单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16441 - 16460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16441 | 2024-08-07 |
Amyloid-Beta Peptides Trigger Premature Functional and Gene Expression Alterations in Human-Induced Neurons
2023-Sep-18, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11092564
PMID:37761004
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研究论文 | 研究探讨了Aβ肽在人诱导神经元中的早期效应及其对功能特性和基因表达谱的影响 | 首次展示了低浓度Aβ肽暴露导致人诱导神经元钙瞬变频率改变，并使用单细胞RNA测序揭示了Aβ肽对突触相关基因表达的调控 | NA | 探究Aβ肽在阿尔茨海默病中导致神经元功能障碍的分子机制 | 人诱导神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种神经元和星形胶质细胞 |
| 16442 | 2024-08-05 |
Investigating the Heterogeneity of Immune Cells in Triple-Negative Breast Cancer at the Single-Cell Level before and after Paclitaxel Chemotherapy
2023-Sep-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241814188
PMID:37762493
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研究论文 | 本研究探讨了在紫杉醇化疗前后三阴性乳腺癌中免疫细胞的异质性及其与治疗结果的关系 | 本研究首次通过单细胞测序分析免疫细胞在三阴性乳腺癌化疗过程中的多样性和其对治疗效果的影响 | 研究仅专注于紫杉醇治疗，可能无法全面反映所有类型化疗对免疫细胞的影响 | 探索免疫细胞的不同角色及其与治疗结果的关系 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤及血液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16443 | 2024-08-07 |
Investigation of Tumor Heterogeneity Using Integrated Single-Cell RNA Sequence Analysis to Focus on Genes Related to Breast Cancer-, EMT-, CSC-, and Metastasis-Related Markers in Patients with HER2-Positive Breast Cancer
2023-09-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182286
PMID:37759508
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，分析HER2阳性乳腺癌患者的肿瘤异质性，重点关注与乳腺癌、EMT、CSC和转移相关标记基因的表达。 | 本研究首次整合公共数据集和自身队列的单细胞RNA测序数据，探讨HER2阳性乳腺癌的肿瘤异质性及其与药物耐药性的关系。 | 研究仅限于HER2阳性乳腺癌患者，且依赖于公共数据集和自身队列的数据，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨HER2阳性乳腺癌的肿瘤异质性及其与药物耐药性的关系。 | HER2阳性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及HER2阳性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据，具体样本数量未详述。 |
| 16444 | 2024-08-07 |
Single-Cell Network-Based Drug Repositioning for Discovery of Therapies against Anti-Tumour Necrosis Factor-Resistant Crohn's Disease
2023-Sep-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241814099
PMID:37762402
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了抗肿瘤坏死因子（TNF）治疗抵抗的克罗恩病患者的细胞现象，并识别了潜在的药物候选 | 本研究首次在克罗恩病中进行了基于单细胞网络的药物再定位研究，并发现了针对抗TNF抵抗的克罗恩病的新药物候选vorinostat | 研究仅使用了Gene Expression Omnibus和Library of Integrated Network-Based Cellular Signatures L1000项目的数据，可能未涵盖所有相关细胞类型和功能 | 阐明抗TNF治疗抵抗的克罗恩病患者中的细胞现象，并识别潜在的药物候选 | 抗TNF治疗抵抗的克罗恩病患者 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 93,893个细胞 |
| 16445 | 2024-08-05 |
Elucidating Cuproptosis-Associated Genes in the Progression from Nash to HCC Using Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Analyses and Experimental Validation
2023-Sep-11, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59091639
PMID:37763758
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研究论文 | 本研究探讨了与杯死亡相关的基因在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）向肝细胞癌（HCC）进展中的作用 | 发现FDX1等基因在NASH和NASH向HCC进展过程中起着关键作用，并构建了与杯死亡相关的基因簇 | 研究未提及样本量的具体细节和方法的广泛应用性 | 探讨杯死亡相关基因在NASH与HCC进展中的角色与机制 | NASH患者及其向HCC进展的病例 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种NASH患者的模型和人类样本 |
| 16446 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immuno-Oncology Characteristics of Tumor-Infiltrating T Lymphocytes in Photodynamic Therapy-Treated Colorectal Cancer Mouse Model
2023-Sep-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813913
PMID:37762216
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了光动力疗法治疗结直肠癌小鼠模型中肿瘤浸润T淋巴细胞的免疫肿瘤学特征 | 首次揭示了光动力疗法通过调节肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是增加CD8激活T细胞和CD8细胞毒性T细胞，减少耗竭CD8 T细胞，从而增强抗肿瘤免疫 | NA | 探究光动力疗法在结直肠癌治疗中的免疫调节机制 | 结直肠癌小鼠模型中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人源化的PD-1/PD-L1 MC38细胞异种移植小鼠模型 |
| 16447 | 2024-08-05 |
Dissecting the Molecular Mechanisms Driving Electropathology in Atrial Fibrillation: Deployment of RNA Sequencing and Transcriptomic Analyses
2023-09-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182242
PMID:37759465
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综述 | 本文综述了房颤中分子机制的解析，特别是RNA测序和转录组分析的应用 | 提供了关于房颤相关的转录组变化的新见解，并介绍了新的RNA-seq方法 | 未明确讨论实验模型与人类研究结果之间的所有差异 | 深入理解驱动房颤的电病理学的分子根源 | 关注房颤患者与正常心律控制组之间的转录组差异 | 数字病理学 | 房颤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多项房颤患者的房腔组织样本 |
| 16448 | 2024-08-07 |
A Novel Lipid Metabolism and Endoplasmic Reticulum Stress-Related Risk Model for Predicting Immune Infiltration and Prognosis in Colorectal Cancer
2023-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813854
PMID:37762157
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研究论文 | 本研究构建了一个基于脂质代谢和内质网应激相关基因的预测结直肠癌患者预后和免疫反应的预后特征模型 | 首次开发了一个结合脂质代谢和内质网应激相关基因的风险模型，用于预测结直肠癌的预后和免疫浸润 | NA | 旨在预测结直肠癌患者的预后和免疫反应 | 结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA序列数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的RNA测序和临床数据 |
| 16449 | 2024-08-07 |
Current Status of Next-Generation Sequencing in Bone Genetic Diseases
2023-Sep-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813802
PMID:37762102
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研究论文 | 本文讨论了下一代测序（NGS）在骨遗传疾病中的应用现状 | NGS技术的发展显著提高了遗传分析的速度和容量，并扩展到基因组、表观基因组、宏基因组和转录组分析 | NA | 探讨NGS在骨遗传疾病中的应用 | 骨组织及其相关的遗传疾病 | 基因组学 | 骨疾病 | NGS | NA | 基因组、表观基因组、转录组数据 | NA |
| 16450 | 2024-08-07 |
Identification of Colon Immune Cell Marker Genes Using Machine Learning Methods
2023-Sep-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13091876
PMID:37763280
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法分析单细胞RNA测序数据，旨在筛选结肠肿瘤微环境中25种候选免疫细胞类型的遗传标记基因 | 采用五种特征排序算法和增量特征选择方法，结合决策树和随机森林分类算法，筛选出不同免疫细胞亚型的标记基因 | NA | 筛选结肠肿瘤微环境中免疫细胞类型的遗传标记基因，并揭示其定量差异 | 结肠肿瘤微环境中的25种候选免疫细胞类型 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 决策树, 随机森林 | 基因表达数据 | 41,650个细胞，每个细胞表达22,164个基因 |
| 16451 | 2024-08-07 |
Establishment of a Seven-Gene Signature Associated with CD8+ T Cells through the Utilization of Both Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Techniques in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813729
PMID:37762031
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，在透明细胞肾细胞癌中建立了一个与CD8+ T细胞相关的七基因标志物 | 首次通过结合单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了与CD8+ T细胞相关的基因标志物，用于透明细胞肾细胞癌的预后评估和免疫治疗反应预测 | 研究样本仅来自TCGA和IMvigor210队列，可能需要更多样本来验证基因标志物的普遍性 | 确定与CD8+ T细胞相关的分子标志物，用于透明细胞肾细胞癌的诊断和治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 来自TCGA的透明细胞肾细胞癌患者被随机分配到测试组和训练组，IMvigor210队列用于评估标志物的有效性 |
| 16452 | 2024-08-07 |
ScRNA-seq revealed disruption in CD8+ NKG2A+ natural killer T cells in patients after liver transplantation and immunosuppressive therapy
2023-Sep, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.990
PMID:37773707
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了肝移植患者在接受免疫抑制治疗后的免疫细胞组成和基因表达变化 | 首次揭示了肝移植后CD8+ NKG2A+自然杀伤T细胞的动态变化及其在免疫耐受中的重要作用 | NA | 阐明肝移植后免疫耐受的机制 | 肝移植患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肝移植 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了17,462个外周血单个核细胞，来自一个正常个体和四个接受肝移植及免疫抑制治疗的患者 |
| 16453 | 2024-08-07 |
Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing
2023-Aug, Bulletin of experimental biology and medicine
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s10517-023-05898-9
PMID:37770788
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研究论文 | 本文研究了从肿瘤活检样本中制备高质量单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 本文开发并优化了机械分离与胶原酶/透明质酸酶混合物孵育相结合的方法，以提高细胞悬液的存活率 | NA | 优化从肿瘤活检组织中制备单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 肿瘤活检样本的单细胞悬液制备方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | 至少80%存活率的细胞悬液 |
| 16454 | 2024-08-05 |
Omics of an Enigmatic Marine Amoeba Uncovers Unprecedented Gene Trafficking from Giant Viruses and Provides Insights into Its Complex Life Cycle
2023-Jun, Microbiology research
IF:2.1Q3
DOI:10.3390/microbiolres14020047
PMID:37752971
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研究论文 | 本研究探索了一种复杂生活周期的海洋变形虫的基因组多样性 | 揭示了海洋变形虫与巨型病毒之间前所未有的基因转移，以及其复杂生活周期的多样性 | 未详细说明具体的实验方法和样本数量 | 探讨海洋变形虫的基因组多样性和异常行为 | 研究一种多核的海洋变形虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 16455 | 2024-08-05 |
Detection of lineage-reprogramming efficiency of tumor cells in a 3D-printed liver-on-a-chip model
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.86921
PMID:37771785
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研究论文 | 该研究探讨了在3D打印的肝脏芯片模型中肿瘤细胞的谱系重编程效率 | 通过简化重编程试剂的制备，使用两种慢病毒载体表达六个转录因子，实现了将MDA-MB-231肿瘤细胞重编程为人源诱导肝细胞样细胞（hiHeps） | 虽然已观察到肝特异性基因的激活，但重编程的所有机制和最佳策略尚未完全确定 | 研究谱系重编程在治疗三阴性乳腺癌肝转移中的应用 | MDA-MB-231肿瘤细胞及其重编程后的肝细胞样细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 慢病毒载体 | 3D打印肝脏芯片模型 | 单细胞测序 | 使用了MDA-MB-231细胞进行研究 |
| 16456 | 2024-08-05 |
Regulatory T cells are associated with the tumor immune microenvironment and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263537
PMID:37767092
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研究论文 | 这篇文章探讨了调节性T细胞与三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应的关系 | 提出了一种基于调节性T细胞浸润的预后模型，并揭示了TK1作为肿瘤生物标志物的潜力 | 未提及具体的临床验证和多中心研究加强结果的局限性 | 研究三阴性乳腺癌中调节性T细胞浸润对肿瘤进展和免疫治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本和相关基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | METABRIC三阴性乳腺癌样本 |
| 16457 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironment of ground glass nodules and solid nodules in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1198338
PMID:37745301
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的磨玻璃结节（GGN）和实性结节（SN）的肿瘤微环境 | 首次详细描述了GGN和SN的肿瘤微环境，并揭示了两者在细胞组成和转录组特征上的差异 | 研究样本量较小，仅包括三名GGN患者和三名SN患者 | 探究肺腺癌中磨玻璃结节和实性结节的不同恶性程度背后的机制 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 共分析了15,902个细胞，来自三名GGN患者和三名SN患者的肿瘤样本 |
| 16458 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in diagnosis and heterogeneous endothelial cells in chronic rhinosinusitis: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1228028
PMID:37745856
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研究论文 | 本研究旨在探讨慢性鼻窦炎（CRS）中与线粒体自噬相关的基因（MRGs）的作用，特别是内皮细胞（ECs）的异质性 | 本研究首次综合分析了线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用，并强调了内皮细胞异质性的重要性 | NA | 研究线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用及其对内皮细胞异质性的影响 | 线粒体自噬相关基因和内皮细胞在慢性鼻窦炎中的作用 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | RNA测序 | 逻辑回归模型 | RNA测序数据 | 92个慢性鼻窦炎样本和35个健康对照样本 |
| 16459 | 2024-08-07 |
A prognostic signature based on seven T-cell-related cell clustering genes in bladder urothelial carcinoma
2023, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2023-0773
PMID:37745978
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，筛选出与膀胱尿路上皮癌预后相关的七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了预测模型。 | 首次基于单细胞RNA测序数据筛选出七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了针对膀胱尿路上皮癌的预后模型。 | NA | 旨在通过分析膀胱尿路上皮癌的免疫微环境，为诊断和治疗提供指导。 | 膀胱尿路上皮癌的免疫细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16460 | 2024-08-07 |
Unveiling novel insights in prostate cancer through single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1224913
PMID:37746302
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示前列腺癌的新见解 | 使用单细胞RNA测序技术，能够在单个细胞水平上提供详细信息，特别适合识别稀有细胞群体 | NA | 揭示前列腺癌的复杂性和多样性 | 前列腺癌的细胞异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |