单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 16221 - 16240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16221 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unravels the transcriptional network underlying zebrafish retina regeneration
2023-Nov-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86507
PMID:37988404
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了斑马鱼视网膜再生过程中Müller胶质细胞、前体细胞及其再生后代的转录网络。 | 发现了损伤诱导的Müller胶质细胞分化轨迹，以及从混合细胞群出发的胶质自我更新和神经发生轨迹。 | NA | 研究Müller胶质细胞反应与前体细胞产生及神经元分化之间的分子机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未受伤和光照损伤的视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。 |
| 16222 | 2024-08-07 |
How to explore what is hidden? A review of techniques for vascular tissue expression profile analysis
2023-Nov-19, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01109-8
PMID:37981669
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综述 | 本文综述了用于血管组织表达谱分析的技术方法 | 讨论了单细胞RNA测序这一高通量技术在转录组分析中的应用及其对传导组织基因表达研究的影响 | NA | 探讨如何研究血管组织（如木质部和韧皮部）的分子基础及其分化过程 | 植物的血管组织，特别是木质部和韧皮部 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16223 | 2024-08-07 |
CDC7 inhibition induces replication stress-mediated aneuploid cells with an inflammatory phenotype sensitizing tumors to immune checkpoint blockade
2023-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43274-3
PMID:37980406
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研究论文 | 本研究探讨了CDC7抑制剂TAK-931的抗肿瘤效果及其对免疫调节的影响 | TAK-931通过诱导复制压力产生类似衰老的非整倍体细胞，这些细胞高表达炎症细胞因子和趋化因子，从而增强肿瘤对免疫检查点阻断的敏感性 | NA | 研究TAK-931的抗肿瘤特性和免疫调节机制 | TAK-931对肿瘤细胞的影响及其免疫调节作用 | NA | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，免疫数据 | NA |
| 16224 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals distinct fibroblast plasticity during tenocyte regeneration in zebrafish
2023-11-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5771
PMID:37967180
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼中不同类型的纤维母细胞，并探讨了它们在肌腱再生中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和激光诱导肌腱损伤模型，揭示了斑马鱼中纤维母细胞的多样性和可塑性，并证实了Hedgehog信号通路在纤维母细胞增殖和肌腱再生中的关键作用 | NA | 研究纤维母细胞在肌腱再生中的多样性和可塑性 | 斑马鱼中的纤维母细胞及其在肌腱再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16225 | 2024-08-07 |
CellDialog: A Computational Framework for Ligand-receptor-mediated Cell-cell Communication Analysis III
2023-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3333828
PMID:37976192
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研究论文 | 本文开发了一个名为CellDialog的计算框架，用于重建基于发送和接收细胞中配体和受体组合表达的细胞间连接网络，并通过三点位估计方法测量配体-受体介导的细胞间通信强度 | CellDialog通过配体-受体相互作用特征提取、选择和分类来捕获高置信度的配体-受体相互作用，并结合配体-受体过滤和单细胞RNA测序数据来测量细胞间通信强度 | NA | 开发一种新的计算框架，用于分析配体-受体介导的细胞间通信 | 配体-受体相互作用及其介导的细胞间通信 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16226 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas depicting the cellular and molecular features in human anterior cruciate ligamental degeneration: A single cell combined spatial transcriptomics study
2023-Nov-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85700
PMID:37970848
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研究论文 | 本文系统性识别了人类韧带的细胞类型，并探讨了其在韧带退化过程中的作用 | 本文识别了新的成纤维细胞亚群，揭示了韧带退化过程中的空间分布和动态轨迹 | NA | 研究韧带细胞身份、功能和相互作用如何参与韧带退化过程 | 大约49,356个健康和退化人类前交叉韧带细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间RNA测序 | NA | 细胞 | 大约49,356个细胞 |
| 16227 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA-seq to explore novel macrophage infiltration-associated biomarkers for diagnosis of heart failure
2023-11-16, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-023-03593-1
PMID:37974098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索与心力衰竭相关的巨噬细胞浸润标志物，以期为心力衰竭的诊断和治疗提供新视角 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与心力衰竭相关的五种不同分化状态的巨噬细胞亚群，并鉴定出四种有效的诊断标志物 | NA | 探索心力衰竭中与免疫细胞相关的诊断标志物，以深入了解其分子机制 | 心力衰竭患者与正常个体的免疫细胞差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 40名正常对照和40名心力衰竭患者 |
| 16228 | 2024-08-07 |
The molecular landscape of neurological disorders: insights from single-cell RNA sequencing in neurology and neurosurgery
2023-Nov-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01504-w
PMID:37974227
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经学和神经外科研究中的应用，特别是在脑肿瘤、神经退行性疾病、癫痫和脊髓疾病等领域的分子层面发现 | scRNA-seq技术揭示了神经系统和神经外科疾病中的细胞异质性、肿瘤微环境、治疗抵抗性和侵袭模式，以及神经退行性疾病和癫痫中的分子亚型和失调通路 | 数据分析、标准化、样本获取、可扩展性和成本效益等方面的挑战需要解决 | 探讨scRNA-seq在神经学和神经外科研究中的应用，以指导精准医学方法、识别临床生物标志物和促进治疗发现 | 脑肿瘤、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化症）、癫痫和脊髓疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16229 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the reproductive variations between primiparous and multiparous Hu ewes
2023-Nov-14, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-023-00941-1
PMID:37964337
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研究论文 | 本研究揭示了在单胎和多胎胡羊之间的生殖差异的分子机制 | 研究识别并分析了高产和低产组胡羊卵巢颗粒细胞的基因表达差异 | 样本量较小，仅为3只羊，可能影响结果的广泛适用性 | 研究胡羊生殖性能的遗传机制，以促进高产量羊的选择和育种 | 研究对象为高产和低产的胡羊，及其卵巢颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 10× Genomics单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6只羊(每组3只) |
| 16230 | 2024-08-07 |
Similarity-assisted variational autoencoder for nonlinear dimension reduction with application to single-cell RNA sequencing data
2023-Nov-14, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05552-1
PMID:37964243
|
研究论文 | 本文提出了一种新的方法，将相似性信息引入变分自编码器（VAE）框架中，用于非线性降维，特别是在单细胞RNA测序数据中的应用 | 本文的创新点在于将相似性信息融入VAE框架，并扩展到条件VAE以考虑协变量效应，从而在降维步骤中产生更清晰的聚类结构 | VAE在没有额外注释信息的情况下，通常不能清晰地显示聚类模式 | 研究目的是开发一种新的非线性降维方法，以更好地可视化和分析大规模数据集，如单细胞RNA测序数据 | 研究对象是单细胞RNA测序数据，旨在揭示潜在的聚类模式或识别异常值 | 机器学习 | NA | RNA-seq | VAE | 数据 | NA |
| 16231 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the heterogeneity of cancer-associated fibroblasts in TNBC
2023-11-13, Aging
DOI:10.18632/aging.205205
PMID:37963845
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研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌（TNBC）中癌相关成纤维细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和散装RNA测序的整合分析揭示TNBC中CAFs的亚群及其功能特征 | 样本数量相对较少，仅包括6个TNBC患者和3个正常乳腺组织，有待进一步验证 | 探讨三阴性乳腺癌中的异质性及其潜在来源 | TNBC患者的单细胞RNA数据和正常乳腺样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无 | 基因表达数据 | 9个样本（6个TNBC患者和3个正常乳腺组织） |
| 16232 | 2024-08-05 |
Single-Nucleus RNA-Sequencing in Brain Tissue
2023-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.919
PMID:37987152
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研究论文 | 本研究提供了一种用于脑组织单核RNA测序的实验协议 | 提出了单核RNA测序的方法，以克服单细胞悬液准备中的技术挑战 | 文中没有详细讨论样本规模的限制 | 研究脑组织细胞类型特异性转录分析 | 脑组织中的单核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 16233 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell transcriptome analysis provides new insights into post-COVID-19 pulmonary fibrosis and potential therapeutic targets
2023-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29201
PMID:37966390
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了COVID-19患者、特发性肺纤维化（IPF）患者及接受抗纤维化药物治疗的转化生长因子β1诱导的纤维化模型大鼠的肺组织，旨在发现PCPF的新治疗靶点 | 研究揭示了巨噬细胞在IPF和COVID-19发展及进展中的关键作用，并发现纤维化和炎症相关基因在两种情况下均上调 | NA | 识别PCPF的新治疗靶点 | COVID-19患者、IPF患者及大鼠纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者、IPF患者及大鼠纤维化模型的肺组织样本 |
| 16234 | 2024-08-07 |
[What if the origin of FAPs was contributing to their heterogeneity in muscle?]
2023-Nov, Medecine sciences : M/S
DOI:10.1051/medsci/2023129
PMID:37975765
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研究论文 | 本文探讨了纤维脂肪原细胞（FAPs）在肌肉中的异质性及其潜在的肌肉外来源 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了FAPs在不同条件下的亚群及其功能，并探讨了脂肪组织中的间充质干细胞可能对FAP异质性的贡献 | NA | 研究FAPs在肌肉中的异质性及其潜在的肌肉外来源 | 纤维脂肪原细胞（FAPs）及其在肌肉中的亚群和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 16235 | 2024-08-05 |
Transcriptional profiles reveal histologic origin and prognosis across 33 The Cancer Genome Atlas tumor types
2023-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-234
PMID:37969389
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研究论文 | 研究揭示了通过转录组特征可以区分不同组织来源的肿瘤及其预后 | 通过使用肿瘤组织特异性基因集(TTSGs)，为肿瘤的组织起源和细胞干性提供了一种新的评估方法 | 研究的样本主要来源于TCGA，可能无法全面反映所有肿瘤类型的特性 | 旨在识别可以用于评估肿瘤组织起源和细胞干性的分子特征 | 从33种肿瘤类型中选取了9,875名患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | NA | RNA表达数据分析 | t-SNE和kNN算法 | 基因表达数据 | 9,875名患者的33种肿瘤类型数据 |
| 16236 | 2024-08-07 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 评估造血干细胞移植（HSCT）受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的体液和适应性免疫反应 | 揭示了移植受者在记忆T细胞群体中存在缺陷，这些缺陷与T细胞反应缺失相关 | 样本量相对较小，且仅包括HSCT受者和少数健康对照 | 研究SARS-CoV-2 mRNA疫苗在造血干细胞移植受者中的疗效 | 造血干细胞移植受者和健康对照对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR和BCR测序 | NA | 血液样本 | 42名造血干细胞移植受者和5名健康对照 |
| 16237 | 2024-08-07 |
Exploring the Shared Gene Signatures and Molecular Mechanisms between Bladder Urothelial Carcinoma and Metabolic Syndrome
2023-Oct, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
|
研究论文 | 本研究旨在探讨膀胱尿路上皮癌（BLCA）与代谢综合征（MS）之间的共同基因特征及潜在分子机制 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和逻辑最小绝对收缩与选择算子（LASSO）回归模型，筛选并验证了五个关键基因，并分析了它们在BLCA和MS中的表达及与临床病理特征和预后的关系 | NA | 探索膀胱尿路上皮癌与代谢综合征之间的共同基因特征及潜在分子机制 | 膀胱尿路上皮癌和代谢综合征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 逻辑最小绝对收缩与选择算子（LASSO）回归模型 | 转录组数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的BLCA和MS的转录组数据，以及TCGA-BLCA队列的数据 |
| 16238 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Analysis for Thymic Epithelial Cells of Aged Mice and Humans
2023-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2023.23.e36
PMID:37970235
|
研究论文 | 本文通过全面的转录组分析，研究了老年小鼠和人类胸腺上皮细胞的生物学特性 | 首次在跨物种层面上验证了老年胸腺上皮细胞中的变化，并揭示了新的潜在机制 | NA | 探讨老年胸腺上皮细胞功能障碍的精确机制及其在人类和小鼠中的共性 | 老年小鼠和人类的胸腺上皮细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的胸腺上皮细胞，以及公开的人类胸腺上皮细胞单细胞RNA测序数据 |
| 16239 | 2024-08-05 |
[Identification of SULF1 as a Shared Gene in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
and Lung Adenocarcinoma]
2023-Sep-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究鉴定了在特发性肺纤维化和肺腺癌中共享的基因SULF1 | 文章创新性在于识别SULF1作为具有潜在免疫相关生物标志物和治疗靶点的共享基因 | 本研究可能在样本量和多样性方面存在局限性，具体的临床应用仍需进一步验证 | 探索IPF与肺腺癌之间的共享致病基因和分子通路 | 研究对象为特发性肺纤维化（IPF）和肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共识别出529个共享基因 |
| 16240 | 2024-08-07 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Merkel细胞癌患者的免疫治疗耐受性进行了纵向多组学分析，识别了T细胞、B细胞和单核细胞的反应特征。 | 首次通过纵向多组学研究揭示了Merkel细胞癌患者免疫治疗耐受性的细胞特征和动态变化。 | 研究样本量较小，仅包括四个时间点的外周血样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究Merkel细胞癌患者免疫逃逸的机制及促进免疫逃避的恶性细胞条件。 | Merkel细胞癌患者的免疫细胞反应和耐药性机制。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个时间点的外周血样本 |