单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-05 |
Chronic hyperactivation of midbrain dopamine neurons causes preferential dopamine neuron degeneration
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588321
PMID:38645054
|
研究论文 | 本研究通过化学遗传学方法慢性激活中脑多巴胺神经元，揭示了帕金森病中多巴胺神经元退化的新机制 | 首次建立了慢性激活多巴胺神经元的化学遗传学小鼠模型，证明了神经活动增强会导致黑质多巴胺神经元优先退化 | 动物模型研究，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究慢性神经活动改变在多巴胺神经元退化中的作用机制 | 中脑多巴胺神经元，特别是黑质致密部多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 化学遗传学(DREADD)，电生理记录，空间转录组学 | DREADD小鼠模型 | 电生理数据，行为数据，钙成像数据，转录组数据 | DREADD转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-05 |
Unveiling the mechanism of Pogostemon cablin (Blanco) Benth in treating heat illnesses via network pharmacology and molecular simulation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331401
PMID:40920657
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和分子模拟技术揭示广藿香治疗热射病的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统解析广藿香治疗热射病的分子靶点 | 样本量较小（11例患者和14例健康志愿者），需要更大规模研究验证 | 阐明广藿香治疗热射病的分子作用机制 | 热射病患者和健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 热射病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学分析, 分子对接模型 | RNA测序数据, 分子结构数据 | 25例（11例热射病患者+14例健康志愿者） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1623 | 2025-10-05 |
NAD + activates renal metabolism and protects from chronic kidney disease in a model of Alport syndrome
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
|
研究论文 | 本研究通过Alport综合征小鼠模型揭示了NAD+补充通过激活肾代谢途径特别是近端小管细胞的脂肪酸氧化来保护慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术，首次报道该模型中转录水平的性别差异，明确了NAD+补充通过近端小管细胞发挥肾脏保护作用的具体机制 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型，尚未在人类或其他慢性肾脏病模型中验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型 | 代谢研究 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化检测 | NA | RNA测序数据, 影像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1624 | 2025-10-05 |
Modeling Glioma Intratumoral Heterogeneity with Primary Human Neural Stem and Progenitor Cells
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619254
PMID:39484434
|
研究论文 | 利用人类神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型研究肿瘤内异质性 | 首次使用从胎儿脑组织纯化的同源神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型，系统研究细胞起源对肿瘤异质性的影响 | 使用免疫缺陷小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究细胞起源如何塑造胶质瘤的肿瘤内异质性 | 人类神经干细胞、胶质祖细胞和少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种同源神经细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-05 |
Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling
2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610447
PMID:39257811
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性社交挫败应激通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多的机制 | 首次发现慢性应激通过I型干扰素信号通路驱动颅骨骨髓来源的中性粒细胞向脑膜迁移 | 研究仅使用小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究应激相关障碍中脑膜免疫反应的分子机制 | 小鼠脑膜免疫细胞 | 神经免疫学 | 应激相关障碍 | 流式细胞术,免疫组织化学,组织透明化,单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2025-10-05 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590194
PMID:38712147
|
研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法及其Python包，用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 引入On-Target Fraction指标量化标记基因特异性，改进算法以识别密切相关的细胞类型间高选择性表达模式的标记基因组合 | NA | 开发可扩展的数据驱动解决方案，识别最小必要且充分的标记基因组合以实现细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 数百万细胞的大规模单细胞RNA测序图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1627 | 2025-10-05 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了儿童肝移植排斥反应中T细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下定义了儿童肝移植排斥中CD8+ T细胞的克隆扩增和基因表达特征，并发现这些克隆在组织学排斥缓解后仍持续存在 | 样本量相对较小（14名患者），且为回顾性研究 | 探究儿童肝移植急性细胞排斥反应中T细胞的转录组特征和免疫应答机制 | 儿童肝移植患者的肝脏活检组织 | 单细胞生物学 | 肝移植排斥反应 | 单细胞测序，免疫受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 14名患者的30份冷冻肝脏活检组织（5份移植前或无排斥，9份有排斥） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞免疫受体谱分析 |
| 1628 | 2025-10-05 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2024-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.21.537881
PMID:37162914
|
研究论文 | 开发了一种基于广义双线性模型的单细胞RNA测序数据降维新方法scGBM | 提出使用泊松双线性模型直接建模计数数据，引入快速估计算法可扩展到数百万细胞的数据集，并能量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确说明方法在其他单细胞数据类型上的适用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物学变异的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义双线性模型,泊松双线性模型 | 基因表达计数数据 | 可扩展到数百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-12-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02833-5
PMID:38114492
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析表达抗HER2 VHH-FcK癌症治疗蛋白的转基因烟草叶片 | 首次在植物系统中应用单细胞RNA测序技术分析重组治疗蛋白的组织特异性表达模式 | 仅针对烟草叶片进行研究，未验证其他植物组织或物种 | 优化植物生物质中重组治疗蛋白的生产效率 | 转基因烟草（Nicotiana tabacum）叶片细胞 | 植物生物技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因烟草叶片细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1630 | 2025-10-05 |
Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis
2023-12-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad062
PMID:37804518
|
研究论文 | 本研究通过自体气道基底细胞移植联合生物凝胶治疗复发性良性气管狭窄，探索其在气道再上皮化中的治疗效果 | 首次将自体气道基底细胞移植与生物凝胶涂层相结合，应用于气管狭窄的再生治疗 | 研究仅在犬类动物模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 探索自体基底细胞移植在恢复气道稳态和治疗气管狭窄中的治疗效果 | 复发性良性气管狭窄患者的气道黏膜和建立气管狭窄模型的犬类 | 单细胞测序 | 气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 犬类动物模型，分为4个实验组，随访16周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1631 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-12, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0125
PMID:37823745
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定小鼠唾液腺腺泡细胞的独特分子标记物 | 首次发现血管紧张素原和甘丙肽分别作为颌下腺浆液性腺泡细胞和舌下腺黏液性腺泡细胞的特异性标记物 | 研究仅使用4周龄小鼠，未涵盖其他发育阶段 | 鉴定小鼠颌下腺和舌下腺腺泡细胞的分子标记物 | 小鼠颌下腺和舌下腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 4周龄小鼠 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 1632 | 2025-10-05 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
|
研究论文 | 本研究通过阻断斑马鱼胚胎细胞周期并采用单细胞RNA测序分析，揭示了细胞分化与细胞分裂在早期胚胎发育中的解耦现象 | 首次在胚胎尺度上证明细胞分裂对所有胚胎组织初始细胞类型分化是非必需的，并展示了结合胚胎水平扰动与单细胞RNA测序的新方法 | 研究仅关注早期原肠胚形成至分节结束阶段，未涉及后期发育过程；细胞分裂缺失导致部分细胞类型分化速度减慢和应激反应 | 探究细胞分裂在细胞分化过程中的作用机制 | 斑马鱼早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-05 |
Construction of a gene-metabolite-microbiome regulatory network reveals novel therapeutic targets in bladder cancer through multi-omics analysis
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2553220
PMID:40908816
|
研究论文 | 通过多组学分析构建膀胱癌的基因-代谢物-微生物调控网络并识别新的治疗靶点 | 首次整合转录组、外显子组、代谢组和微生物组数据构建膀胱癌调控网络，发现成纤维细胞作为核心调控因子 | 样本来源相对有限，需要更大规模验证 | 阐明膀胱癌的发病机制并识别新的治疗靶点 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 转录组测序,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析,单细胞测序 | 调控网络分析,分子分型 | 基因组数据,转录组数据,代谢组数据,微生物组数据 | 膀胱癌患者组织样本，结合公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析 | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-05 |
KAT6A Promotes Macrophage Inflammation and Periodontitis
2025-Oct, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14203
PMID:40635126
|
研究论文 | 本研究揭示KAT6A通过调控巨噬细胞炎症反应促进牙周炎进展的机制 | 首次发现KAT6A在牙周炎巨噬细胞中表达上调，并通过基因敲除小鼠模型证实其在牙周炎发病中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究KAT6A在牙周炎发病机制中的作用 | 巨噬细胞、牙周炎小鼠模型 | 表观遗传学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNA-seq, 流式细胞术, Cut&tag | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1635 | 2025-10-05 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量，揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序 | 首次在单细胞水平识别HMO合成基因的差异表达模式，发现新的候选基因和转录因子，提出HMO合成可能通过乳腺细胞亚型特化实现 | HMO生物合成通路在哺乳期乳腺中的复杂机制仍未被完全阐明 | 解析人类母乳寡糖在乳腺细胞中的生物合成机制 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，HMO浓度测量数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-05 |
Adaptive individualized gene pair signatures distinguishing melanoma and predicting response to immune checkpoint blockade
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113329
PMID:40917881
|
研究论文 | 提出自适应个体化基因对特征方法，用于区分黑色素瘤亚型并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 开发基于基因对逆转的自适应特征选择方法，相比现有方法提高分类准确率5%以上，预测性能提升6% | 研究样本量相对有限（850个样本用于分类，252个样本用于预测），需要更多独立队列验证 | 开发稳健的基因特征方法以区分相似癌症亚型并预测免疫治疗反应 | 黑色素瘤患者样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 850个样本来自24个队列用于分类，252个样本来自7个队列用于预测 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-05 |
TREM-1 as a novel immunotherapeutic target to treat pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.201034
PMID:40917508
|
研究论文 | 本研究探讨TREM-1激活在胰腺导管腺癌中改变肿瘤微环境和增强肿瘤免疫的潜力 | 首次发现TREM-1激活能通过重编程免疫抑制性肿瘤微环境来治疗胰腺导管腺癌 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚不充分 | 探索TREM-1作为胰腺导管腺癌免疫治疗新靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类PDAC组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1638 | 2025-10-05 |
Integrative analysis identifies FERMT3 as a key regulator of metabolic reprogramming in keloid scarring and metabolic syndrome
2025-Sep-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01705-y
PMID:40928556
|
研究论文 | 通过整合分析识别FERMT3作为瘢痕疙瘩和代谢综合征中代谢重编程的关键调控因子 | 首次发现瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享转录组特征，并确定FERMT3作为调控代谢和炎症表型的关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证FERMT3的调控机制 | 识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共同调控基因，探索新的治疗靶点 | 瘢痕疙瘩组织、代谢综合征组织及相应健康对照组织 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩, 代谢综合征 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, LASSO回归, 机器学习, 体外实验 | WGCNA, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 1639 | 2025-10-05 |
Bcl6 reactivity is associated with a distinct immune landscape and spatial transcriptome in COVID-19
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189134
PMID:40924502
|
研究论文 | 本研究通过多重成像和空间转录组学分析COVID-19患者肺引流淋巴结，揭示了Bcl6反应性与免疫景观和空间转录组的关联 | 首次在COVID-19背景下基于Bcl6表达水平对反应性滤泡进行分类，并发现不同Bcl6表达水平对应不同的免疫细胞组成和空间转录组特征 | 研究样本来源于尸检组织，可能无法完全反映活体免疫反应动态；样本量有限 | 探索人类淋巴结中滤泡和生发中心免疫反应性的调控机制，特别是在急性病毒感染期间 | COVID-19患者的肺引流淋巴结和膈下淋巴结 | 空间转录组学 | COVID-19 | 多重成像，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | COVID-19尸检淋巴结样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-05 |
ZEB1 promotes chemo-immune resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Sep-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
|
研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫抵抗的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16促进胰腺癌化疗免疫抵抗，并证实靶向ZEB1可增强多种免疫疗法疗效 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证 | 探索胰腺癌化疗免疫抵抗的表观遗传机制 | 胰腺癌模型（患者来源类器官、异种移植模型、原位模型） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |