单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 16321 - 16340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16321 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals the immune heterogeneity and interactions in lungs undergoing hepatic ischemia-reperfusion
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111043
PMID:37844464
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肝脏缺血再灌注后肺部免疫细胞的异质性和相互作用 | 发现了两种新的细胞亚型（TspoEndothelial细胞和Vcan单核细胞），并描述了肺细胞簇的独特转录谱 | NA | 探究肝脏缺血再灌注后急性肺损伤的机制 | 肝脏缺血再灌注后肺部的免疫细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 使用肝脏缺血再灌注诱导的小鼠肺部样本 |
| 16322 | 2024-08-07 |
CD146 promotes malignant progression of breast phyllodes tumor through suppressing DCBLD2 degradation and activating the AKT pathway
2023-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12495
PMID:37856423
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研究论文 | 本研究旨在阐明CD146在促进乳腺恶性叶状肿瘤（PTs）恶性进展中的作用和机制，并确定其作为新的预后标志物和治疗靶点的潜力。 | 研究揭示了CD146通过抑制DCBLD2降解并激活AKT途径促进PTs恶性进展的新机制，并验证了抗CD146单克隆抗体AA98在恶性PTs中的疗效。 | NA | 阐明CD146在乳腺恶性叶状肿瘤恶性进展中的作用和机制，并确定其作为新的预后标志物和治疗靶点。 | 乳腺恶性叶状肿瘤（PTs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 免疫染色, 实时PCR, 转录组测序, 蛋白质组分析 | NA | RNA | NA |
| 16323 | 2024-08-07 |
The cellular states and fates of shed intestinal cells
2023-Nov, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00905-9
PMID:37857731
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研究论文 | 本文研究了脱落的小肠细胞的细胞状态和命运 | 首次展示了脱落的上皮细胞在脱落时保持活力并上调特定的抗微生物程序 | NA | 探讨脱落的小肠细胞的功能及其在肠道腔中的潜在作用 | 小肠上皮细胞和免疫细胞 | NA | NA | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雄性小鼠的肠道粪便洗脱物 |
| 16324 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immune cells in human livers affected by HBV-related cirrhosis
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100883
PMID:37860052
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HBV相关肝硬化患者肝脏中免疫细胞的转录组 | 首次揭示了HBV相关肝硬化患者肝脏中独特的免疫生态系统，包括特定免疫细胞群的积累和减少，以及细胞间通信的增强 | NA | 探究HBV相关肝硬化患者肝脏中免疫细胞的微环境 | HBV相关肝硬化患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 76,210个免疫细胞，来自6名健康个体和5名HBV肝硬化患者 |
| 16325 | 2024-08-07 |
DELFOS-drug efficacy leveraging forked and specialized networks-benchmarking scRNA-seq data in multi-omics-based prediction of cancer sensitivity
2023-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad645
PMID:37862234
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DELFOS的新型药物反应预测算法，该算法利用分叉和专业化网络从多组学数据中预测癌症敏感性 | DELFOS算法结合了多组学数据和单细胞表达数据，用于预测药物反应，并在多个相关性和误差指标上实现了高预测性能 | NA | 开发一种新的策略，用于识别治疗每种肿瘤的最佳化合物组合 | 癌症细胞对不同化合物的敏感性 | 机器学习 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 超过65种癌症细胞系和200种化合物的结构数据 |
| 16326 | 2024-08-07 |
The change of Siglec-9 expression in peripheral blood NK cells of SFTS patients can affect the function of NK cells
2023-11, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2023.10.004
PMID:37865296
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研究论文 | 研究SFTS患者外周血NK细胞上Siglec-9表达的变化及其对NK细胞功能的影响 | 发现Siglec-9在SFTS患者NK细胞上的表达减少，可能作为SFTS患者功能性NK细胞亚群的潜在标志 | NA | 探讨SFTS患者外周血NK细胞上Siglec-9的变化及其机制 | SFTS患者外周血NK细胞上的Siglec-9表达 | NA | SFTS | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | SFTS患者和健康对照组的外周血单个核细胞(PBMCs) |
| 16327 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing analysis reveals that N-acetylcysteine partially reverses hepatic immune dysfunction in biliary atresia
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100908
PMID:37869073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，评估了N-乙酰半胱氨酸（NAC）治疗在胆道闭锁（BA）中的临床疗效，并揭示了NAC对肝脏免疫细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了NAC治疗对胆道闭锁患者肝脏免疫细胞的影响，并揭示了其对免疫功能的部分逆转作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模临床研究来验证NAC治疗的效果 | 评估NAC治疗在胆道闭锁中的临床疗效，并通过单细胞RNA测序分析其对肝脏免疫细胞的影响 | 胆道闭锁患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 控制组4例，胆道闭锁组6例，胆道闭锁+NAC治疗组6例 |
| 16328 | 2024-08-07 |
Collagen 1-mediated CXCL1 secretion in tumor cells activates fibroblasts to promote radioresistance of esophageal cancer
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113270
PMID:37851572
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研究论文 | 本研究通过建立食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的患者源性异种移植模型（PDXs），探讨了放射抵抗性的分子机制，并发现胶原蛋白1（Col1）和CXCL1在其中的作用 | 揭示了Col1通过增强DNA修复能力促进放射抵抗性，并诱导肿瘤细胞分泌CXCL1，进而通过CXCR2-STAT3途径激活癌症相关成纤维细胞（CAFs），形成正反馈循环 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌放射治疗中放射抵抗性的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的患者源性异种移植模型（PDXs） | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序，细胞因子阵列，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名ESCC患者 |
| 16329 | 2024-08-07 |
Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113309
PMID:37862168
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠丘脑室旁核（PVT）神经元的转录组特征，并探讨了其在前后轴上的差异和连续性 | 发现了PVT神经元在前后轴上的转录组差异和细胞类型的连续性，以及不同亚群对食欲相关神经肽的不同反应 | NA | 揭示丘脑室旁核神经元的功能基础 | 小鼠丘脑室旁核神经元的转录组特征及其在前后轴上的差异和连续性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16330 | 2024-08-07 |
Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
2023-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42371-7
PMID:37863903
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研究论文 | 本文通过跨物种分析，研究了非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征，特别是SHH亚组的神经前体细胞起源 | 首次明确区分了来自小脑前叶（CAL）和基底神经节/室管膜（BG/IV）区域的SHH ATRT，并利用单细胞RNA测序支持这些假设 | NA | 探讨ATRT不同亚组的神经前体细胞起源 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 影像数据，分子数据 | NA |
| 16331 | 2024-08-07 |
Sympathetic activity regulates epithelial proliferation and wound healing via adrenergic receptor α2A
2023-10-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45160-w
PMID:37863979
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研究论文 | 研究探讨了交感神经系统通过肾上腺素受体α2A调节肠道上皮细胞增殖和伤口愈合的作用 | 首次证实了肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的主要作用，并展示了其对上皮细胞增殖、分化和宿主防御的影响 | NA | 研究肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的作用及其对伤口愈合的影响 | 肠道上皮细胞和小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了公开的单细胞RNA测序数据集和小鼠模型及肠道类器官培养 |
| 16332 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal basal sex differences in supraoptic nucleus gene expression of adult rats related to cell signaling and ribosomal pathways
2023-10-19, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-023-00554-3
PMID:37858270
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研究论文 | 本研究揭示了成年大鼠上视核中与细胞信号和核糖体通路相关的性别差异基因表达 | 首次使用空间转录组技术来探究成年大鼠上视核中性别差异基因表达 | 样本量相对较小，仅为8只大鼠，限制了结果的广泛性 | 探讨上视核中性别差异的基因表达及其相关通路 | 成年雄性和雌性斯普拉格-道利鼠 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8只大鼠（4只雄性，4只雌性） |
| 16333 | 2024-08-05 |
Macrophage-driven cardiac inflammation and healing: insights from homeostasis and myocardial infarction
2023-Oct-19, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00491-4
PMID:37858035
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综述 | 本文总结了巨噬细胞在心脏稳态和心肌梗死后修复过程中的作用 | 探讨了巨噬细胞的异质性与可塑性，并讨论了精准医学在临床研究中的应用 | 经典的M1和M2巨噬细胞分类过于简化，未能满足精准医疗的标准 | 研究巨噬细胞在心肌梗死发生后对心脏炎症和修复的影响 | 巨噬细胞的起源、组织分布、分类和表面标记 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 16334 | 2024-08-07 |
The energy metabolism of Balantidium polyvacuolum inhabiting the hindgut of Xenocypris davidi
2023-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09706-6
PMID:37858069
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研究论文 | 本研究使用透射电子显微镜和单细胞转录组分析揭示了寄生于戴氏鲌鱼后肠的Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | 首次详细描述了Balantidium polyvacuolum的线粒体相关器官（MROs）的特殊结构及其可能的代谢途径 | NA | 探究Balantidium polyvacuolum适应消化道微环境的分子机制 | Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | NA | NA | 透射电子显微镜（TEM）、单细胞转录组分析 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 16335 | 2024-08-05 |
Exploring the global immune landscape of peripheral blood mononuclear cells in H5N6-infected patient with single-cell transcriptomics
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01693-7
PMID:37853397
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术描绘了H5N6感染患者外周血单核细胞的免疫细胞景观 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了H5N6感染个体外周血中的免疫细胞组成及其相关的分子机制 | 样本量有限，仅包括一名重症儿童和一名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究H5N6感染患者的免疫细胞组成和其在发病机制中的作用 | 外周血单核细胞样本来自一名H5N6禽流感感染的危重儿童和一名健康对照供体 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 合计3,248个单细胞转录组，包括一名H5N6感染儿童和一名健康对照供体 |
| 16336 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene SLC31A1: prognosis values and potential biological functions in cancer
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44681-8
PMID:37853210
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研究论文 | 本研究探讨了SLC31A1在癌症中的作用及其预后价值 | 揭示了SLC31A1在多种癌症中的表达变化及其与免疫细胞的正相关性 | 对于SLC31A1在各种癌症中的具体机制仍未深入探讨 | 阐明SLC31A1在多种人类恶性肿瘤中的作用及预后价值 | 各类癌症患者中的SLC31A1基因及其表达情况 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞测序、基因组数据库分析 | NA | 基因表达数据 | 采用来自癌症基因组图谱数据库的原始数据，涉及33种癌症 |
| 16337 | 2024-08-05 |
Potential network markers and signaling pathways for B cells of COVID-19 based on single-cell condition-specific networks
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09719-1
PMID:37853311
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19感染的人类B细胞的潜在网络标记和相关信号通路 | 研究揭示了与COVID-19高度相关的枢纽基因和'黑暗'基因，并首次链接了这些基因及其编码的关键蛋白与JAK-STAT通路 | 未提及具体的样本数量和实验细节，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19感染对人类B细胞的影响及其潜在的生物标志物 | 人类B细胞，尤其是受到COVID-19感染的B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 条件细胞特异性网络模型 | 基因表达数据 | NA |
| 16338 | 2024-08-05 |
Deciphering intratumoral heterogeneity of hepatocellular carcinoma with microvascular invasion with radiogenomic analysis
2023-10-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04586-6
PMID:37853415
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研究论文 | 本研究揭示了微血管侵袭阳性肝细胞癌的细胞图谱和免疫浸润模式 | 本研究创新性地结合了辐射基因组学分析，揭示了MVI+ HCC的细胞亚群相互作用和独特的代谢特征 | 样本数量相对较小，可能限制了结果的普遍性和代表性 | 本研究旨在通过辐射组学分析探索MVI+ 肝细胞癌的细胞图谱及其免疫浸润特征 | 分析了三例MVI阳性和三例MVI阴性的肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，整体转录组测序，辐射组学分析，外显子组测序 | NA | 组织样本 | 使用了6个单细胞样本以及26个MVI阳性和30个MVI阴性肝细胞癌组织样本 |
| 16339 | 2024-08-05 |
Interaction, immune infiltration characteristics and prognostic modeling of efferocytosis-related subtypes in glioblastoma
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01688-4
PMID:37853449
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研究论文 | 本文探讨了与吞噬作用相关的亚型在胶质母细胞瘤中的相互作用、免疫浸润特征和预后建模 | 提出了一种新的与吞噬作用相关的评分系统，提供了胶质母细胞瘤肿瘤微环境的深入见解 | 对吞噬作用在胶质母细胞瘤中的作用了解不足 | 研究与吞噬作用相关的基因在胶质母细胞瘤中的表达和功能 | 549名胶质母细胞瘤患者和相关的22个与吞噬作用相关的基因 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | 无监督聚类算法 | 基因表达数据 | 549名胶质母细胞瘤患者 |
| 16340 | 2024-08-07 |
Author Correction: Probabilistic embedding, clustering, and alignment for integrating spatial transcriptomics data with PRECAST
2023-Oct-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42412-1
PMID:37852962
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |