单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 16301 - 16320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16301 | 2024-08-07 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本文研究了神经发育转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，揭示了它们在调控GBM肿瘤细胞异质性和层次结构中的关键角色 | 首次展示了ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤细胞类型和迁移程度中的动态水平和相互结合作用，并通过单细胞RNA测序揭示了ASCL1在定义胶质瘤干细胞（GSCs）中的关键作用 | NA | 探讨ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中的调控作用及其对肿瘤细胞异质性和层次结构的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16302 | 2024-08-05 |
YAP/ACSL4 Pathway-Mediated Ferroptosis Promotes Renal Fibrosis in the Presence of Kidney Stones
2023-Oct-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102692
PMID:37893066
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研究论文 | 这项研究探讨了YAP/ACSL4通路介导的铁死亡如何促进肾结石引发的肾纤维化 | 首次阐明了YAP-ACSL4轴介导的铁死亡在钙草酸盐结晶沉积引发的肾纤维化中的作用及其分子机制 | 未提及具体的临床试验数据或长期影响评估 | 探讨钙草酸盐结石对肾纤维化的影响及其相关机制 | 钙草酸盐结石患者的肾组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、转录组RNA测序、免疫组化分析、西方 blot 分析 | NA | 组织样本 | 患者的肾组织和小鼠模型的样本 |
| 16303 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome and metagenome profiling reveals the genetic basis of rumen functions and convergent developmental patterns in ruminants
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278239.123
PMID:37884341
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和元基因组分析，揭示了反刍动物瘤胃功能和发育模式的遗传基础 | 构建了从胚胎早期到反刍阶段的全面转录组和元基因组图谱，重现了瘤胃的组织形态学和转录特征，揭示了瘤胃细胞、微生物群和核心转录调控网络发育的关键过渡特征 | NA | 研究瘤胃发育过程中的动态变化，并揭示其遗传基础 | 羊和山羊的瘤胃组织 | NA | NA | 单细胞转录组和元基因组分析 | NA | 转录组和元基因组数据 | 约308,000个细胞，来自17个时间点的羊和山羊瘤胃组织 |
| 16304 | 2024-08-07 |
An RNA-Scaffold Protein Subunit Vaccine for Nasal Immunization
2023-Sep-29, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101550
PMID:37896953
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研究论文 | 本文开发了一种自佐剂的蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗，用于鼻腔免疫，并在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中验证了其有效性 | 该疫苗结合了刺突RBD（作为抗原）、核蛋白（作为适配器）和ssRNA（作为佐剂和RNA支架），能强有力地诱导黏膜IgA、中和抗体和多功能T细胞，同时提供对活病毒挑战的灭菌免疫 | NA | 开发安全且有效的鼻腔疫苗以对抗呼吸道病毒感染 | 蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中的效果 | 疫苗学 | 呼吸道病毒感染 | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠和SARS-CoV-2感染模型 |
| 16305 | 2024-08-07 |
White Adipose Tissue Heterogeneity in the Single-Cell Era: From Mice and Humans to Cattle
2023-Sep-27, Biology
DOI:10.3390/biology12101289
PMID:37886999
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术研究白色脂肪组织在不同哺乳动物中的转录和功能细胞多样性，特别关注了牛的研究进展和未来方向 | 利用下一代测序技术进行单细胞RNA测序，揭示了人类和小鼠模型中白色脂肪组织的细胞异质性，并探讨了其在畜牧物种中的应用 | NA | 总结当前关于白色脂肪组织细胞多样性的知识，并强调其在不同哺乳动物物种中的特定功能 | 白色脂肪组织在不同哺乳动物中的细胞类型和功能 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 16306 | 2024-08-07 |
Robust Identification of Differential Gene Expression Patterns from Multiple Transcriptomics Datasets for Early Diagnosis, Prognosis, and Therapies for Breast Cancer
2023-09-24, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59101705
PMID:37893423
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研究论文 | 本研究通过综合稳健统计学和生物信息学方法，从多个转录组数据集中识别出与乳腺癌相关的差异表达基因，用于早期诊断、预后和治疗。 | 本研究采用稳健的统计方法来识别乳腺癌相关的关键基因，这些方法对异常值不敏感，提高了结果的可靠性。 | NA | 探索乳腺癌相关潜在的关键基因，并评估其在早期诊断、预后和治疗中的表现。 | 乳腺癌相关的差异表达基因及其在诊断、预后和治疗中的应用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 从三个微阵列（GSE26910, GSE42568, GSE65194）和一个单细胞RNA测序（GSE235168）数据集中识别出46个共同差异表达基因。 |
| 16307 | 2024-08-05 |
Emerging Insights into Molecular Mechanisms of Inflammation in Myelodysplastic Syndromes
2023-Sep-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102613
PMID:37892987
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综述 | 本文总结了慢性骨髓增生性疾病(MDS)中炎症信号的作用机制。 | 通过单细胞测序和多组学方法揭示了MDS进展中炎症信号及天然免疫反应的重要性。 | 本文未提供具体的实验数据来支持所讨论的机制。 | 探讨炎症在骨髓增生性疾病中的作用与机制。 | 主要关注骨髓微环境中炎症因子对造血干细胞(HSC)命运的影响。 | 数字病理 | 骨髓增生性疾病 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | NA | NA |
| 16308 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised leaning
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad383
PMID:37898127
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的新型深度学习框架VGAAE | 创新地引入了多头注意力机制和自监督学习以提高聚类质量 | 未提及模型在真实生物场景中的应用情况 | 研究希望改善单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 集中在单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分图注意自编码器（VGAAE） | NA | 在不同数据集上进行实验 |
| 16309 | 2024-08-07 |
Quantum annealing-based clustering of single cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad377
PMID:37874950
|
研究论文 | 本文探讨了使用量子退火技术对单细胞RNA测序数据进行聚类分析的方法 | 提出了一种利用量子计算中的量子退火技术来探索聚类成本函数的新方法 | NA | 解决单细胞基因表达数据聚类分析中参数选择和算法选择的难题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 量子退火 | 量子计算 | 基因表达数据 | NA |
| 16310 | 2024-08-05 |
[Applications of single-cell analysis in blood research]
2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.64.1047
PMID:37899182
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研究论文 | 本文介绍了单细胞技术在血液研究中的应用及其成果 | 探讨了单细胞测序技术在血液研究中的最新进展 | NA | 总结单细胞分析在血液研究中的应用 | 单细胞水平的DNA序列、RNA和蛋白质表达水平及表观基因组修饰 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16311 | 2024-08-07 |
RGS5 as a Biomarker of Pericytes, Involvement in Vascular Remodeling and Pulmonary Arterial Hypertension
2023, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S429535
PMID:37881333
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研究论文 | 本文研究了RGS5作为周细胞生物标志物在血管重塑和肺动脉高压中的作用 | 发现RGS5通过周细胞调节肺微血管的血管重塑，为肺动脉高压的发生和创新治疗提供了新思路 | NA | 识别关键驱动基因以调控肺微血管的血管重塑，对肺动脉高压管理至关重要 | RGS5在肺动脉高压中的表达及其在血管重塑中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 逆转录定量PCR (RT-qPCR) | NA | RNA序列 | 使用了多个GEO数据集（GSE117261, GSE48149, GSE113439, GSE53408, GSE16947）和正常及肺动脉高压小鼠样本 |
| 16312 | 2024-08-07 |
Chronic HCV infection promotes cytotoxicity in antigen-specific CD8+ T cells regardless of virus specificity
2023, Frontiers in virology (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fviro.2023.1198361
PMID:37886042
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研究论文 | 本研究探讨了慢性HCV感染对特定CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并分析了不同治疗阶段对这些细胞的影响。 | 本研究首次描述了慢性HCV感染对非HCV病毒特异性CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并提供了单细胞RNA测序技术的新见解。 | 研究仅包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者，可能无法全面代表所有HCV感染情况。 | 深入了解HCV感染对CD8+ T细胞的影响，为开发有效的HCV疫苗提供依据。 | HCV特异性CD8+ T细胞及非HCV病毒特异性CD8+ T细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者 |
| 16313 | 2024-08-07 |
Unveiling mitophagy-mediated molecular heterogeneity and development of a risk signature model for colorectal cancer by integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq analysis
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad066
PMID:37886241
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了线粒体自噬在结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的作用，并建立了一个基于线粒体自噬的风险模型。 | 首次通过单细胞分辨率揭示了线粒体自噬在结直肠癌肿瘤微环境中的分子异质性，并开发了一个新的风险签名模型。 | 研究仅使用了有限的样本和数据集进行验证，可能需要更多的数据来进一步验证模型的普遍性和准确性。 | 阐明线粒体自噬在结直肠癌肿瘤微环境中的作用，并建立一个基于线粒体自噬的风险模型。 | 结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的线粒体自噬相关通路和分子特征。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 无监督聚类算法，LASSO Cox分析 | RNA序列 | 14,719个细胞来自8个样本 |
| 16314 | 2024-08-05 |
Rotenone impairs brain glial energetics and locomotor behavior in bumblebees
2024-Jan-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.167870
PMID:37865240
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研究论文 | 该文章研究了罗腾农对大黄蜂脑胶质细胞能量代谢和运动行为的影响 | 首次揭示了环境现实暴露水平的罗腾农如何影响大黄蜂的胶质细胞能量代谢和运动能力 | 尚未明确罗腾农对大黄蜂神经元的具体损害机制 | 探讨罗腾农对大黄蜂的脑胶质细胞和运动行为的影响 | 大黄蜂的胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16315 | 2024-08-07 |
Combination of CRISPR-Cas9-RNP and Single-Cell RNAseq to Identify Cell State-Specific FOXJ1 Functions in the Human Airway Epithelium
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3507-0_1
PMID:37856015
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研究论文 | 本研究结合CRISPR-Cas9-RNP技术和单细胞RNA测序，探讨了FOXJ1在人呼吸道上皮细胞中的细胞状态特异性功能 | 采用CRISPR-Cas9-RNP技术直接转染核糖核蛋白复合物，无需选择步骤，效率超过95% | 该方法生成的细胞群体包含异质性缺失，使得无效化效率评估困难 | 研究FOXJ1在人呼吸道上皮细胞中的功能及其对多纤毛细胞最终分化步骤的影响 | 人呼吸道上皮细胞中的FOXJ1基因 | 数字病理 | NA | CRISPR-Cas9-RNP, 单细胞RNA测序, Flongle测序(Nanopore) | NA | RNA | 来自鼻甲的基底细胞培养物 |
| 16316 | 2024-08-05 |
Abnormal lactate metabolism is linked to albuminuria and kidney injury in diabetic nephropathy
2023-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.08.006
PMID:37843477
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研究论文 | 该文章探讨了异常乳酸代谢与糖尿病肾病中白蛋白尿和肾损伤之间的关联 | 创新点在于发现乳酸水平的增加与糖尿病肾病的病理变化相关，并指出尿液乳酸水平可能成为肾病进展风险的潜在生物标志物 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需更多人群研究 | 研究糖尿病肾病发病机制中的代谢异常及其对疾病进展的影响 | 研究对象为糖尿病小鼠模型及东南亚糖尿病患者队列 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 针对性代谢组学分析 | NA | 尿液样本及血清生物标志物 | 涉及小鼠模型和东南亚患者队列 |
| 16317 | 2024-08-07 |
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-Dec, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202300401
PMID:37863820
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研究论文 | 本研究探讨了高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟和胚胎发育的影响，以及其对雌性生育能力的损害机制 | 首次揭示了高盐饮食通过影响卵母细胞的自噬、凋亡水平和线粒体功能，导致卵母细胞和胚胎质量下降，从而损害雌性生育能力 | NA | 研究高盐饮食对雌性小鼠生育能力的影响及其机制 | 小鼠的卵母细胞成熟、受精率、胚胎发育和雌性生育能力 | NA | NA | 单细胞转录组数据分析 | NA | 转录组数据 | C57BL/6雌性小鼠 |
| 16318 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of peripheral blood immunoinflammatory landscapes in patients with acute cholangitis and its secondary septic shock using single-cell RNA sequencing
2023-11-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149121
PMID:37864923
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术比较分析了急性胆管炎及其继发性脓毒性休克患者外周血中的免疫炎症反应 | 首次分析了急性胆管炎与继发性脓毒性休克之间免疫反应的差异，并揭示了免疫细胞在细胞数量、基因表达、功能、分化轨迹和细胞间相互作用等方面的显著差异 | NA | 探讨急性胆管炎及其继发性脓毒性休克患者外周血中免疫细胞的差异 | 急性胆管炎及其继发性脓毒性休克患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 急性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括急性胆管炎（A1, A2, A3）和继发性脓毒性休克（B1, B2, B3）患者的样本 |
| 16319 | 2024-08-05 |
Cell atlas of trabecular meshwork in glaucomatous non-human primates and DEGs related to tissue contract based on single-cell transcriptomics
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108024
PMID:37867950
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研究论文 | 本研究构建了青光眼非人灵长类动物的网状小梁细胞图谱并探索与组织收缩相关的差异表达基因 | 首次识别与网状小梁收缩相关的多个基因，并确定其在青光眼与健康组中的差异表达 | 研究仅限于非人灵长类动物，结果可能不完全适用于人类 | 探讨与青光眼相关的网状小梁细胞异质性和功能缺陷 | 青光眼非人灵长类动物（猕猴）和健康猕猴 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型，共识别14种不同的细胞类型 |
| 16320 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2023-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01455-9
PMID:37845544
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠前额叶皮层的不同细胞类型和基因表达模式与相邻皮层区域的区别 | 首次使用空间转录组学技术绘制了小鼠前额叶皮层的细胞和电路组织图谱，特别是与慢性疼痛相关的神经元亚型 | 该研究主要集中在小鼠模型上，结果的外推性可能有限 | 解码前额叶皮层和调控慢性疼痛的神经元亚型的细胞及电路组织 | 成年小鼠的前额叶皮层及其相关神经元亚型 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠 |