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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2025-11-29 |
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30213-z
PMID:41310117
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示乳酰化相关基因在牙周炎免疫调控中的关键作用,并建立诊断标志物 | 首次系统研究乳酰化相关基因在牙周炎中的作用,通过整合机器学习算法和单细胞测序技术识别核心诊断标志物 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索乳酰化相关基因在牙周炎免疫调控中的作用并开发诊断生物标志物 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织及外周血单核细胞 | 生物信息学 | 牙周炎 | 微阵列基因表达分析, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | LASSO回归, 随机森林, XGBoost, 非负矩阵分解 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 来自GSE10334和GSE16134队列的牙龈组织样本及外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列基因表达分析 | NA | NA |
| 1582 | 2025-11-29 |
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09248-5
PMID:41310172
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研究论文 | 本研究开发了过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,用于增强类风湿性关节炎治疗 | 首次创建了保留关键细胞器并具有免疫调节、旁分泌和归巢能力的去核人间充质干细胞 | 研究仅在雄性大鼠模型中进行验证,缺乏人类临床试验数据 | 开发更安全有效的类风湿性关节炎细胞治疗方法 | 人间充质干细胞和去核人间充质干细胞 | 细胞治疗 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1583 | 2025-11-29 |
A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66691-y
PMID:41310346
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的多尺度整合方法,将空间转录组学与肿瘤形态学相结合 | 开发了能够从常规H&E染色切片预测空间转录组数据的深度学习模型MISO,实现接近单细胞分辨率的空间基因表达预测 | NA | 整合空间转录组学与常规病理切片,实现从H&E图像预测基因表达 | 肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学,深度学习 | 深度学习模型 | 图像,基因表达数据 | 72个10X Genomics Visium样本 + 348个MOSAIC联盟样本 | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Genomics Visium空间转录组平台 |
| 1584 | 2025-11-29 |
p75NTR alleviates diabetic periodontitis in mice by inhibiting inflammatory macrophage recruitment
2025-Nov-27, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-07220-7
PMID:41310587
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研究论文 | 本研究探讨p75NTR通过抑制炎症巨噬细胞募集缓解糖尿病牙周炎的作用机制 | 首次揭示p75NTR缺失通过调节巨噬细胞异质性和炎症因子分泌缓解糖尿病牙周炎 | 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(每组6只),缺乏临床验证 | 探究p75NTR在糖尿病牙周炎中对巨噬细胞的影响及作用机制 | p75NTR野生型和基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 糖尿病牙周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,Micro-CT,组织学染色 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 24只健康雄性小鼠(WT和KO各12只),分为4组每组6只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1585 | 2025-11-29 |
Location and aetiology are determinants of fibroblast activation and heterogeneity in the failing human heart
2025-Nov-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01580-z
PMID:41310709
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析人类左心室组织,揭示了心力衰竭中成纤维细胞的异质性和空间分布特征 | 首次在人类衰竭心脏中系统描绘了成纤维细胞亚群的异质性、空间分布及其在不同病因(缺血性和扩张型心肌病)中的特异性激活模式 | 样本量相对有限(共20例),且仅分析了终末期心力衰竭患者,未涵盖疾病早期阶段 | 探究人类衰竭心脏中成纤维细胞的异质性和空间分布特征,及其在不同病因和纤维化类型中的作用机制 | 人类左心室组织样本,包括非衰竭心脏、扩张型心肌病心脏、缺血性心肌病心脏及梗死瘢痕区域 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序,空间转录组学,生物信息学分析 | 聚类分析,差异表达分析,配体-受体推断,伪时间轨迹映射 | RNA测序数据,空间转录组数据 | 20例人类左心室组织样本(非衰竭4例,扩张型心肌病6例,缺血性心肌病5例,梗死瘢痕5例) | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1586 | 2025-11-29 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
|
研究论文 | 本研究通过体外模型探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用 | 首次使用2D和3D共培养模型系统研究TEC介导的免疫调控,并通过单细胞RNA测序发现TEC新亚群和血管周M2样巨噬细胞亚群 | 研究主要基于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞调控免疫细胞群的分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞(T细胞、巨噬细胞) | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、激酶组学分析 | 2D和3D共培养模型、多细胞肿瘤球体模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1587 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1588 | 2025-11-29 |
A fibroblast-specific gene signature as a therapeutic target for glioblastoma developed based on the characteristics of tumor microenvironment
2025-Nov-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03528-w
PMID:41310846
|
研究论文 | 基于胶质母细胞瘤肿瘤微环境中成纤维细胞特征开发风险评分模型用于预后预测和治疗指导 | 首次基于单细胞RNA测序识别成纤维细胞特异性基因构建6基因风险评分模型,并验证VWA1基因在胶质母细胞瘤中的功能 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发胶质母细胞瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,qPCR,CCK-8,伤口愈合实验,Transwell实验 | 风险评分模型,Lasso Cox回归 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | GSE273274队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1589 | 2025-11-29 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术鉴定出促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构,揭示其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索免疫治疗中T细胞与肿瘤细胞相互作用的时空动态机制 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1590 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化,从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1591 | 2025-11-29 |
MHC-II-restricted neoantigen vaccine reverses immune microenvironment and overcomes resistance to immune-checkpoint inhibitors in cold tumors
2025-Nov-26, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100936
PMID:41308654
|
研究论文 | 本研究探讨了MHC-II限制性新抗原疫苗如何重塑冷肿瘤的免疫微环境并与TIGIT阻断剂协同克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 首次证明MHC-II限制性新抗原疫苗可逆转冷肿瘤的免疫抑制微环境,并通过NicheNet分析发现PVR-TIGIT轴作为联合治疗靶点 | 研究仅使用B16F10小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服冷肿瘤对免疫检查点抑制剂耐药性的联合治疗策略 | B16F10小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,NicheNet分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1592 | 2025-11-29 |
Impact of single-cell cell cycle regulation of intercellular communication on the prognosis of hepatocellular carcinoma in the tumor microenvironment
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01963-x
PMID:41286375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对肿瘤进展和患者预后的影响 | 首次在单细胞水平系统分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯网络的相互作用及其临床意义 | 样本量相对有限,仅分析了两个单细胞RNA测序数据集 | 探究肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对患者预后的影响机制 | 肝癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类,CellChat,Monocle,SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 24,637个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1593 | 2025-11-29 |
Decoding colorectal cancer chemotherapy and immunotherapy resistance: revealing the role of NOL3 using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01913-7
PMID:41286470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了NOL3在结直肠癌化疗和免疫治疗耐药中的关键作用 | 首次系统探索缺氧与18种程序性细胞死亡特征之间的关联,并识别NOL3作为结直肠癌预后关键标志物 | 研究基于回顾性多中心队列,需要进一步的前瞻性验证 | 探索结直肠癌化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习,数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,MTT测定,Western blot | XGBoost,RR,RF | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 4个多中心队列共1294例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1594 | 2025-11-29 |
Lineage plasticity and signal dysregulation define the cellular trajectory of osteoarthritis progression
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01947-x
PMID:41286526
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索骨关节炎进展过程中细胞谱系的可塑性变化及其与信号通路失调的关系 | 首次系统揭示骨关节炎中PreFC细胞向FC和preHTC细胞转化的轨迹,并鉴定HIF1A和ANGPTL4为关键分子调控因子 | NA | 探索骨关节炎进展的细胞轨迹和分子机制,为精准治疗提供新靶点 | 骨关节炎患者的关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,KEGG和GO富集分析,伪时间轨迹分析,体外实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1595 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate a prognostic function of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65421-8
PMID:41290589
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析揭示三级淋巴结构在胃癌中的预后功能 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析不同空间定位模式的三级淋巴结构,发现iTLS富集肿瘤中特定免疫细胞亚群,并揭示HEV通过VCAM1/ICAM1-CXCL13-ACKR1通路促进TLS形成的新机制 | 样本量相对有限(30例胃癌标本),需要在更大队列中验证发现 | 探究三级淋巴结构在胃癌中的预后功能和免疫治疗预测价值 | 30例按TLS空间定位模式分层的胃癌标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 30例胃癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1596 | 2025-11-29 |
Machine learning driven multiomics analysis identifies disulfidptosis associated molecular subtypes in ovarian cancer
2025-Nov-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26157-z
PMID:41290867
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研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析,在卵巢癌中鉴定出与双硫死亡相关的分子亚型 | 首次将双硫死亡机制纳入卵巢癌分类系统,并构建了10基因预测模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 建立卵巢癌双硫死亡相关分子亚型分类系统 | 卵巢癌患者样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学,免疫组化 | CNN+GRU, LASSO回归,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1597 | 2025-11-29 |
Immune cell-resolved transcriptomics provides insights into the basis for variations of fish genetic resistance to viral disease
2025-Nov-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02452-z
PMID:41291655
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研究论文 | 通过整合批量组织RNA-seq和单细胞RNA-seq技术,揭示虹鳟鱼对病毒性出血性败血症病毒遗传抗性的免疫细胞特异性转录组基础 | 首次在鱼类中结合批量组织和单细胞分辨率转录组学,解析不同遗传抗性品系免疫细胞对病毒感染的异质性响应 | 研究仅针对两个极端抗性品系,可能无法完全代表自然种群中的遗传多样性 | 探究鱼类对病毒感染的遗传抗性机制 | 虹鳟鱼(抗性和易感性等基因系) | 转录组学 | 病毒性出血性败血症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 两个虹鳟鱼等基因系的前肾组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1598 | 2025-11-29 |
Identification and validation of PANoptosis-related biomarkers in Alzheimer's disease via single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03335-3
PMID:41291841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别并验证了阿尔茨海默病中与PANoptosis相关的生物标志物 | 首次在阿尔茨海默病中系统研究PANoptosis相关基因,并整合单细胞测序与多种机器学习算法识别生物标志物 | BACH2基因的转录组学发现未能通过qRT-PCR验证,样本来源和数量可能存在限制 | 探索PANoptosis在阿尔茨海默病发病机制中的作用并识别相关生物标志物 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的基因表达数据及临床样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,机器学习 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 多个数据集(GSE181279,GSE85426,GSE48350)和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1599 | 2025-11-29 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal the reorganization of cerebellar microglia with aging
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116624
PMID:41307999
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了小脑小胶质细胞随衰老的重组过程 | 首次发现小脑小胶质细胞具有神经保护特征表达升高和脂滴积累特征表达降低的年龄相关变化,并识别出神经元相关小胶质细胞特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究小脑在衰老过程中的转录组变化和小胶质细胞重组机制 | 小鼠小脑组织和小胶质细胞 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病,衰老相关疾病 | 单核RNA测序,批量小胶质细胞RNA测序,MERFISH空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 十五个小鼠脑区域 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1600 | 2025-11-29 |
Biomechanical and Inflammatory Pathways Underlying the Genetic Architecture of Keratoconus: A Genomic SEM Study
2025-Nov-25, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110770
PMID:41308946
|
研究论文 | 通过基因组结构方程模型解析圆锥角膜的双通路遗传架构,识别关键候选基因并进行功能验证 | 首次应用基因组SEM方法量化解析圆锥角膜的生物力学和炎症双重遗传通路,结合多组学数据验证候选基因功能 | 研究主要基于欧洲人群GWAS数据,需要在其他人群中验证普适性 | 阐明圆锥角膜的遗传架构和发病机制 | 圆锥角膜患者群体 | 基因组学 | 圆锥角膜 | 基因组结构方程建模,GWAS,单细胞RNA-seq,蛋白质组学分析 | 基因组SEM | 基因组汇总统计数据,转录组数据,蛋白质表达数据 | 大规模GWAS汇总统计数据,两个独立患者转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |