单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16181 - 16200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16181 | 2024-08-07 |
SAA suppresses α-PD-1 induced anti-tumor immunity by driving TH2 polarization in lung adenocarcinoma
2023-11-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06198-w
PMID:37925492
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肺腺癌干细胞的特征，并探讨其与免疫微环境的相互作用 | 首次揭示了肺腺癌干细胞通过分泌急性期蛋白SAA重塑肿瘤微环境，并通过P2X7受体驱动类型2免疫极化，从而促进治疗抵抗和肿瘤纤维化 | NA | 探究肺腺癌干细胞与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤发展的影响 | 肺腺癌干细胞及其分泌的SAA对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用公开数据集进行分析 |
| 16182 | 2024-08-05 |
Annotation of cell types (ACT): a convenient web server for cell type annotation
2023-11-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01249-5
PMID:37924118
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研究论文 | 本研究开发了一个便利的网络服务器ACT，用于细胞类型标注。 | 提出了一种基于分层组织标记图和加权整合基因集富集方法WISE的新策略，显著提升了细胞类型标注的准确性和速度 | 目前的研究主要依赖于输入简单的上调基因列表，对于其他类型的数据可能不适用 | 旨在提高单细胞数据集的分析和解释能力，改进细胞类型标注流程 | 从7000多篇文献中手动整理的26000个细胞标记条目 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16183 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing and population-based studies reveals hand osteoarthritis-associated chondrocyte subpopulations and pathways
2023-11-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00292-7
PMID:37914703
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和人群研究相结合的方法，揭示了手骨关节炎相关的软骨细胞亚群及其通路 | 发现了新的具有炎症调节潜力的亚群——炎症软骨细胞，并揭示了铁死亡途径在手骨关节炎中的重要作用 | NA | 揭示手骨关节炎的分子机制及潜在治疗靶点 | 手骨关节炎患者的指间关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 105,142个细胞，5个骨关节炎软骨样本和5个非骨关节炎软骨样本，以及UK Biobank中的332,668名参与者和湘雅骨关节炎研究中的1,241名参与者 |
| 16184 | 2024-08-07 |
KMD clustering: robust general-purpose clustering of biological data
2023-11-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05480-z
PMID:37919399
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研究论文 | 本文介绍了一种名为k最小距离（KMD）聚类的通用生物数据聚类方法 | KMD聚类基于单链接和平均链接层次聚类的泛化，引入了一种广义的类似轮廓函数来消除隐秘的超参数k，并使用采样技术应用于百万对象数据集 | NA | 开发一种适用于各种生物数据类型的通用且稳健的聚类方法 | 生物数据，包括模拟数据、质谱流式细胞术数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 聚类算法 | KMD聚类 | 生物数据 | 百万对象数据集 |
| 16185 | 2024-08-05 |
Deficiency of Complement C3a and C5a receptors Does Not Prevent Angiotensin II-Induced Hypertension and Hypertensive End-Organ Damage
2023-Nov-01, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 该文章探讨了补体C3a和C5a受体在高血压及其导致的肾脏损伤中的作用 | 文章提出C3aR/C5aR1轴在Ang II诱导的高血压中并没有发挥作用，从而挑战了治疗高血压疾病时针对过敏源受体的概念 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能无法完全模拟人类高血压的复杂性 | 深入理解针对C3aR和C5aR1受体在高血压治疗中的潜力 | 研究对象为接受手术的高血压患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 高血压 | 单细胞测序和免疫组化 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及人类患者和多个小鼠模型的组织样本 |
| 16186 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Novel Cellular Factors for Response to Immunosuppressive Therapy in Aplastic Anemia
2023-Nov, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1097/HS9.0000000000000977
PMID:37908861
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了健康对照组和再生障碍性贫血（AA）患者骨髓中的细胞因子，揭示了免疫抑制治疗（IST）反应的潜在细胞标志物。 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究AA患者骨髓细胞，发现了与IST反应相关的CD8 T细胞和T细胞激活的细胞间相互作用。 | 研究仅限于诊断时的骨髓样本，未涉及治疗过程中的动态变化。 | 探究再生障碍性贫血的发病机制及免疫抑制治疗的抵抗机制。 | 健康对照组和再生障碍性贫血患者的骨髓细胞。 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 健康对照组和AA患者的骨髓样本 |
| 16187 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed potential targets for immunotherapy studies in hepatocellular carcinoma
2023-11-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46132-w
PMID:37914817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据构建了肝细胞癌的单细胞全景图谱，并分析了不同细胞在肝细胞癌中的信号通路富集情况和细胞亚群的发展轨迹 | 本研究发现了新的肝细胞癌细胞簇和表达HP的粒细胞簇，这些新发现的细胞簇可能对免疫治疗研究具有潜在意义 | NA | 旨在揭示肝细胞癌的单细胞异质性，并发现新的细胞簇及其在免疫治疗研究中的潜在应用 | 肝细胞癌的肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27个肝细胞癌肿瘤组织和4个邻近非肿瘤组织，以及374个TCGA-肝细胞癌样本 |
| 16188 | 2024-08-05 |
In-organoid single-cell CRISPR screening reveals determinants of hepatocyte differentiation and maturation
2023-10-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03084-8
PMID:37907970
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研究论文 | 本研究开发了一种基于类器官的单细胞CRISPR筛选框架，以揭示肝细胞分化和成熟的遗传决定因素。 | 创新性地使用了调控活性作为读出，以解析类器官中基因敲除的效应，并识别出已知和新发现的正负调节因子 | 在单细胞测序中，由于噪音和掉失，转录因子的表达水平难以准确估计，这限制了关键调节因子的识别 | 全面了解肝细胞分化和成熟的遗传决定因素 | 主要研究成人干细胞衍生的肝类器官及其转录组 | 数字病理学 | NA | CRISPR | NA | 转录组数据 | 80,576个细胞，246个相关干扰 |
| 16189 | 2024-08-05 |
HArmonized single-cell RNA-seq Cell type Assisted Deconvolution (HASCAD)
2023-10-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01674-w
PMID:37907883
|
研究论文 | 本文介绍了一种深度神经网络模型HASCAD，用于预测多达15种免疫细胞类型的细胞成分。 | HASCAD使用Harmony-Symphony策略处理批次效应，提供了一种新的细胞成分去卷积方法，优于当前流行的CCD方法。 | 研究中提到的局限性未在摘要中明确列出。 | 研究的目的是优化细胞组成去卷积，以提高对免疫细胞异质性影响的分析能力。 | 研究对象主要是针对免疫细胞类型的细胞成分和肝癌样本的RNA-seq数据。 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 包括多个模拟的bulk RNA-seq数据集和三个人类PBMC RNA-seq数据集 |
| 16190 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis reveals XCL2 as a cancer prognosis and immune infiltration-related biomarker
2023-10-30, Aging
DOI:10.18632/aging.205156
PMID:37905956
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研究论文 | 本研究揭示了XCL2作为癌症预后和免疫浸润相关的生物标志物 | 此研究首次全面分析了XCL2在多种癌症中的表达、预后关系及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究对XCL2的功能及其在各种疾病条件下的机制探讨仍然不足 | 探索XCL2在癌症中的作用及其作为潜在生物标志物的可能性 | XCL2在33种癌症中的表达、突变状态及与生存时间的关系 | 数字病理学 | 癌症 | 生物信息学 | NA | 人类样本及孤立癌细胞的实验数据 | 33种癌症相关的样本 |
| 16191 | 2024-08-07 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在视网膜生理学和疾病生物学中的应用 | scRNA-seq技术能够详细研究视网膜细胞的复杂动态，揭示细胞亚群及其在疾病发生和进展中的作用 | NA | 深入理解视网膜疾病，特别是通过研究视网膜细胞异质性 | 视网膜细胞及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16192 | 2024-08-07 |
Construction and Validation of a Prognostic Model of Metabolism-Related Genes Driven by Somatic Mutation in Bladder Cancer
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810242
PMID:37919060
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，基于膀胱癌患者的转录组数据，构建并验证了一个由体细胞突变驱动的与代谢相关基因的预后模型 | 本研究构建了一个新的基于临床和分子因素的预后模型，该模型与代谢重编程相关，有望改善膀胱癌患者的独立预后指标预测和管理 | NA | 利用生物信息学方法建立基于代谢相关基因的膀胱癌预后模型，筛选潜在的生物标志物 | 膀胱癌患者的代谢相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR） | Cox回归分析 | 转录组数据 | 201个差异表达的代谢相关基因 |
| 16193 | 2024-08-05 |
[Characterization of Cell Subsets Associated With Prognosis of Osteosarcoma Based on Single-Cell Sequencing Data]
2023-Oct, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.15573
PMID:37927019
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研究论文 | 本研究旨在通过分析不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本的细胞组成，探讨与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 首次建立了基于巨噬细胞分化的差异表达基因的预后模型，揭示了巨噬细胞亚群与骨肉瘤预后的密切关系 | 研究主要依赖于单细胞测序数据，样本量以及不同患者的异质性可能影响结果的普遍适用性 | 探索与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 不同骨肉瘤患者的样本 |
| 16194 | 2024-08-07 |
Infernape uncovers cell type-specific and spatially resolved alternative polyadenylation in the brain
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277864.123
PMID:37907328
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研究论文 | 本文介绍了Infernape工具，用于从单细胞和空间转录组数据中推断和量化多聚腺苷酸化位点（PA）的使用，并在小鼠大脑中展示了其应用 | Infernape首次系统地揭示了大脑中细胞类型特异性和空间解析的替代多聚腺苷酸化 | NA | 研究大脑中细胞类型特异性和空间分布的差异多聚腺苷酸化位点（PA）的使用 | 小鼠大脑中的多聚腺苷酸化位点（PA） | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑样本 |
| 16195 | 2024-08-05 |
Research progress of single-cell sequencing in tuberculosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276194
PMID:37901241
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研究论文 | 这篇文章综述了单细胞测序在结核病研究中的进展 | 强调了单细胞测序技术在揭示结核病发病机制及免疫反应中的不同应用 | 文章提到各种技术的应用限制，但具体限制细节未详述 | 深入理解结核病研究中的空白和潜在的未来发展 | 单细胞测序技术在结核病的发病机制和免疫反应中的应用 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16196 | 2024-08-05 |
Cardiac cellular diversity and functionality in cardiac repair by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1237208
PMID:37920179
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评论 | 这篇文章总结了单细胞转录组学在心脏修复中的主要发现 | 探讨了心脏细胞异质性及其在心肌缺血修复过程中的作用 | 文章未提供新的实验数据，仅为文献综述 | 旨在探讨心脏修复机制及开发新的治疗方法 | 涵盖心脏细胞类型、成分动态和与缺血相关的分子特征 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 16197 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis technologies for cancer research: from tumor-specific single cell discovery to cancer therapy
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1276959
PMID:37900181
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综述 | 该文章探讨了单细胞测序(SCS)技术在癌症研究中的应用及其临床优势 | 文章系统性地研究了多种单细胞技术的基础概念、过程步骤及其在癌症治疗中的独特临床优势 | 尽管SCS技术具有改变癌症研究的潜力，但在管理和分析大规模数据方面仍面临挑战 | 突出SCS在癌症研究中的关键作用，并促进单细胞技术在癌症治疗中的应用 | 单细胞，包括循环肿瘤细胞(CTCs)、谱系追踪、肿瘤异质性、耐药性及肿瘤免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序(SCS) | NA | 单细胞数据 | 成千上万到百万的单细胞 |
| 16198 | 2024-08-05 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文回顾了黑色素瘤中预后和预测免疫生物标志物检测的不同技术 | 强调了多种方法用于表征黑色素瘤的免疫微环境并提供新型生物标志物 | 未明确提及具体的实验数据或样本规模 | 改善黑色素瘤的免疫生物标志物的检测方法 | 研究不同技术如何检测黑色素瘤中的生物标志物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱、空间转录组学、基于人工智能的图像分析 | NA | NA | NA |
| 16199 | 2024-08-07 |
Proposing a novel molecular subtyping scheme for predicting distant recurrence-free survival in breast cancer post-neoadjuvant chemotherapy with close correlation to metabolism and senescence
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1265520
PMID:37900131
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研究论文 | 本研究提出了一种新的分子分型方案，用于预测乳腺癌患者在接受新辅助化疗后的无远处复发生存期，该方案与肿瘤代谢和细胞衰老密切相关。 | 本研究结合生物信息学和机器学习方法，通过综合分析确定了与乳腺癌远处复发相关的关键基因，并开发了一种新的分子分型方案。 | NA | 优化乳腺癌患者在接受新辅助化疗后远处复发的监测方案。 | 乳腺癌患者的无远处复发生存期。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列数据分析、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 101种算法组合 |
| 16200 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific molecular characterization of cells from circulation and kidney in IgA nephropathy with nephrotic syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1231937
PMID:37908345
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞的细胞类型特异性分子特征 | 首次系统地分析了肾病综合征IgA肾病患者的循环系统和肾脏组织的分子事件，为未来的靶向治疗提供了新的见解 | NA | 探究肾病综合征IgA肾病的细胞和分子状态 | 患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 儿童患者 |