单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 15981 - 16000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15981 | 2024-08-07 |
The role of Jagged1 as a dynamic switch of cancer cell plasticity in PDAC assembloids
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71364
PMID:35673567
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研究论文 | 本文研究了Jagged1在胰腺导管腺癌（PDAC）集合体中作为癌症细胞可塑性的动态开关的作用 | 首次成功区分了PDAC集合体中的癌症起始细胞（CIC）向上皮管状癌的方向发展，并揭示了Jagged1通过与WNT5B的相互作用在PDAC细胞可塑性中的关键作用 | 癌症细胞可塑性使用患者来源的PDAC类器官的研究仍然不足 | 探讨PDAC细胞可塑性的机制及其在肿瘤异质性维持中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）集合体中的癌症细胞可塑性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PDAC集合体中的上皮管状癌细胞、内皮细胞（ECs）和自体免疫细胞 |
| 15982 | 2024-08-07 |
Discovering a Four-Gene Prognostic Model Based on Single-Cell Data and Gene Expression Data of Pancreatic Adenocarcinoma
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.883548
PMID:35800432
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研究论文 | 本研究基于单细胞数据和基因表达数据，探索了胰腺腺癌的新分子亚型和预后模型 | 本研究首次识别了与胰腺腺癌预后显著相关的记忆B细胞（MBCs），并构建了两个具有不同总生存期的免疫亚型（IS1和IS2） | NA | 探索胰腺腺癌的新分子亚型和预后模型 | 胰腺腺癌的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox | 基因表达数据 | 3个具有单细胞数据的胰腺腺癌样本和566个具有基因表达数据的样本 |
| 15983 | 2024-08-07 |
Circulating Monocytes Act as a Common Trigger for the Calcification Paradox of Osteoporosis and Carotid Atherosclerosis via TGFB1-SP1 and TNFSF10-NFKB1 Axis
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.944751
PMID:35937796
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研究论文 | 本文研究了循环单核细胞通过TGFB1-SP1和TNFSF10-NFKB1轴在骨质疏松症和颈动脉粥样硬化中的钙化悖论中的触发作用。 | 首次揭示了CD14+单核细胞在骨质疏松症和颈动脉粥样硬化中钙化悖论的触发作用，并基于scRNA和mRNA数据阐明了其机制。 | NA | 旨在展示CD14+单核细胞如何促进共存的女性绝经后骨质疏松症和颈动脉粥样硬化的病理生理过程。 | 研究对象包括骨质疏松症和颈动脉粥样硬化的数据集，以及CD14+单核细胞与成骨细胞和血管平滑肌细胞（SMC）之间的相互作用。 | 数字病理学 | 骨质疏松症，心血管疾病 | scRNA-seq, mRNA | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE56814和GSM4423510的骨质疏松症数据集，以及GSE23746和GSM4705591的颈动脉粥样硬化数据集。 |
| 15984 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals heterogeneity between pancreatic adenosquamous carcinoma and pancreatic ductal adenocarcinoma with prognostic value
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.972298
PMID:36052088
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了胰腺腺鳞癌（ASPC）和胰腺导管腺癌（PDAC）的细胞异质性，并探讨了其预后价值 | 首次通过单细胞测序揭示了ASPC与PDAC在免疫微环境中的细胞类型和分化路径差异，并发现了两种新型癌症相关成纤维细胞（nCAFs和imCAFs）以及具有鳞状细胞特征的ASPC特异性癌细胞亚群 | 研究样本量较小，且仅基于单个ASPC患者和IPMN患者的肿瘤组织进行分析 | 探讨胰腺腺鳞癌与胰腺导管腺癌的细胞异质性及其预后价值 | 胰腺腺鳞癌（ASPC）和胰腺导管腺癌（PDAC）的细胞类型及其在免疫微环境中的差异 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 共分析了五个PDAC患者、一个IPMN患者和一个ASPC患者的单细胞测序数据 |
| 15985 | 2024-08-07 |
The integration of single-cell sequencing, TCGA, and GEO data analysis revealed that PRRT3-AS1 is a biomarker and therapeutic target of SKCM
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.919145
PMID:36211371
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、TCGA和GEO数据库的数据分析，揭示了PRRT3-AS1作为皮肤黑色素瘤（SKCM）的生物标志物和治疗靶点 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，探索了SKCM中的预后lncRNAs，并构建了一个具有显著预后价值的5标记lncRNAs模型 | NA | 探索SKCM中的预后lncRNAs，并确定PRRT3-AS1作为诊断和预后的生物标志物 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）及其生物标志物PRRT3-AS1 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 包括TCGA队列和GEO数据库中的多个黑色素瘤样本（GSE72056, GSE19234, GSE15605, GSE7553, GSE81383） |
| 15986 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of PBMC characterizes the altered transcriptomic landscape of classical monocytes in BNT162b2-induced myocarditis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.979188
PMID:36225942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了BNT162b2疫苗引起的心肌炎患者外周血单个核细胞的转录组变化，特别是经典单核细胞的基因表达特征 | 首次揭示了BNT162b2疫苗接种后心肌炎发病机制中经典单核细胞的重要性，并提出了疫苗可能影响单核细胞，进而诱导其分化和浸润心脏的可能性 | NA | 确定BNT162b2疫苗引起的心肌炎的发病机制，并开发预测接种后是否可能发展为心肌炎的生物标志物 | BNT162b2疫苗引起的心肌炎患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个患者的外周血单个核细胞 |
| 15987 | 2024-08-07 |
Identification of the Immune Status of Hypertrophic Cardiomyopathy by Integrated Analysis of Bulk- and Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2022/7153491
PMID:36238494
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研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞RNA测序数据，分析了肥厚型心肌病（HCM）中的免疫浸润相关基因 | 结合批量测序和单细胞测序技术，首次全面分析了HCM中的免疫细胞浸润模式及其相关基因 | 研究主要基于公共数据库中的数据，未涉及临床样本的直接分析 | 探索肥厚型心肌病中的免疫浸润情况及其相关基因 | 肥厚型心肌病患者与正常组的免疫细胞浸润差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 使用了GSE36961、GSE160997和GSE122930三个数据集 |
| 15988 | 2024-08-07 |
A necroptosis related prognostic model of pancreatic cancer based on single cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1022420
PMID:36275722
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析和转录组分析构建了与坏死性凋亡相关的胰腺癌预后模型 | 首次通过单细胞测序和转录组分析构建了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的预后模型，并验证了关键基因EPS8的作用 | NA | 探讨坏死性凋亡在胰腺癌中的意义，并构建相关的预后模型 | 胰腺癌的转录组数据和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 转录组分析 | COX回归, Lasso回归 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 使用了来自TCGA数据库、ICGC数据库和GEO数据库的多个队列数据，以及来自GSE154778的单细胞测序数据 |
| 15989 | 2024-08-07 |
Innate immunity in pancreatic cancer: Lineage tracing and function
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1081919
PMID:36726981
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研究论文 | 本文探讨了胰腺癌中先天免疫细胞的来源与功能，以指导胰腺癌的免疫治疗 | 通过单细胞RNA测序研究胰腺癌免疫微环境，发现先天免疫细胞的主导作用 | NA | 深入研究胰腺癌中先天免疫淋巴细胞的来源与功能，以改善免疫治疗效果 | 胰腺癌中的先天免疫细胞，如巨噬细胞、树突状细胞、肥大细胞和先天免疫淋巴细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15990 | 2024-08-07 |
TNF receptor-related factor 3 inactivation promotes the development of intrahepatic cholangiocarcinoma through NF-κB-inducing kinase-mediated hepatocyte transdifferentiation
2023-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32317
PMID:34995376
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研究论文 | 本研究通过体内插入突变筛选，发现TNF受体相关因子3（TRAF3）失活通过NF-κB诱导激酶（NIK）介导的肝细胞转分化促进肝内胆管癌（ICC）的发展 | 首次揭示TRAF3失活通过NIK介导的肝细胞转分化促进ICC发展的机制，并提出TRAF3-NIK轴作为潜在的治疗靶点 | NA | 识别肝内胆管癌的分子驱动因素并寻找治疗靶点 | 肝内胆管癌（ICC） | NA | 肝内胆管癌 | Sleeping Beauty转座子、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Pten敲除和KrasG12D突变小鼠模型，以及多个人类ICC细胞系 |
| 15991 | 2024-08-07 |
Cigarette smoke augments CSF3 expression in neutrophils to compromise alveolar-capillary barrier function during influenza infection
2022-08, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02049-2021
PMID:35058252
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研究论文 | 研究吸烟如何通过增加中性粒细胞中CSF3表达来损害流感感染时的肺泡-毛细血管屏障功能 | 揭示了吸烟加剧流感感染的机制，并发现了潜在的治疗靶点（如过量的vRNA积累、水肿性CSF3R信号传导） | 临床上rCSF3治疗在病毒性传染病中的潜在限制 | 探讨吸烟与流感感染之间的免疫机制 | 吸烟对流感感染的影响及其免疫机制 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 15992 | 2024-08-07 |
Development and validation of prognostic and diagnostic model for pancreatic ductal adenocarcinoma based on scRNA-seq and bulk-seq datasets
2022-05-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab343
PMID:34957503
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研究论文 | 本文开发并验证了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序数据集的胰腺导管腺癌（PDAC）预后和诊断模型 | 本文通过比较肿瘤细胞和正常导管细胞的差异表达基因（DEGs），利用多变量Cox或逻辑回归分析构建了预后和诊断模型，并开发了一种易于使用的诺模图来预测PDAC的2年和3年总体生存率 | NA | 开发和验证胰腺导管腺癌的预后和诊断模型 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其预后和诊断 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型，逻辑回归模型 | 基因-细胞矩阵 | 从GSA数据库下载的scRNA-seq分析的原始基因-细胞矩阵数据 |
| 15993 | 2024-08-07 |
Loss of Rnf43 Accelerates Kras-Mediated Neoplasia and Remodels the Tumor Immune Microenvironment in Pancreatic Adenocarcinoma
2022-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.12.273
PMID:34973294
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研究论文 | 本研究描述了一种遗传工程小鼠模型（GEMM），该模型具有条件性表达的致癌Kras和外分泌细胞中Rnf43催化域的缺失，用于研究RNF43突变对胰腺导管腺癌（PDAC）的影响。 | 本研究首次展示了RNF43缺失加速Kras介导的胰腺肿瘤形成，并重塑了肿瘤免疫微环境，为PDAC的免疫治疗提供了新的策略。 | NA | 研究RNF43突变对胰腺导管腺癌的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用。 | 遗传工程小鼠模型（GEMM）中的胰腺导管腺癌。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KRC和KC小鼠模型 |
| 15994 | 2024-08-07 |
Downregulated cytotoxic CD8+ T-cell identifies with the NKG2A-soluble HLA-E axis as a predictive biomarker and potential therapeutic target in keloids
2022-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00834-1
PMID:35039632
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研究论文 | 本研究旨在通过分析瘢痕疙瘩组织和血液细胞，发现细胞毒性CD8 T细胞下调是瘢痕疙瘩的一个特征，并探讨NKG2A/CD94复合体和可溶性人类白细胞抗原-E（sHLA-E）在其中的作用。 | 首次揭示了NKG2A/CD94复合体在瘢痕疙瘩中的上调现象，并发现sHLA-E作为诊断和预后标志物的潜力。 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证sHLA-E作为生物标志物的有效性。 | 寻找瘢痕疙瘩的分子和细胞水平特征，以开发新的生物标志物和治疗靶点。 | 瘢痕疙瘩组织和血液细胞中的细胞毒性CD8 T细胞及NKG2A/CD94复合体。 | 免疫学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和组织样本 | 104名瘢痕疙瘩患者，512名健康捐赠者，100名其他疾病患者 |
| 15995 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of Nicotiana attenuata corolla cells reveals the biosynthetic pathway of a floral scent
2022-04, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.17992
PMID:35075650
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了野生烟草Nicotiana attenuata花冠细胞中苯乙酮（BA）的生物合成途径 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了野生烟草花冠细胞中苯乙酮的完整生物合成途径 | NA | 揭示植物细胞类型特异性代谢的分子特征 | 野生烟草Nicotiana attenuata的花冠细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 3756个单细胞 |
| 15996 | 2024-08-07 |
Expansion of Fcγ Receptor IIIa-Positive Macrophages, Ficolin 1-Positive Monocyte-Derived Dendritic Cells, and Plasmacytoid Dendritic Cells Associated With Severe Skin Disease in Systemic Sclerosis
2022-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41813
PMID:34042322
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2465个来自12名弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者和10名健康对照者的皮肤活检样本中的髓系细胞转录组，以全面理解驱动dcSSc皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了dcSSc特异性的髓系细胞集群，并发现与正常对照相比，dcSSc中存在高度表达Fcγ受体IIIA的巨噬细胞集群和高度表达FCN-1等单核细胞标志物的mo-DCs，这些细胞与更严重的皮肤疾病相关。 | 本研究仅分析了12名dcSSc患者和10名健康对照者的皮肤样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。此外，髓系细胞的活化在不同患者间存在差异，表明潜在的病理机制和/或疾病活动的时间差异，但具体机制未深入探讨。 | 旨在全面理解驱动弥漫性皮肤系统性硬化症皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤活检样本中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2465个髓系细胞样本，来自12名dcSSc患者和10名健康对照者 |
| 15997 | 2024-08-07 |
The critical role of B4GALT4 in promoting microtubule spindle assembly in HCC through the regulation of PLK1 and RHAMM expression
2022-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30531
PMID:34270095
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研究论文 | 本文通过生物信息学方法研究了B4GALT家族糖基转移酶在肝细胞癌（HCC）中的表达及其与临床病理参数和下游靶基因的相关性，特别是B4GALT4在微管纺锤体组装中的作用。 | 首次揭示了B4GALT4通过调节PLK1和RHAMM的表达在HCC中促进微管纺锤体组装的关键作用，并通过基因本体分析和单细胞RNA测序数据验证了这一发现。 | NA | 探讨B4GALT家族成员在肝细胞癌中的作用及其对患者预后的影响。 | B4GALT家族糖基转移酶在肝细胞癌中的表达及其生物学功能。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个数据库中的肿瘤组织样本和HCC患者数据 |
| 15998 | 2024-08-07 |
On the Origin of Pancreatic Cancer: Molecular Tumor Subtypes in Perspective of Exocrine Cell Plasticity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.11.010
PMID:34875393
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）的起源，特别是外分泌细胞可塑性对分子肿瘤亚型的影响 | 探讨了外分泌细胞的不同分化状态与PDAC分子亚型之间的转录组和表观遗传学关系，提出了不同肿瘤亚型的不同起源 | NA | 旨在深入理解PDAC的生物学特性，特别是外分泌细胞在PDAC起源中的作用 | 胰腺导管腺癌及其细胞起源 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传组数据 | NA |
| 15999 | 2024-08-07 |
Genetic ancestry effects on the response to viral infection are pervasive but cell type specific
2021-Nov-26, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abg0928
PMID:34822289
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了欧洲和非洲血统男性在流感感染后外周血单核细胞的反应差异 | 发现遗传血统对病毒感染反应的影响普遍存在但具有细胞类型特异性，且与COVID-19疾病严重性相关的基因富集 | NA | 探究遗传血统对病毒感染免疫反应的影响 | 欧洲和非洲血统男性的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 欧洲和非洲血统男性 |
| 16000 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Thyroid Hormone Effectors in the Human Fetal Neocortex: Expression of SLCO1C1, DIO2, and THRB in Specific Cell Types
2021-10, Thyroid : official journal of the American Thyroid Association
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/thy.2021.0057
PMID:34114484
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了人胎脑新皮质中甲状腺激素效应蛋白SLCO1C1、DIO2和THRB在特定细胞类型中的表达 | 发现甲状腺激素效应蛋白在特定细胞类型中的独特表达模式，特别是在中间神经元中的表达，这一发现具有新的病理生理意义 | NA | 填补关于人胎脑中甲状腺激素作用的知识的空白 | 人胎脑新皮质中的甲状腺激素效应蛋白 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 分析了来自三个不同研究的公开单细胞转录组数据集，涉及393至近40,000个细胞 |