单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 16021 - 16040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16021 | 2024-08-07 |
Interactions of Indoleamine 2,3-dioxygenase-expressing LAMP3+ dendritic cells with CD4+ regulatory T cells and CD8+ exhausted T cells: synergistically remodeling of the immunosuppressive microenvironment in cervical cancer and therapeutic implications
2023-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12486
PMID:37794698
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研究论文 | 本研究探讨了表达吲哚胺2,3-双加氧酶的LAMP3+树突状细胞与CD4+调节T细胞和CD8+耗竭T细胞之间的相互作用，以及这些相互作用在宫颈癌免疫抑制微环境重塑中的作用及其治疗意义。 | 研究揭示了LAMP3+树突状细胞与CD4+调节T细胞和CD8+耗竭T细胞之间的协同作用，形成了一个恶性的免疫抑制循环，并介导了宫颈癌的免疫逃逸。 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的单细胞RNA测序，需要进一步的临床试验来验证这些发现。 | 旨在探讨宫颈癌免疫重塑的机制并探索潜在的治疗靶点。 | 研究对象包括正常宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变和宫颈癌组织。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 17个临床样本 |
| 16022 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics illuminates regulatory steps driving anterior-posterior patterning of Drosophila embryonic mesoderm
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113289
PMID:37858470
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研究论文 | 本研究应用单细胞技术和遗传分析探讨果蝇胚胎中胚层形态发生的动态转录变化 | 揭示了转录状态的空间调控时间过渡，以及ecdysone信号在胚层的上皮-间质转变中的早期作用 | 未提及具体样本数量的限制 | 研究果蝇胚胎发育过程中转录程序如何驱动前后轴模式的调控步骤 | 果蝇胚胎中的细胞谱系和转录状态 | 生物学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16023 | 2024-08-05 |
Exosome and lipid metabolism-related genes in pancreatic adenocarcinoma: a prognosis analysis
2023-10-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205130
PMID:37857015
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研究论文 | 本研究旨在探讨外泌体和脂质代谢相关基因在胰腺腺癌中的诊断和预后的作用 | 创新点在于构建了基于EALMRGs的预后模型，并验证其在多种癌症中的预后价值 | 研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本偏倚 | 研究胰腺腺癌中外泌体和脂质代谢相关基因的mRNA水平与疾病的诊断和预后的关系 | 胰腺腺癌及其他类型的癌症患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | LASSO回归 | COX回归分析 | 基因表达数据 | NA |
| 16024 | 2024-08-07 |
S100P as a potential biomarker for immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer: a bioinformatics analysis and in vitro study
2023-Oct-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11490-1
PMID:37853345
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研究论文 | 本研究探讨了S100P蛋白在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | 发现S100P与免疫细胞浸润呈负相关，特别是CD8+ T细胞，并且与免疫治疗相关基因表达水平和肿瘤突变负荷有显著关联 | NA | 研究S100P在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | S100P蛋白在胰腺癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-Seq, 微阵列, scRNA-Seq, DNA甲基化分析, 逆转录PCR, 免疫组化 | NA | RNA序列, 微阵列数据, 单细胞RNA序列, DNA甲基化数据, 组织样本 | 五个胰腺癌细胞系和60个胰腺癌组织样本 |
| 16025 | 2024-08-05 |
Identification of novel therapeutic target and prognostic biomarker in matrix metalloproteinase gene family in pancreatic cancer
2023-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44506-8
PMID:37821678
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研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶基因家族在胰腺癌中的新治疗靶点和预后生物标志物 | 本研究发现MMP28在胰腺导管腺癌中的表达与患者预后及临床特征密切相关，提出了其作为潜在生物标志物的可能性 | 本研究未探讨MMP28与免疫细胞浸润之间的相关性 | 探究基质金属蛋白酶在胰腺导管腺癌中的表达模式及其预后和免疫学价值 | 主要研究对象为与胰腺导管腺癌相关的基质金属蛋白酶基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 研究涉及多个胰腺癌细胞系和正常胰腺细胞的样本 |
| 16026 | 2024-08-05 |
Identifying Subpopulations of Cells in Single-Cell Transcriptomic Data: A Bayesian Mixture Modeling Approach to Zero Inflation of Counts
2023-10, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0273
PMID:37871291
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研究论文 | 本文开发了一种新的贝叶斯混合模型，用于在单细胞转录组数据中识别细胞亚群。 | 提出了一种新的Dirichlet过程混合模型，结合细胞水平的混合和转录本水平的零膨胀负二项混合模型，以更好地处理scRNA-Seq数据中的计数膨胀现象。 | 本文未提及可能存在的具体限制。 | 研究的目的是通过建模基因表达来识别单细胞数据中的细胞亚群。 | 研究对象是来自小鼠皮层和海马体的多个细胞类型的scRNA-Seq计数数据。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | Dirichlet过程混合模型 | 计数数据 | 来自小鼠皮层和海马体的多个细胞类型的公开可用scRNA-Seq计数数据 |
| 16027 | 2024-08-07 |
Potential involvement of IL-32 in cell-to-cell communication between macrophages and hepatoblastoma
2023-Sep-26, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-023-05557-0
PMID:37751001
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研究论文 | 本研究调查了白细胞介素32（IL-32）在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的可能作用 | 发现IL-32在肝母细胞瘤细胞系中的表达上调，并可能通过诱导肿瘤激活的巨噬细胞介导肝母细胞瘤的化学耐药性 | IL-32的免疫组化染色仅在48%的病例中呈阳性，且在下载的数据集中IL-32基因表达为阴性 | 研究IL-32在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的作用 | 肝母细胞瘤细胞系和巨噬细胞 | NA | 肝母细胞瘤 | RNA-seq分析、RT-qPCR、免疫组化染色（IHC）、western blot分析 | NA | RNA-seq数据 | 21例肝母细胞瘤患者样本 |
| 16028 | 2024-08-05 |
[Heterogeneity analysis of pancreatic cancer and identification of molecular subtypes of tumor cells based on CEACAM5, LGALS1 and CENPF gene expression]
2023-Sep-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌的异质性以及肿瘤细胞分子亚型的新方法，识别了胰腺癌进展中的标志基因 | 通过分析单细胞测序数据，识别了胰腺癌细胞的不同亚型及其特征基因，揭示了其在发育过程中的表达模式 | 本研究主要基于有限的样本数据，可能无法全面反映胰腺癌的所有亚型特征 | 研究胰腺癌的异质性及肿瘤细胞的分子亚型 | 16个胰腺癌组织样本中的单细胞 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 16个胰腺癌样本和179名胰腺癌患者及171名健康对照的数据 |
| 16029 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis revealing the intratumoral heterogeneity of ccRCC and validation of MT2A in pathogenesis
2023-Sep-15, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01225-7
PMID:37713131
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性，并验证了MT2A在ccRCC发病机制中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了ccRCC的单细胞景观，并发现了MT2A在ccRCC中的重要作用 | NA | 探讨ccRCC的肿瘤内异质性及MT2A在其发病机制中的作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CNN | 转录组数据 | 来自TCGA和Young等人的研究数据 |
| 16030 | 2024-08-07 |
Combination of RUNX1 inhibitor and gemcitabine mitigates chemo-resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma by modulating BiP/PERK/eIF2α-axis-mediated endoplasmic reticulum stress
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02814-x
PMID:37697370
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研究论文 | 本研究探讨了RUNX1抑制剂与吉西他滨联合使用通过调节内质网应激的BiP/PERK/eIF2α轴来减轻胰腺导管腺癌的化疗抗性 | 首次揭示了RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及其通过内质网应激信号通路的机制 | 研究主要基于体外和动物模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及机制，并评估其作为预测生物标志物的潜力 | 胰腺导管腺癌及其化疗抗性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), qRT-PCR, 免疫组织化学(IHC), 蛋白质印迹(western blot) | NA | RNA | 使用了多个数据集，包括GSE223463和GSE183795，以及构建了稳定表达shRUNX1和RUNX1的细胞系 |
| 16031 | 2024-08-05 |
Unveiling the role of regulatory T cells in the tumor microenvironment of pancreatic cancer through single-cell transcriptomics and in vitro experiments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242909
PMID:37753069
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞在胰腺癌肿瘤微环境中的作用 | 首次通过单细胞转录组学和体外实验揭示了Treg细胞在胰腺癌免疫反应中的重要性 | 研究的特定细胞类型和信号通路可能限制了对Treg细胞功能全面了解的能力 | 调查Treg细胞浸润对胰腺癌免疫反应的影响及其相关的mRNA标记物 | 案例研究胰腺癌中的调节性T细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析，机器学习 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16032 | 2024-08-07 |
Transcriptional profiles of non-neuronal and immune cells in mouse trigeminal ganglia
2023, Frontiers in pain research (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fpain.2023.1274811
PMID:38028432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，对正常雄性小鼠三叉神经节中的非神经元细胞进行了鉴定、分类和总结 | 首次详细描述了三叉神经节中非神经元细胞的类型和特征，包括三种巨噬细胞和四种中性粒细胞的亚型 | 研究仅限于正常雄性小鼠，未涉及其他性别或病理状态下的情况 | 旨在识别和总结三叉神经节中非神经元细胞的类型，为研究细胞可塑性、神经元与非神经元细胞间的相互作用网络及疼痛功能提供基础信息 | 小鼠三叉神经节中的非神经元细胞，包括神经胶质细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞、内皮细胞和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 正常雄性小鼠的三叉神经节样本 |
| 16033 | 2024-08-05 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究探讨了粘附蛋白VIM在胶质瘤进展及其对氧化磷酸化抑制的耐药性中的作用 | 揭示了VIM在胶质瘤细胞中的高表达与氧化磷酸化抑制耐药性之间的关系 | 该研究主要依赖于生物信息学数据和细胞实验，缺乏临床试验验证 | 研究VIM在胶质瘤中的作用，尤其是在氧化磷酸化抑制敏感性方面 | 黏附蛋白VIM及其在胶质瘤细胞中的表达与功能 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序，单细胞测序，DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库获取胶质瘤患者和正常样本的数据进行分析 |
| 16034 | 2024-08-07 |
Meta-Analysis of COVID-19 BAL Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alveolar Epithelial Transitions and Unique Alveolar Epithelial Cell Fates
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0077OC
PMID:37523502
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meta-分析 | 本研究对COVID-19患者的BAL单细胞RNA测序数据进行meta分析，揭示了肺泡上皮细胞的转变和独特的肺泡上皮细胞命运 | 发现了先前未描述的肺泡上皮细胞I型状态，并确认了SPRR3在COVID-19中的上调 | 研究受限于小规模患者队列 | 通过meta分析探讨COVID-19中BAL单细胞RNA测序数据的特征 | COVID-19患者的BAL细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 167,280个高质量细胞，来自13名健康对照和20名COVID-19患者 |
| 16035 | 2024-08-05 |
Identification of a novel cuproptosis-related gene signature for rheumatoid arthritis-A prospective study
2023-Nov, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3535
PMID:37338187
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研究论文 | 本研究旨在识别与类风湿性关节炎（RA）发病机制相关的中心铜死亡基因。 | 首次将铜死亡基因与类风湿性关节炎的免疫细胞浸润关联起来，并识别了中心基因DLAT。 | 样本规模和实验条件可能限制了结果的普遍适用性。 | 识别与类风湿性关节炎相关的铜死亡基因。 | 针对类风湿性关节炎患者的基因表达和免疫细胞浸润进行分析。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 类风湿性关节炎患者样本和细胞实验样本 |
| 16036 | 2024-08-07 |
Integrating imaging-based classification and transcriptomics for quality assessment of human oocytes according to their reproductive efficiency
2023-Nov, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02911-y
PMID:37610606
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研究论文 | 本文通过结合基于影像的分类和转录组学，评估人类卵母细胞的生殖效率 | 开发了一种使用影像数据和单细胞RNA测序的排名工具，用于预测卵母细胞的受精、发育和植入率 | 排名工具的特异性有限，需要进一步的多中心研究验证 | 利用非侵入性影像参数评估人类卵母细胞的受精、发育和植入，并研究其对转录组学的影响 | 人类卵母细胞的影像数据和转录组学 | 数字病理学 | NA | Hoffman调制对比显微镜，单细胞RNA测序 | 二元逻辑回归 | 影像，转录组 | 957个中期II阶段卵母细胞，23个成熟卵母细胞 |
| 16037 | 2024-08-07 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了胰腺导管腺癌肝转移相关的免疫细胞亚群 | 首次通过高维单细胞分析揭示了胰腺导管腺癌微环境中与肝转移相关的免疫细胞变化 | 研究样本量较小，且仅限于特定阶段的病人样本 | 识别胰腺导管腺癌肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞组成，以开发新的治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、血液和淋巴结样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 26个样本来自11名患者 |
| 16038 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of the oncogenic effects of G-protein-coupled receptor kinase-interacting protein-1 and validation on liver hepatocellular carcinoma
2023-Oct, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/161157
PMID:36994687
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研究论文 | 该文章探讨了G-蛋白偶联受体激酶相互作用蛋白-1（GIT1）在泛癌症及肝细胞癌中的肿瘤促进作用 | 该研究首次系统性揭示了GIT1在多种人类癌症中的肿瘤促进机制 | 本研究缺乏临床试验的数据来验证GIT1作为生物标志物的实用性 | 阐明GIT1在泛癌症及肝细胞癌中的分子机制 | 研究对象为人类的多种类型癌症，包括肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 生物信息学方法 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 16039 | 2024-08-05 |
Spatially Resolved Multi-Omics Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Immune Dysfunction in Pancreatic Cancer
2023-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.036
PMID:37263303
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研究论文 | 本文揭示了胰腺癌中免疫微环境的详细视图 | 采用空间分辨的多组学单细胞方法，首次详细描绘了胰腺癌中的免疫景观 | 研究主要集中于治疗未干预的PDAC肿瘤，可能不适用于已有治疗的情况 | 深入了解胰腺癌中的免疫微环境，以指导免疫疗法的研究 | 胰腺导管腺癌（PDAC）和与之匹配的正常胰腺组织以及循环系统中的免疫成分 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫组化，质谱细胞分析 | NA | 免疫表型数据 | 治疗未干预的PDAC肿瘤及其相邻正常胰腺组织的样本 |
| 16040 | 2024-08-07 |
Mature tertiary lymphoid structures are key niches of tumour-specific immune responses in pancreatic ductal adenocarcinomas
2023-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328697
PMID:37230755
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研究论文 | 本文探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中三级淋巴结构（TLSs）对局部抗肿瘤免疫的作用 | 发现PDAC中成熟TLSs支持T细胞活性和肿瘤特异性T细胞的富集，以及肿瘤特异性T细胞通过产生CXCL13作为TLS组织者 | NA | 更好地理解胰腺导管腺癌的免疫微环境 | 胰腺导管腺癌中的T细胞和B细胞及其在三级淋巴结构中的功能状态和空间组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、多色免疫荧光 | NA | RNA | 涉及八种癌症类型的肿瘤浸润T细胞数据以及PDAC患者的批量RNA-seq数据 |