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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1581 | 2025-10-05 |
Interferon-induced senescent CD8+ T cells reduce anti-PD1 immunotherapy efficacy in early triple-negative breast cancer
2025-Sep-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj7808
PMID:40929245
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现干扰素诱导的衰老CD8+ T细胞是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的关键因素 | 首次发现干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的驱动因素,并提出了烟酰胺单核苷酸治疗策略 | 样本量相对有限(171例患者),需要在更大队列中验证 | 探索早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的机制并寻找解决方案 | 早期三阴性乳腺癌患者样本、患者来源类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 病理学检测 | NA | 基因表达数据, 病理图像 | 171例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1582 | 2025-10-05 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Sep-10, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期生命阶段脂肪组织快速扩张的机制,发现IGF2通过驱动DPP4+前体脂肪细胞增殖而非分化来促进脂肪组织发育 | 首次发现IGF2在早期发育阶段特异性表达于皮下脂肪组织网状间质中的DPP4+前体细胞群,并阐明其通过促进细胞增殖而非分化来扩大前体脂肪细胞库 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;机制研究可能不够深入 | 阐明早期生命阶段脂肪组织快速扩张的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织,特别是DPP4+前体脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼年和成年小鼠皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1583 | 2025-10-05 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Sep-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
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研究论文 | 本研究揭示了肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作,促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症的新机制 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用,并阐明ET-1/EDNRA轴通过调控HIF-1α和AKT信号通路促进ILC3糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间相互作用在肠道炎症调控中的作用机制 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白质表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1584 | 2025-10-05 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Sep-10, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
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研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异,并发现p21衰老细胞和SASP因子在年龄相关愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,结果可能不适用于雌性或其他品系小鼠 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响,验证该模型用于研究年龄相关骨折愈合延迟分子机制的适用性 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析,μCT分析,组织形态计量学,免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,分子表达数据,组织学数据 | 年轻(12周)和中年(52周)雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1585 | 2025-10-05 |
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2025-Sep-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003453
PMID:40932351
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示左右结肠癌免疫微环境差异,发现右结肠癌特有的CASC15⁺KLK6⁺上皮亚群与免疫细胞互作机制 | 首次在单细胞层面鉴定出右结肠癌特有的CASC15⁺KLK6⁺恶性上皮亚群,并揭示其通过MIF和CD99信号通路与T细胞、肥大细胞的动态互作 | 样本量较小(6例单细胞测序,70例验证),需更大队列验证发现 | 探究左右结肠癌免疫微环境差异及其分子机制 | 结肠癌患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat | 单细胞转录组数据,图像数据 | 6例单细胞测序(3左结肠癌+3右结肠癌),70例验证(30左结肠癌+40右结肠癌) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1586 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2025-Sep-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003459
PMID:40932376
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌免疫治疗耐药相关的调控程序 | 首次在转移性dMMR结直肠癌中系统分析T细胞亚群在免疫治疗耐药中的作用机制,发现KLRB1作为新型生物标志物 | 样本量相对有限,机制研究主要基于相关性分析 | 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 | 转移性DNA错配修复缺陷结直肠癌患者 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 细胞通讯分析, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 临床样本 | 190例结直肠癌患者及其配对癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1587 | 2025-10-05 |
CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions
2025-Sep-09, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00510-24
PMID:40757822
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的遗传工具在研究宿主-微生物相互作用中的应用与进展 | 系统总结了CRISPR工具在宿主-微生物互作研究中的创新应用,包括筛选、基因组编辑和记录系统,以及与单细胞RNA测序等新兴技术的结合 | 当前工具仍存在一定局限性,需要进一步发展更先进的遗传工具包 | 研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用 | 宿主细胞、微生物细胞和动物模型 | 基因编辑技术 | 与宿主-微生物相互作用相关的疾病 | CRISPR基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1588 | 2025-10-05 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Sep-09, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法揭示PET-MPs通过CLK4基因影响男性不育的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能的毒性作用机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育症 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
1589 | 2025-10-05 |
Targeting annexin A2 enhances anti-PD-1 immunotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Sep-09, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115504
PMID:40929955
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研究论文 | 本研究探讨膜联蛋白A2在胰腺导管腺癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序发现ANXA2表达与PDAC患者预后不良相关,并证实ANXA2抑制可增强抗PD-1免疫疗法效果 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索ANXA2在PDAC免疫治疗中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 共培养系统, 流式细胞术, 蛋白质印迹法 | 小鼠PDAC模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1590 | 2025-10-05 |
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Sep-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.009
PMID:40930099
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型探索了activin和BMP4信号如何指导人类原肠胚形成过程中的命运特化 | 揭示了细胞命运决定的谱系收敛现象:定型内胚层可通过从多能性直接分化和经由中胚层祖细胞状态的间接分化两条路径产生 | 研究基于干细胞模型,可能与体内真实发育过程存在差异 | 探索组合信号如何影响人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 | 人类干细胞模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 活细胞成像, 数学模型 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1591 | 2025-10-05 |
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity
2025-Sep-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.013
PMID:40347947
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示了神经母细胞瘤的发育可塑性机制 | 首次结合小鼠自发肿瘤模型的单细胞多组学和人类患者样本的空间转录组学,揭示了神经母细胞瘤发育中间状态及其恶性转化的表观遗传调控机制 | 研究样本数量有限,主要依赖小鼠模型和部分人类样本 | 解析神经母细胞瘤发育可塑性的调控机制 | 神经母细胞瘤小鼠模型和人类患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1592 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover distinct cellular subtypes involved in neural invasion in pancreatic cancer
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.020
PMID:40680743
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示胰腺癌神经侵袭中涉及的独特细胞亚型 | 首次系统描绘胰腺癌神经侵袭的细胞组成、谱系动态和空间组织特征,发现新的神经周围成纤维细胞群体和施万细胞亚群 | 样本量相对有限(25例患者),需要进一步验证这些发现在更大队列中的普适性 | 探索胰腺癌神经侵袭的细胞机制和微环境特征 | 25例胰腺导管腺癌患者的62个样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞/单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 25例患者的62个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1593 | 2025-10-05 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
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研究论文 | 开发了一种名为RECODR的计算流程,通过分析单细胞RNA测序数据中基因共表达网络的变化来识别癌症治疗耐药机制 | 首次将基因共表达网络与图嵌入方法相结合,通过检测基因共表达背景的漂移变化来揭示传统方法无法发现的耐药机制 | NA | 识别癌症治疗耐药机制并发现新的药物靶点 | 脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 图嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1594 | 2025-10-05 |
S100A4 facilitates radiation-induced tumor repopulation by driving polyploid giant cancer cells budding
2025-Sep-04, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218017
PMID:40914345
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研究论文 | 本研究揭示了S100A4通过驱动多倍体巨癌细胞出芽促进放射治疗后肿瘤再生的分子机制 | 首次发现S100A4-ISG15轴通过调控IRF3介导的干扰素-I信号通路促进PGCCs出芽过程 | 研究主要聚焦结直肠癌,其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 阐明放射治疗后多倍体巨癌细胞驱动肿瘤再生的分子机制 | 结直肠癌中的多倍体巨癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学,功能基因组学 | 纵向模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1595 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic and genomic changes in the ageing human brain
2025-Sep-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09435-8
PMID:40903571
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究人类前额叶皮层从婴儿期到百岁老人的基因表达和基因组变化 | 首次结合单核RNA测序、单细胞全基因组测序和空间转录组学技术,系统揭示人类大脑发育和衰老过程中的转录组和基因组动态变化 | 研究主要聚焦于前额叶皮层,未涵盖其他脑区;样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明 | 探索人类大脑衰老过程中的细胞分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间基因表达数据 | 从婴儿到百岁老人的年龄跨度样本(具体数量未说明) | NA | 单核RNA-seq, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1596 | 2025-10-05 |
Spatial and functional characterization of IL1RL1+ mast cells reveals immune regulatory roles in renal cancer
2025-Sep-03, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102049
PMID:40912479
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研究论文 | 本研究通过空间和功能分析揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾癌中的免疫调节作用 | 首次系统揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾透明细胞癌中的空间分布特征及其通过MHC-I信号通路调控CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内功能验证 | 阐明IL1RL1在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的表达特征和免疫功能 | 肾透明细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 图像数据 | TCGA和GEO数据库中的肾癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1597 | 2025-10-05 |
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Sep-03, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100984
PMID:40930101
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研究论文 | 开发TESLA-seq技术结合CRISPR激活筛选与靶向单细胞RNA测序,用于精确解析基因组调控景观 | 开发了TESLA-seq新技术,能够并行读取数百个增强子对基因座内所有基因的影响 | 研究主要聚焦于PHOX2B基因座,可能不适用于所有基因组区域 | 识别和功能扰动内源性增强子及其靶基因 | PHOX2B基因座周围的基因组调控元件 | 基因组学 | 神经母细胞瘤 | CRISPR激活筛选, 靶向单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1598 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2427116122
PMID:40854129
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组学技术,构建小鼠前列腺细胞图谱并揭示去势抵抗的关键决定因素 | 首次系统整合多组学数据揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势治疗响应中的转录和表观遗传基础 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺癌的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺癌对雄激素剥夺疗法(ADT)抵抗的细胞机制 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学, 荟萃分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1599 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing In Pediatric Sepsis: γδ T Cell Exhibits A Differentiation To γδT17 Subtype Along With Significantly Enhanced Cell Communication With Neutrophils
2025-Sep-02, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000547934
PMID:40931501
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿科脓毒症患者γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 首次在儿科脓毒症中发现γδ T细胞向γδT17亚型分化,并揭示中性粒细胞通过RETN-CAP1结合增强与γδ T细胞的通讯 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 阐明儿科脓毒症中γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 儿科脓毒症患者外周血单个核细胞中的γδ T细胞 | 单细胞测序分析 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 伪时序分析,细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 儿科脓毒症患者PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1600 | 2025-10-05 |
An Organ-on-Chip Platform for Strain-Controlled, Tissue-Specific Compression of Cartilage and Mineralized Osteochondral Interface to Study Mechanical Overloading in Osteoarthritis
2025-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501588
PMID:40556597
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研究论文 | 开发了一种用于研究骨关节炎机械过载的骨软骨单元芯片平台 | 首次在芯片上实现应变控制、组织特异性压缩的骨软骨界面模型,模拟体内应变梯度 | 该模型仍为体外微组织系统,无法完全模拟完整关节的复杂生物力学环境 | 研究机械过载在骨关节炎发生发展中的分子机制 | 人源复合透明软骨-矿化软骨下骨微组织 | 组织工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |