单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28063 篇文献，本页显示第 16141 - 16160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16141 | 2024-08-07 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2023-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.29.534769
PMID:37034687
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术比较了四种遗传工程小鼠模型中的间充质细胞与野生型对照，以及相应基因型的人类肿瘤，揭示了肿瘤间质在前列腺癌进展中的作用 | 发现了8种转录和功能上不同的间质细胞群，这些细胞群负责常见的和特定于小鼠模型的转录程序，并构建了一个可以预测前列腺癌患者转移进展的基因特征 | NA | 探讨肿瘤间质在前列腺癌进展和转移潜力中的分子基础 | 间充质细胞、遗传工程小鼠模型、人类前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种遗传工程小鼠模型和相应基因型的人类肿瘤 |
| 16142 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of the cellular landscape of vulvar melanoma provides new insight for immunotherapy administration
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11839-0
PMID:38233802
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了外阴黑色素瘤的细胞景观，为免疫治疗提供了新的见解 | 发现了CD8+ T细胞激活在外阴黑色素瘤中的作用，以及抗原呈递分子功能在黑色素瘤转移中的参与 | 研究样本仅来自一位68岁女性患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明外阴黑色素瘤中紊乱的免疫微环境在癌症进展中的作用 | 外阴黑色素瘤的细胞景观及其在免疫治疗中的潜在应用 | 数字病理学 | 外阴黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 12,243个单细胞 |
| 16143 | 2024-08-07 |
Splenic monocytes drive pathogenic subretinal inflammation in age-related macular degeneration
2024-Jan-17, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03011-z
PMID:38233865
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研究论文 | 本文研究了年龄相关性黄斑变性（AMD）中脾脏单核细胞在病理性视网膜下炎症中的作用 | 首次展示了血管紧张素II能够动员ATR1脾脏单核细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其转录特征，这些细胞在功能上与骨髓单核细胞不同 | NA | 探讨脾脏单核细胞在年龄相关性黄斑变性中的作用及其潜在的治疗策略 | 年龄相关性黄斑变性中的脾脏单核细胞 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16144 | 2024-08-07 |
Heterogeneous Expression Patterns of the Minichromosome Maintenance Complex Members in Retinoblastoma Unveil Its Clinical Significance
2024-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.1.31
PMID:38231525
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研究论文 | 研究探讨了微染色体维持（MCM）复合体成员在视网膜母细胞瘤（RB）中的表达模式及其临床意义 | 首次在单细胞水平上整合了来自正常视网膜、眼内和眼外RB样本的单细胞RNA测序数据，以表征MCM复合体成员的表达模式 | NA | 探索MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达模式及其临床意义 | MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个正常视网膜样本、六个眼内RB样本和五个眼外RB样本 |
| 16145 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171417
PMID:38063198
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研究论文 | 这项研究揭示了痛风发作与缓解过程中单细胞转录组中单核细胞和调节性T细胞的变化 | 识别了与痛风发作相关的HLA-DQA1+非经典单核细胞，上调与抗原处理和呈递相关 | 缺乏对痛风发作机制的全面理解与其他炎性疾病的比较 | 研究痛风发作与缓解中免疫细胞反应和系统性炎症模式 | 对比分析了痛风发作和缓解阶段的单核细胞及调节性T细胞 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用独立验证队列进行分析 |
| 16146 | 2024-08-05 |
Angiocrine Signaling in Sinusoidal Health and Disease
2023-08, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/a-2128-5907
PMID:37442155
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综述 | 本文总结了血管信号在健康和疾病中的作用 | 文章总结了不同情况下LSEC亚群的作用及其空间转录组学研究 | NA | 阐明血管信号在肝脏健康和疾病中的作用 | 肝窦内皮细胞及其在肝脏中与其他细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 16147 | 2024-08-07 |
Stromal-induced epithelial-mesenchymal transition induces targetable drug resistance in acute lymphoblastic leukemia
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112804
PMID:37453060
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研究论文 | 本文研究了骨髓微环境通过与骨髓龛相互作用在急性淋巴细胞白血病中驱动药物抗性的机制 | 发现急性淋巴细胞白血病细胞与间充质干细胞通过整合素β1相互作用，诱导类似上皮-间质转化的程序，导致药物抗性和增强生存 | NA | 探讨骨髓微环境在急性淋巴细胞白血病中诱导药物抗性的机制，并寻找潜在的治疗方法 | 急性淋巴细胞白血病细胞与间充质干细胞的相互作用 | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16148 | 2024-08-07 |
Network-based analysis identifies key regulatory transcription factors involved in skin aging
2023-07, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2023.112202
PMID:37178875
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，探讨了犬类皮肤老化的转录调控机制，并验证了人类皮肤老化中的相关基因表达变化。 | 本研究首次在犬类皮肤老化中应用WGCNA和scRNA-seq技术，揭示了皮肤老化过程中的关键转录因子及其调控网络。 | 研究主要集中在犬类和人类皮肤老化，未来研究可扩展到其他物种以验证结果的普遍性。 | 探讨皮肤老化的转录调控机制，并寻找潜在的干预靶点。 | 犬类和人类皮肤老化过程中的基因表达变化及转录因子调控。 | 生物信息学 | 皮肤老化 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16149 | 2024-08-07 |
Dissecting cellular heterogeneity and intercellular communication in cholangiocarcinoma: implications for individualized therapeutic strategies
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1241834
PMID:38239853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胆管癌中的细胞异质性和细胞间通讯，并分析了细胞类型、基因富集通路及细胞间通讯网络，为个性化治疗策略提供依据 | 首次通过单细胞RNA测序和CellChat分析揭示胆管癌中细胞异质性和细胞间通讯的复杂性，并发现肿瘤微环境中成纤维细胞的关键作用及T细胞的新克隆型 | 研究样本仅来自两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示胆管癌的细胞异质性和细胞间通讯，为开发有效治疗策略提供依据 | 胆管癌及其邻近正常组织的细胞异质性和细胞间通讯 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 两名患者的胆管癌及邻近正常组织 |
| 16150 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals spatial distribution of IL34+ cancer-associated fibroblasts in hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2023-Dec-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00483-9
PMID:38081923
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中IL34+癌症相关成纤维细胞的空间分布特征 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细分析了IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的作用机制 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，可能需要更多的临床数据支持 | 探究IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织中的IL34+癌症相关成纤维细胞及其与T细胞和肝细胞癌细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织的单细胞转录组数据集 |
| 16151 | 2024-08-07 |
scQA: A dual-perspective cell type identification model for single cell transcriptome data
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.021
PMID:38235363
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研究论文 | 介绍了一种名为scQA的新方法，该方法能够从定性和定量两个角度同时识别细胞类型和细胞类型特异性关键基因 | scQA方法不仅识别细胞类型，还提取与这些细胞类型相关的关键基因，实现双向聚类，并采用创新的标签传播策略进行细胞聚类 | NA | 开发一种新的算法，用于从单细胞转录组数据中识别细胞类型和关键基因 | 单细胞转录组数据中的细胞类型和关键基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双向聚类模型 | 转录组数据 | 20个公开可用的单细胞转录组数据集 |
| 16152 | 2024-08-07 |
Microgel-based carriers enhance skeletal stem cell reprogramming towards immunomodulatory phenotype in osteoarthritic therapy
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.022
PMID:38235309
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研究论文 | 本研究探讨了微凝胶载体在骨关节炎治疗中对骨骼干细胞向免疫调节表型重编程的影响 | 首次揭示了微凝胶载体通过促进YAP蛋白核转位，增强骨骼干细胞的免疫调节能力，从而有效治疗骨关节炎 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需进一步验证在临床环境中的效果 | 探索微凝胶载体在骨骼干细胞治疗骨关节炎中的作用机制 | 骨骼干细胞及其在骨关节炎治疗中的应用 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及骨关节炎大鼠模型 |
| 16153 | 2024-08-07 |
EMP3 as a prognostic biomarker correlates with EMT in GBM
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11796-0
PMID:38229014
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研究论文 | 本文研究了EMP3作为GBM中的预后生物标志物与EMT的相关性 | EMP3被发现是与EMT相关的基因，可作为诊断胶质瘤患者的特异性生物标志物，并作为胶质瘤患者总体生存的独立预后因子 | NA | 探索EMP3促进GBM生长的可能机制，对GBM治疗具有重要意义 | EMP3在GBM中的作用及其与EMT的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 5个单细胞RNA测序数据集，EMP3沉默的U87和U251细胞系 |
| 16154 | 2024-08-07 |
Extraocular muscle stem cells exhibit distinct cellular properties associated with non-muscle molecular signatures
2024-Jan-17, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202144
PMID:38240380
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研究论文 | 本研究通过克隆分析、活体成像和单细胞RNA测序，揭示了眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞在细胞特性和分子标志上的差异 | 首次发现眼外肌干细胞具有不同于传统肌肉细胞的分子特征，这些特征与非肌肉细胞的分子标志相关 | 研究主要集中在体外激活的眼外肌干细胞，对体内环境的影响尚未深入探讨 | 探究眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞在功能异质性上的机制 | 眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞的细胞特性和分子标志 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16155 | 2024-08-07 |
Quercetin inhibits caspase-1-dependent macrophage pyroptosis in experimental folic acid nephropathy
2024-Jan-16, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00885-2
PMID:38229085
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研究论文 | 本研究探讨了槲皮素在实验性叶酸肾病中抑制依赖于caspase-1的巨噬细胞焦亡的作用 | 首次验证了槲皮素通过下调巨噬细胞中的caspase-1来保护细胞免受焦亡的影响 | NA | 验证焦亡在实验性叶酸肾病中的重要性，并探索槲皮素对焦亡的保护作用 | 槲皮素对巨噬细胞焦亡的影响及其在叶酸肾病中的作用 | NA | 肾病 | 基因集富集分析（GSEA），加权基因共表达网络分析（WGCNA），分子对接，单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据，细胞数据 | 动物模型和RAW264.7细胞系 |
| 16156 | 2024-08-05 |
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad874
PMID:37855686
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为CellSTAR的综合单细胞转录组注释资源数据库 | 首次提供全面专家注释的参考数据，可用于注释数百种细胞类型，并结合数万个标记基因 | NA | 探讨细胞异质性和准确注释细胞类型的重要性 | 单细胞转录组信息和细胞类型的注释 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 包含数百种细胞类型的参考数据和数万个标记基因 |
| 16157 | 2024-08-07 |
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad906
PMID:37850657
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research paper | 介绍了一个名为CellCommuNet的综合数据资源，用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下基于单细胞RNA测序数据的细胞间通信网络 | CellCommuNet提供了一个全面的平台，用于分析和比较健康与疾病状态下的细胞间通信强度和相关信号通路 | NA | 研究细胞间通信在维持细胞、器官和整个生物体生物功能及微环境稳态中的作用 | 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的细胞间通信网络 | digital pathology | cancer | scRNA-seq | NA | scRNA-seq data | 376个单数据集，118个疾病与正常样本的比较数据集 |
| 16158 | 2024-08-05 |
Tumor immune microenvironment-based therapies in pancreatic ductal adenocarcinoma: time to update the concept
2024-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02935-3
PMID:38167055
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综述 | 本文探讨了肿瘤免疫微环境在胰腺导管腺癌中的疗法及其最新研究进展 | 提出了通过单细胞测序技术对胰腺导管腺癌的免疫表型进行更全面的分类 | 未详细说明特定治疗对不同免疫表型患者的效果和适应性 | 增强对胰腺导管腺癌治疗中肿瘤免疫微环境的理解 | 肿瘤细胞、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞（CAF）及细胞外基质（ECM） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16159 | 2024-08-07 |
Prostaglandin E2 Induces Long-Lasting Inhibition of Noradrenergic Neurons in the Locus Coeruleus and Moderates the Behavioral Response to Stressors
2023-11-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0353-23.2023
PMID:37734949
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研究论文 | 本文通过脑切片中的细胞内钙成像技术，筛选并鉴定了影响蓝斑去甲肾上腺素神经元活性的五种新型生物活性物质，并重点研究了前列腺素E通过EP受体引起的长期钙变化及其对行为反应的影响。 | 建立了无偏见的筛选方法，用于鉴定影响特定神经元群体活性的物质，并发现了前列腺素E在调节应激行为反应中的新作用。 | 仅限于筛选了53种生物活性物质，可能还有其他未被识别的物质影响神经元活性。 | 研究生物活性物质如何调节蓝斑去甲肾上腺素神经元的活性及其在生理功能中的作用。 | 蓝斑去甲肾上腺素神经元及其在睡眠/觉醒和应激反应中的作用。 | 神经科学 | NA | 细胞内钙成像 | NA | 钙信号 | 使用了雌雄两性的小鼠样本 |
| 16160 | 2024-08-07 |
Muscle denervation promotes functional interactions between glial and mesenchymal cells through NGFR and NGF
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107114
PMID:37416457
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研究论文 | 研究通过scRNA-seq/snATAC-seq技术分析了坐骨神经切断后骨骼肌在不同时间点的细胞类型特异性基因表达和染色质可及性模式 | 揭示了神经切断后神经胶质细胞和表达CD90的间充质细胞之间的功能性相互作用，并阐明了NGF/NGFR介导的细胞间通讯机制 | NA | 探讨神经切断后骨骼肌中细胞类型特异性基因表达和染色质可及性的变化 | 骨骼肌在坐骨神经切断后的细胞反应 | NA | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |