07	Single-cell transcriptome analysis reveals the effectiveness of cytokine priming irrespective of heterogeneity in mesenchymal stromal cells 2023-11, Cytotherapy IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.jcyt.2023.08.006 PMID:37715776	研究论文	本研究通过分析从原始状态到细胞因子预刺激状态的人骨髓间充质干细胞的单细胞转录组图谱，阐明了细胞因子预刺激间充质干细胞的潜在机制	研究发现细胞因子预刺激的间充质干细胞具有独特的转录组图谱，尽管存在显著的异质性，但细胞因子预刺激增强了与治疗效果相关的多个间充质干细胞特征	NA	探讨间充质干细胞在细胞因子预刺激下的治疗潜力及其机制	人骨髓间充质干细胞	再生医学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	NA
16474	2024-08-07	Sanguisorba officinalis ethyl acetate extract attenuates ulcerative colitis through inhibiting PI3K-AKT/NF-κB/ STAT3 pathway uncovered by single-cell RNA sequencing 2023-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2023.155052 PMID:37717310	研究论文	研究了丹参乙酸乙酯提取物通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路减轻溃疡性结肠炎的作用及其分子机制	首次揭示了丹参乙酸乙酯提取物在治疗溃疡性结肠炎中的显著疗效，并通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路改善临床症状和炎症反应	NA	全面探索丹参活性成分的药理作用及其分子机制，并生成其化学基础和作用机制的综合新指南图	丹参乙酸乙酯提取物对溃疡性结肠炎的影响及其分子机制	数字病理学	溃疡性结肠炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	溃疡性结肠炎模型小鼠
16475	2024-08-07	Extracellular shuttling miR-21 contributes to esophageal cancers and human umbilical vein endothelial cell communication in the tumor microenvironment and promotes tumor angiogenesis by targeting phosphatase and tensinhomolog 2023-11, Thoracic cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1111/1759-7714.15103 PMID:37726969	研究论文	本研究探讨了外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌（ESCC）和人类脐静脉内皮细胞（HUVECs）间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制	本研究首次揭示了外泌体miR-21在食管鳞状细胞癌中的作用及其通过靶向磷酸酶和张力蛋白同源物（PTEN）促进血管生成的具体机制	NA	探索外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌和内皮细胞间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制	食管鳞状细胞癌（ESCC）和人类脐静脉内皮细胞（HUVECs）	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（ScRNA-Seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-Seq）	NA	RNA	3842个内皮细胞
16476	2024-08-07	Single-cell analysis of human dermal fibroblasts isolated from a single male donor over 35 years 2023-11, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.14929 PMID:37727050	研究论文	本研究旨在基于同一供体的样本，探讨年龄对皮肤成纤维细胞异质性的影响	通过单细胞RNA测序分析，揭示了随着年龄增长，衰老成纤维细胞的增加以及与细胞外基质重塑相关基因的下调	仅基于单一供体的样本进行研究，可能限制了结果的普遍性	研究皮肤老化过程中成纤维细胞的行为	从同一健康男性供体分离的皮肤成纤维细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	从36岁和72岁两个时间点采集的成纤维细胞样本
16477	2024-08-07	Monocyte-derived Kupffer cells dominate in the Kupffer cell pool during liver injury 2023-10-31, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2023.113164 PMID:37740916	研究论文	本研究使用增强绿色荧光蛋白标记的骨髓细胞的嵌合小鼠模型，探讨了在胆汁淤积或毒性肝损伤情况下，骨髓来源的单核细胞衍生的库普弗细胞（MoKCs）如何成为库普弗细胞池中的主导细胞	首次揭示了MoKCs在肝损伤后成为库普弗细胞池中的主导细胞，并具有增强的增殖、抗凋亡特性和修复潜力	NA	探讨肝损伤后库普弗细胞池的变化及其对肝脏功能的影响	库普弗细胞在肝损伤后的变化及其生物学特性	NA	肝损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞	使用嵌合小鼠模型进行研究
16478	2024-08-07	Stromal cells-specific retinoic acid determines parturition timing at single-cell and spatial-temporal resolution 2023-Oct-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.107796 PMID:37720083	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠子宫内膜中不同细胞类型在分娩启动中的作用，并揭示了基质细胞通过调节局部视黄酸合成来准备分娩的新机制。	本研究首次揭示了基质细胞在分娩启动中的作用，并通过调节局部视黄酸合成来准备分娩，为理解分娩机制提供了新视角。	NA	全面解码接近分娩时子宫内膜的细胞异质性，并揭示分娩启动的新见解。	小鼠子宫内膜中的各种细胞类型及其在分娩过程中的作用。	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	涉及五种不同的基质细胞群体和一种蜕膜化基质细胞
16479	2024-08-07	Bibliometric analysis of research on neurodegenerative diseases and single-cell RNA sequencing: Opportunities and challenges 2023-Oct-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.107833 PMID:37736042	综述	本文通过文献计量分析方法，深入探讨了2009年至2022年间单细胞RNA测序技术在神经退行性疾病研究中的应用	利用单细胞RNA测序技术提供前所未有的细胞层面洞察，揭示神经退行性疾病的潜在机制	NA	分析单细胞RNA测序技术在神经退行性疾病研究中的机遇与挑战	神经退行性疾病及其单细胞RNA测序技术的应用	数字病理学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	NA	文本	NA
16480	2024-08-05	Cell-type-specific responses to fungal infection in plants revealed by single-cell transcriptomics 2023-10-11, Cell host & microbe IF:20.6Q1 DOI:10.1016/j.chom.2023.08.019 PMID:37741284	研究论文	本文利用单细胞转录组学研究植物对真菌感染的细胞类型特异性反应	揭示了在植物组织中不同细胞类型对真菌感染的转录重编程和免疫反应	未提及具体的限制	探究植物在真菌感染下的反应异质性	阿拉伯芥（Arabidopsis thaliana）叶片中的细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	细胞转录组数据	95,040个细胞