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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2026-05-04 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
|
research paper | 开发了一种名为人工土壤（ArtSoil）的合成植物生长培养基，能够模拟土壤条件，支持植物生长并维持土壤微生物组，避免了传统培养基中蔗糖的副作用 | 首次提出一种无需添加糖分的合成培养基，通过添加水性土壤提取物保持土壤微生物组和土壤因素，使植物在类似土壤的条件下生长，更接近自然状态 | 文章未明确说明ArtSoil在不同土壤类型或长期培养中的稳定性，以及其在实际农业应用中的可行性 | 开发一种更接近土壤条件的合成植物生长培养基，以便在实验室中准确研究植物生理和多组学特征 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | machine learning | NA | NA | NA | single-cell transcriptomics data | 拟南芥样本在不同生长条件下进行比较，未提供具体数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1622 | 2026-05-04 |
Molecular Characterization of the Effect of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Semaglutide in the Nephrotoxic Serum Nephritis Mouse Model
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001067
PMID:41945470
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研究论文 | 探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂Semaglutide在肾毒性血清肾炎小鼠模型中的作用机制 | 首次在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中揭示Semaglutide通过抗炎、抗纤维化及改善肾血流动力学独立于代谢效应的肾脏保护作用 | 仅在小鼠模型中进行研究，尚未在人类中验证；未涉及长期治疗效果评估 | 阐明Semaglutide在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中的肾脏保护机制 | 肾毒性血清肾炎小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 空间转录组测序、单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织切片分析；10x Chromium单细胞核RNA测序用于肾细胞亚群分析 |
| 1623 | 2026-05-04 |
Cell type annotation for scATAC-seq via DNA large language model and graph domain adaptation
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014226
PMID:42060707
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研究论文 | 提出scLLMDA框架，利用DNA大语言模型和图域自适应实现scATAC-seq细胞类型注释 | 首次结合DNA特异性语言模型和图神经网络进行域自适应，捕获峰值序列上下文嵌入与细胞邻域结构，解决了跨模态注释的模态不匹配和信号失真问题 | 文章未明确提到局限性，但可能依赖参考数据的质量与相似性，且大规模数据集的计算效率有待验证 | 开发更准确和鲁棒的scATAC-seq细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | ATAC-seq | DNA大语言模型、图神经网络 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1624 | 2026-05-04 |
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117053
PMID:41811846
|
研究论文 | 本研究通过染色体报告系统量化活细胞中在物理压缩后发生的染色体丢失现象，发现细胞压缩会触发延迟但可遗传的染色体丢失 | 首次使用染色体报告系统（ChReporters）在活细胞中定量测量物理压缩导致的染色体丢失，并揭示压缩后延迟出现的染色体错误分离机制 | 研究主要基于体外细胞实验，体内肿瘤微环境中更复杂的力学因素和多细胞相互作用未被充分模拟 | 探究细胞物理压缩如何引发可遗传的染色体丢失及其分子机制 | 活体哺乳动物细胞 | 计算机视觉 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及多种细胞系和药物处理条件 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1625 | 2026-05-04 |
scComm: a contrastive learning framework for deciphering cell-cell communications at single-cell resolution
2026-Mar-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04043-9
PMID:41877186
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研究论文 | 提出scComm框架，利用监督对比学习在单细胞分辨率下推断细胞间通讯，并在结直肠癌和肝癌研究中揭示新见解 | 首次将监督对比学习应用于单细胞分辨率的细胞间通讯推断，克服传统聚类方法忽视细胞内异质性的局限，并在多种癌症分析中展示优越性能 | 未提及计算资源需求或对大规模数据集的扩展性，也未讨论模型对噪声数据的鲁棒性 | 开发能高分辨率解析细胞间通讯的计算方法，以发现传统方法遗漏的生物学见解 | 单细胞RNA测序数据模拟样本，以及结直肠癌和肝癌患者的真实scRNA-seq数据 | 机器学习 | 结直肠癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 对比学习网络 | 单细胞基因表达数据（模拟和真实数据） | 模拟数据集（具体数量未说明），以及结直肠癌和肝癌患者的scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2026-05-04 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
|
研究论文 | 提出一种名为ITEC的全自动方法，通过迭代追踪与纠错，高保真度重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图谱 | 开发了首个全自动无监督的胚胎细胞谱系重建方法ITEC，结合误差校正实现超过99.7%的准确性，并揭示了体节边界形成等关键形态发生过程的时空动态和细胞运动与空间转录组学的关联 | 未明确说明局限性，但基于摘要可能涉及计算资源需求或对极大型数据集的拓展性挑战 | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图谱，探索发育生物学中细胞尺度动态过程 | 斑马鱼、小鼠等跨物种胚胎中的细胞谱系 | 计算机视觉 | NA | 迭代追踪与误差校正 | ITEC | 图像 | 四组跨物种数据集（斑马鱼、小鼠等），其中一个斑马鱼胚胎包含1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1627 | 2026-05-04 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
|
研究论文 | 提出UniST统一生成式人工智能框架，用于从稀疏序列切片中计算重建致密连续的3D空间转录组学景观 | 将核点卷积与交叉注意力层结合用于点云上采样、基于光流的连续切片插值以及利用隐式神经表示的图自编码器进行基因表达插补，三种互补模块集成实现3D重建 | 仅依赖2D切片数据进行计算重建，无法完全替代实验获取的3D数据；稀疏切片和组织损失仍可能影响重建精度 | 解决3D空间转录组学数据稀疏、异质及组织缺失导致的分析挑战，实现连贯的3D组织结构重建 | 小鼠胚胎和人类癌症组织（包括肿瘤-免疫边界和三级淋巴结构） | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学（ST） | 核点卷积神经网络、图自编码器、隐式神经表示 | 空间转录组学切片图像及基因表达数据 | 多个空间转录组平台和多种组织样本人（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1628 | 2026-05-04 |
Single-cell and spatial profiling reveal cDC2A-CXCL13+CD8+ T-epithelial cell crosstalk and cytotoxicity through TNFRSF9 in cutaneous and mucosal lichen planus
2026-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70506-z
PMID:41832141
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学分析揭示皮肤和黏膜扁平苔藓中cDC2A-CXCL13+CD8+ T细胞与上皮细胞通过TNFRSF9的相互作用和细胞毒性机制 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和蛋白质组学数据，系统揭示了cDC2A细胞在驱动CXCL13+CD8+ T细胞介导的上皮细胞毒性中的关键作用，并发现TNFRSF9通路是潜在治疗靶点 | 样本量有限（28例患者和18例对照），且仅分析了皮肤和黏膜两种亚型，未覆盖其他变体；功能性验证实验未在文中提及 | 解析皮肤和黏膜扁平苔藓的免疫微环境，阐明T细胞与上皮细胞相互作用的分子机制 | 皮肤和黏膜扁平苔藓患者的组织样本 | 数字病理学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 28例患者和18例健康对照的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1629 | 2026-05-04 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
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研究论文 | 结合单细胞拉曼光谱与机器学习预测黑色素瘤靶向治疗和免疫治疗反应结局 | 首次将单细胞拉曼光谱与机器学习结合，用于非破坏性预测黑色素瘤治疗抵抗性 | 未提及具体限制 | 开发一种非破坏性、单细胞水平的方法，用于快速细胞分型并预测治疗反应 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系及九例黑色素瘤患者衍生样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 拉曼光谱、单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 拉曼光谱数据 | 九例黑色素瘤患者样本及多种细胞系 | NA | 单细胞拉曼光谱 | NA | NA |
| 1630 | 2026-05-04 |
IRF7 orchestrates maladaptive smooth muscle cell phenotype switching in atherosclerosis
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf039
PMID:41625231
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研究论文 | 通过分析谱系追踪小鼠的单细胞RNA测序数据，发现IRF7是驱动动脉粥样硬化中平滑肌细胞向促炎性巨噬细胞样细胞转分化的关键转录因子，并验证了其在体内对斑块进展和稳定性的调控作用 | 首次揭示IRF7作为主转录调控因子，协调平滑肌细胞通过'干细胞-内皮-单核细胞'中间状态向促炎性巨噬细胞样亚群转化的恶性表型转换机制 | 未提及具体限制 | 阐明驱动动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞向致病状态（如巨噬细胞样细胞）转化的分子机制 | 平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转换及IRF7的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 谱系追踪小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1631 | 2026-05-04 |
stGrads: decoding spatial gene expression gradients through proximity-driven analysis in complex tissues
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag201
PMID:42061906
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研究论文 | 提出stGrads计算框架，通过邻近驱动分析解码复杂组织中的空间基因表达梯度 | 首次将空间邻近建模与基于衰减的信号传播相结合，在基因表达和细胞组成水平上表征特定细胞类型诱导的空间梯度 | 未明确说明局限性 | 开发一种通用且高效的计算工具，用于表征复杂组织环境中的空间相互作用和功能响应 | 多种空间转录组数据集中的组织样本 | 计算机视觉、机器学习 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1632 | 2026-05-04 |
Nanoparticle-Mediated PPAR Modulation of Macrophage Polarization in Radiation Enteritis: A Narrative Review
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S595650
PMID:41913737
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综述 | 本文探讨了巨噬细胞极化与PPAR信号在放射性肠炎中的分子机制，综述了PPAR靶向治疗及纳米递送策略 | 系统整合了放射性肠炎中PPAR调节巨噬细胞极化的分子机制、纳米递送技术和多组学方法，提出了精准纳米药物的开发方向 | 作为叙述性综述，缺乏原始实验数据验证，未对纳入文献进行系统性偏倚评估 | 阐明放射性肠炎中PPAR信号调控巨噬细胞极化的机制，并综述靶向治疗与纳米递送策略 | 放射性肠炎中的巨噬细胞和PPAR信号通路 | 机器学习 | 放射性肠炎 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1633 | 2026-05-04 |
Gut-Brain Axis Dysregulation in Inflammatory Bowel Disease: Implications for Coagulation Abnormalities and Extraintestinal Manifestations
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S590621
PMID:41913906
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综述 | 探讨炎症性肠病中肠-脑轴失调对凝血异常及肠外表现的影响 | 提出通过整合多组学分析和人工智能辅助系统来管理IBD相关凝血功能障碍的新范式 | 缺乏严格随机对照试验的验证，肠-脑-肝轴对凝血的调控机制尚未阐明 | 阐明肠-脑轴在IBD相关凝血异常和肠外表现中的作用机制并探索新的管理策略 | 炎症性肠病（IBD）患者 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 多组学分析，宏基因组学，代谢组学，单细胞转录组学 | NA | 宏基因组数据，代谢组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1634 | 2026-05-04 |
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259261426818
PMID:42041246
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研究论文 | 通过多组学整合策略，结合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，开发机器学习预测模型，揭示狼疮性肾炎的关键细胞驱动因子和潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA-seq与大规模批量RNA-seq数据，利用非负矩阵分解定义免疫元程序，并通过CellChat解码细胞间通讯网络，开发基于先天免疫、昼夜节律等通路的399种机器学习预测模型 | 分子对接模拟仅提供结构基础，需进一步实验验证CYBB与地塞米松的相互作用 | 利用多组学方法阐明狼疮性肾炎的细胞和分子机制，并开发精准诊断模型 | 狼疮性肾炎患者的肾脏活检组织及批量RNA-seq队列数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq、非负矩阵分解、CellChat、分子对接 | 机器学习（399种模型） | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 单细胞RNA-seq样本及多个独立批量RNA-seq队列（具体样本量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2026-05-04 |
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-02-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01507-24
PMID:39727412
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研究论文 | 该研究通过条件性敲除小鼠的分泌细胞（潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞），发现黏蛋白2（MUC2）和MHC II分子的缺失导致小鼠对轮状病毒感染产生罕见的抵抗力 | 首次揭示杯状细胞产物MUC2与MHC II分子在轮状病毒易感性中的未知关联，并发现分泌细胞缺失可赋予小鼠罕见的抗感染能力 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全代表人类轮状病毒感染的机制；未明确MUC2和MHC II在抗病毒中的协同作用细节 | 探究肠道分泌细胞（尤其是杯状细胞）在轮状病毒感染发病机制中的作用 | Atoh1条件性敲除小鼠（缺乏潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞）及MUC2或MHC II缺陷小鼠 | 分子生物学 | 轮状病毒感染 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | Atoh1条件性敲除小鼠模型、MUC2敲除小鼠模型、MHC II敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 多种基因修饰小鼠品系，具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1636 | 2026-05-04 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
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研究论文 | 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 | 首次开发RAS剂量递增模型，揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型，并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 | 未明确说明局限性 | 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 | 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1637 | 2026-05-04 |
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
PMID:39027343
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱，发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞（OSCs），其具有高趋化活性，可招募间充质干细胞，参与骨重塑中的逆转阶段 | 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群（骨静细胞），并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力，揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 | 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验，骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 | 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制，探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 | 人皮质骨（正常、感染和重建状态）样本，以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理学, 机器学习 | 骨髓炎, 骨延迟愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞转录组）、图像（免疫荧光、生物发光成像） | 人皮质骨样本（具体数量未提及，包含正常、感染和重建三种状态），小鼠模型样本（正常骨折和骨髓炎骨折模型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1638 | 2026-05-04 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
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研究论文 | 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物，构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型，并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 | 未提及具体的局限性 | 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解，开发预后模型并识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11例骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1639 | 2026-05-04 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 结合混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序方法（dual perturb-seq），高通量鉴定弓形虫效应蛋白并揭示其调控宿主细胞转录的机制 | 首次将混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序结合为dual perturb-seq技术，实现高通量鉴定病原体效应蛋白并直接从转录组数据推断其功能 | 方法在弓形虫特定效应蛋白的验证上仍有待进一步扩展至其他病原体系统 | 高通量鉴定细胞内病原体产生的、靶向宿主细胞转录的效应蛋白及其功能 | 弓形虫及其感染宿主细胞 | 数字病理学 | 弓形虫病 | CRISPR敲除筛选、单细胞RNA测序、dual perturb-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 弓形虫混合CRISPR敲除文库感染宿主细胞后的单细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1640 | 2026-05-04 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 利用单细胞测序技术探究轮状病毒感染后肠道上皮的细胞特异性修复机制及簇细胞的感染情况 | 首次发现轮状病毒感染可感染簇细胞，并揭示簇细胞通过干扰素相关通路应对病毒感染；同时发现特定细胞亚群增殖频率增加并伴随隐窝扩张和不成熟肠细胞增多 | 未阐明簇细胞感染在肠道修复中的具体功能角色，且仅基于轮状病毒模型，其他病原体相关修复机制需进一步验证 | 在单细胞水平上探索轮状病毒引起的肠道上皮损伤后再生修复的转录反应 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞（包括簇细胞、肠干细胞、不成熟肠细胞等特定亚群） | 数字病理学 | 轮状病毒感染相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 轮状病毒感染小鼠的肠道上皮细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |