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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 1601 - 1620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137515
PMID:39947082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析PFOS暴露对斑马鱼幼虫组织特异性转录组的影响 | 首次使用单细胞RNA-seq揭示PFOS在斑马鱼幼虫中诱导的组织特异性转录组变化，并发现消化器官、肌肉和耳石是受影响最显著的组织 | 研究局限于单一浓度（16 µM）和短期暴露（3-72小时），未测试剂量-反应关系或长期效应 | 探究全氟辛烷磺酸（PFOS）对斑马鱼幼虫发育毒性的组织特异性分子机制 | 斑马鱼幼虫（Danio rerio） | 机器学习 | 发育毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 暴露于16 µM PFOS或0.01% DMSO的斑马鱼幼虫，共检测27,698个基因，其中2,390个差异表达 | 10x Genomics | 单细胞转录组 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1602 | 2026-04-28 |
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08973-5
PMID:40335697
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research paper | 本研究利用单细胞技术揭示癌基因异常驱动髓母细胞瘤进展而非起始的过程 | 首次通过单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序和空间转录组学技术，证明大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件，而单基因癌基因事件在后期出现并呈亚克隆性 | 未提及具体限制 | 阐明癌基因异常和广泛拷贝数变异在髓母细胞瘤肿瘤进化和治疗抵抗中的作用 | 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序、空间转录组学 | 群体遗传学模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 一群已知MYC、MYCN和PRDM6癌基因改变的3/4组髓母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1603 | 2026-04-28 |
Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09071-2
PMID:40468066
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研究论文 | 该研究通过泛癌分析揭示Y染色体缺失在癌症与T细胞中并发存在并影响患者预后 | 首次系统证明外周血单核细胞和肿瘤中Y染色体缺失的关联性，并建立恶性上皮细胞与免疫细胞中LOY共存的预后模型 | 未明确LOY导致免疫抑制的分子机制及功能验证的局限性 | 探究Y染色体缺失在外周血单核细胞、免疫细胞和癌细胞中的相互关系及其对癌症死亡率的影响 | 29种人类肿瘤类型的bulk和单细胞RNA测序数据，以及自发性及同源小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 泛癌种 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本序列数据 | 涵盖29种人类肿瘤类型及小鼠模型的多组学数据 | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 使用Illumina NovaSeq进行bulk RNA测序，10x Chromium进行单细胞测序 |
| 1604 | 2026-04-28 |
Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137375
PMID:39892134
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示全氟辛酸诱导小鼠胚胎着床障碍的机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示低剂量PFOA暴露通过破坏子宫内膜上皮细胞功能及ANGPTL信号通路导致胚胎着床失败的具体分子机制 | 该研究仅在小鼠模型中开展，缺乏人类临床样本验证；未深入探讨其他细胞类型（如免疫细胞）在PFOA暴露下的作用 | 探究全氟辛酸暴露对子宫内膜容受性的影响及其分子机制 | 小鼠子宫内膜组织及胚胎着床过程 | 数字病理学 | 生殖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本量，但涉及多组小鼠模型的子宫内膜组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 1605 | 2026-04-28 |
Programs, origins and immunomodulatory functions of myeloid cells in glioma
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08633-8
PMID:40011771
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、染色质可及性、空间转录组学和胶质瘤类器官外植体系统，系统研究胶质瘤中髓系细胞的免疫调节程序、起源和功能 | 首次发现四种免疫调节表达程序，包括两种原发性脑肿瘤特有的小胶质细胞炎症和清除免疫抑制程序，以及两种非脑肿瘤中也表达的系统性炎症和补体免疫抑制程序，并揭示了微环境信号驱动而非细胞类型或突变状态决定这些程序 | 未明确说明具体局限性 | 阐明胶质瘤中髓系细胞的免疫调节表型及其调控机制 | 胶质瘤中的髓系细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 染色质可及性测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1606 | 2026-04-28 |
Uncovering endothelial to mesenchymal transition drivers in atherosclerosis via multi-omics analysis
2025-02-17, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04571-5
PMID:39956907
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研究论文 | 通过整合多组学数据，揭示了动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，系统鉴定出七个新的内皮-间充质转化候选基因（PTGS2、TPM1、SERPINE1、FN1、RASD1、SEMA3C和ESM1） | 研究主要依赖公开数据库和生物信息学分析，验证仅通过qPCR和western blotting进行，尚未在体内模型或临床样本中进行功能验证 | 识别动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选分子 | 动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞及体外内皮-间充质转化模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列分析、qPCR、western blotting | NA | 基因表达数据 | 三个数据集：GSE159677（scRNA-seq）、GSE118446（bulk RNA-seq）和GSE56309（微阵列） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1607 | 2026-04-28 |
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2025-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08247-6
PMID:39567700
|
研究论文 | 研究发现肝X受体（LXR）通路在肠道损伤中激活，通过调节上皮细胞分泌双调蛋白（Areg）促进再生，同时抑制肿瘤发生 | 首次揭示LXR可作为肠道再生与肿瘤发生之间的分子开关，通过CYP27A1酶介导的配体生成机制实现损伤修复与抗癌的平衡调节 | 需要进一步验证LXR在人肠道中的具体调控网络，以及长期激活LXR对正常组织稳态的影响 | 探究肠道损伤后组织再生与肿瘤发生之间是否存在解偶联的分子机制 | 小鼠肠道损伤模型、肠道类器官、人结直肠癌标本 | 分子生物学， 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA-seq， 单细胞RNA测序， 药理学干预， 基因敲除/过表达 | NA | 基因表达数据， 单细胞转录组数据 | 两种小鼠肠道损伤模型的RNA-seq数据集， 人结直肠癌标本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1608 | 2026-04-28 |
Single-cell multi-omics analysis reveals cellular subpopulations associated with relapse in high-risk B-ALL following intensified chemotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1645546
PMID:41312364
|
研究论文 | 对高危B细胞急性淋巴细胞白血病强化化疗后复发相关的细胞亚群进行单细胞多组学分析 | 结合scRNA-seq和scATAC-seq的单细胞多组学分析，首次鉴定出与强化化疗耐药相关的HSC/MPP和Pro-B细胞亚群及其分子特征 | NA | 揭示高危B-ALL强化化疗后复发的分子机制 | 高危B-ALL患儿强化化疗后的外周血单核细胞（PBMCs）及健康对照 | 数字病理学 | 儿童急性淋巴细胞白血病（B-ALL） | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞组学数据 | 高危B-ALL患儿及健康对照的PBMCs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Chromium Single Cell ATAC |
| 1609 | 2026-04-28 |
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003
PMID:39306240
|
研究论文 | 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响，重点关注单核吞噬细胞的变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示干眼症诱导结膜单核吞噬细胞中TLF+调节性巨噬细胞和CCR2+炎性细胞的差异化基因表达模式，并证实调节性巨噬细胞对抑制炎症和杯状细胞丢失的关键作用 | 主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证；调节性巨噬细胞耗竭实验依赖甘露糖化氯膦酸盐脂质体，可能存在非特异性效应 | 阐明干眼症条件下结膜免疫细胞的动态变化及调节性巨噬细胞的免疫抑制功能 | C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq | Monocle 3细胞轨迹模型 | 单细胞转录组数据、染色质开放性数据 | 非应激和干燥应激处理的C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 对分选的结膜免疫细胞进行单细胞RNA测序和scATAC-seq分析 |
| 1610 | 2026-04-28 |
Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08087-4
PMID:39478210
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析了来自6种癌症类型的131个肿瘤切片，结合单核RNA测序和CODEX数据，研究了肿瘤在二维和三维空间中的演化及其与微环境的相互作用 | 首次大规模结合Visium空间转录组学、单核RNA测序和CODEX多模态数据，定义了肿瘤微区域和空间亚克隆，并利用深度学习算法重建三维肿瘤结构，揭示了免疫热区和冷区的空间分布 | 样本量有限且仅涵盖6种癌症类型；三维重构基于连续切片可能引入对齐误差；深度学习算法依赖未监督学习，需进一步验证其生物学意义 | 研究肿瘤细胞与非癌细胞在二维和三维空间中的空间相互作用和演化机制 | 来自78例病例的131个肿瘤切片，涵盖6种癌症类型 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学, 单核RNA测序, CODEX多重免疫荧光 | 无监督深度学习 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, CODEX多重成像数据 | 131个肿瘤切片（78例患者，6种癌症类型），48例匹配的单核RNA测序样本，22例匹配的CODEX样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台，结合10x单核RNA测序和CODEX多重免疫荧光技术 |
| 1611 | 2026-04-28 |
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07793-3
PMID:39112711
|
研究论文 | 利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术，重建了成人近端小肠的综合空间表达图谱，揭示了沿隐窝-绒毛轴的区域化表达和细胞类型分布 | 首次在成人近端小肠中系统描绘了沿隐窝-绒毛轴的基因表达空间异质性，发现迁移性肠上皮细胞从绒毛底部脂滴组装和铁吸收向顶端乳糜微粒合成和铁释放的转变，并揭示绒毛顶端细胞具有促免疫原性特征 | 未明确提及具体局限性 | 重建成人近端小肠的空间表达图谱，解析隐窝-绒毛轴的基因表达和细胞类型空间异质性 | 成人近端小肠组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学， 空间蛋白质组学， 单分子荧光原位杂交 | NA | 空间基因表达数据， 空间蛋白质表达数据 | 成人近端小肠组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学， 单分子荧光原位杂交 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台， 单分子荧光原位杂交技术 |
| 1612 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.04.006
PMID:38703817
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示GVHD小鼠模型泪腺的转录景观 | 首次构建GVHD小鼠泪腺细胞图谱，发现Lrg1高表达上皮细胞新亚群，并描绘细胞间通信网络 | 仅基于小鼠模型，需在人类样本中验证；部分转录结果通过免疫荧光验证，缺乏功能实验 | 研究GVHD小鼠模型中泪腺细胞群的全局转录表达谱，揭示眼表GVHD的发病机制 | GVHD小鼠模型的泪腺细胞 | 转录组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | GVHD小鼠模型泪腺细胞（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1613 | 2026-04-28 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
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研究论文 | 揭示急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞被炎症性募集的机制 | 首次证明健康造血干细胞和祖细胞在低白血病浸润时即主动参与骨髓微环境炎症反应，并识别出AML来源的纳米级胞外囊泡是触发该炎症反应的关键因素 | 未明确讨论样本量大小及临床验证结果 | 探究急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞是否主动参与炎症传播及其机制 | 急性髓系白血病小鼠模型中的健康造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立同源小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1614 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞微环境及潜在发病机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析翼状胬肉的细胞异质性，发现免疫成纤维细胞、EMT上皮细胞和活化血管内皮细胞等新亚群，并揭示巨噬细胞与ACKR1+活化血管内皮细胞的相互作用在疾病发展中的关键作用 | 需要进一步的体内外实验验证单细胞测序发现的细胞间相互作用机制，且样本量有限 | 探究翼状胬肉的发病机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者及正常对照者的结膜组织细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 45605个细胞（来自翼状胬肉患者和正常对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1615 | 2026-04-28 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
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研究论文 | 通过人类神经网络模型揭示ALS和FTLD中NPTX2的病理作用 | 首次利用iCoMoNSCs衍生的长寿命功能性神经网络iNets模拟TDP-43蛋白病，并鉴定出NTPX2作为TDP-43关键调控靶点，阐明其在神经毒性中的直接作用 | 未提及明确的局限性 | 研究TDP-43病理在神经退行性疾病中的出现机制及后果 | 诱导多能干细胞衍生的神经干细胞及其分化形成的神经网络 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本（肌萎缩侧索硬化症和额颞叶变性患者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1616 | 2026-04-28 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
|
研究论文 | 循环髓系来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用 | 首次揭示外周髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中通过直接浸润脑区影响细胞外空间和神经生理的机制 | 未明确MMP8从外周进入脑实质的具体分子途径，且研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及血清水平检测 | 探究外周免疫系统改变如何通过特定分子影响中枢神经系统功能和压力相关行为 | 人类重度抑郁症患者血清样本及慢性社交挫败应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据 | 人类患者血清样本与小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于免疫细胞高维表型分析 |
| 1617 | 2026-04-28 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
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研究论文 | 利用NSC-seq分子时钟记录哺乳动物发育和癌前病变的细胞事件时序 | 首次开发并验证了一种多用途单细胞CRISPR平台NSC-seq，将分子时钟与细胞状态和谱系信息相结合，实现了对细胞事件时序和克隆性的精准记录 | 未提及具体局限性，但可能包括对CRISPR编辑效率的依赖性以及人类癌前样本分析中的样本代表性 | 开发一种能够记录细胞事件时序和克隆性的分子时钟方法，并应用于哺乳动物发育和癌前病变的研究 | 小鼠胚胎、小鼠腺瘤、人结肠癌前病变 | 数字病理学 | 结肠癌前病变 | NSC-seq（单细胞CRISPR平台）、单细胞多组学分析 | 分子时钟模型 | 单细胞RNA测序数据、克隆分析数据 | 116个单细胞RNA测序数据集和418个人类息肉 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | 10x Chromium | NSC-seq平台 |
| 1618 | 2026-04-28 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
|
研究论文 | 该论文通过转基因雪貂模型定义了肺部离子细胞的多样性和功能 | 首次在鼬科动物中建立条件性遗传模型，揭示人类与小鼠间进化保守的肺部离子细胞功能及亚型 | NA | 阐明肺部离子细胞在气道中的生物学功能及其在囊性纤维化中的作用 | 转基因雪貂模型（FOXI1-Cre::ROSA-TG, FOXI1-KO, FOXI1-Cre::CFTR）及囊性纤维化雪貂 | 自然语言处理 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学、谱系追踪、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1619 | 2026-04-28 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 开发LRT框架，整合单细胞RNA测序与单细胞T细胞受体测序数据，研究克隆分化异质性 | 首次提出综合计算框架LRT，整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，揭示克隆分化轨迹异质性，弥补单一方法在T细胞克隆分析中的不足 | 研究未涉及其他免疫细胞类型或更大范围的数据验证 | 探索克隆分化轨迹异质性，提供综合分析方法 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞（急性淋巴性脉络丛脑膜炎病毒感染样本） | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1620 | 2026-04-28 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
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研究论文 | 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN，用于单细胞RNA测序数据 | UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法，利用已知基因集来确定聚类，显著优于传统聚类方法 | 可能依赖已知基因集的完整性和准确性，未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 | 人类和小鼠的scRNA-seq数据集，来自多个不同器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 人类和小鼠scRNA-seq数据集，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |