单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16161 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis of liver immune microenvironment changes induced by microplastics in mice with non-alcoholic fatty liver
2024-Feb-20, The Science of the total environment
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了微塑料暴露下非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的改变 首次揭示了微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞亚群的影响及其分子机制 研究仅限于小鼠模型,未来需在人体中验证相关发现 探究微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的影响 非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞 数字病理学 非酒精性脂肪肝 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 43,480个细胞
16162 2024-08-07
Saa3 promotes pro-inflammatory macrophage differentiation and contributes to sepsis-induced AKI
2024-Jan-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据,探讨了脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫反应的复杂机制,特别是识别了Saa3基因在促进炎症性巨噬细胞分化中的作用。 本研究首次揭示了Saa3在脓毒症诱导的急性肾损伤中的重要作用,并提出其可能作为预测标记。 需要进一步探索人类同源基因以验证Saa3作为预测标记的潜力。 探讨脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫细胞失调的机制。 脓毒症诱导的急性肾损伤中的免疫反应和巨噬细胞的作用。 NA 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 利用公开的单细胞RNA测序数据集
16163 2024-08-07
PD-1 and TIGIT coexpressing CD8 + CD103 + tissue-resident memory cells in endometrial cancer as potential targets for immunotherapy
2024-Jan-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了程序性细胞死亡蛋白1基因(PD-1)和T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域基因(TIGIT)共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 本研究发现PD-1和TIGIT在组织驻留记忆细胞中共表达,并通过双重阻断PD-1和TIGIT更有效地恢复T细胞功能,增强了治疗潜力 NA 探索PD-1和TIGIT共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 子宫内膜癌中的组织驻留记忆细胞 免疫学 子宫内膜癌 RNA测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术 NA RNA NA
16164 2024-08-07
Artesunate attenuates serum amyloid A-induced M1 macrophage differentiation through the promotion of PHGDH
2024-Jan-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究探讨了青蒿琥酯通过促进PHGDH表达减轻血清淀粉样蛋白A诱导的M1巨噬细胞分化 发现青蒿琥酯通过上调PHGDH表达抑制M1巨噬细胞分化和促炎细胞因子水平,从而减轻系统性红斑狼疮的疾病活动 NA 阐明血清淀粉样蛋白A与系统性红斑狼疮中特定免疫细胞类型的关系 血清淀粉样蛋白A、M1巨噬细胞、系统性红斑狼疮 免疫学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序 NA RNA 使用GEO数据库中的单细胞RNA测序数据和MRL/lpr模型中的脾脏巨噬细胞
16165 2024-08-07
The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63-ubiquitination and activation of Lck downstream of TCR signalling
2024-Jan-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了磷酸酶DUSP22通过抑制UBR2介导的K63泛素化和Lck激酶的激活来抑制T细胞活化的机制 首次揭示了DUSP22通过去磷酸化UBR2并导致其泛素化降解,从而抑制Lck的激活,进而调控T细胞活化和炎症反应 NA 探讨DUSP22在T细胞活化和炎症调控中的作用机制 DUSP22、UBR2和Lck在T细胞活化中的相互作用 生物学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
16166 2024-08-05
SORC: an integrated spatial omics resource in cancer
2024-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文开发了一个集成的癌症空间组学资源(SORC),用于交互式可视化和分析癌症中的空间转录组数据 SORC整合了17种癌症的空间转录组数据,并提供了多种分析模块以满足空间转录组学分析的关键需求 目前的空间转录组数据主要集中在17种癌症,可能不代表所有癌症类型 研究肿瘤细胞与微环境之间的相互作用,以揭示癌症的复杂动态 手动整理的空间转录组数据和引用的单细胞RNA测序数据 数字病理学 癌症 空间转录组学 NA 空间转录组数据 722899个点和269个切片的数据,涉及334379个细胞和46种不同的细胞类型
16167 2024-08-07
Single-Cell Transcriptomic Sequencing Reveals Tissue Architecture and Deciphers Pathological Reprogramming During Retinal Ischemia in Macaca fascicularis
2024-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了猕猴视网膜缺血过程中的组织结构变化和病理重编程 首次使用单细胞RNA测序技术研究急性视网膜动脉缺血疾病的分子复杂性 NA 旨在理解急性视网膜动脉缺血疾病的分子机制 猕猴视网膜在缺血条件下的细胞和分子变化 数字病理学 眼科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 两例猕猴的视网膜样本
16168 2024-08-05
Alzheimer's Disease and Aging Association: Identification and Validation of Related Genes
2024, The journal of prevention of Alzheimer's disease
研究论文 本研究旨在通过生物信息学分析识别与阿尔茨海默病相关的潜在衰老基因 本文创新性地结合了衰老相关基因和差异表达基因,以识别新的生物标志物和潜在药物 使用的数据集可能存在偏倚,结果的泛化能力需在更大样本中验证 研究衰老与阿尔茨海默病之间的关系,识别相关基因 选取与阿尔茨海默病相关的衰老基因 数字病理学 阿尔茨海默病 生物信息学分析 NA 基因表达数据 共计582个样本来自GSE36980和GSE5281数据集
16169 2024-08-05
Single-cell RNA-Seq Elucidates the Crosstalk Between Cancer Stem Cells and the Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序阐明了肝细胞癌中癌症干细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 本文创新性地揭示了癌症干细胞和肿瘤微环境中基质细胞或免疫细胞之间的相互作用机制,并建立了一种预后风险模型 缺乏对CSC与TME中特定细胞类型间更细致的交互作用的研究 探讨肝细胞癌中癌症干细胞与肿瘤微环境的相互作用及其影响机制 研究对象为16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 机器学习算法 基因组数据 16名肝细胞癌患者的样本
16170 2024-08-05
Single-Cell Sequencing Data Analysis Unveiled HDAC1 as the Therapeutic Target for Chronic Pancreatitis
2024-Jan, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
研究论文 本研究揭示了HDAC1作为慢性胰腺炎的治疗靶点 通过单细胞测序数据发现HDAC1的过表达,并验证其在小鼠模型中的功能 缺乏临床试验数据来支持HDAC1作为靶点的有效性 探索慢性胰腺炎的治疗生物标志物 主要研究特发性慢性胰腺炎患者的基因表达变化 数字病理学 胰腺炎 单细胞测序 小鼠模型 基因表达数据 208个特发性慢性胰腺炎患者的基因
16171 2024-08-07
Whole-embryo scRNA-seq of mouse development
2024-Jan, Nature genetics IF:31.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16172 2024-08-07
Exploring the resistance mechanism of triple-negative breast cancer to paclitaxel through the scRNA-seq analysis
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析探索三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制。 识别了与紫杉醇耐药相关的三个关键转录因子和它们的抑制剂,为临床治疗提供了新的分子基础和指导。 研究仅基于从GEO数据库下载的数据,可能需要进一步的实验验证。 揭示三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制,寻找新的治疗靶点。 三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇的耐药性。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 2798个细胞
16173 2024-08-07
Characterization of the Immune Microenvironment and Identification of Biomarkers in Chronic Rhinosinusitis with Nasal Polyps Using Single-Cell RNA Sequencing and Transcriptome Analysis
2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和转录组分析技术,研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)的免疫微环境,并鉴定相关的生物标志物 本研究首次整合单细胞RNA测序和全转录组测序技术,筛选并鉴定了与CRSwNP进展相关的树突状细胞(DC)相关生物标志物 NA 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉的病理机制,并探索相关的生物标志物 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻黏膜免疫防御机制 数字病理学 慢性鼻窦炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
16174 2024-08-05
Decoding mTOR signalling heterogeneity in the tumour microenvironment using multiplexed imaging and graph convolutional networks
2023-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 这篇文章探讨了肿瘤微环境中mTOR信号的异质性及其对患者预后的影响 使用高度多重化的数据集和图卷积网络揭示了mTOR信号在肿瘤和免疫区室中的异质激活模式 本文未提及任何限制 研究肿瘤微环境中mTOR信号对结直肠肿瘤患者预后的影响 746个结直肠肿瘤样本 数字病理学 结直肠癌 多重成像 图神经网络 标记数据 746个肿瘤样本
16175 2024-08-05
Personalized Immunotherapy of Patients: Defining by Single-cell RNA-seq with Artificial Intelligence
2023-Aug, Medical research archives
研究论文 这篇文章探讨了使用单细胞RNA测序和人工智能来个性化患者的免疫疗法 结合机器学习模型的单细胞RNA测序数据,用于评估个体患者的最佳免疫疗法和药物组合 研究中可能缺乏与其他疗法直接比较的长期临床数据 旨在提高临床免疫疗法的有效性,降低不良反应和临床应用成本 研究了肿瘤浸润淋巴细胞的基因组学,包括详述的单细胞RNA-seq数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因组数据 包括多种免疫细胞治疗相关的数据和临床试验数据
16176 2024-08-05
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了空间组学数据与图基深度学习在癌症病理分析中的结合 提出了一种对比性交叉模态预训练机制,利用空间转录组学数据来生成深度学习模型 未提及具体的样本数量和数据来源限制 旨在改善图基深度学习模型在病理切片分析中的表现 利用空间转录组学数据与组织学成像数据进行癌症分期和预后预测 数字病理学 癌症 空间转录组学 图基深度学习 图像 NA
16177 2024-08-05
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文构建了一个成人人的乳腺单细胞基因组图谱 首次以单细胞和空间分辨率构建了全面的人类乳腺细胞图谱 对非上皮细胞类型的研究仍然相对不足 研究成人正常乳腺组织,以了解乳腺生物学和相关疾病状态 535,941个细胞和120,024个细胞核的数据来自62名和20名女性 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组测序 NA 细胞数据 535,941个细胞和120,024个细胞核
16178 2024-08-07
Gastric Stem Cell Biology and Helicobacter pylori Infection
2023, Current topics in microbiology and immunology
研究论文 研究幽门螺杆菌感染对胃干细胞生物学的影响及其在胃癌发展中的作用 利用细胞系追踪、类器官和单细胞RNA测序技术,深入了解正常稳态和感染状态下上皮和间质细胞亚型的分子“身份”,并揭示了幽门螺杆菌感染下干细胞(微环境)行为的原理 NA 探讨幽门螺杆菌感染如何影响胃干细胞行为及其在胃癌发展中的作用 胃干细胞、幽门螺杆菌感染、胃癌发展 数字病理学 胃癌 细胞系追踪、类器官、单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
16179 2024-08-07
Targeting epigenetic modifiers to reprogramme macrophages in non-resolving inflammation-driven atherosclerosis
2021-Sep, European heart journal open
综述 本文综述了表观遗传修饰在非消退性炎症驱动下的动脉粥样硬化中重编程巨噬细胞的作用 探讨了表观遗传修饰在动脉粥样硬化和相关炎症中的作用,并提出了针对这些修饰的潜在抗炎治疗策略 对表观遗传修饰在动脉粥样硬化中的研究仍处于初级阶段 探讨表观遗传修饰在动脉粥样硬化发病和进展中非控制性炎症的机制 动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其表观遗传修饰 心血管疾病 心血管疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
16180 2024-08-05
Spatial transcriptomic interrogation of the tumour-stroma boundary in a 3D engineered model of ameloblastoma
2024-Feb, Materials today. Bio
研究论文 本文研究了在3D设计的肿瘤-基质模型中,肿瘤-基质边界的空间转录组学特征 首次展示了肿瘤细胞基因表达如何受到不同基质细胞存在的影响 研究可能限制在特定类型的基质细胞与肿瘤细胞之间的相互作用 研究肿瘤微环境中基质细胞对肿瘤行为的影响 使用工程化的多腔肿瘤体进行研究,以探讨不同基质对肿瘤细胞的影响 数字病理学 NA 空间转录组学 多腔肿瘤体 基因表达数据 多个工程化肿瘤模型样本
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