单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 16261 - 16280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16261 | 2024-08-07 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在视网膜生理学和疾病生物学中的应用 | scRNA-seq技术能够详细研究视网膜细胞的复杂动态，揭示细胞亚群及其在疾病发生和进展中的作用 | NA | 深入理解视网膜疾病，特别是通过研究视网膜细胞异质性 | 视网膜细胞及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16262 | 2024-08-07 |
Construction and Validation of a Prognostic Model of Metabolism-Related Genes Driven by Somatic Mutation in Bladder Cancer
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810242
PMID:37919060
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，基于膀胱癌患者的转录组数据，构建并验证了一个由体细胞突变驱动的与代谢相关基因的预后模型 | 本研究构建了一个新的基于临床和分子因素的预后模型，该模型与代谢重编程相关，有望改善膀胱癌患者的独立预后指标预测和管理 | NA | 利用生物信息学方法建立基于代谢相关基因的膀胱癌预后模型，筛选潜在的生物标志物 | 膀胱癌患者的代谢相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR） | Cox回归分析 | 转录组数据 | 201个差异表达的代谢相关基因 |
| 16263 | 2024-08-05 |
[Characterization of Cell Subsets Associated With Prognosis of Osteosarcoma Based on Single-Cell Sequencing Data]
2023-Oct, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.15573
PMID:37927019
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研究论文 | 本研究旨在通过分析不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本的细胞组成，探讨与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 首次建立了基于巨噬细胞分化的差异表达基因的预后模型，揭示了巨噬细胞亚群与骨肉瘤预后的密切关系 | 研究主要依赖于单细胞测序数据，样本量以及不同患者的异质性可能影响结果的普遍适用性 | 探索与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 不同骨肉瘤患者的样本 |
| 16264 | 2024-08-07 |
Infernape uncovers cell type-specific and spatially resolved alternative polyadenylation in the brain
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277864.123
PMID:37907328
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研究论文 | 本文介绍了Infernape工具，用于从单细胞和空间转录组数据中推断和量化多聚腺苷酸化位点（PA）的使用，并在小鼠大脑中展示了其应用 | Infernape首次系统地揭示了大脑中细胞类型特异性和空间解析的替代多聚腺苷酸化 | NA | 研究大脑中细胞类型特异性和空间分布的差异多聚腺苷酸化位点（PA）的使用 | 小鼠大脑中的多聚腺苷酸化位点（PA） | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑样本 |
| 16265 | 2024-08-05 |
Research progress of single-cell sequencing in tuberculosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276194
PMID:37901241
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研究论文 | 这篇文章综述了单细胞测序在结核病研究中的进展 | 强调了单细胞测序技术在揭示结核病发病机制及免疫反应中的不同应用 | 文章提到各种技术的应用限制，但具体限制细节未详述 | 深入理解结核病研究中的空白和潜在的未来发展 | 单细胞测序技术在结核病的发病机制和免疫反应中的应用 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16266 | 2024-08-05 |
Cardiac cellular diversity and functionality in cardiac repair by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1237208
PMID:37920179
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评论 | 这篇文章总结了单细胞转录组学在心脏修复中的主要发现 | 探讨了心脏细胞异质性及其在心肌缺血修复过程中的作用 | 文章未提供新的实验数据，仅为文献综述 | 旨在探讨心脏修复机制及开发新的治疗方法 | 涵盖心脏细胞类型、成分动态和与缺血相关的分子特征 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 16267 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis technologies for cancer research: from tumor-specific single cell discovery to cancer therapy
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1276959
PMID:37900181
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综述 | 该文章探讨了单细胞测序(SCS)技术在癌症研究中的应用及其临床优势 | 文章系统性地研究了多种单细胞技术的基础概念、过程步骤及其在癌症治疗中的独特临床优势 | 尽管SCS技术具有改变癌症研究的潜力，但在管理和分析大规模数据方面仍面临挑战 | 突出SCS在癌症研究中的关键作用，并促进单细胞技术在癌症治疗中的应用 | 单细胞，包括循环肿瘤细胞(CTCs)、谱系追踪、肿瘤异质性、耐药性及肿瘤免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序(SCS) | NA | 单细胞数据 | 成千上万到百万的单细胞 |
| 16268 | 2024-08-05 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文回顾了黑色素瘤中预后和预测免疫生物标志物检测的不同技术 | 强调了多种方法用于表征黑色素瘤的免疫微环境并提供新型生物标志物 | 未明确提及具体的实验数据或样本规模 | 改善黑色素瘤的免疫生物标志物的检测方法 | 研究不同技术如何检测黑色素瘤中的生物标志物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱、空间转录组学、基于人工智能的图像分析 | NA | NA | NA |
| 16269 | 2024-08-07 |
Proposing a novel molecular subtyping scheme for predicting distant recurrence-free survival in breast cancer post-neoadjuvant chemotherapy with close correlation to metabolism and senescence
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1265520
PMID:37900131
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研究论文 | 本研究提出了一种新的分子分型方案，用于预测乳腺癌患者在接受新辅助化疗后的无远处复发生存期，该方案与肿瘤代谢和细胞衰老密切相关。 | 本研究结合生物信息学和机器学习方法，通过综合分析确定了与乳腺癌远处复发相关的关键基因，并开发了一种新的分子分型方案。 | NA | 优化乳腺癌患者在接受新辅助化疗后远处复发的监测方案。 | 乳腺癌患者的无远处复发生存期。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列数据分析、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 101种算法组合 |
| 16270 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific molecular characterization of cells from circulation and kidney in IgA nephropathy with nephrotic syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1231937
PMID:37908345
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞的细胞类型特异性分子特征 | 首次系统地分析了肾病综合征IgA肾病患者的循环系统和肾脏组织的分子事件，为未来的靶向治疗提供了新的见解 | NA | 探究肾病综合征IgA肾病的细胞和分子状态 | 患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 儿童患者 |
| 16271 | 2024-08-07 |
Unraveling the prognostic significance and molecular characteristics of tumor-infiltrating B lymphocytes in clear cell renal cell carcinoma through a comprehensive bioinformatics analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1238312
PMID:37908350
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，探索了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后意义和分子特征 | 本研究首次系统地探讨了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征，并提出了一个10基因标志物 | 需要进一步研究以明确肿瘤浸润B淋巴细胞在透明细胞肾细胞癌患者预后和治疗中的具体影响 | 探索透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | xCell算法, WGCNA方法, scRNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了TCGA-KIRC和其他透明细胞肾细胞癌转录组数据集 |
| 16272 | 2024-08-07 |
Construction and validation of a novel senescence-related risk score can help predict the prognosis and tumor microenvironment of gastric cancer patients and determine that STK40 can affect the ROS accumulation and proliferation ability of gastric cancer cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259231
PMID:37915566
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研究论文 | 本研究构建并验证了一种新型衰老相关风险评分，有助于预测胃癌患者的预后和肿瘤微环境，并确定STK40能影响胃癌细胞的ROS积累和增殖能力 | 本研究通过WGCNA算法和Lasso-Cox算法筛选出KL、SERPINE1和STK40作为构建预后模型的关键基因，并利用SSGSEA算法评估不同患者中免疫细胞和免疫功能的浸润及其与风险评分的关联 | NA | 评估胃癌患者的预后和免疫治疗效果 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | WGCNA算法, Lasso-Cox方法, SSGSEA算法, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16273 | 2024-08-07 |
Hepatitis B surface antigen reduction is associated with hepatitis B core-specific CD8+ T cell quality
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1257113
PMID:37920475
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研究论文 | 研究了慢性乙型肝炎（CHB）患者在接受核苷（酸）类似物（NUC）治疗期间，CD8 T细胞的特性及其与乙型肝炎表面抗原（HBsAg）水平的关系 | 揭示了HBV特异性CD8 T细胞在患者体内的质量差异，并发现HBcore特异性CD8 T细胞的多功能性与HBsAg水平呈负相关 | 研究样本量较小，且仅限于特定病毒基因型的患者 | 探讨CD8 T细胞在CHB患者中的作用及其对HBsAg水平的影响 | 慢性乙型肝炎患者的CD8 T细胞及其与HBsAg的关系 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色流式细胞术 | NA | RNA | 6名捐赠者的CD69 CD8 T细胞用于scRNA-seq分析，26名捐赠者的PBMCs用于HBV特异性CD8 T细胞检测 |
| 16274 | 2024-08-07 |
Identification of Cell-Cell Communications by Single-Cell RNA Sequencing in End Stage Renal Disease Provides New Insights into Immune Cell Heterogeneity
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S424911
PMID:37927961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的细胞间通讯，揭示了免疫细胞异质性的新见解 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的免疫细胞异质性及其细胞间通讯，发现了MIF信号通路在Th17/Treg细胞间通讯中的重要作用 | NA | 揭示慢性肾脏病进展过程中免疫细胞功能、组成及细胞间通讯的改变 | 终末期肾病患者及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括常规血液透析患者和健康对照组的临床数据、血清及外周血单个核细胞样本 |
| 16275 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系 | 样本量仅限于五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用 | 四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 五名患者（包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者） |
| 16276 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-Jan, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病诱导认知障碍模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | 首次详细分析了长期高血糖状态下海马细胞群的异质性，并揭示了特定细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于db糖尿病小鼠模型，结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探讨糖尿病诱导认知障碍中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | db糖尿病小鼠的海马细胞 | 神经科学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 认知障碍组21,379个细胞，对照组20,045个细胞 |
| 16277 | 2024-08-05 |
Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages
2023-Nov-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011
PMID:37875117
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研究论文 | 本文探讨了α-1肾上腺素信号在斑马鱼巨噬细胞中的心脏再生和细胞外基质重塑转录程序的机制 | 发现α-1肾上腺素受体在心脏损伤后调节巨噬细胞表型多样化，推动细胞外基质重塑 | 尚未探究不同条件下神经调节对再生过程的影响 | 揭示自律神经系统在心脏修复中的作用机制 | 斑马鱼的巨噬细胞及其在心脏损伤后的反应 | 数字病理学 | NA | 药理学方法，基因操控，单细胞转录组测序 | NA | NA | NA |
| 16278 | 2024-08-07 |
Circulating small extracellular vesicle-derived splicing factor 3b subunit 4 as a non-invasive diagnostic biomarker of early hepatocellular carcinoma
2023-Oct-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02867-y
PMID:37899451
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研究论文 | 本研究评估了剪接因子3b亚基4（SF3B4）作为肝细胞癌（HCC）新型非侵入性生物标志物的诊断价值，并探讨了SF3B4表达与免疫细胞浸润的关联 | SF3B4在血浆中的表达水平在HCC患者中显著高于健康对照组，且EV-SF3B4在HCC的诊断性能优于α-胎蛋白（AFP） | SF3B4蛋白和自身抗体在HCC患者血浆中的诊断性能并未优于α-胎蛋白（AFP） | 评估SF3B4作为HCC非侵入性诊断生物标志物的价值及其与免疫细胞浸润的关联 | 肝细胞癌（HCC）患者及健康对照组的血浆样本 | NA | 肝细胞癌 | 酶联免疫吸附试验（ELISA）、定量逆转录PCR | NA | 血浆样本 | 健康对照组和不同阶段的HCC患者 |
| 16279 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal evolution of AML immune microenvironment remodeling and RNF149-driven drug resistance through single-cell multidimensional analysis
2023-10-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04579-5
PMID:37891580
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研究论文 | 通过单细胞多维分析，分析急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的构成及RNF149驱动的药物耐药性演变 | 首次揭示了RNF149在急性髓性白血病进展中的作用及其对免疫微环境的影响 | 未能完全探索所有E3泛素连接酶相关基因对药物耐药的影响 | 探讨急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的组成及其在药物耐药中的作用 | 急性髓性白血病患者的骨髓免疫微环境中不同T细胞亚群 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 16280 | 2024-08-05 |
Selective control of transposable element expression during T cell exhaustion and anti-PD-1 treatment
2023-10-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adf8838
PMID:37889984
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研究论文 | 该文章分析了在慢性感染和癌症中，T细胞耗竭和抗PD-1治疗期间转座元件的表达情况 | 揭示了在T细胞耗竭过程中，转座元件表达的选择性调控及其作为免疫检查点抑制反应生物标志物的潜力 | 本研究主要基于小鼠和人类的TIL亚群，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究在T细胞耗竭过程中转座元件的表达及其在抗PD-1治疗中的角色 | 小鼠和人类的CD8肿瘤浸润性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 转录组学 | NA | RNA数据 | NA |