单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 16001 - 16020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16001 | 2024-08-07 |
A Comparative Study of Endoderm Differentiation Between Activin A and Small Molecules
2023-Dec, Experimental and clinical endocrinology & diabetes : official journal, German Society of Endocrinology [and] German Diabetes Association
IF:1.6Q4
DOI:10.1055/a-2182-8936
PMID:38056491
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研究论文 | 本研究比较了Activin A和小分子化合物在诱导内胚层分化中的效果 | 发现CHIR99021能有效促进内胚层分化，且IDE1和CHIR99021的协同作用下，实验细胞中有43.4%为SOX17阳性 | IDE1和CHIR99021协同作用下内胚层分化的能力仍不足 | 验证小分子化合物对内胚层分化的促进作用 | 内胚层分化 | NA | NA | Western blot分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验涉及的细胞数量未明确提及 |
| 16002 | 2024-08-07 |
Resident regulatory T cells reflect the immune history of individual lymph nodes
2023-11-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj5789
PMID:37874251
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研究论文 | 本文通过使用稳定的光可转换蛋白进行原位标记，揭示了淋巴结中调节性T细胞的转换率，并发现其中一部分具有记忆样特性的驻留细胞 | 首次揭示了淋巴结中调节性T细胞的驻留记忆样群体，并展示了这些细胞在局部慢性炎症治疗中的潜在应用 | 文章未明确提及研究的具体限制 | 研究淋巴结中调节性T细胞的动态及其在免疫反应中的作用 | 淋巴结中的调节性T细胞及其亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10至20%的淋巴结中的调节性T细胞为记忆样驻留细胞 |
| 16003 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing data and transcriptomic data to unravel potential mechanisms and signature genes of the progression of idiopathic pulmonary fibrosis to lung adenocarcinoma and predict therapeutic agents
2023-Nov-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01274-y
PMID:37996625
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序数据和转录组数据，揭示特发性肺纤维化向肺腺癌进展的潜在机制和特征基因，并预测治疗药物 | 本研究首次通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，识别了特发性肺纤维化和肺腺癌共有的特征基因，并构建了TF-基因-miRNA调控网络，预测了潜在的治疗药物 | 本研究主要基于公共数据库的数据，需要进一步的实验验证 | 揭示特发性肺纤维化向肺腺癌进展的潜在机制和特征基因，并预测治疗药物 | 特发性肺纤维化和肺腺癌的特征基因及治疗药物 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 涉及650个差异表达基因和1773个模块特征基因 |
| 16004 | 2024-08-07 |
Intestinal Paneth cell differentiation relies on asymmetric regulation of Wnt signaling by Daam1/2
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9673
PMID:38000028
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研究论文 | 本文研究了肠道Paneth细胞分化依赖于Daam1/2不对称调控Wnt信号通路 | 首次报道Daam1和Daam2不对称调节Wnt信号通路的机制，并揭示其对Paneth细胞分化的影响 | NA | 探究Daam1/2在肠道Paneth细胞分化中的作用及其对Wnt信号通路的调控机制 | 肠道Paneth细胞的分化及Wnt信号通路的调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16005 | 2024-08-07 |
Neurodevelopmental defects in human cortical organoids with N-acetylneuraminic acid synthase mutation
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf2772
PMID:38000033
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研究论文 | 本文研究了N-乙酰神经氨酸合酶（NANS）突变对人类皮质类器官神经发育缺陷的影响。 | 首次揭示了NANS介导的内源性唾液酸生物合成在调节人类皮质发育中的关键作用，并将其与临床相关的神经发育障碍联系起来。 | NA | 探讨NANS突变对神经发育的影响及其机制。 | 人类皮质类器官和NANS突变。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16006 | 2024-08-07 |
The cellular trajectories of tumor-associated macrophages decipher the heterogeneity of pancreatic cancer
2023-Nov-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01266-y
PMID:37991591
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过Seurat和Monocle算法分析肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在胰腺癌中的细胞轨迹，揭示其异质性并探索潜在的治疗策略。 | 首次详细分析了胰腺癌中TAMs的进化轨迹，并根据其分子分类和免疫景观预测了治疗敏感性。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的体外和体内实验验证。 | 揭示胰腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并探索针对性的治疗策略。 | 胰腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | digital pathology | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 16007 | 2024-08-07 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568285
PMID:38045409
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research paper | 本文介绍了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于从单细胞测序数据中准确识别克隆性线粒体突变并推断进化谱系 | MitoTracer算法在识别克隆性线粒体突变方面表现出高灵敏度和特异性，优于现有方法 | NA | 开发一种能够自动识别有信息量的线粒体突变并推断细胞谱系的计算算法 | 线粒体突变和单细胞测序数据 | machine learning | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | single cell sequencing data | 未具体说明样本数量 |
| 16008 | 2024-08-05 |
Temporal and spatial analysis of astrocytes following stroke identifies novel drivers of reactivity
2023-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566710
PMID:38014211
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研究论文 | 本研究探讨了中风后星形胶质细胞的时间和空间变化 | 识别出了一些独特的星形胶质细胞亚群体及其反应性的驱动因素 | 研究中使用的是小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 了解中风后星形胶质细胞的反应机制及其异质性 | 约138,000个小鼠前脑星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约138,000个小鼠前脑星形胶质细胞 |
| 16009 | 2024-08-07 |
Investigating EGF and PAG1 as necroptosis-related biomarkers for diabetic nephropathy: an in silico and in vitro validation study
2023-11-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205233
PMID:37988198
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学和实验验证，探讨糖尿病肾病中调控细胞死亡（RCD）的机制并识别相关生物标志物 | 本研究通过基因集变异分析（GSVA）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），结合实验验证，首次识别出EGF和PAG1作为糖尿病肾病中与坏死性凋亡相关的生物标志物 | NA | 理解糖尿病肾病中调控细胞死亡的机制并识别相关生物标志物 | 糖尿病肾病中的调控细胞死亡机制及相关生物标志物 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 基因集变异分析（GSVA），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA测序数据 | 独立队列和HK-2细胞 |
| 16010 | 2024-08-07 |
Prognostic hub gene CBX2 drives a cancer stem cell-like phenotype in HCC revealed by multi-omics and multi-cohorts
2023-11-17, Aging
DOI:10.18632/aging.205173
PMID:37980163
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研究论文 | 本研究通过多组学和多队列数据，揭示了CBX2基因在肝细胞癌（HCC）中作为癌症干细胞样表型的驱动因子 | 首次详细探讨了CBX2在HCC中的作用及其与癌症干细胞样表型的关联，并揭示了其在免疫治疗中的潜在应用 | NA | 探讨CBX2基因在肝细胞癌中的作用及其对癌症干细胞样表型的影响 | CBX2基因及其在肝细胞癌中的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 使用了TCGA-LIHC和GSE140845两个数据集 |
| 16011 | 2024-08-05 |
Deciphering the Functional Roles of Individual Cancer Alleles Across Comprehensive Cancer Genomic Studies
2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567106
PMID:38014215
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研究论文 | 本论文介绍了一种新数学公式的REVEALER 2.0算法，用于解析个别癌症等位基因的功能角色 | REVEALER 2.0算法在速度和效率上提升了约150倍，适用于更大规模的数据集 | 未提及具体的限制 | 解析个别癌症等位基因在复杂癌症基因组数据中的功能角色 | 癌症基因组中的个体基因组病变 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序技术 | REVEALER 2.0 | 基因组数据 | NA |
| 16012 | 2024-08-05 |
Transcriptome-based identification of tumor-reactive and bystander CD8+ T cell receptor clonotypes in human pancreatic cancer
2023-11-15, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh9562
PMID:37967201
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体功能测试，识别了胰腺癌中肿瘤反应性和旁观者CD8+ T细胞受体克隆类型 | 本研究结合了单细胞转录组技术与功能测试，为胰腺癌提供了新颖的T细胞亚群区分标准 | 研究样本数量有限，可能无法完全代表所有胰腺癌病例 | 旨在通过识别CD8+ T细胞受体克隆类型，为个性化免疫疗法提供依据 | 研究对象为胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润性T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 93个肿瘤反应性TCR克隆类型和65个旁观者TCR克隆类型 |
| 16013 | 2024-08-05 |
Single cell spatial transcriptomic profiling of childhood-onset lupus nephritis reveals complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.09.566503
PMID:38014158
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学揭示了儿童起病狼疮性肾炎中肾间质与浸润免疫细胞之间的复杂相互作用 | 该研究利用空间转录组学技术获得了儿童起病狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞分辨率图谱，提供了新的免疫病理机制见解 | 肾小管细胞转录特征与组织学评分之间几乎没有相关性，说明在个别肾小管级别上仍存在信息缺口 | 探索儿童起病狼疮性肾炎（cLN）中肾脏细胞与免疫细胞之间的互动 | 来自八名儿童起病狼疮性肾炎患者和两名对照者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自八名儿童起病狼疮性肾炎患者和两名对照者的超过40万细胞样本 |
| 16014 | 2024-08-07 |
PCDH1, a poor prognostic biomarker and potential target for pancreatic adenocarcinoma metastatic therapy
2023-Nov-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11474-1
PMID:37957639
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研究论文 | 本研究探讨了PCDH1作为胰腺腺癌（PAAD）的预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 发现PCDH1在PAAD细胞中的表达显著高于正常胰腺导管细胞，并且其上调促进了胰腺癌细胞的转移 | NA | 识别PAAD的新潜在治疗靶点和预后生物标志物 | PCDH1在PAAD中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学（IHC），实时定量聚合酶链反应（qPCR），蛋白质印迹（western blotting） | NA | RNA，蛋白质 | 来自患者的蜡块切片，PAAD细胞系Panc-0813 |
| 16015 | 2024-08-07 |
Identification of Cellular Interactions in the Tumor Immune Microenvironment Underlying CD8 T Cell Exhaustion
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.09.566384
PMID:38014233
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研究论文 | 本研究构建了一个分析框架，用于识别与CD8 T细胞耗竭相关的免疫细胞类型特异性基因调控网络模式，并分析了单细胞RNA测序数据，以比较肿瘤和慢性病毒感染样本中T细胞耗竭过程的差异 | 本研究开发了一个新的分析框架，不仅可以应用于肿瘤免疫微环境，还可以扩展到任何涉及细胞间通信的系统，有助于深入理解支持癌症和其他复杂疾病有效治疗的关键生物学过程 | 由于过程的复杂性，无法简单推断其他细胞类型对单一细胞类型过程的贡献 | 研究CD8 T细胞耗竭过程及其在免疫治疗中的作用 | 肿瘤浸润性CD8 T细胞的耗竭程度及免疫细胞类型特异性基因调控网络模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类皮肤肿瘤样本及慢性病毒感染样本 |
| 16016 | 2024-08-05 |
An integrated study to decipher immunosuppressive cellular communication in the PDAC environment
2023-Nov-10, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00320-6
PMID:37945567
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研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）环境中的免疫抑制细胞通信。 | 探索了TAMs在PDAC微环境中的关键作用，并揭示了LGALS9基因的上调及其与其他细胞的相互作用。 | NA | 揭示PDAC肿瘤微环境中的细胞通信机制。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤样本中的细胞。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，scRNA-seq，和bulk RNA-seq | NA | RNA数据 | PDAC样本和健康样本对比 |
| 16017 | 2024-08-07 |
Dynamic scRNA-seq of live human pancreatic slices reveals functional endocrine cell neogenesis through an intermediate ducto-acinar stage
2023-11-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.10.001
PMID:37898119
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，分析了人胰腺切片在不同时间点和再生刺激下的细胞变化，揭示了内分泌细胞通过中间导管腺泡阶段的新生过程。 | 首次对整个人类胰腺组织进行纵向单细胞RNA测序分析，动态展示了胰腺的可塑性。 | 研究主要基于同一供体的胰腺切片，可能限制了结果的普遍性。 | 探究人类胰腺的可塑性及其内分泌细胞的生成过程。 | 人胰腺切片及其在不同时间点和再生刺激下的细胞变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自同一供体的多个时间点的胰腺切片样本 |
| 16018 | 2024-08-07 |
Kidney single-cell transcriptomes uncover SGLT2i-induced metabolic reprogramming via restoring glycolysis and fatty acid oxidation
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.564836
PMID:37961186
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研究论文 | 本研究通过分析公开的单细胞RNA测序数据，探讨了SGLT2抑制剂对db/db小鼠肾脏代谢的影响 | 首次揭示了SGLT2抑制剂通过恢复糖酵解和脂肪酸氧化来保护肾脏代谢的新机制 | 研究仅基于db/db小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨SGLT2抑制剂对糖尿病肾病肾脏代谢的保护作用及其机制 | db/db小鼠的肾脏单细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | db/db小鼠及对照组 |
| 16019 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals characteristics in tumor microenvironment of PDAC with MSI-H following neoadjuvant chemotherapy with anti-PD-1 therapy
2023-11-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216421
PMID:37778681
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受新辅助化疗和免疫治疗后高微卫星不稳定性胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境特征 | 首次揭示了新辅助治疗后高微卫星不稳定性胰腺导管腺癌残余病变的特征以及肿瘤微环境的变化 | 研究只基于单个病例，样本量较小，结果可能不具广泛适用性 | 探讨高微卫星不稳定性胰腺导管腺癌的肿瘤微环境在化疗与免疫治疗联合治疗后的变化 | 一例接受新辅助治疗后进行根治性手术的高微卫星不稳定性胰腺导管腺癌患者的残余病变 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1例 |
| 16020 | 2024-08-05 |
Landscape and the immune patterns of cuproptosis in oral squamous cell carcinoma
2023-Nov, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13489
PMID:37828627
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研究论文 | 本研究旨在探讨与口腔鳞状细胞癌相关的cuproptosis基因及其预后价值 | 首次将cuproptosis相关基因与口腔鳞状细胞癌的免疫微环境和预后相结合进行分析 | 仅分析了特定的基因和数据集，可能不适用于所有类型的口腔鳞状细胞癌 | 研究cuproptosis相关基因在口腔鳞状细胞癌中的作用及其预后意义 | 分析了13个与cuproptosis相关的基因 | 数字病理学 | 口腔癌 | RNA-seq | 随机森林算法 | 基因组数据和RNA-seq数据 | NA |