单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15981 2024-08-05
NUSAP1-LDHA-Glycolysis-Lactate feedforward loop promotes Warburg effect and metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了NUSAP1在胰腺导管腺癌中的糖酵解代谢和转移中的作用 提出了NUSAP1-LDHA-糖酵解-乳酸的正反馈环作为胰腺导管腺癌转移和代谢潜能的新机制 研究未提及具体的样本大小和临床验证 探索NUSAP1在胰腺导管腺癌发病机制中的作用 胰腺导管腺癌(PDAC)和常见的胃肠道肿瘤 数字病理学 胰腺癌 RNA测序,ChIP-seq 小鼠异种移植模型,自发性PDAC小鼠模型 基因表达数据,组织微阵列 NA
15982 2024-08-07
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和巨噬细胞命运图谱方法,研究了胰腺导管腺癌(PDA)中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的调控作用 首次揭示了肿瘤特异性CD4 T细胞通过促进单核细胞分化为MHCII抗肿瘤巨噬细胞,从而影响肿瘤微环境 NA 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的影响 胰腺导管腺癌中的单核细胞和巨噬细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
15983 2024-08-05
Nerve growth factor receptor (Ngfr) induces neurogenic plasticity by suppressing reactive astroglial Lcn2/Slc22a17 signaling in Alzheimer's disease
2023-Jul-10, NPJ Regenerative medicine IF:6.4Q1
研究论文 这项研究探讨了神经生长因子受体(Ngfr)如何通过抑制阿尔茨海默病中的反应性星形胶质细胞信号传导来诱导神经发生可塑性 该研究揭示了Ngfr在阿尔茨海默病背景下促进星形胶质细胞神经发生命运的作用,并识别了Lcn2/Slc22a17信号通路的关键作用 本研究的局限性在于没有详细探讨Ngfr在不同阶段阿尔茨海默病进展中的具体作用 研究Ngfr在阿尔茨海默病中调控星形胶质细胞神经发生的机制 使用APP/PS1dE9小鼠模型和人类阿尔茨海默病组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,空间蛋白组学,功能敲除研究 小鼠模型及人类星形胶质细胞三维培养 组织,转录组数据 使用APP/PS1dE9小鼠模型及后期人类阿尔茨海默病海马体组织
15984 2024-08-05
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-Jul, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
综述 这篇文章回顾了反应性星形胶质细胞在多种神经退行性疾病中的重要作用 提出了基于单细胞测序分析的星形胶质细胞亚群与其功能之间的精确联系 对于反应性星形胶质细胞的亚群识别和功能仍存在争议 探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维角色 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化和肌萎缩侧索硬化的特点 神经科学 NA 单细胞测序 NA NA NA
15985 2024-08-07
IL-4 drastically decreases deuterosomal and multiciliated cells via alteration in progenitor cell differentiation
2023-07, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响,特别是在IL-4刺激下的细胞亚型变化 首次揭示了IL-4通过改变前体细胞分化,显著减少多纤毛细胞和双体细胞的比例,并提出了可能对研究呼吸系统炎症疾病至关重要的细胞特异性标记 NA 研究过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响 人鼻上皮细胞及其在IL-4刺激下的转录组特征 NA 呼吸系统炎症疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及培养的人鼻上皮细胞和活体鼻上皮细胞样本
15986 2024-08-05
The coagulation-related genes for prognosis and tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Jun-29, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了与凝血相关的基因对胰腺导管腺癌的预后和肿瘤微环境的影响 研究区分了两种与凝血相关的基因亚型,并建立了预后模型以进行风险分层 只有与TCGA数据库相关的样本数据,没有长期的临床随访数据 进一步区分与凝血相关的基因并探讨其在胰腺导管腺癌中的免疫浸润情况 胰腺导管腺癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 数字病理学 胰腺癌 转录组测序 LASSO模型 基因组数据和临床信息 收集了胰腺导管腺癌患者的实验样本,并进行了免疫组化分析
15987 2024-08-07
Multi-omics analysis reveals the chemoresistance mechanism of proliferating tissue-resident macrophages in PDAC via metabolic adaptation
2023-06-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌(PDAC)中增殖性组织驻留巨噬细胞通过代谢适应产生化疗耐药性的机制 首次识别出PDAC中与不良临床结果密切相关的增殖性组织驻留巨噬细胞(proliferating rMφs),并阐明了其通过代谢适应产生化疗耐药性的具体机制 NA 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进化疗耐药性的具体机制 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在化疗耐药性中的作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、多色免疫组化(mIHC)、流式细胞术、代谢组学 NA 转录组数据、免疫组化图像、流式细胞数据、代谢组数据 人类和鼠类的化疗治疗样本
15988 2024-08-05
Complex subsets but redundant clonality after B cells egress from spontaneous germinal centers
2023-06-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究使用小鼠模型分析自发性生发中心后B细胞的特征 提出了B细胞在自发性生发中心后的复杂亚群体以及冗余克隆性的概念 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类疾病的理解 分析自发性生发中心后B细胞的组成及其在自身免疫中的作用 分析B细胞亚群体及其在自发性生发中心后的发育状态 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞转录组学, 抗体库分析 NA 转录组数据 使用小鼠模型进行多个B细胞亚群的分析
15989 2024-08-07
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了衰老对小鼠中风恢复机制的影响 首次揭示了衰老小鼠中风后早期修复转录重编程的缺失,并发现年轻小鼠的微胶质细胞和巨噬细胞移植可以部分恢复老年小鼠的血管生成和少突胶质细胞生成 研究仅限于小鼠模型,未来需要进一步在人类中验证这些发现 探究衰老如何影响中风后脑组织修复的机制 年轻和老年小鼠中风后急性期和慢性期的脑组织 数字病理学 中风 单细胞RNA测序 NA 转录组 年轻和老年小鼠的中风脑组织样本
15990 2024-08-05
Tissue-resident CXCR4+ macrophage as a poor prognosis signature promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression
2023-06-01, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的预后价值及其免疫特征和功能 发现CXCR4+巨噬细胞的浸润与胰腺导管腺癌的差预后相关,为靶向这些细胞的免疫治疗提供了新方向 研究仅限于手术后样本,未涉及胰腺癌早期患者的相关数据 评估CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用及其预后意义 102名术后胰腺癌患者的组织样本 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术, 免疫荧光, RNA-seq 小鼠同种异体PDAC模型 组织样本 102个手术后胰腺癌患者样本
15991 2024-08-07
EPAS1 prevents telomeric damage-induced senescence by enhancing transcription of TRF1, TRF2, and RAD50
2023-May-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过跨物种比较,发现EPAS1基因在蝙蝠纤维母细胞中高表达,增强TRF1、TRF2和RAD50的转录,从而赋予蝙蝠纤维母细胞抵抗衰老的能力 首次揭示了EPAS1在蝙蝠和人类中保护端粒的机制,并发现EPAS1激动剂M1001对博来霉素诱导的肺部端粒损伤和衰老具有保护作用 NA 探索调节人类肺部疾病中端粒稳定性的潜在机制 蝙蝠纤维母细胞和人类肺部内皮细胞 分子生物学 肺部疾病 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA
15992 2024-08-07
ARL13B promotes angiogenesis and glioma growth by activating VEGFA-VEGFR2 signaling
2023-05-04, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本文研究了ARL13B通过激活VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成和胶质瘤生长的机制。 发现ARL13B通过与VEGFR2相互作用,调控VEGFR2的膜和纤毛定位,从而激活其下游信号,促进血管生成和肿瘤生长。 NA 旨在识别参与肿瘤血管生成的潜在信号通路。 研究了ARL13B在视网膜和脑部血管发育中的作用,以及在胶质瘤和黑色素瘤模型中对肿瘤生长和血管生成的影响。 数字病理学 胶质瘤 免疫组织化学, scRNA-seq, GST融合蛋白-蛋白相互作用, 共免疫沉淀 NA 组织, 细胞 使用转基因小鼠模型和人类胶质瘤组织样本进行研究。
15993 2024-08-05
Single-cell RNA-seq analysis reveals BHLHE40-driven pro-tumour neutrophils with hyperactivated glycolysis in pancreatic tumour microenvironment
2023-05, Gut IF:23.0Q1
研究论文 这项研究探讨了胰腺导管腺癌中的肿瘤相关中性粒细胞的异质性和促肿瘤机制。 发现BHLHE40在中性粒细胞极化为促肿瘤表型中的关键调节作用,并提供了多组学分析验证的支持。 研究样本仅限于5名胰腺导管腺癌患者,样本数量较小,可能影响结果的广泛适用性。 研究旨在探讨胰腺导管腺癌中非T细胞丰富的肿瘤中性粒细胞的作用。 研究对象为来自五名胰腺导管腺癌患者的外周血多形核白细胞及肿瘤浸润免疫细胞。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组, 蛋白组和代谢组数据 来自五名胰腺导管腺癌患者的样本
15994 2024-08-07
Role of Up-Regulated Transmembrane Channel-Like Protein 5 in Pancreatic Adenocarcinoma
2023-05, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2
研究论文 研究上调的跨膜通道样蛋白5(TMC5)在胰腺腺癌(PAAD)中的作用 首次全面验证TMC5在PAAD中的高表达,并探讨其在细胞群体和细胞间通讯中的表达及潜在机制 研究结果需要进一步的实验验证 探讨TMC5在PAAD中的表达及其临床价值和潜在机制 胰腺腺癌(PAAD)中的TMC5表达 数字病理学 胰腺癌 免疫组织化学(IHC)、微阵列、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 组织样本数据 148个PAAD样本和19个非PAAD样本,以及1166个PAAD样本和704个非PAAD样本的微阵列和RNA测序数据
15995 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of intestinal immune cells in neonatal necrotizing enterocolitis
2023-Apr-11, Pediatric surgery international IF:1.5Q3
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)患者的肠道免疫细胞基因表达谱 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了NEC患者肠道免疫细胞中MTOR、TNF-α和MYC信号通路的富集,表明炎症和细胞增殖相关的免疫反应上调 样本量较小,仅包括四名新生儿,且未涉及更多NEC和非NEC病例的比较 分析NEC患者的肠道免疫反应,以增进对NEC发病机制的理解 NEC患者的肠道免疫细胞 数字病理学 新生儿疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 四名新生儿(两名为NEC患者,两名为非NEC患者)
15996 2024-08-07
A novel immune checkpoint score system for prognostic evaluation in pancreatic adenocarcinoma
2023-Apr-06, BMC gastroenterology IF:2.5Q2
研究论文 本文研究了胰腺腺癌(PAAD)中免疫检查点评分系统的预测能力,并验证了OX40作为独立预后相关基因的作用。 首次建立了基于三个免疫检查点(OX40、TNFSF14和KIR3DL1)的风险评分系统,并验证了其在PAAD患者中的独立预后因子作用。 NA 探索胰腺腺癌的新型预后生物标志物 胰腺腺癌患者的免疫检查点和预后 数字病理学 胰腺癌 scRNA-seq, RT-PCR, IHC LASSO和Cox回归分析 基因表达数据 84个PAAD临床样本
15997 2024-08-05
MANGEM: a web app for Multimodal Analysis of Neuronal Gene expression, Electrophysiology and Morphology
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为MANGEM的云端web应用,用于分析神经元的多模态数据 该应用提供了一种易于使用的界面,使生物学家和神经科学家能够进行多模态数据的机器学习对齐,而无需计算专业知识 使用此方法需要适当的计算基础设施,并且对生物学家和神经科学家的计算能力要求较高 旨在为神经元的多模态数据提供可访问的分析工具 研究对象是小鼠视觉皮层中的神经元细胞 机器学习 NA Patch-seq NA 多模态数据 小鼠视觉皮层中的神经元细胞
15998 2024-08-05
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer IF:23.5Q1
评论 这篇文章概述了单细胞分析在胰腺癌中的应用及其对疾病理解的影响 文章介绍了高分辨率单细胞测序和空间转录组技术在研究胰腺癌异质性和可塑性方面的最新进展 该文章可能缺乏实际的实验数据支持其观点 探讨胰腺导管腺癌的异质性、可塑性及其对治疗的反应 胰腺癌的恶性细胞和宿主细胞类型 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序, 空间转录组 NA 细胞类型 NA
15999 2024-08-05
Integrated single-nucleus and spatial transcriptomics captures transitional states in soybean nodule maturation
2023-04, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过整合单核和空间转录组技术,建立了大豆结节和根部的细胞图谱 首次揭示了未感染细胞在结节发育过程中专门化为功能上不同的亚群体,并发现了富含结节相关基因的感染细胞过渡亚型 NA 研究根瘤菌与豆科植物的共生关系 大豆结节和根部细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组和空间转录组 NA 细胞 NA
16000 2024-08-05
AIRE illuminates the feature of medullary thymic epithelial cells in thymic carcinoma
2023-04, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 该文章探讨了胸腺癌中髓样胸腺上皮细胞的特征,并强调了AIRE的重要性 首次将AIRE与胸腺癌的起源联系起来,并指出胸腺癌可能来源于mTECs 未能完全确定胸腺癌的所有分子特征及其来源 阐明胸腺癌及相关胸腺上皮肿瘤的细胞起源 胸腺癌样本及其与mTECs的关系 数字病理学 NA RNA测序 NA 组织样本 使用了TCGA-THYM数据库和最新的人类单细胞RNA-seq数据
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