单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
16201	2024-08-07	Unraveling the prognostic significance and molecular characteristics of tumor-infiltrating B lymphocytes in clear cell renal cell carcinoma through a comprehensive bioinformatics analysis 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1238312 PMID:37908350	研究论文	本研究通过综合生物信息学分析，探索了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后意义和分子特征	本研究首次系统地探讨了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征，并提出了一个10基因标志物	需要进一步研究以明确肿瘤浸润B淋巴细胞在透明细胞肾细胞癌患者预后和治疗中的具体影响	探索透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征	透明细胞肾细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞	数字病理学	肾细胞癌	xCell算法, WGCNA方法, scRNA-seq数据分析	NA	转录组数据	使用了TCGA-KIRC和其他透明细胞肾细胞癌转录组数据集
16202	2024-08-07	Construction and validation of a novel senescence-related risk score can help predict the prognosis and tumor microenvironment of gastric cancer patients and determine that STK40 can affect the ROS accumulation and proliferation ability of gastric cancer cells 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1259231 PMID:37915566	研究论文	本研究构建并验证了一种新型衰老相关风险评分，有助于预测胃癌患者的预后和肿瘤微环境，并确定STK40能影响胃癌细胞的ROS积累和增殖能力	本研究通过WGCNA算法和Lasso-Cox算法筛选出KL、SERPINE1和STK40作为构建预后模型的关键基因，并利用SSGSEA算法评估不同患者中免疫细胞和免疫功能的浸润及其与风险评分的关联	NA	评估胃癌患者的预后和免疫治疗效果	胃癌患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胃癌	WGCNA算法, Lasso-Cox方法, SSGSEA算法, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
16203	2024-08-07	Hepatitis B surface antigen reduction is associated with hepatitis B core-specific CD8+ T cell quality 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1257113 PMID:37920475	研究论文	研究了慢性乙型肝炎（CHB）患者在接受核苷（酸）类似物（NUC）治疗期间，CD8 T细胞的特性及其与乙型肝炎表面抗原（HBsAg）水平的关系	揭示了HBV特异性CD8 T细胞在患者体内的质量差异，并发现HBcore特异性CD8 T细胞的多功能性与HBsAg水平呈负相关	研究样本量较小，且仅限于特定病毒基因型的患者	探讨CD8 T细胞在CHB患者中的作用及其对HBsAg水平的影响	慢性乙型肝炎患者的CD8 T细胞及其与HBsAg的关系	免疫学	乙型肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色流式细胞术	NA	RNA	6名捐赠者的CD69 CD8 T细胞用于scRNA-seq分析，26名捐赠者的PBMCs用于HBV特异性CD8 T细胞检测
16204	2024-08-07	Identification of Cell-Cell Communications by Single-Cell RNA Sequencing in End Stage Renal Disease Provides New Insights into Immune Cell Heterogeneity 2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S424911 PMID:37927961	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的细胞间通讯，揭示了免疫细胞异质性的新见解	本研究首次通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的免疫细胞异质性及其细胞间通讯，发现了MIF信号通路在Th17/Treg细胞间通讯中的重要作用	NA	揭示慢性肾脏病进展过程中免疫细胞功能、组成及细胞间通讯的改变	终末期肾病患者及健康对照组的外周血单个核细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括常规血液透析患者和健康对照组的临床数据、血清及外周血单个核细胞样本
16205	2024-08-05	Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer 2024-Jan, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mc.23631 PMID:37877736	研究论文	这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制	首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系	样本量仅限于五名患者，可能影响结果的普遍性	探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用	四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本	数字病理学	乳头状甲状腺癌	单细胞RNA测序	NA	细胞基因表达数据	五名患者（包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者）
16206	2024-08-07	Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy 2024-Jan, Psychoneuroendocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412 PMID:37898037	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病诱导认知障碍模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化	首次详细分析了长期高血糖状态下海马细胞群的异质性，并揭示了特定细胞亚群及其基因表达特征	研究仅限于db糖尿病小鼠模型，结果的普遍性和临床应用需进一步验证	探讨糖尿病诱导认知障碍中海马细胞的异质性和突触可塑性变化	db糖尿病小鼠的海马细胞	神经科学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	认知障碍组21,379个细胞，对照组20,045个细胞
16207	2024-08-05	Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages 2023-Nov-20, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011 PMID:37875117	研究论文	本文探讨了α-1肾上腺素信号在斑马鱼巨噬细胞中的心脏再生和细胞外基质重塑转录程序的机制	发现α-1肾上腺素受体在心脏损伤后调节巨噬细胞表型多样化，推动细胞外基质重塑	尚未探究不同条件下神经调节对再生过程的影响	揭示自律神经系统在心脏修复中的作用机制	斑马鱼的巨噬细胞及其在心脏损伤后的反应	数字病理学	NA	药理学方法，基因操控，单细胞转录组测序	NA	NA	NA
16208	2024-08-07	Circulating small extracellular vesicle-derived splicing factor 3b subunit 4 as a non-invasive diagnostic biomarker of early hepatocellular carcinoma 2023-Oct-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-023-02867-y PMID:37899451	研究论文	本研究评估了剪接因子3b亚基4（SF3B4）作为肝细胞癌（HCC）新型非侵入性生物标志物的诊断价值，并探讨了SF3B4表达与免疫细胞浸润的关联	SF3B4在血浆中的表达水平在HCC患者中显著高于健康对照组，且EV-SF3B4在HCC的诊断性能优于α-胎蛋白（AFP）	SF3B4蛋白和自身抗体在HCC患者血浆中的诊断性能并未优于α-胎蛋白（AFP）	评估SF3B4作为HCC非侵入性诊断生物标志物的价值及其与免疫细胞浸润的关联	肝细胞癌（HCC）患者及健康对照组的血浆样本	NA	肝细胞癌	酶联免疫吸附试验（ELISA）、定量逆转录PCR	NA	血浆样本	健康对照组和不同阶段的HCC患者
16209	2024-08-05	Spatiotemporal evolution of AML immune microenvironment remodeling and RNF149-driven drug resistance through single-cell multidimensional analysis 2023-10-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-023-04579-5 PMID:37891580	研究论文	通过单细胞多维分析，分析急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的构成及RNF149驱动的药物耐药性演变	首次揭示了RNF149在急性髓性白血病进展中的作用及其对免疫微环境的影响	未能完全探索所有E3泛素连接酶相关基因对药物耐药的影响	探讨急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的组成及其在药物耐药中的作用	急性髓性白血病患者的骨髓免疫微环境中不同T细胞亚群	数字病理学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	多个单细胞RNA测序数据集
16210	2024-08-05	Selective control of transposable element expression during T cell exhaustion and anti-PD-1 treatment 2023-10-27, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adf8838 PMID:37889984	研究论文	该文章分析了在慢性感染和癌症中，T细胞耗竭和抗PD-1治疗期间转座元件的表达情况	揭示了在T细胞耗竭过程中，转座元件表达的选择性调控及其作为免疫检查点抑制反应生物标志物的潜力	本研究主要基于小鼠和人类的TIL亚群，可能限制了结果的广泛适用性	研究在T细胞耗竭过程中转座元件的表达及其在抗PD-1治疗中的角色	小鼠和人类的CD8肿瘤浸润性T淋巴细胞	数字病理学	癌症	转录组学	NA	RNA数据	NA
16211	2024-08-07	The structural and functional complexity of the integrative hypothalamus 2023-10-27, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adh8488 PMID:37883552	review	本文概述了哺乳动物下丘脑的组织结构、发育和连接	利用单细胞RNA测序研究和现代光子工具，揭示了下丘脑细胞异质性和复杂电路的高分辨率解析	NA	帮助新进入者了解这一激动人心的领域	哺乳动物的下丘脑	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
16212	2024-08-07	Prediction of Prognosis and Immunotherapy Response with a Novel Natural Killer Cell Marker Genes Signature in Osteosarcoma 2023-Oct-27, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals DOI:10.1089/cbr.2023.0103 PMID:37889617	研究论文	本文构建了一种基于自然杀伤细胞标记基因的新型签名，用于预测骨肉瘤患者的预后和免疫治疗反应	开发了一种基于自然杀伤细胞标记基因的五基因预后签名，用于预测骨肉瘤患者的生存和免疫治疗反应	NA	构建一种新的基于自然杀伤细胞的签名，以识别对免疫治疗更敏感的骨肉瘤患者	骨肉瘤患者	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	LASSO Cox回归分析	基因表达数据	共八个公开的骨肉瘤患者数据集
16213	2024-08-05	Immunological role and clinical prognostic significance of P2RY6 in lung adenocarcinoma: a multi-omics studies and single-cell sequencing analysis 2023-Oct-26, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-023-03216-1 PMID:37880703	研究论文	本研究探讨了P2RY6在肺腺癌中的免疫学作用及其临床预后意义	P2RY6在肺腺癌中高度表达且与患者预后相关，开发了基于P2RY6的炎症预测模型	目前尚不清楚P2RY6在其他类型肿瘤中的作用	研究P2RY6在肺腺癌中的作用及其作为免疫治疗新靶点的可能性	采用肿瘤基因组数据库中的数据分析P2RY6的异常状态及其预后价值	数字病理学	肺癌	单细胞转录组测序，甲基化测序	NA	转录组数据，基因组数据	涉及多种癌症组织样本，特指肺腺癌
16214	2024-08-07	Metabolic and senescence characteristics associated with the immune microenvironment in non-small cell lung cancer: insights from single-cell RNA sequencing 2023-10-26, Aging DOI:10.18632/aging.205146 PMID:37889543	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了非小细胞肺癌中的细胞类型及其与免疫微环境的关系	利用单细胞RNA测序技术揭示了非小细胞肺癌中细胞组成的基线图谱和功能表型	NA	深入理解非小细胞肺癌中细胞成分的复杂性和肿瘤微环境的异质性	非小细胞肺癌样本中的细胞类型及其与免疫微环境的关系	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	两个与非小细胞肺癌相关的单细胞RNA测序数据集
16215	2024-08-05	Characteristics of premanufacture CD8+T cells determine CAR-T efficacy in patients with diffuse large B-cell lymphoma 2023-10-25, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-023-01659-2 PMID:37875502	研究论文	该文章探讨了预制CD8+T细胞的特征如何决定CAR-T在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的疗效	通过分析预制T细胞的细胞和分子特征，揭示了其在CAR-T细胞治疗中疗效差异的分子基础	该研究为回顾性分析，结果可能受到样本选择和数据偏倚的影响	揭示CAR-T细胞治疗中的变化并识别反应生物标志物	58例接受CD19/CD20双靶向CAR-T细胞治疗的复发/难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者	数字病理学	弥漫性大B细胞淋巴瘤	RNA-Seq，单细胞RNA-Seq，配对T细胞受体测序	NA	细胞，分子数据	58例患者的先制T细胞和CAR-T细胞产品
16216	2024-08-07	Multi-omics characteristics of tumor-associated macrophages in the tumor microenvironment of gastric cancer and their exploration of immunotherapy potential 2023-10-25, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-38822-2 PMID:37880233	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序筛选肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的标记基因，并结合胃癌（GC）转录组数据，分析不同亚型患者的临床特征、预后差异、免疫浸润和药物敏感性，构建了胃癌的预后模型。	本研究发现了MDMs中的突变如CGN、S100A6和C1QA，并揭示了不同胃癌亚型中免疫细胞和免疫检查点的浸润差异，构建了高准确性的预测评分系统。	NA	探索肿瘤相关巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的多组学特征及其在免疫治疗中的潜力。	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和胃癌（GC）患者。	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	不同数据集中的不同亚型胃癌患者
16217	2024-08-07	Decoding the metastatic potential and optimal postoperative adjuvant therapy of melanoma based on metastasis score 2023-Oct-25, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-023-01678-6 PMID:37880239	研究论文	本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个用于预测黑色素瘤转移潜力的转移评分（MET评分），并通过多种机器学习算法验证其可靠性和稳健性。	本研究首次构建了一个基于机器学习算法的转移评分（MET评分），用于准确预测非转移性黑色素瘤的转移潜力和确定有效的术后辅助治疗。	NA	研究旨在准确预测非转移性黑色素瘤的转移潜力，并确定有效的术后辅助治疗以抑制转移。	研究对象为非转移性黑色素瘤（NMM）及其转移潜力。	数字病理学	黑色素瘤	RNA测序	机器学习算法	RNA测序数据	NA
16218	2024-08-07	Construction and validation of a novel prognostic model of neutrophil‑related genes signature of lung adenocarcinoma 2023-10-25, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-45289-8 PMID:37880277	研究论文	本研究旨在探索肺腺癌中的中性粒细胞相关基因（NRGs），并开发一种预测肺腺癌预后的预测模型	本研究通过结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序数据，构建了一个新的中性粒细胞相关基因的预后模型	NA	探索肺腺癌中的中性粒细胞相关基因，并开发预后预测模型	肺腺癌中的中性粒细胞相关基因	数字病理学	肺腺癌	RNA测序	Cox回归模型	RNA序列数据	NA
16219	2024-08-07	Unveiling adcyap1 as a protective factor linking pain and nerve regeneration through single-cell RNA sequencing of rat dorsal root ganglion neurons 2023-10-25, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-023-01742-8 PMID:37880634	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了Adcyap1在大鼠背根神经节神经元中作为疼痛和神经再生的保护因子的作用	首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了Adcyap1在疼痛和神经再生之间的内在联系，并验证了其在疼痛缓解和神经再生中的作用	研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中进行验证	探索外周神经损伤后疼痛和神经再生之间的内在联系，并寻找潜在的分子治疗靶点	大鼠背根神经节神经元	数字病理学	神经疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个时间点的SNC和正常大鼠的背根神经节
16220	2024-08-07	Decoding meningioma heterogeneity and neoplastic cell-macrophage interaction through single-cell transcriptome profiling across pathological grades 2023-10-25, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-023-04445-4 PMID:37880655	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了不同病理类型脑膜瘤的异质性和肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用	首次揭示了脑膜瘤中肿瘤细胞的高异质性和不同生物学功能，以及肿瘤细胞与巨噬细胞之间的关键相互作用	研究样本量较小，且仅限于特定类型的脑膜瘤	探究脑膜瘤的异质性和肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用	不同病理类型的脑膜瘤样本	数字病理学	脑膜瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	五种不同病理类型的脑膜瘤样本