单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16341 2024-08-07
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis identified pyroptosis-related signature for diagnosis and prognosis in osteoarthritis
2023-10-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,探讨了焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其在不同软骨细胞亚型中的表达 本研究首次识别了与焦亡相关的骨关节炎诊断和预后标志物,并探索了软骨细胞在骨关节炎和正常样本中的异质性 NA 研究焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其表达,以识别新的诊断和预后标志物 骨关节炎及其相关软骨细胞亚型 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序和RNA-seq NA RNA 涉及多个骨关节炎相关数据集和正常样本
16342 2024-08-07
Single-cell characterization of self-renewing primary trophoblast organoids as modeling of EVT differentiation and interactions with decidual natural killer cells
2023-Oct-18, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文首次从人类胎盘绒毛中生成自我更新的滋养层器官(TO),并将其分化为外绒毛滋养层细胞(EVT-TO),以研究分化事件和与母体蜕膜自然杀伤(NK)细胞的相互作用。 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)全面表征和分子探索了TO模型中的EVT分化及其与dNK的相互作用,揭示了多种不同的滋养层状态和dNK亚群,并发现了细胞类型特异性的转录因子(TF)调控网络和配体-受体复合物。 NA 研究外绒毛滋养层细胞(EVT)的分化及其与母体蜕膜自然杀伤(NK)细胞的相互作用,为人类胎盘研究提供新的方法和线索。 人类胎盘绒毛生成的自我更新滋养层器官(TO)及其分化为的外绒毛滋养层细胞(EVT-TO),以及与母体蜕膜自然杀伤(NK)细胞的相互作用。 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 多种不同的滋养层状态和dNK亚群
16343 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals pro-invasive cancer-associated fibroblasts in hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2023-10-18, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了喉下鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞,揭示了其在肿瘤微环境中的作用 首次详细描述了喉下鳞状细胞癌中恶性肿瘤相关成纤维细胞的亚型及其在促进肿瘤侵袭和构建肿瘤有利微环境中的作用 NA 探索喉下鳞状细胞癌的治疗新靶点和联合治疗策略 喉下鳞状细胞癌组织及其邻近正常黏膜 数字病理学 喉癌 单细胞RNA测序 NA RNA 6例未经治疗的喉下鳞状细胞癌患者的主要肿瘤组织和2例邻近正常黏膜
16344 2024-08-05
Resolving the tissue response to neoadjuvant chemotherapy in rectal cancer
2023-10-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本文呈现了直肠癌肿瘤微环境在新辅助化疗前后的综合单细胞转录组分析 提供了直肠癌新辅助化疗对肿瘤微环境影响的深入数据 没有提供更广泛人群的样本数据 研究新辅助化疗对直肠癌肿瘤微环境的影响 直肠癌肿瘤及其微环境 数字病理学 直肠癌 单细胞转录组学 NA NA NA
16345 2024-08-05
Cancer-associated fibroblasts undergoing neoadjuvant chemotherapy suppress rectal cancer revealed by single-cell and spatial transcriptomics
2023-10-17, Cell reports. Medicine
研究论文 这项研究探讨了新辅助化疗对直肠癌相关成纤维细胞的影响 揭示了新辅助化疗如何通过重塑癌伴随成纤维细胞调节肿瘤微环境,提高治疗反应 未提及具体的局限性 阐明新辅助化疗对直肠癌的治疗反应及其对肿瘤微环境的影响 对29名接受新辅助化疗直肠癌患者的细胞动态进行研究 数字病理学 直肠癌 单细胞RNA测序和空间转录组测序 NA NA 29名直肠癌患者
16346 2024-08-07
Author Correction: Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis
2023-Oct-17, Nature communications IF:14.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16347 2024-08-07
Decoding the immune landscape following hip fracture in elderly patients: unveiling temporal dynamics through single-cell RNA sequencing
2023-Oct-17, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了老年髋部骨折患者从创伤后到恢复期的免疫谱动态变化。 研究首次揭示了老年髋部骨折患者在不同阶段免疫细胞亚群的比例变化和基因表达差异,特别是发现了新的CD14单核细胞亚群。 研究样本量较小,仅包括四名老年患者,可能影响结果的普遍性。 探讨老年髋部骨折患者在创伤后到恢复期间的免疫微环境动态变化。 老年髋部骨折患者的外周血样本。 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 四名老年髋部骨折患者的外周血样本,包括两名男性和两名女性,年龄均大于75岁。
16348 2024-08-07
Systematic analysis of glutamine metabolism family genes and exploration of the biological role of GPT in colorectal cancer
2023-10-17, Aging
研究论文 本研究系统分析了谷氨酰胺代谢家族基因在结直肠癌中的生物学作用,并探索了GPT在结直肠癌中的重要性 首次系统分析了谷氨酰胺代谢相关基因(GMRGs)在结直肠癌中的生物学作用,并发现GPT是结直肠癌的重要诊断、预后标志物和治疗靶点 NA 探索谷氨酰胺代谢相关基因在结直肠癌中的生物学作用及GPT的重要性 结直肠癌患者的基因表达数据、临床数据及单细胞RNA测序数据 数字病理学 结直肠癌 RNA测序 SVM-REF和RandomForest 基因表达数据 结直肠癌患者的基因表达数据和临床数据来自TCGA数据库,单细胞RNA测序数据来自GEO数据库
16349 2024-08-05
Zfp335 establishes eTreg lineage and neonatal immune tolerance by targeting Hadha-mediated fatty acid oxidation
2023-10-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了Zfp335在调节性T细胞(eTregs)谱系建立和新生免疫耐受中的作用 揭示了Zfp335通过调控脂肪酸氧化介导的eTreg分化机制 本研究未探讨其他可能影响Treg分化的因素 阐明Zfp335在调节性T细胞分化及免疫耐受中的作用 研究调节性T细胞及其功能 免疫学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 KO小鼠 RNA数据 涉及Zfp335缺失的调节性T细胞相关样本
16350 2024-08-05
Adenine crosses the biomarker bridge: from 'omics to treatment in diabetic kidney disease
2023-10-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过多组学方法识别腺苷作为早期糖尿病肾病的非侵入性生物标志物 首次提出腺苷作为糖尿病肾病进展的机制性生物标志物,并展示了多组学方法的潜力 研究未明确提及样本量和其他潜在的干扰因素 识别糖尿病肾病的机制性生物标志物以预测病程并作为治疗靶点 早期糖尿病肾病患者的尿腺苷/肌酐比率 数字病理学 糖尿病肾病 多组学方法 NA 尿液样本 独立队列中的早期糖尿病肾病参与者
16351 2024-08-05
Single-cell landscape and spatial transcriptomic analysis reveals macrophage infiltration and glycolytic metabolism in kidney renal clear cell carcinoma
2023-10-16, Aging
研究论文 本研究探讨了肾脏透明细胞癌肿瘤微环境中糖酵解因子PGAM1的临床相关性 揭示了PGAM1在肾脏透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系,具有重要的诊断和预后意义 PGAM1的具体机制和如何在不同的肾脏区域发挥作用尚不明确 研究PGAM1在肾脏透明细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 肾脏透明细胞癌患者的肿瘤样本以及小鼠肾损伤模型 数字病理学 肾脏癌症 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA 基因表达数据和临床数据 60名肾脏透明细胞癌患者的肿瘤标本
16352 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing distinctly characterizes the wide heterogeneity in pediatric mixed phenotype acute leukemia
2023-10-16, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术对儿童混合表型急性白血病(MPAL)的骨髓样本进行了分析,以揭示其细胞异质性和微环境特征。 首次描述了儿童MPAL的单细胞转录组景观,并展示了B/My和T/My MPAL在单细胞RNA测序中的独特特征。 需要更大规模的研究来验证基于治疗反应的转录组差异。 更好地理解MPAL的亚型异质性及其与急性髓系白血病(AML)和急性淋巴细胞白血病(ALL)的比较。 儿童MPAL的骨髓样本。 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 转录组数据 分析了来自九名儿童MPAL骨髓样本的超过40,000个细胞。
16353 2024-08-05
Spatial transcriptomics map of the embryonic mouse brain - a tool to explore neurogenesis
2023-10-15, Biology open IF:1.8Q3
研究论文 这篇文章提供了一个关于胚胎小鼠大脑的空间转录组图谱,旨在探索神经发生 建立了一个空间转录组图谱,并结合了单细胞RNAseq数据,揭示了特定解剖领域内的独特转录特征 NA 研究胚胎小鼠大脑发育中细胞类型及其相互作用 胚胎小鼠大脑的不同类型神经和非神经细胞 数字病理学 NA RNA测序 NA RNA数据 胚胎第13.5天小鼠脑切片的RNA测序数据
16354 2024-08-05
Integrative analysis of miRNA in cartilage-derived extracellular vesicles and single-cell RNA-seq profiles in knee osteoarthritis
2023-10-15, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1
研究论文 该文章探讨了膝关节骨关节炎中源自软骨的细胞外囊泡的miRNA及单细胞RNA测序的整合分析 首次整合了源自软骨的EV-DE-miRNA靶基因与每个软骨细胞亚群特异性标记基因之间的关联 关于EV-miRNA与软骨细胞群体特征标记基因的关联尚需进一步验证 研究源自软骨的EV-miRNA在膝关节骨关节炎中的作用及其潜在的诊断和治疗方法 研究对象包括膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及其来源的细胞外囊泡 数字病理学 膝关节骨关节炎 miRNA测序和单细胞RNA测序 NA 基因数据 涉及来自膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及细胞外囊泡
16355 2024-08-05
Telomere maintenance mechanism subtype reveals different immune activity in vestibular schwannoma
2023-Oct, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2
研究论文 本文研究了端粒酶及端粒的替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 本研究揭示了不同端粒维护机制亚型在前庭神经瘤患者中的免疫活动差异 当前对前庭神经瘤中端粒酶活性和替代延长机制的了解仍然有限 阐明端粒酶和端粒替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 前庭神经瘤患者,分为高端粒酶组和高ALT样组 数字病理学 NA RNA-seq NA 基因数据 NA
16356 2024-08-07
Cartilage tissue from sites of weight bearing in patients with osteoarthritis exhibits a differential phenotype with distinct chondrocytes subests
2023-10, RMD open IF:5.1Q1
研究论文 本研究探讨了骨关节炎患者负重区域的软骨组织中是否存在不同亚群的软骨细胞,并分析了这些亚群在不同负重条件下的表型差异。 首次鉴定并验证了骨关节炎软骨组织负重区域中存在一种名为OA肥大软骨细胞的亚群,这些细胞具有独特的表型和分子特征。 NA 阐明骨关节炎患者负重区域软骨组织中不同软骨细胞亚群的表型差异及其分子机制。 骨关节炎患者的软骨组织,特别是负重区域的软骨细胞亚群。 数字病理学 骨关节炎 蛋白质组分析,单细胞RNA测序,全转录组测序 NA 组织,细胞 NA
16357 2024-08-07
Divergent tumor and immune cell reprogramming underlying immunotherapy response and immune-related adverse events in lung squamous cell carcinoma
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,研究了免疫检查点抑制剂治疗前后肺鳞状细胞癌中的肿瘤和免疫细胞重编程,以及其与治疗反应和免疫相关不良事件的关系 揭示了免疫检查点抑制剂治疗中肿瘤和免疫细胞的特定重编程,以及肿瘤坏死因子信号通路在抗肿瘤免疫和免疫相关不良事件中的不同作用 NA 深入了解免疫检查点抑制剂治疗肺鳞状细胞癌的抗肿瘤反应和免疫相关不良事件的免疫特征,以最大化患者的治疗益处 肺鳞状细胞癌患者的肿瘤和免疫细胞 数字病理学 肺鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 两个独立的肺鳞状细胞癌患者队列和一个已发表的免疫检查点抑制剂治疗患者队列
16358 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals neurovascular-osteochondral network crosstalk during temporomandibular joint osteoarthritis: Pilot study in a human condylar cartilage
2023-Oct, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络的交叉对话 首次使用单细胞RNA测序技术识别人类颞下颌关节骨关节炎软骨中的细胞和基因,并展示了神经血管-骨软骨网络在人类颞下颌关节骨关节炎过程中的交叉对话 NA 旨在发现人类颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络交叉对话中起重要作用的细胞和基因 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨 数字病理学 颞下颌关节骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨样本及其他良性髁状增生患者的对照样本
16359 2024-08-07
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 研究主要基于在线资源和公共数据库,缺乏实验验证 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 数字病理学 乳腺癌,结肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Bulk RNA-seq NA RNA序列数据 多种人类癌症样本
16360 2024-08-07
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research IF:4.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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