单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16041 2024-08-07
LncRNAs associated with vascular mimicry establish a novel molecular subtype and prognostic model for pancreatic cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过差异分析和Spearman相关性分析,从文献中收集的血管拟态相关基因中识别出胰腺癌中的关键长非编码RNA(lncRNA)特征,并利用非负矩阵分解(NMF)算法确定最佳聚类,比较了不同聚类间的临床病理特征和预后差异。 本研究首次基于血管拟态相关lncRNA特征开发了一种新的三聚类分子亚型,并构建了基于这些特征的新型预后风险模型。 NA 探索血管拟态在胰腺癌中的作用,并开发新的分子亚型和预后模型。 胰腺癌中的血管拟态相关lncRNA特征及其在肿瘤微环境中的作用。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 非负矩阵分解(NMF) 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
16042 2024-08-05
Lorazepam Stimulates IL6 Production and Is Associated with Poor Survival Outcomes in Pancreatic Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了苯二氮卓类药物与癌症患者生存结果之间的关系 首次显示洛拉西泮刺激IL6的产生并与胰腺癌患者的生存结果相关 本研究为回顾性分析,可能受到遗传和环境因素的影响 调查苯二氮卓类药物对胰腺癌患者生存的影响及其在肿瘤微环境中的作用 以胰腺癌患者为研究对象,评估洛拉西泮对肿瘤微环境的影响 数字病理学 胰腺癌 ELISA, qPCR, RNA测序, 免疫组化等 NA 实验数据 NA
16043 2024-08-07
Adrenergic nerves regulate intestinal regeneration through IL-22 signaling from type 3 innate lymphoid cells
2023-09-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 研究探讨了肠道交感神经通过IL-22信号从第3型先天淋巴细胞(ILC3s)调节肠道再生的机制 首次揭示了交感神经-ILC3轴在肠道再生中的重要作用 NA 研究交感神经在肠道上皮细胞再生中的作用 肠道交感神经和第3型先天淋巴细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
16044 2024-08-05
Effects of PYCR1 on prognosis and immunotherapy plus tyrosine kinase inhibition responsiveness in metastatic renal cell carcinoma patients
2023-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本文研究了PYCR1在转移性肾细胞癌患者中的预后和对免疫疗法加酪氨酸激酶抑制反应的影响 提出了PYCR1作为生物标志物来区分最佳治疗策略的潜力 缺少大规模多中心验证,需要进一步研究以确认结果 探讨PYCR1表达与转移性肾细胞癌患者免疫治疗及酪氨酸激酶抑制的相关性 转移性肾细胞癌患者的生物标志物分析 数字病理学 肾癌 RNA测序 随机森林 基因表达数据 三个队列,总体样本量未明示,涉及的两个来自本机构,一个来自临床试验
16045 2024-08-07
Single-cell analysis of megakaryopoiesis in peripheral CD34+ cells: insights into ETV6-related thrombocytopenia
2023-09, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程,并探讨了ETV6相关血小板减少症的转录机制和基因调控网络 首次揭示了ETV6缺陷在巨核细胞生成早期阶段导致异常细胞发育的机制,并发现了一个高度失调的核心“核糖体生物合成”途径 NA 解析ETV6基因突变与血小板减少症之间的转录机制和基因调控网络 外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程 数字病理学 血小板减少症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 健康对照组和ETV6相关血小板减少症患者的CD34+细胞
16046 2024-08-07
Transcriptional Profiles of Non-neuronal and Immune Cells in Mouse Trigeminal Ganglia
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
综述 本综述研究旨在通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组织化学技术,对小鼠三叉神经节中的非神经元细胞类型进行鉴定、分析和总结 本研究将先前报道的三叉神经节中的单一免疫细胞群细分为三种巨噬细胞和四种中性粒细胞,并使用特定的基因标记进行分类 NA 鉴定和分析小鼠三叉神经节中的非神经元细胞类型 小鼠三叉神经节中的非神经元细胞 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术(FC)、免疫组织化学(IHC) NA 基因表达数据 NA
16047 2024-08-05
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Reveals That TAM2-Driven Genes Affect Immunotherapeutic Response and Prognosis in Pancreatic Cancer
2023-Aug-14, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞M2(TAM2)驱动基因在胰腺癌免疫治疗反应和预后中的影响 提出了基于TAM2驱动基因的免疫表型和预后模型,为胰腺癌的临床管理奠定了基础 对TAM2相关基因在胰腺癌中的免疫治疗反应和预后意义仍缺乏深入了解 研究TAM2驱动基因在胰腺癌中的作用及其对免疫治疗的影响 研究对象为胰腺癌患者及其肿瘤组织样本 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序和批量RNA测序 Lasso-COX回归模型 转录组数据 178个样本
16048 2024-08-05
Machine learning modeling and prognostic value analysis of invasion-related genes in cutaneous melanoma
2023-08, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究确定了与侵袭相关的风险特征和预后模型,以便于皮肤黑色素瘤的个性化治疗和预后预测 提出了一个基于20个预后基因的风险评分模型,识别了与黑色素瘤相关的潜在生物标记 研究可能受到样本量和基因验证方法限制 为皮肤黑色素瘤开发个性化治疗和预后预测模型 皮肤黑色素瘤中的侵袭相关基因 机器学习 皮肤黑色素瘤 基因表达分析、单细胞测序 Extra Trees Classifier 基因表达数据 124个差异表达的侵袭相关基因
16049 2024-08-07
Analysis of cuproptosis-related lncRNA signature for predicting prognosis and tumor immune microenvironment in pancreatic cancer
2023-08, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究旨在建立一种与铜死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA)特征,用于预测胰腺癌患者的预后并辅助临床决策 首次建立了基于铜死亡相关lncRNA的预后特征,并验证了CASC8在胰腺癌进展和免疫微环境中的作用 NA 建立和验证一种新的生物标志物,用于预测胰腺癌患者的预后和免疫反应 胰腺癌患者及其肿瘤免疫微环境 数字病理学 胰腺癌 实时聚合酶链反应(Real-Time PCR),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 30名胰腺癌患者样本,TCGA-PAAD数据库和ICGC队列数据
16050 2024-08-07
The ALOX5 inhibitor Zileuton regulates tumor-associated macrophage M2 polarization by JAK/STAT and inhibits pancreatic cancer invasion and metastasis
2023-Aug, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究Zileuton通过抑制ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞M2极化,从而抑制胰腺癌的侵袭和转移 首次揭示了Zileuton通过抑制ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞M2极化,进而抑制胰腺癌侵袭和转移的机制 NA 探讨Zileuton对肿瘤相关巨噬细胞M2极化和胰腺癌侵袭及转移的影响 胰腺癌细胞和肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 胰腺癌 RNA测序 NA RNA 包括人类胰腺癌细胞和巨噬细胞,以及裸鼠模型
16051 2024-08-05
NUSAP1-LDHA-Glycolysis-Lactate feedforward loop promotes Warburg effect and metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了NUSAP1在胰腺导管腺癌中的糖酵解代谢和转移中的作用 提出了NUSAP1-LDHA-糖酵解-乳酸的正反馈环作为胰腺导管腺癌转移和代谢潜能的新机制 研究未提及具体的样本大小和临床验证 探索NUSAP1在胰腺导管腺癌发病机制中的作用 胰腺导管腺癌(PDAC)和常见的胃肠道肿瘤 数字病理学 胰腺癌 RNA测序,ChIP-seq 小鼠异种移植模型,自发性PDAC小鼠模型 基因表达数据,组织微阵列 NA
16052 2024-08-07
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和巨噬细胞命运图谱方法,研究了胰腺导管腺癌(PDA)中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的调控作用 首次揭示了肿瘤特异性CD4 T细胞通过促进单核细胞分化为MHCII抗肿瘤巨噬细胞,从而影响肿瘤微环境 NA 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的影响 胰腺导管腺癌中的单核细胞和巨噬细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
16053 2024-08-05
Nerve growth factor receptor (Ngfr) induces neurogenic plasticity by suppressing reactive astroglial Lcn2/Slc22a17 signaling in Alzheimer's disease
2023-Jul-10, NPJ Regenerative medicine IF:6.4Q1
研究论文 这项研究探讨了神经生长因子受体(Ngfr)如何通过抑制阿尔茨海默病中的反应性星形胶质细胞信号传导来诱导神经发生可塑性 该研究揭示了Ngfr在阿尔茨海默病背景下促进星形胶质细胞神经发生命运的作用,并识别了Lcn2/Slc22a17信号通路的关键作用 本研究的局限性在于没有详细探讨Ngfr在不同阶段阿尔茨海默病进展中的具体作用 研究Ngfr在阿尔茨海默病中调控星形胶质细胞神经发生的机制 使用APP/PS1dE9小鼠模型和人类阿尔茨海默病组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,空间蛋白组学,功能敲除研究 小鼠模型及人类星形胶质细胞三维培养 组织,转录组数据 使用APP/PS1dE9小鼠模型及后期人类阿尔茨海默病海马体组织
16054 2024-08-05
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-Jul, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
综述 这篇文章回顾了反应性星形胶质细胞在多种神经退行性疾病中的重要作用 提出了基于单细胞测序分析的星形胶质细胞亚群与其功能之间的精确联系 对于反应性星形胶质细胞的亚群识别和功能仍存在争议 探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维角色 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化和肌萎缩侧索硬化的特点 神经科学 NA 单细胞测序 NA NA NA
16055 2024-08-07
IL-4 drastically decreases deuterosomal and multiciliated cells via alteration in progenitor cell differentiation
2023-07, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响,特别是在IL-4刺激下的细胞亚型变化 首次揭示了IL-4通过改变前体细胞分化,显著减少多纤毛细胞和双体细胞的比例,并提出了可能对研究呼吸系统炎症疾病至关重要的细胞特异性标记 NA 研究过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响 人鼻上皮细胞及其在IL-4刺激下的转录组特征 NA 呼吸系统炎症疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及培养的人鼻上皮细胞和活体鼻上皮细胞样本
16056 2024-08-05
The coagulation-related genes for prognosis and tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Jun-29, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了与凝血相关的基因对胰腺导管腺癌的预后和肿瘤微环境的影响 研究区分了两种与凝血相关的基因亚型,并建立了预后模型以进行风险分层 只有与TCGA数据库相关的样本数据,没有长期的临床随访数据 进一步区分与凝血相关的基因并探讨其在胰腺导管腺癌中的免疫浸润情况 胰腺导管腺癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 数字病理学 胰腺癌 转录组测序 LASSO模型 基因组数据和临床信息 收集了胰腺导管腺癌患者的实验样本,并进行了免疫组化分析
16057 2024-08-07
Multi-omics analysis reveals the chemoresistance mechanism of proliferating tissue-resident macrophages in PDAC via metabolic adaptation
2023-06-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌(PDAC)中增殖性组织驻留巨噬细胞通过代谢适应产生化疗耐药性的机制 首次识别出PDAC中与不良临床结果密切相关的增殖性组织驻留巨噬细胞(proliferating rMφs),并阐明了其通过代谢适应产生化疗耐药性的具体机制 NA 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进化疗耐药性的具体机制 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在化疗耐药性中的作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、多色免疫组化(mIHC)、流式细胞术、代谢组学 NA 转录组数据、免疫组化图像、流式细胞数据、代谢组数据 人类和鼠类的化疗治疗样本
16058 2024-08-05
Complex subsets but redundant clonality after B cells egress from spontaneous germinal centers
2023-06-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究使用小鼠模型分析自发性生发中心后B细胞的特征 提出了B细胞在自发性生发中心后的复杂亚群体以及冗余克隆性的概念 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类疾病的理解 分析自发性生发中心后B细胞的组成及其在自身免疫中的作用 分析B细胞亚群体及其在自发性生发中心后的发育状态 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞转录组学, 抗体库分析 NA 转录组数据 使用小鼠模型进行多个B细胞亚群的分析
16059 2024-08-07
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了衰老对小鼠中风恢复机制的影响 首次揭示了衰老小鼠中风后早期修复转录重编程的缺失,并发现年轻小鼠的微胶质细胞和巨噬细胞移植可以部分恢复老年小鼠的血管生成和少突胶质细胞生成 研究仅限于小鼠模型,未来需要进一步在人类中验证这些发现 探究衰老如何影响中风后脑组织修复的机制 年轻和老年小鼠中风后急性期和慢性期的脑组织 数字病理学 中风 单细胞RNA测序 NA 转录组 年轻和老年小鼠的中风脑组织样本
16060 2024-08-05
Tissue-resident CXCR4+ macrophage as a poor prognosis signature promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression
2023-06-01, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的预后价值及其免疫特征和功能 发现CXCR4+巨噬细胞的浸润与胰腺导管腺癌的差预后相关,为靶向这些细胞的免疫治疗提供了新方向 研究仅限于手术后样本,未涉及胰腺癌早期患者的相关数据 评估CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用及其预后意义 102名术后胰腺癌患者的组织样本 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术, 免疫荧光, RNA-seq 小鼠同种异体PDAC模型 组织样本 102个手术后胰腺癌患者样本
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