单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39398 篇文献,本页显示第 1621 - 1640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1621 2026-04-27
Efferocytosis-related biomarkers and immune infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma based on single-cell sequencing and machine learning: a comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 基于单细胞测序和机器学习整合生物信息学分析与实验验证,揭示胞葬作用相关生物标志物在胰腺导管腺癌中的免疫浸润特征 首次通过单细胞转录组学与机器学习结合,系统解析胰腺导管腺癌中巨噬细胞胞葬作用的异质性,并构建包含六基因(CD36、ITGAV、PANX1、PPARG、S100A4、THBS1)的风险预测模型 研究主要依赖公开数据集,样本量有限且缺乏多中心独立外部验证;THBS1基因功能验证仅在体外进行,未涉及体内动物模型或临床前瞻性队列验证 探索胞葬作用相关基因在胰腺导管腺癌中的表达模式、预后预测价值及肿瘤微环境重塑机制 胰腺导管腺癌患者组织样本及细胞系(如用于THBS1敲降实验的PDAC细胞) 机器学习, 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, RNA-seq, 实时荧光定量PCR, 蛋白质印迹法 Cox回归, LASSO回归 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA-PDAC和GTEx数据集(具体样本数未明确)、GEO数据集(如单细胞数据集)、6基因模型构建基于训练组及验证组(样本量未具体说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1622 2026-04-27
In silico virtual knockout identifies PXDNL as a fibroblast-specific driver of sarcopenia and GABA as a potential modulator
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过虚拟基因敲除和单细胞RNA测序分析,确定PXDNL是肌肉减少症成纤维细胞特异的驱动因子,并发现GABA作为潜在调节剂 首次利用计算机模拟虚拟基因敲除与多组学数据结合,识别出成纤维细胞特异的肌肉减少症驱动基因PXDNL,并验证了GABA作为可重靶向药物的治疗潜力 研究主要基于计算机模拟和体外实验,缺乏体内动物模型验证,且样本量相对较小 识别肌肉减少症的因果机制和可转化的治疗靶点 肌肉减少症中成纤维细胞特异基因PXDNL及其调控的细胞外基质基因 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序, 虚拟基因敲除, 分子对接 WGCNA, scTenifoldKnk, plsRglm 基因表达数据 238份活检样本(来自5个GEO队列)和10份单细胞样本(12,847个细胞) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1623 2026-04-27
Single-Cell Nanodroplet Processing Proteomics Pipeline for Analysis of Human-Derived Microglia
2026-May, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 提出一种基于纳升液滴处理的单细胞蛋白质组学流程,用于分析人源小胶质细胞 首次实现从人脑死后组织来源的小胶质细胞中进行单细胞蛋白质组学分析,无需标记,鉴定蛋白数量与单细胞RNA测序相当 该研究仅为初步验证,样本量有限,且未进行大规模亚型分类或疾病相关分析 开发一种可用于大规模蛋白质组学的小胶质细胞亚型分类方法,以研究其在神经退行性疾病中的作用 人脑死后皮层来源的小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病、神经退行性疾病 单细胞质谱蛋白质组学、荧光激活细胞分选、纳升液滴处理 NA 蛋白质组数据 单个小胶质细胞,平均鉴定1039种蛋白质 NA 单细胞蛋白质组学 NA 基于荧光激活细胞分选和纳升液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学流程
1624 2026-04-27
A machine learning-driven framework integrating cell death and senescence signatures for multi-target drug design and immunotherapy optimization in ovarian cancer
2026-Apr-26, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习整合细胞死亡与衰老特征,建立多靶点药物设计和免疫治疗优化的预测框架,并在卵巢癌中验证 首次将非凋亡性细胞死亡与衰老通路整合为一个可预测的机器学习模型(CDSLS),并结合多组学分析和人工智能靶向药物设计,为卵巢癌多靶点治疗和免疫治疗优化提供新策略 部分关键基因的功能验证仅限于RB1,其他潜在靶点未深入探索;模型在临床转化前需更多独立大规模队列验证 构建基于机器学习的多靶点药物设计与免疫治疗优化框架,用于卵巢癌精准治疗 卵巢癌患者样本(n=1858)及免疫治疗数据集 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、多组学分析、人工智能靶向化合物预测 机器学习模型(CDSLS) 基因表达数据、单细胞转录组数据 1858例卵巢癌患者样本(多队列汇总)及免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1625 2026-04-27
Identification of synovial lymphatic system in the temporomandibular joint and their roles in arthritis and pain
2026-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 鉴定颞下颌关节中的滑膜淋巴系统及其在关节炎和疼痛中的作用 首次在颞下颌关节中发现滑膜淋巴系统,并揭示其功能障碍驱动关节炎和疼痛的机制 主要基于小鼠模型,人类组织样本有限,可能需进一步验证临床相关性 研究颞下颌关节中淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 颞下颌关节滑膜淋巴系统 数字病理学 颞下颌关节炎 单细胞RNA测序, 组织透明化, 三维体积成像, 功能遗传学 NA 基因表达数据, 成像数据 使用了遗传报告小鼠和人类组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1626 2026-04-27
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量DNA测序,揭示了乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性,并鉴定了GABRB3和NRXN1作为脑转移潜能的候选调节因子 首次在单细胞分辨率下系统描绘了乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境,发现循环TAMs和组织驻留TAMs分别呈现M1样和M2样表型,并鉴定了与脑转移相关的神经相关肿瘤细胞亚型和反复突变 样本量较小(7例患者进行单细胞测序,47例进行批量DNA测序),且功能验证仅在异种移植模型中进行,需进一步在更大队列和临床研究中验证 探索乳腺癌脑转移的分子机制,特别是肿瘤免疫微环境和转移性肿瘤细胞的异质性 乳腺癌脑转移患者 单细胞生物学 乳腺癌脑转移 单细胞RNA测序、批量DNA测序 NA 单细胞转录组数据、DNA突变数据 7例患者(scRNA-seq)和47例患者(批量DNA测序) NA 单细胞RNA-seq, 批量DNA-seq NA NA
1627 2026-04-27
PW1+ cells give rise to cardiac adipocytes during development and myofibroblasts following injury
2026-Apr-25, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示了PW1+细胞在心脏发育过程中分化为脂肪细胞,并在心肌梗死后分化为肌成纤维细胞的双重潜能 首次证明PW1+细胞在心脏中具有干细胞特性,可分别贡献于心脏脂肪细胞和肌成纤维细胞的形成,为心脏脂肪生成和纤维化机制提供了新见解 尚未明确PW1+细胞分化的具体分子调控机制,以及其在其他心脏病理条件下的作用 探究PW1+细胞在心脏中的干细胞特性及其在发育和损伤后的分化潜能 小鼠心脏中的PW1+细胞 数字病理学 心血管疾病 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 成年小鼠心脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1628 2026-04-27
Integrator subunit IntS11 orchestrates the temporal dynamics of neural lineage progression in Drosophila
2026-Apr-25, Cell & bioscience
研究文章 利用果蝇模型揭示Integrator亚基IntS11通过转录调控细胞周期基因和维持长3'UTR异构体来协调神经谱系进展的时间动态 首次发现IntS11作为神经谱系进展的阶段特异性调控因子,通过转录控制细胞周期基因维持神经母细胞增殖,并通过维持长3'UTR异构体稳定分化程序 未提及具体局限性,可能包括需要进一步在哺乳动物模型中验证 探究IntS11在神经谱系进展中的具体调控功能 果蝇神经母细胞及其后代细胞 数字病理学 神经发育疾病 单细胞RNA测序,ChIP-qPCR,FUCCI分析,活体成像,MARCM NA 基因表达数据 果蝇幼虫脑样本,具体数量未在摘要中给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1629 2026-04-27
Pathway-level somatic mutation burden reflects diffuse genomic accumulation rather than selective transcriptional disruption in ovarian serous carcinoma: Evidence from bulk, spatial, and multi-region genomic analyses
2026-Apr-24, Gynecologic oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过分析批量、空间和多区域基因组数据,探讨卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷与转录通路活性的关系,发现TMB增加反映弥散性基因组积累而非选择性转录通路破坏 首次在多尺度基因组数据(批量、空间、多区域)中系统验证TMB与转录通路活性的关系,并揭示染色质重塑通路在TMB增加和上皮细胞区隔中优先突变 研究统计效能有限,无法检测到TMB与通路活性的微小关联;仅基于单一癌症类型进行分析 明确卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷增加是否驱动选择性转录通路破坏或反映弥散性基因组积累 卵巢浆液性癌患者的肿瘤样本(包括CPTAC-GDC队列84例、Gray Foundation空间转录组队列43例、MSK SPECTRUM多区域基因组队列42例) 机器学习 卵巢浆液性癌 空间转录组学, 全外显子组测序 NA 基因表达数据, 突变数据, 空间转录组数据 共169例患者(CPTAC-GDC 84例、Gray Foundation 43例、MSK SPECTRUM 42例) NanoString, Illumina 空间转录组学, 批量RNA测序 GeoMx Digital Spatial Profiler, NovaSeq GeoMx空间转录组平台用于原位基因表达分析,Illumina NovaSeq用于全外显子组测序
1630 2026-04-27
Type I interferon drives T cell responses to amyloid beta in the central nervous system
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了APP23转基因小鼠模型中中枢神经系统淀粉样蛋白病理进展过程中,T细胞从依赖于微胶质细胞转变为介导神经炎症的免疫微环境动态变化,并发现I型干扰素驱动CD8+ T细胞对β-淀粉样蛋白的应答 首次在单细胞水平揭示淀粉样蛋白病理晚期T细胞显著增加及其围绕Aβ斑块的聚集现象,鉴定出表达干扰素刺激基因的CD8+ T细胞亚群,并阐明其通过CXCL10-CXCR3轴招募非ISG T细胞的机制 主要基于小鼠模型,人类样本验证范围有限;未深入探讨T细胞亚群的功能异质性及长期效应 研究中枢神经系统淀粉样蛋白病理中适应性免疫系统(特别是T细胞)的动态变化及其调控机制 APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理组织样本(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1631 2026-04-27
Intragraft clonal expansion of cytotoxic CD8+ and CD4+ T cells in antibody-mediated kidney transplant rejection
2026-Apr-23, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 通过多组学分析揭示了抗体介导的肾移植排斥反应中细胞毒性CD8+和CD4+ T细胞的克隆扩增现象 首次在抗体介导的排斥反应中系统证实CD4+和CD8+细胞毒性T细胞的克隆扩增,挑战了传统AMR与TCMR的二元分类框架 样本量有限(仅16例单细胞测序),且未涉及功能验证实验 探索抗体介导的肾移植排斥反应中T细胞的克隆性和空间组织特征 肾移植活检组织中的CD4+和CD8+ T细胞 数字病理学 肾移植排斥反应 RNA-seq, 单细胞RNA/TCR测序, 多重免疫染色 NA 转录组数据, 单细胞测序数据, 空间蛋白组数据 192例批量转录组、16例单细胞RNA/TCR测序、18例和75例多重免疫染色 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1632 2026-04-27
Adversarial validation of in silico perturbation profiles for intelligence-associated genes in human prefrontal cortex
2026-Apr-21, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 基于Geneformer模型对与智力相关的21个基因在人类前额叶皮层中的计算机扰动进行对抗性验证 提出了一个可复现的对抗性验证框架,用于评估基础模型的计算机扰动结果,并揭示了表达水平混杂因素会显著放大原始扰动信号 研究在供体层面统计效力不足(n=3,估计效力约27%),推荐至少20个供体;交叉模型一致性受标记化问题限制 建立标准化对抗性验证框架,评估基础模型在计算机基因扰动中的可靠性,并检验智力相关基因的细胞类型特异性机制 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)单细胞RNA-seq数据中的21个智力相关基因 自然语言处理 智力相关疾病 单细胞RNA测序 Geneformer, scGPT 单细胞RNA-seq表达数据 3个供体的500个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1633 2026-04-27
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略,并提出了最佳实践方法 首次系统比较了多种整合策略(包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤)在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果,并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 研究仅基于四种组织类型进行基准测试,可能未涵盖所有组织类型;跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息,实际应用中可能受限于数据可用性 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 四种组织类型(具体未列出)的scRNA-seq和snRNA-seq数据;真实的脂肪组织批量样本 机器学习 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq 条件/非条件scVI(单细胞变分推断) 基因表达数据 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集;真实的脂肪组织批量样本(具体数量未说明) NA scRNA-seq, snRNA-seq NA NA
1634 2026-04-27
Brain endothelial tmTNFα overexpression in a mouse model altered cell type-specific signaling changes linked to schizophrenia-relevant behaviors
2026-Apr-20, Brain, behavior, and immunity
研究论文 在小鼠模型中,脑内皮细胞tmTNFα过表达引发与精神分裂症相关行为相关的细胞类型特异性信号变化 首次在脑内皮细胞中通过tmTNFα过表达模型,揭示其通过TNFR2信号通路引发精神分裂症相关行为的细胞类型特异性分子机制,包括从急性星形胶质细胞和突触紊乱到慢性免疫激活、代谢失调和翻译后调控的时序演变 未明确提及研究局限性 探究脑内皮细胞中tmTNFα过表达导致精神分裂症相关行为的分子机制 小鼠模型(短期和长期tmTNFα表达模型)及TNFR2敲除小鼠 机器学习 精神分裂症 RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质印迹, sGC活性检测 NA 转录组数据, 蛋白质表达数据, 信号通路数据 小鼠模型(短期4周和长期28周表达模型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1635 2026-04-27
Maternal immune activation causes sex-specific impairment of microglial function during prefrontal cortex development
2026-Apr-19, Brain, behavior, and immunity
研究论文 该研究揭示了孕期母体免疫激活通过性别特异性损害小胶质细胞功能,导致前额叶皮层发育异常和雄性后代行为缺陷 首次证明MIA通过性别特异性方式损害小胶质细胞反应性,导致雄性后代前额叶皮层突触修剪缺陷和行为异常 未明确小胶质细胞功能障碍与神经发育异常之间的分子机制 探究母体免疫激活如何通过小胶质细胞介导性别特异性神经发育异常 母体免疫激活小鼠模型的后代,特别是前额叶皮层中的小胶质细胞 机器学习 神经发育障碍 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 MIA诱导的雄性及雌性小鼠后代,具体数量未在摘要中明确 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1636 2026-04-27
M2 macrophage-derived exosomes deliver NGF-modified mRNA to promote comprehensive corneal repair
2026-Apr-17, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 利用M2巨噬细胞来源的外泌体递送NGF修饰mRNA用于促进角膜综合修复 首次将M2巨噬细胞外泌体与NGF修饰mRNA结合,实现多维度的角膜修复,同时促进组织再生、抑制炎症和新生血管 未明确提及研究限制 开发一种基于M2巨噬细胞外泌体和NGF修饰mRNA的创新递送平台,用于角膜损伤后的综合修复 M2巨噬细胞来源的外泌体、NGF修饰mRNA、碱烧伤的角膜组织 数字病理学 角膜疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1637 2026-04-27
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 SCTGE是一种基于Transformer的图嵌入新架构,整合自适应多尺度注意力和图神经网络,用于解决单细胞转录组空间嵌入难题并提升细胞间相互作用识别与细胞身份注释性能 创新性地融合Transformer自注意力机制与图神经网络,引入上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强特征传播,有效应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 在特定数据集上细胞身份注释性能存在例外情况 开发可扩展且可解释的解决方案,用于空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释 单细胞转录组数据中的空间嵌入和细胞间相互作用 机器学习 NA 单细胞转录组测序 基于Transformer的图神经网络 单细胞转录组数据 六个数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1638 2026-04-27
Clonal amplification of peripheral CD4+ and CD8+ T cells is associated with clinical response to checkpoint blockade in chronic hepatitis B
2026-Apr-11, ImmunoHorizons
研究论文 通过单细胞测序分析,发现慢性乙型肝炎患者中外周血CD4+和CD8+ T细胞的克隆扩增与检查点阻断治疗的临床反应相关 首次揭示单次纳武利尤单抗治疗后,功能性治愈患者中干细胞样记忆CD8+ T细胞基线水平升高,以及T和B细胞特异性克隆的出现与阳性反应相关 样本量较小,仅对4名患者的血液样本进行分析 探究检查点阻断疗法在慢性乙型肝炎中的免疫机制 慢性乙型肝炎患者的血液样本,包括对纳武利尤单抗有反应和无反应的患者 机器学习 慢性乙型肝炎 单细胞测序 NA 测序数据 4名患者,多个时间点的血液样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1639 2026-04-27
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in lymphatic malformations
2026-Apr-01, Protein & cell IF:13.6Q1
research paper 通过单细胞多组学分析揭示了淋巴管畸形中免疫功能障碍和炎症反应的细胞类型特异性机制 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和B细胞受体测序对淋巴管畸形患者外周血和胸腔积液进行多维免疫图谱分析,发现促炎性单核细胞和记忆B细胞扩增、细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞减少,并鉴定出S100A8作为潜在治疗靶点 未提及 阐明淋巴管畸形中循环细胞的免疫表型和潜在分子机制 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 单细胞组学 淋巴管畸形 scRNA-seq, scTCR-seq, scBCR-seq NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、B细胞受体序列 淋巴管畸形患者样本 NA single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, single-cell BCR-seq NA NA
1640 2026-04-27
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合多组学数据分析,识别帕金森病单核细胞相关生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测潜在靶向药物 首次结合单细胞测序与hdWGCNA分析,鉴定帕金森病外周血中单核细胞相关生物标志物,并预测其靶向药物 NA 通过多组学数据整合分析,揭示帕金森病中单核细胞的关键分子变化,识别新型生物标志物 帕金森病患者外周血单核细胞 机器学习 帕金森病 单细胞RNA测序、芯片分析 NA 单细胞转录组数据、芯片数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部