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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-11-29 |
Deciphering the molecular mechanism of YY1/HIF1A modulating ovarian cancer angiogenesis based on single-cell transcriptomics technology
2025 Jul-Dec, Mutation research
DOI:10.1016/j.mrfmmm.2025.111916
PMID:41072350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了YY1通过调控FBXW7/HIF1A轴促进卵巢癌血管生成的具体分子机制 | 首次发现YY1通过竞争性结合FBXW7来稳定HIF1A表达,从而促进卵巢癌血管生成基因转录激活的新机制 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 深入探究YY1在卵巢癌血管生成中的作用机制 | 卵巢癌肿瘤样本和癌旁样本 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,共免疫沉淀,染色质免疫沉淀,双荧光素酶报告基因检测,qRT-PCR,血管生成实验,Western blotting | NA | 单细胞转录组数据 | 从GEO数据库下载的卵巢癌肿瘤和癌旁样本单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1622 | 2025-11-29 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Defines N7-Methylguanosine (m7G)-Mediated Modifications' Role in Prognosis and the Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70992
PMID:40485623
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,研究m7G修饰在肝细胞癌预后和肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统分析m7G修饰模式在肝细胞癌中的临床意义,建立m7Gscore评分系统并验证其预后价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探讨m7G修饰在肝细胞癌预后、肿瘤免疫微环境和免疫治疗敏感性中的作用 | 肝细胞癌患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 主成分分析, ssGSEA, GSVA, 蛋白质印迹, 免疫组化, RT-qPCR | 无监督聚类, 主成分分析 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自GEO、TCGA、ICGC数据库的多中心数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1623 | 2025-11-29 |
Sequencing-free whole genome spatial transcriptomics at molecular resolution in intact tissue
2025-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641951
PMID:40161724
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研究论文 | 开发了一种名为RAEFISH的新型空间转录组技术,可在完整组织中实现全基因组覆盖和单分子空间分辨率 | 首次实现无需测序的全基因组空间转录组分析,同时保持单分子空间分辨率 | 技术尚未在更广泛的生物医学应用中验证 | 开发高覆盖度高分辨率的空间转录组技术 | 人类和小鼠的完整组织切片及培养细胞 | 空间转录组学 | NA | RAEFISH(反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交) | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学,图像分析 | RAEFISH | 反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交技术,可检测23,000种人类转录本或22,000种小鼠转录本 |
| 1624 | 2025-11-29 |
New Multiomic Studies Shed Light on Cellular Diversity and Neuronal Susceptibility in Parkinson's Disease
2025-Mar, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.30097
PMID:39812497
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综述 | 本文综述了多组学技术在帕金森病细胞多样性和神经元易感性研究中的最新进展 | 整合空间转录组学、表观基因组学和蛋白质组学等多组学方法研究帕金森病 | NA | 揭示帕金森病中神经元易感性网络和疾病修饰因子 | 帕金森病患者和啮齿类动物模型中的神经元和胶质细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组学,蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1625 | 2025-11-29 |
A CRISPR view on genetic screens in Toxoplasma gondii
2025-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102577
PMID:39778479
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9基因组编辑技术在弓形虫基因筛选研究中的应用现状与发展前景 | 重点介绍了将CRISPR-Cas9筛选技术应用于非生存相关表型研究的最新进展,包括条件系统与成像、单细胞RNA测序等创新方法 | 存在当前技术局限性,需要进一步开发完善 | 探讨CRISPR-Cas9筛选技术在顶复门寄生虫弓形虫研究中的应用 | 弓形虫及其与宿主的相互作用 | 基因组编辑 | 寄生虫感染 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序, 成像技术 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2025-11-29 |
The Expression of the LDLR, LDLRAP1, and PCSK9 Genes has Prognostic Significance in Triple-negative Breast Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨胆固醇摄取基因在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 首次系统评估LDLR、LDLRAP1和PCSK9等胆固醇摄取基因在不同乳腺癌亚型中的预后价值差异 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 评估胆固醇摄取基因对乳腺癌患者总生存期的预后意义及其在不同亚型间的差异 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | mRNA测序,单细胞测序 | DESeq2,Fisher检验 | 基因表达数据 | 癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌肿瘤样本 | NA | mRNA测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 1627 | 2025-11-29 |
Double-Responsive Macrophage-Derived Exosomes Alleviate Acute Lung Injury
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0277
PMID:41293091
|
研究论文 | 本研究开发了一种EGFR单克隆抗体修饰的巨噬细胞来源外泌体miR-126a-3p,用于治疗脓毒症引起的急性肺损伤 | 首次构建了具有巨噬细胞靶向能力的双响应外泌体递送系统,通过抑制PIK3R2/NLRP3信号通路和铁死亡发挥治疗作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠急性肺损伤模型,尚未在临床患者中验证 | 探索新型外泌体治疗方法对急性肺损伤的治疗效果及机制 | 巨噬细胞、外泌体、miR-126a-3p、急性肺损伤小鼠模型 | 生物医学工程 | 急性肺损伤 | 单细胞测序、miRNA芯片、免疫荧光、电穿孔技术、小动物成像 | NA | 基因表达数据、成像数据、细胞表型数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1628 | 2025-11-29 |
The Strontium Ion Reprograms Monocyte Subsets via TRPM2 Channel Regulation to Enhance Osseointegration
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0286
PMID:41293090
|
研究论文 | 本研究揭示了锶离子通过调控TRPM2通道重编程单核细胞亚群以增强骨整合的机制 | 首次阐明锶修饰生物材料通过TRPM2-Ca-NLRP3轴调控单核细胞亚群分布和功能的免疫调节机制 | 未明确说明样本规模,且机制研究主要集中于单核细胞,其他免疫细胞的作用未深入探讨 | 探究锶离子对单核细胞亚群动态重编程的机制及其在骨整合中的作用 | 单核细胞亚群、钛植入物、骨髓间充质基质细胞 | 免疫工程 | 骨整合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2025-11-29 |
Clinical application and drug resistance mechanism of gemcitabine
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1702720
PMID:41293424
|
综述 | 系统综述吉西他滨的耐药机制并探索新型递药系统和联合治疗策略的突破方向 | 整合单细胞测序和人工智能药物敏感性预测等前沿技术,提出通过动态监测多组学生物标志物构建'预防-监测-干预'全链条管理体系 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨吉西他滨的临床应用及耐药机制 | 吉西他滨及其耐药机制 | NA | 肿瘤 | 单细胞测序,人工智能药物敏感性预测,多组学生物标志物监测 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1630 | 2025-11-29 |
Decoding IL-1 receptor 1 and 2 expression profiles across organs in sepsis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1675870
PMID:41293423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证,系统分析了脓毒症中IL-1R1和IL-1R2受体在不同器官中的细胞类型特异性表达动态 | 首次在单细胞水平揭示IL-1受体在脓毒症中具有器官特异性和细胞类型特异性的表达模式 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 阐明IL-1受体在脓毒症中的表达动态及其在免疫调节和组织特异性反应中的作用 | 小鼠盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症模型中的肺、肝、心脏和小肠组织 | 单细胞生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1631 | 2025-11-29 |
Integrative Multi-Omics and Functional Validation Reveal the Role of the TACE Refractoriness-Associated Gene ATP1B3 in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S537990
PMID:41293558
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和功能验证,揭示了ATP1B3基因在肝细胞癌TACE耐药性和肿瘤进展中的关键作用 | 首次将ATP1B3鉴定为与TACE耐药性相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤-免疫细胞相互作用中的功能 | 样本量相对有限(104例患者),需要在更大队列中进一步验证 | 识别与肝细胞癌TACE耐药性相关的基因并探索其功能机制 | 104例接受TACE治疗的肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 功能验证实验 | 无监督聚类, Cox回归, lasso回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 104例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1632 | 2025-11-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals CCL3+ Classical Monocyte Subset Linked to Autoimmune Pathogenesis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S547283
PMID:41293646
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研究论文 | 通过整合六种自身免疫性疾病的单细胞RNA测序数据,揭示了CCL3+经典单核细胞亚群在自身免疫发病机制中的关键作用 | 首次在多种自身免疫性疾病中发现并鉴定了一个新的CCL3+经典单核细胞亚群,该亚群具有强烈的炎症特性和趋化作用 | 研究主要基于外周血单核细胞,未深入探讨组织特异性变化 | 表征自身免疫疾病中单核巨噬细胞的共享和疾病特异性改变,以增进对自身免疫疾病免疫景观的理解 | 自身免疫疾病患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学染色,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 350,043个外周血免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2025-11-29 |
Relationship between SPP1 (Osteopontin) and extracellular matrix dynamics: a comprehensive review
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700652
PMID:41293726
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综述 | 本综述系统总结了SPP1(骨桥蛋白)在细胞外基质动态调控中的核心作用及其在多种疾病中的病理机制 | 首次提出SPP1作为病理性ECM动态的主调控因子,强调保守的SPP1+巨噬细胞-ECM相互作用机制 | 缺乏体内验证数据,特别是在骨关节炎模型中的验证 | 阐明SPP1介导的细胞外基质失调机制及其作为中心病理枢纽的作用 | SPP1(骨桥蛋白)及其与胶原蛋白和其他ECM组分的相互作用 | 生物医学研究 | 纤维化疾病、转移性疾病、骨关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习、体内/体外实验 | NA | 多组学数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1634 | 2025-11-29 |
Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling
2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae188
PMID:39213186
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综述 | 本文总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的现状,探讨了技术挑战、现有研究成果和未来研究方向 | 首次系统性地总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的各种方法,提出了统一技术标准和跨研究比较的重要性 | 嗜酸性粒细胞存在细胞脆弱性和RNA提取困难等技术挑战,人类样本研究相对有限 | 建立统一的嗜酸性粒细胞转录特征,提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断和治疗精准度 | 小鼠和人类嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性粒细胞相关疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2025-11-29 |
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666
PMID:39602512
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研究论文 | 通过空间转录组学技术构建儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱,揭示肾脏基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息分析儿童狼疮性肾炎肾脏组织,发现了免疫细胞特异性定位模式和基因表达的空间依赖性 | 样本量较小(8例患者和4例对照),组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者,4例对照个体 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1636 | 2025-11-29 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现表面凹陷结构促进肿瘤-免疫相互作用并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现黑色素瘤表面凹陷结构是CD8 T细胞识别抗原和杀伤肿瘤的主要场所,并证明其预测免疫治疗反应的价值 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | 斑马鱼肿瘤模型 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1637 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
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研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12,从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子,并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析,微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 1638 | 2025-11-29 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 本研究探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能分化的影响 | 首次在內源性多克隆T细胞反应中揭示TCR结合强度与祖细胞样表型分化的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TCR结合强度如何影响T细胞在肿瘤微环境中的功能分化 | 肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和TCR转基因小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,MHC四聚体标记 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1639 | 2025-11-29 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
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研究论文 | 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 | 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导,而非传统认为的Th17通路 | 样本量有限,仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 | 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 | 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤炎症和结肠炎 | 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1640 | 2025-11-28 |
Perfluorooctanoic acid disrupts splenic immunity and antiviral responses in the LCMV model: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了全氟辛酸对脾脏免疫功能和抗病毒反应的破坏机制 | 首次在LCMV病毒感染模型中系统阐明PFOA通过细胞类型特异性机制导致免疫抑制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠,样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统的影响及其在病毒感染中的细胞特异性机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞,共13个注释细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |