单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28063 篇文献，本页显示第 16241 - 16260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16241 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
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研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序，荧光原位杂交，单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据，单细胞数据 | NA |
| 16242 | 2024-08-05 |
Integration of clinical characteristics and molecular signatures of the tumor microenvironment to predict the prognosis of neuroblastoma
2023-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02372-x
PMID:37712965
|
研究论文 | 本研究旨在分析神经母细胞瘤的临床特征、细胞类型和肿瘤微环境的分子特征，以更好地预测预后 | 建立了基于基因特征和临床特征的多变量Cox模型，有助于更准确地预测神经母细胞瘤的预后 | 研究可能受到样本量和所用数据来源的限制 | 改善神经母细胞瘤的预后预测 | 分析498例神经母细胞瘤患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox模型 | 基因表达数据 | 498例神经母细胞瘤患者 |
| 16243 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
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研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本，包括来自胰腺和血液的T细胞 |
| 16244 | 2024-08-05 |
Integrating spatial transcriptomics data across different conditions, technologies and developmental stages
2023-Oct, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00528-w
PMID:38177758
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研究论文 | 本文介绍了一种称为STAligner的图注意神经网络，用于整合和对齐空间转录组数据集 | 创新点在于STAligner能够实现空间意识的数据整合和下游比较分析 | 本文未提及特定的局限性 | 研究不同条件、技术和发育阶段下的空间转录组数据整合 | 研究对象包括人类皮层切片、小鼠嗅球切片、小鼠海马组织切片以及小鼠器官发生的时空图集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图注意神经网络 | 切片数据 | 涉及人类和小鼠的多个样本切片 |
| 16245 | 2024-08-07 |
STAligner enables the integration and alignment of multiple spatial transcriptomics datasets
2023-Oct, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00543-x
PMID:38177765
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16246 | 2024-08-07 |
scGEM: Unveiling the Nested Tree-Structured Gene Co-Expressing Modules in Single Cell Transcriptome Data
2023-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15174277
PMID:37686554
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研究论文 | 本文介绍了scGEM模型，用于揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块 | scGEM是一个嵌套树结构的非参数贝叶斯模型，能够识别和量化决定细胞类型特化和分化的潜在细胞程序 | NA | 揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块，以理解细胞功能的隐藏机制 | 单细胞转录组数据，包括外周血单个核细胞和早期脑发育细胞 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | 非参数贝叶斯模型 | 转录组数据 | 包括外周血单个核细胞、早期脑发育细胞和三阴性乳腺癌细胞 |
| 16247 | 2024-08-07 |
Single-cell meta-analysis of inflammatory bowel disease with scIBD
2023-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00464-9
PMID:38177426
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研究论文 | 本文介绍了scIBD平台，用于炎症性肠病（IBD）的单细胞元分析，结合高质量的单细胞数据集，识别罕见或较少表征的细胞类型，并分析溃疡性结肠炎和克罗恩病的共性和差异 | scIBD平台整合了多功能的生物信息，包括调节子活性、GWAS相关风险基因和治疗靶向基因，以推断临床相关的细胞类型特异性 | NA | 深入理解炎症性肠病的发病机制 | 炎症性肠病的肠道微环境 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 16248 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of PIT1-positive pituitary adenoma highlights the pro-tumour microenvironment mediated by IFN-γ-induced tumour-associated fibroblasts remodelling
2023-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02126-5
PMID:36631635
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIT1阳性垂体腺瘤中IFN-γ诱导的肿瘤相关成纤维细胞重塑所介导的促肿瘤微环境 | 本研究揭示了PIT1-PA微环境中细胞类型的功能异质性，以及IFN-γ在肿瘤相关成纤维细胞重塑中的抗肿瘤作用 | 仍需进一步研究以完全了解PIT1-PA中肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞的细胞和功能异质性 | 研究PIT1-阳性垂体腺瘤中的微环境及其在肿瘤发展的作用 | 研究了四个PIT1阳性垂体腺瘤样本中的28种不同细胞亚型 | 数字病理学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个PIT1-阳性垂体腺瘤样本 |
| 16249 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组，揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析，揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 |
| 16250 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱，揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响，特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性，沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 |
| 16251 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
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research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢，增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 |
| 16252 | 2024-08-07 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
|
研究论文 | 介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在处理大量细胞和突变数据时，运行时间呈线性增长，且在模拟和真实肿瘤测序数据中显示出比现有方法更快的速度和相当的或更好的准确性 | NA | 开发一种快速且准确的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的肿瘤内异质性 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | 计算方法 | 基因型矩阵 | NA |
| 16253 | 2024-08-07 |
Graphing cell relations in spatial transcriptomics
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00269-2
PMID:38177581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16254 | 2024-08-07 |
Cell clustering for spatial transcriptomics data with graph neural networks
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00266-5
PMID:38177586
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络的无监督细胞聚类方法，用于空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型发现 | 利用空间转录组学和图神经网络，有效整合了基因表达信息和空间信息，提高了细胞聚类和细胞亚型发现的准确性 | NA | 改进基于空间转录组数据的细胞聚类和细胞亚型发现 | 空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | 五个体外和体内的空间数据集 |
| 16255 | 2024-08-07 |
Adversarial domain translation networks for integrating large-scale atlas-level single-cell datasets
2022-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00251-y
PMID:38177826
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Portal的统一框架，利用对抗域翻译网络来学习大规模图谱级别单细胞RNA-seq数据集的协调表示 | Portal框架在集成过程中能更好地保留生物变异，且在低内存消耗下快速集成数百万个细胞 | NA | 开发一种能够有效集成和协调大规模单细胞RNA-seq数据集的方法 | 大规模图谱级别的单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗域翻译网络 | 单细胞RNA-seq数据 | 数百万个细胞 |
| 16256 | 2024-08-07 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
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研究论文 | 研究探讨了机械疗法在老年肌肉恢复期间对细胞外基质（ECM）重塑的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了机械疗法对老年肌肉恢复期间ECM重塑的影响，并验证了其效果 | 研究仅限于实验动物模型，尚未在人体中验证 | 探究机械疗法是否能促进老年肌肉在废用性萎缩恢复期间的ECM重塑 | 老年和成年大鼠的腓肠肌在废用性萎缩恢复期间的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年和老年大鼠的腓肠肌细胞 |
| 16257 | 2024-08-05 |
ImmunoPET imaging of Trop2 expression in solid tumors with nanobody tracers
2024-Jan, European journal of nuclear medicine and molecular imaging
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s00259-023-06454-3
PMID:37792026
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研究论文 | 本文研究了使用纳米抗体探针在固体肿瘤中进行Trop2表达的免疫正电子发射成像（immunoPET） | 构建了特异性针对Trop2的免疫PET探针，并评估了其在前临床胰腺癌和胃癌模型中的诊断能力 | 文中未提及样本量的具体大小及其对结果的影响 | 评估Trop2在胰腺癌和胃癌中的表达及其作为靶向治疗的潜力 | 胰腺癌细胞系及其相关患者来源的胃癌模型 | 数字病理学 | 胰腺癌，胃癌 | 免疫正电子发射成像（immunoPET） | NA | 组织微阵列，单细胞测序 | 未明确提及具体样本量 |
| 16258 | 2024-08-07 |
Altered bile acid metabolism in skin tissues in response to ionizing radiation: deoxycholic acid (DCA) as a novel treatment for radiogenic skin injury
2024, International journal of radiation biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1080/09553002.2023.2245461
PMID:37540505
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研究论文 | 研究放射性皮肤损伤（RSI）中胆汁酸（BAs）及其衍生物的代谢变化，并探讨去氧胆酸（DCA）作为治疗RSI的新疗法 | 发现放射性皮肤损伤中胆汁酸代谢的显著变化，并证实去氧胆酸（DCA）具有促进伤口愈合和减轻表皮增生的作用 | NA | 探究放射性皮肤损伤中胆汁酸及其衍生物的代谢变化 | 放射性皮肤损伤中的胆汁酸代谢 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS），单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 大鼠皮肤组织，放射性皮肤损伤的人类和动物模型 |
| 16259 | 2024-08-07 |
Decreased CNNM2 expression in prefrontal cortex affects sensorimotor gating function, cognition, dendritic spine morphogenesis and risk of schizophrenia
2024-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-023-01732-y
PMID:37715107
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究（GWAS）和数量性状位点（QTL）分析，发现CNNM2基因在额叶皮层中的表达降低影响感觉运动门控功能、认知、树突棘形态发生以及精神分裂症的风险 | 首次揭示CNNM2基因在精神分裂症发病机制中的重要作用，并通过小鼠模型和蛋白质组学分析验证了其与精神分裂症内表型的关联 | NA | 旨在识别与精神分裂症风险相关的基因，并探讨其分子机制 | CNNM2基因在额叶皮层中的表达及其对感觉运动门控功能、认知和树突棘形态发生的影响 | 神经科学 | 精神分裂症 | 全基因组关联研究（GWAS）、数量性状位点（QTL）分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 使用PsychENCODE、ROSMAP和Banner数据库中的额叶皮层表达QTL（eQTL）和蛋白质QTL（pQTL）数据集 |
| 16260 | 2024-08-07 |
Single-Cell Mapping of Brain Myeloid Cell Subsets Reveals Key Transcriptomic Changes Favoring Neuroplasticity after Ischemic Stroke
2024-Jan, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01109-7
PMID:37755676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞组成和转录特征，揭示了微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在促进神经再生中的作用 | 首次详细描述了脑缺血后梗死周边区域免疫细胞的单细胞转录组特征，特别是微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在神经再生中的作用 | NA | 探究脑缺血后免疫细胞在促进神经可塑性和神经再生中的作用 | 脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |