单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16221 - 16240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16221 | 2024-08-07 |
A risk score model based on lipid metabolism-related genes could predict response to immunotherapy and prognosis of lung adenocarcinoma: a multi-dataset study and cytological validation
2023-Oct-24, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00802-3
PMID:37874388
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研究论文 | 本研究基于脂质代谢相关基因构建了一个风险评分模型，用于预测肺腺癌对免疫治疗的反应和预后 | 首次探讨了脂质代谢与肺腺癌预后及治疗反应之间的关系，并构建了一个基于脂质代谢相关基因的风险评分模型 | 需要进一步的临床试验来验证该模型的预测准确性和实用性 | 研究脂质代谢在肺腺癌中的作用，并开发一个能够预测患者对免疫治疗反应和预后的风险评分模型 | 肺腺癌患者的脂质代谢相关基因及其对免疫治疗反应和预后的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA测序数据 | 包括七个批量RNA测序数据集和一个单细胞RNA测序数据集，以及多个用于测试免疫治疗反应的数据集 |
| 16222 | 2024-08-07 |
ZDHHC9: a promising therapeutic target for triple-negative breast cancer through immune modulation and immune checkpoint blockade resistance
2023-Oct-24, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00790-4
PMID:37875591
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研究论文 | 本研究通过分析不同表达基因（DEGs）的表达谱，旨在识别三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在治疗靶点 | 发现ZDHHC9通过免疫调节和免疫检查点阻断抵抗，是三阴性乳腺癌的一个有前景的治疗靶点 | NA | 识别三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | NA | 乳腺癌 | Limma包，免疫组织化学（IHC）分析，蛋白质印迹（western blotting），流式细胞术，组织免疫荧光分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，组织样本 | 使用了TCGA和GEO数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 16223 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals exosome-associated biomarkers for prognostic prediction and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023-10-24, Aging
DOI:10.18632/aging.205140
PMID:37878007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因，并开发了外泌体相关签名用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 首次综合利用单细胞和批量RNA测序分析，开发了外泌体相关签名，为肺腺癌的临床诊断和治疗管理提供了重要见解 | NA | 探索外泌体相关基因在肺腺癌中的作用，并开发用于预后预测和免疫治疗的生物标志物 | 肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个批量RNA测序数据集 |
| 16224 | 2024-08-05 |
The Communication from Immune Cells to the Fibroblasts in Keloids: Implications for Immunotherapy
2023-Oct-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015475
PMID:37895153
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综述 | 本文更新了关于瘢痕疙瘩微环境的知识，重点关注免疫细胞与成纤维细胞之间的沟通。 | 探讨了瘢痕疙瘩作为一种炎症性皮肤疾病的潜力，为靶向免疫介导的新药开发提供了新的思路。 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果以支持观点。 | 旨在加深对瘢痕疙瘩发病机制的理解，以促进有效治疗方法的发展。 | 重点研究免疫细胞与瘢痕疙瘩成纤维细胞之间的交流及其对治疗的影响。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 16225 | 2024-08-07 |
TSPLASSO: A Two-stage Prior LASSO Algorithm for Gene Selection using Omics Data
2023-Oct-23, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3326485
PMID:37871092
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研究论文 | 本文提出了一种名为TSPLASSO的两阶段先验LASSO算法，用于利用组学数据进行基因选择 | TSPLASSO算法首次尝试在特征选择中使用先验信息，通过两阶段过程进行基因选择和样本分类 | NA | 开发一种新的算法，用于提高从组学数据中选择癌症基因的准确性 | 癌症基因和样本分类 | 生物信息学 | NA | LASSO | 线性回归和逻辑回归模型 | 组学数据 | 涉及六个真实世界数据集 |
| 16226 | 2024-08-07 |
Venetoclax Overcomes Sorafenib Resistance in Acute Myeloid Leukemia by Targeting BCL2
2023-Oct-16, Biology
DOI:10.3390/biology12101337
PMID:37887047
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研究论文 | 研究通过分析单细胞和批量转录数据，探讨了维奈托克克服索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药性的机制 | 开发了一个平台来预测AML患者在接受索拉非尼治疗后的耐药性和临床结果，并发现维奈托克与索拉非尼联合使用可能是一种有效的治疗策略 | NA | 探讨索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药机制及克服耐药性的策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞和批量转录数据 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | 耐药性和对照的急性髓系白血病患者 |
| 16227 | 2024-08-05 |
A Methodological Approach to Identify Natural Compounds with Antifibrotic Activity and the Potential to Treat Pulmonary Fibrosis Using Single-Cell Sequencing and Primary Human Lung Macrophages
2023-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015104
PMID:37894784
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研究论文 | 本文提出了一种方法论来识别具有抗纤维化活性的天然化合物，潜在用于治疗肺纤维化 | 文章创新地利用单细胞测序和人肺巨噬细胞筛选抗纤维化化合物，为肺纤维化治疗提供新思路 | 研究中使用的人肺巨噬细胞来自硅肺病患者，可能影响结果的广泛适用性 | 识别能够促进巨噬细胞向抗纤维化转化的天然化合物 | 以特定的单细胞转录组数据为基础，研究巨噬细胞基因表达和反应 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 从整个肺洗液中回收的人肺巨噬细胞样本 |
| 16228 | 2024-08-07 |
Using LLMs and Explainable ML to Analyze Biomarkers at Single-Cell Level for Improved Understanding of Diseases
2023-10-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13101516
PMID:37892198
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研究论文 | 本文提出了一种结合大型语言模型（LLM）和可解释机器学习的方法，用于分析单细胞水平的生物标志物，以更好地理解疾病 | 本文的创新点在于使用LLM框架和可解释机器学习来促进单细胞数据集之间的泛化，并识别基因签名以捕捉疾病驱动的转录变化 | NA | 旨在通过分析单细胞RNA测序数据，提高对疾病相关细胞类型的识别和理解 | 单细胞RNA测序数据和疾病相关细胞类型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | scBERT | 转录组数据 | 使用了来自健康个体和溃疡性结肠炎患者的四个公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 16229 | 2024-08-05 |
The Overlooked Role of Specimen Preparation in Bolstering Deep Learning-Enhanced Spatial Transcriptomics Workflows
2023-Oct-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.09.23296700
PMID:37873287
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研究论文 | 本文探讨了改进的标本处理流程在深度学习增强的空间转录组学评估中的作用 | 提出了一种结合自动H&E染色和高分辨率全切片成像的新型标本准备流程 | 研究基于小规模的患者队列，可能影响结果的广泛适用性 | 研究如何通过改进的标本准备流程增强空间转录组学的可靠性和精确性 | 针对13例pT3期结直肠癌患者的组织样本进行深度学习模型的训练与评估 | 数字病理学 | 结直肠癌 | Visium CytAssist分析 | Inceptionv3神经网络 | 组织切片图像 | 13例结直肠癌患者 |
| 16230 | 2024-08-05 |
Feasibility of Inferring Spatial Transcriptomics from Single-Cell Histological Patterns for Studying Colon Cancer Tumor Heterogeneity
2023-Oct-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.09.23296701
PMID:37873186
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研究论文 | 本研究探讨了通过整合单细胞组织学和转录组数据推断结肠癌肿瘤异质性的空间mRNA表达模式的可行性 | 该研究提出了一种创新的方法，通过单细胞层面的组织学和转录组数据的协同共映射，提高了空间分子检测的分辨率 | 初步结果尚需严格验证，包括与病理学家合作以精确识别不同细胞类型 | 研究通过单细胞水平的整合分析，提升空间分子检测的效率与准确性 | 针对阶段pT3结肠癌患者的全幻灯片图像进行分析 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 图像 | NA |
| 16231 | 2024-08-07 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本文研究了神经发育转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，揭示了它们在调控GBM肿瘤细胞异质性和层次结构中的关键角色 | 首次展示了ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤细胞类型和迁移程度中的动态水平和相互结合作用，并通过单细胞RNA测序揭示了ASCL1在定义胶质瘤干细胞（GSCs）中的关键作用 | NA | 探讨ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中的调控作用及其对肿瘤细胞异质性和层次结构的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16232 | 2024-08-05 |
YAP/ACSL4 Pathway-Mediated Ferroptosis Promotes Renal Fibrosis in the Presence of Kidney Stones
2023-Oct-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102692
PMID:37893066
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研究论文 | 这项研究探讨了YAP/ACSL4通路介导的铁死亡如何促进肾结石引发的肾纤维化 | 首次阐明了YAP-ACSL4轴介导的铁死亡在钙草酸盐结晶沉积引发的肾纤维化中的作用及其分子机制 | 未提及具体的临床试验数据或长期影响评估 | 探讨钙草酸盐结石对肾纤维化的影响及其相关机制 | 钙草酸盐结石患者的肾组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、转录组RNA测序、免疫组化分析、西方 blot 分析 | NA | 组织样本 | 患者的肾组织和小鼠模型的样本 |
| 16233 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome and metagenome profiling reveals the genetic basis of rumen functions and convergent developmental patterns in ruminants
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278239.123
PMID:37884341
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和元基因组分析，揭示了反刍动物瘤胃功能和发育模式的遗传基础 | 构建了从胚胎早期到反刍阶段的全面转录组和元基因组图谱，重现了瘤胃的组织形态学和转录特征，揭示了瘤胃细胞、微生物群和核心转录调控网络发育的关键过渡特征 | NA | 研究瘤胃发育过程中的动态变化，并揭示其遗传基础 | 羊和山羊的瘤胃组织 | NA | NA | 单细胞转录组和元基因组分析 | NA | 转录组和元基因组数据 | 约308,000个细胞，来自17个时间点的羊和山羊瘤胃组织 |
| 16234 | 2024-08-07 |
An RNA-Scaffold Protein Subunit Vaccine for Nasal Immunization
2023-Sep-29, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101550
PMID:37896953
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研究论文 | 本文开发了一种自佐剂的蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗，用于鼻腔免疫，并在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中验证了其有效性 | 该疫苗结合了刺突RBD（作为抗原）、核蛋白（作为适配器）和ssRNA（作为佐剂和RNA支架），能强有力地诱导黏膜IgA、中和抗体和多功能T细胞，同时提供对活病毒挑战的灭菌免疫 | NA | 开发安全且有效的鼻腔疫苗以对抗呼吸道病毒感染 | 蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中的效果 | 疫苗学 | 呼吸道病毒感染 | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠和SARS-CoV-2感染模型 |
| 16235 | 2024-08-07 |
White Adipose Tissue Heterogeneity in the Single-Cell Era: From Mice and Humans to Cattle
2023-Sep-27, Biology
DOI:10.3390/biology12101289
PMID:37886999
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术研究白色脂肪组织在不同哺乳动物中的转录和功能细胞多样性，特别关注了牛的研究进展和未来方向 | 利用下一代测序技术进行单细胞RNA测序，揭示了人类和小鼠模型中白色脂肪组织的细胞异质性，并探讨了其在畜牧物种中的应用 | NA | 总结当前关于白色脂肪组织细胞多样性的知识，并强调其在不同哺乳动物物种中的特定功能 | 白色脂肪组织在不同哺乳动物中的细胞类型和功能 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 16236 | 2024-08-07 |
Robust Identification of Differential Gene Expression Patterns from Multiple Transcriptomics Datasets for Early Diagnosis, Prognosis, and Therapies for Breast Cancer
2023-09-24, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59101705
PMID:37893423
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研究论文 | 本研究通过综合稳健统计学和生物信息学方法，从多个转录组数据集中识别出与乳腺癌相关的差异表达基因，用于早期诊断、预后和治疗。 | 本研究采用稳健的统计方法来识别乳腺癌相关的关键基因，这些方法对异常值不敏感，提高了结果的可靠性。 | NA | 探索乳腺癌相关潜在的关键基因，并评估其在早期诊断、预后和治疗中的表现。 | 乳腺癌相关的差异表达基因及其在诊断、预后和治疗中的应用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 从三个微阵列（GSE26910, GSE42568, GSE65194）和一个单细胞RNA测序（GSE235168）数据集中识别出46个共同差异表达基因。 |
| 16237 | 2024-08-05 |
Emerging Insights into Molecular Mechanisms of Inflammation in Myelodysplastic Syndromes
2023-Sep-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102613
PMID:37892987
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综述 | 本文总结了慢性骨髓增生性疾病(MDS)中炎症信号的作用机制。 | 通过单细胞测序和多组学方法揭示了MDS进展中炎症信号及天然免疫反应的重要性。 | 本文未提供具体的实验数据来支持所讨论的机制。 | 探讨炎症在骨髓增生性疾病中的作用与机制。 | 主要关注骨髓微环境中炎症因子对造血干细胞(HSC)命运的影响。 | 数字病理 | 骨髓增生性疾病 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | NA | NA |
| 16238 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised leaning
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad383
PMID:37898127
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的新型深度学习框架VGAAE | 创新地引入了多头注意力机制和自监督学习以提高聚类质量 | 未提及模型在真实生物场景中的应用情况 | 研究希望改善单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 集中在单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分图注意自编码器（VGAAE） | NA | 在不同数据集上进行实验 |
| 16239 | 2024-08-07 |
Quantum annealing-based clustering of single cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad377
PMID:37874950
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研究论文 | 本文探讨了使用量子退火技术对单细胞RNA测序数据进行聚类分析的方法 | 提出了一种利用量子计算中的量子退火技术来探索聚类成本函数的新方法 | NA | 解决单细胞基因表达数据聚类分析中参数选择和算法选择的难题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 量子退火 | 量子计算 | 基因表达数据 | NA |
| 16240 | 2024-08-05 |
[Applications of single-cell analysis in blood research]
2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.64.1047
PMID:37899182
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研究论文 | 本文介绍了单细胞技术在血液研究中的应用及其成果 | 探讨了单细胞测序技术在血液研究中的最新进展 | NA | 总结单细胞分析在血液研究中的应用 | 单细胞水平的DNA序列、RNA和蛋白质表达水平及表观基因组修饰 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |