单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16001 2024-08-07
Myosin light-chain 4 gene-transfer attenuates atrial fibrosis while correcting autophagic flux dysregulation
2023-04, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 研究MYL4基因调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的紊乱作用 首次揭示了MYL4蛋白通过调控溶酶体移动性影响心房心肌细胞自噬流,并提出MYL4过表达作为一种潜在的生物治疗策略 NA 探讨MYL4调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的作用 MYL4基因、溶酶体功能、纤维化心房心肌病 NA 心血管疾病 免疫荧光、电子显微镜、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 NA 蛋白质、RNA 涉及MYL4p.E11K突变的小鼠模型
16002 2024-08-07
Immune profiling and prognostic model of pancreatic cancer using quantitative pathology and single-cell RNA sequencing
2023-03-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用定量病理学和单细胞RNA测序技术,对胰腺癌的免疫特征和预后模型进行了深入分析 首次结合定量病理学和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺癌的免疫微环境特征,并建立了基于免疫特征的风险评分预后模型 NA 旨在描绘胰腺导管腺癌的免疫景观,并确定免疫特征在肿瘤免疫微环境中的临床价值 胰腺导管腺癌及其免疫微环境 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化(mIHC) Cox回归分析 免疫特征数据 具体样本数量未在摘要中提及
16003 2024-08-07
Integrated transcriptional analysis reveals macrophage heterogeneity and macrophage-tumor cell interactions in the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar-02, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过综合转录组分析揭示了胰腺导管腺癌进展中巨噬细胞的异质性和巨噬细胞-肿瘤细胞相互作用 开发了一种结合批量和单细胞转录组测序的计算方法,用于描绘巨噬细胞异质性,并应用CellPhoneDB算法推断巨噬细胞-肿瘤相互作用网络 NA 识别肿瘤-巨噬细胞相互作用的分子机制,从而设计新的治疗策略 胰腺导管腺癌中的巨噬细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞转录组测序 CellPhoneDB算法 转录组数据 多个巨噬细胞亚群和胰腺癌细胞系
16004 2024-08-05
Molecular features and evolutionary trajectory of ASCL1+ and NEUROD1+ SCLC cells
2023-03, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文探讨了ASCL1+和NEUROD1+小细胞肺癌细胞的分子特征和演化轨迹 发现ASCL1+和NEUROD1+ SCLC细胞在同一肿瘤组织中共存,并揭示了它们的不同生物学特征和代谢能力 未提及具体的样本量和研究范围的限制 研究小细胞肺癌(SCLC)亚型的生物学功能和演变过程 人类原发性小细胞肺癌组织中的ASCL1+和NEUROD1+细胞 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序 NA 组织样本 NA
16005 2024-08-07
Single-cell profiling of the microenvironment in decidual tissue from women with missed abortions
2023-03, Fertility and sterility IF:6.6Q1
研究论文 本研究旨在定义正常染色体和非整倍体流产及选择性终止妊娠中的蜕膜微环境 首次通过单细胞RNA测序揭示了非整倍体流产蜕膜组织微环境的改变,并发现衰老的基质细胞比例与胚胎染色体异常的相关性 研究样本量较小,且仅限于特定时间段内的患者 探索流产中蜕膜组织的微环境变化及其与胚胎染色体异常的关系 34名经历流产的女性,包括6名选择性终止妊娠和28名非整倍体流产患者 数字病理学 妊娠并发症 单细胞RNA测序,逆转录定量聚合酶链反应 NA 转录组数据 16名女性的蜕膜组织进行单细胞RNA测序,18名女性的蜕膜组织进行逆转录定量聚合酶链反应
16006 2024-08-07
Pancreatic stellate cells exploit Wnt/β-catenin/TCF7-mediated glutamine metabolism to promote pancreatic cancer cells growth
2023-Feb-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 研究揭示了胰腺星状细胞通过Wnt/β-catenin/TCF7介导的谷氨酰胺代谢促进胰腺癌细胞生长的机制 首次详细阐明了胰腺星状细胞在谷氨酰胺代谢和肿瘤-基质代谢相互作用中的具体机制 NA 探讨胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的代谢作用及其机制 胰腺星状细胞和胰腺癌细胞的谷氨酰胺代谢 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及人类组织和细胞样本
16007 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing to identify cellular heterogeneity and targets in cardiovascular diseases: from bench to bedside
2023-02-07, Basic research in cardiology IF:7.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在心血管疾病(CVDs)中的应用,探讨了其在揭示细胞异质性和疾病机制方面的作用 scRNA-seq技术提供了前所未有的单细胞转录组分析分辨率和通量,有助于发现心血管疾病的潜在治疗靶点 NA 探讨scRNA-seq技术在精准医学和临床应用中的潜力 心血管疾病的细胞异质性和疾病机制 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
16008 2024-08-05
Tissue resident iNKT17 cells facilitate cancer cell extravasation in liver metastasis via interleukin-22
2023-01-10, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究探讨了白细胞介素-22在癌症转移中的作用,特别是在肝转移中。 首次揭示了组织驻留的iNKT17细胞通过分泌IL-22促进癌细胞的外渗和转移。 该研究主要集中在小鼠模型,可能不完全适用于人类肿瘤转移的复杂性。 研究IL-22在癌细胞转移过程中的作用及其潜在的治疗靶点。 研究对象为小鼠,特别是IL-22缺失小鼠及相应的iNKT细胞。 数字病理学 肝癌 流式细胞术和单细胞测序 小鼠模型 细胞 多个小鼠样本,包括IL-22缺失小鼠和野生型小鼠
16009 2024-08-07
Macrophage activation drives ovarian failure and masculinization
2023-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过斑马鱼模型研究了巨噬细胞激活与卵巢功能障碍之间的关系 首次揭示了BMP15基因突变通过激活巨噬细胞导致卵巢功能障碍的细胞机制 研究仅在斑马鱼模型中进行,需要进一步在人类中验证 探讨BMP15基因突变导致的卵巢功能障碍的细胞机制及其与免疫系统的关系 斑马鱼模型中的卵巢功能和巨噬细胞激活 NA 卵巢功能障碍 单细胞RNA测序 NA RNA 斑马鱼模型
16010 2024-08-05
OX40L-Armed Oncolytic Virus Boosts T-cell Response and Remodels Tumor Microenvironment for Pancreatic Cancer Treatment
2023, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 该论文探讨了OX40L武装的溶瘤病毒在胰腺癌治疗中的治疗效果 研究表明OX40L武装溶瘤病毒能够重塑肿瘤微环境并增强T细胞反应 未提及具体的临床试验数据或人类研究结果 研究OX40L武装溶瘤病毒在胰腺导管腺癌治療中的疗效及其机制 以KPC鼠模型为对象,研究溶瘤病毒对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 数字病理学 胰腺癌 HSV-1显性病毒 NA 单细胞RNA测序 KPC肿瘤-bearing C57BL/6小鼠
16011 2024-08-05
The application of single-cell sequencing in pancreatic neoplasm: analysis, diagnosis and treatment
2023-01, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文总结了单细胞测序在胰腺肿瘤中的应用,包括技术、肿瘤异质性和治疗。 提出了单细胞RNA测序的使用,以分析肿瘤内每个细胞,而不是它们的平均水平,增强了对胰腺肿瘤异质性的理解。 先前的研究仅集中于患者与健康个体之间的差异,而忽视了肿瘤内的异质性。 研究胰腺肿瘤,包括胰腺导管腺癌、腺样囊性肿瘤和胰腺囊性肿瘤的单细胞测序应用。 胰腺肿瘤,特别是胰腺导管腺癌、腺样囊性肿瘤和胰腺囊性肿瘤。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA NA
16012 2024-08-05
Pan-cancer analysis of Krüppel-like factor 3 and its carcinogenesis in pancreatic cancer
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了克鲁伯样因子3(KLF3)在各种癌症及肿瘤微环境中的作用。 发现KLF3在胰腺癌中的异常表达能够有效预测患者预后,并在肿瘤微环境中发挥重要作用。 本研究未详细探讨KLF3在所有类型肿瘤中的具体机制,部分数据来源于已有数据库。 研究KLF3在全癌症中的表达及其在胰腺癌中的致癌作用。 聚焦于KLF3在不同癌症及胰腺癌中的作用及其机制。 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序,Cox回归分析,Kaplan-Meier分析 NA 基因表达数据 使用TCGA和GTEx数据库进行大规模数据分析,具体样本数量未明确
16013 2024-08-05
Integrated analyses of single-cell transcriptomics identify metastasis-associated myeloid subpopulations in breast cancer lung metastasis
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析识别了在乳腺癌肺转移中与转移相关的髓系亚群。 首次整合分析髓系细胞的异质性和特异性,揭示其在肺转移中的重要作用 对于其他类型的转移或癌症中髓系细胞的角色尚未进行广泛研究 阐明髓系细胞在乳腺癌肺转移中的作用及其分子机制 研究乳腺癌肺转移中的髓系细胞亚群,包括单核细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组学 MMTV-PyVT 转基因小鼠 细胞转录组数据 涉及MMTV-PyVT转基因小鼠中的髓系细胞亚群
16014 2024-08-05
Prognostic-related genes for pancreatic cancer typing and immunotherapy response prediction based on single-cell sequencing data and bulk sequencing data
2023, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胰腺癌的分子亚型和与预后相关的关键基因 首次基于单细胞测序和大规模RNA测序数据将胰腺癌分类为三种分子亚型,并鉴定了五个与预后相关的基因 未提及具体限制因素 研究胰腺癌患者的分子亚型及其预后和免疫治疗反应 胰腺癌患者及其单细胞和大规模RNA测序数据 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序和大规模RNA测序 NA 基因组数据 NA
16015 2024-08-05
Identification of fibroblast-related genes based on single-cell and machine learning to predict the prognosis and endocrine metabolism of pancreatic cancer
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究基于单细胞测序和机器学习识别了与成纤维细胞相关的基因,以预测胰腺癌的预后和内分泌代谢 通过单细胞分析和加权共表达网络分析,构建了一个新的风险评估工具以评估胰腺癌的预后 本研究的样本量和数据集限制可能影响模型的泛化能力 探索胰腺癌相关基因的作用,并构建预测胰腺癌预后的风险评估工具 研究对象为胰腺腺癌细胞中的特定细胞亚群及相关基因 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序 COX模型 基因组数据 GSE165399数据集中的多种细胞亚群
16016 2024-08-05
VG161 activates systemic antitumor immunity in pancreatic cancer models as a novel oncolytic herpesvirus expressing multiple immunomodulatory transgenes
2023-01, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 VG161是一种表达多种免疫调节转基因的新型溶瘤疱疹病毒,可以激活胰腺癌模型中的全身抗肿瘤免疫 VG161是首个携带多种协同抗肿瘤免疫调节因素的重组溶瘤疱疹病毒 目前尚未进行临床试验,实际临床效果需进一步验证 研究VG161在胰腺癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制 胰腺癌模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序、气流辅助解吸电喷雾离子化-质谱成像(AFADSI-MSI)、纳米字符串技术 NA 细胞样本 临床样本变化,具体数量未明确
16017 2024-08-07
Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses along with abundant machine learning methods identify a novel monocyte signature in SKCM
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析,结合多种机器学习方法,识别出皮肤黑色素瘤(SKCM)中与疾病特异性生存相关的新型单核细胞特征 本研究构建了一个由八个基因组成的单核细胞相关特征(MRS),并验证其为疾病特异性生存的独立风险因素,具有比传统临床变量和分子特征更高的准确性 NA 探索皮肤黑色素瘤(SKCM)免疫微环境中免疫细胞通信的全局模式,并建立基于关键特异性生物标志物的预后特征 皮肤黑色素瘤(SKCM)中的免疫细胞及其通信网络 数字病理学 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习 RNA测序数据 使用了来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的单细胞RNA测序数据集,具体样本数量未详细说明
16018 2024-08-07
An extensive bioinformatics study on the role of mitochondrial solute carrier family 25 in PC and its mechanism behind affecting immune infiltration and tumor energy metabolism
2022-12-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过lasso方法构建了一个基于SLC25A成员的胰腺癌(PC)新型预后风险模型,并探讨了其在肿瘤免疫学和能量代谢中的作用 首次构建了基于SLC25A成员的胰腺癌预后风险模型,并揭示了SLC25A11、SLC25A29和SLC25A44在肿瘤能量代谢和免疫浸润中的作用 NA 探讨线粒体溶质载体家族25(SLC25A)成员在胰腺癌中的生物学作用及其影响免疫浸润和肿瘤能量代谢的机制 SLC25A成员在胰腺癌中的作用及其机制 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) lasso方法 基因表达数据 NA
16019 2024-08-07
Cancer immunotherapies transition endothelial cells into HEVs that generate TCF1+ T lymphocyte niches through a feed-forward loop
2022-12-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学、内皮细胞命运图谱和功能性多重免疫分析,展示了抗血管生成免疫调节疗法如何通过淋巴毒素/淋巴毒素β受体信号传导诱导后毛细血管静脉向炎症性高内皮小静脉(HEVs)的转分化 本文首次揭示了肿瘤HEVs通过淋巴毒素/淋巴毒素β受体信号传导促进肿瘤内淋巴细胞流入和形成允许性淋巴细胞微环境的新机制 本文未详细探讨肿瘤HEVs在不同类型癌症中的普遍性和具体作用机制 探讨肿瘤相关三级淋巴样结构(TA-TLLSs)的形成机制及其在免疫治疗中的作用 肿瘤内皮细胞、淋巴细胞及其相互作用 免疫学 癌症 单细胞转录组学、内皮细胞命运图谱、功能性多重免疫分析 NA 转录组数据 未具体说明样本数量
16020 2024-08-07
Single-cell analysis reveals nanosecond pulsed electric field ablation induced myeloid cells remodeling in pancreatic cancer
2022-Dec, Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了纳米秒脉冲电场(nsPEF)处理后胰腺癌小鼠模型中骨髓细胞的表型和功能变化 首次详细描述了nsPEF处理对胰腺癌中肿瘤浸润性骨髓细胞的重组作用 NA 探究nsPEF治疗对胰腺癌中骨髓细胞的影响及其对肿瘤免疫的调控作用 胰腺癌小鼠模型中的骨髓细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA Panc02胰腺癌小鼠模型
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