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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1581 | 2025-10-05 |
Targeting annexin A2 enhances anti-PD-1 immunotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Sep-09, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115504
PMID:40929955
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研究论文 | 本研究探讨膜联蛋白A2在胰腺导管腺癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序发现ANXA2表达与PDAC患者预后不良相关,并证实ANXA2抑制可增强抗PD-1免疫疗法效果 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索ANXA2在PDAC免疫治疗中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 共培养系统, 流式细胞术, 蛋白质印迹法 | 小鼠PDAC模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1582 | 2025-10-05 |
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Sep-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.009
PMID:40930099
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型探索了activin和BMP4信号如何指导人类原肠胚形成过程中的命运特化 | 揭示了细胞命运决定的谱系收敛现象:定型内胚层可通过从多能性直接分化和经由中胚层祖细胞状态的间接分化两条路径产生 | 研究基于干细胞模型,可能与体内真实发育过程存在差异 | 探索组合信号如何影响人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 | 人类干细胞模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 活细胞成像, 数学模型 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1583 | 2025-10-05 |
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity
2025-Sep-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.013
PMID:40347947
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示了神经母细胞瘤的发育可塑性机制 | 首次结合小鼠自发肿瘤模型的单细胞多组学和人类患者样本的空间转录组学,揭示了神经母细胞瘤发育中间状态及其恶性转化的表观遗传调控机制 | 研究样本数量有限,主要依赖小鼠模型和部分人类样本 | 解析神经母细胞瘤发育可塑性的调控机制 | 神经母细胞瘤小鼠模型和人类患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1584 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover distinct cellular subtypes involved in neural invasion in pancreatic cancer
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.020
PMID:40680743
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示胰腺癌神经侵袭中涉及的独特细胞亚型 | 首次系统描绘胰腺癌神经侵袭的细胞组成、谱系动态和空间组织特征,发现新的神经周围成纤维细胞群体和施万细胞亚群 | 样本量相对有限(25例患者),需要进一步验证这些发现在更大队列中的普适性 | 探索胰腺癌神经侵袭的细胞机制和微环境特征 | 25例胰腺导管腺癌患者的62个样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞/单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 25例患者的62个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1585 | 2025-10-05 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
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研究论文 | 开发了一种名为RECODR的计算流程,通过分析单细胞RNA测序数据中基因共表达网络的变化来识别癌症治疗耐药机制 | 首次将基因共表达网络与图嵌入方法相结合,通过检测基因共表达背景的漂移变化来揭示传统方法无法发现的耐药机制 | NA | 识别癌症治疗耐药机制并发现新的药物靶点 | 脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 图嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1586 | 2025-10-05 |
S100A4 facilitates radiation-induced tumor repopulation by driving polyploid giant cancer cells budding
2025-Sep-04, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218017
PMID:40914345
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研究论文 | 本研究揭示了S100A4通过驱动多倍体巨癌细胞出芽促进放射治疗后肿瘤再生的分子机制 | 首次发现S100A4-ISG15轴通过调控IRF3介导的干扰素-I信号通路促进PGCCs出芽过程 | 研究主要聚焦结直肠癌,其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 阐明放射治疗后多倍体巨癌细胞驱动肿瘤再生的分子机制 | 结直肠癌中的多倍体巨癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学,功能基因组学 | 纵向模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1587 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic and genomic changes in the ageing human brain
2025-Sep-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09435-8
PMID:40903571
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究人类前额叶皮层从婴儿期到百岁老人的基因表达和基因组变化 | 首次结合单核RNA测序、单细胞全基因组测序和空间转录组学技术,系统揭示人类大脑发育和衰老过程中的转录组和基因组动态变化 | 研究主要聚焦于前额叶皮层,未涵盖其他脑区;样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明 | 探索人类大脑衰老过程中的细胞分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间基因表达数据 | 从婴儿到百岁老人的年龄跨度样本(具体数量未说明) | NA | 单核RNA-seq, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1588 | 2025-10-05 |
Spatial and functional characterization of IL1RL1+ mast cells reveals immune regulatory roles in renal cancer
2025-Sep-03, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102049
PMID:40912479
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研究论文 | 本研究通过空间和功能分析揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾癌中的免疫调节作用 | 首次系统揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾透明细胞癌中的空间分布特征及其通过MHC-I信号通路调控CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内功能验证 | 阐明IL1RL1在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的表达特征和免疫功能 | 肾透明细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 图像数据 | TCGA和GEO数据库中的肾癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1589 | 2025-10-05 |
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Sep-03, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100984
PMID:40930101
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研究论文 | 开发TESLA-seq技术结合CRISPR激活筛选与靶向单细胞RNA测序,用于精确解析基因组调控景观 | 开发了TESLA-seq新技术,能够并行读取数百个增强子对基因座内所有基因的影响 | 研究主要聚焦于PHOX2B基因座,可能不适用于所有基因组区域 | 识别和功能扰动内源性增强子及其靶基因 | PHOX2B基因座周围的基因组调控元件 | 基因组学 | 神经母细胞瘤 | CRISPR激活筛选, 靶向单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1590 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2427116122
PMID:40854129
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组学技术,构建小鼠前列腺细胞图谱并揭示去势抵抗的关键决定因素 | 首次系统整合多组学数据揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势治疗响应中的转录和表观遗传基础 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺癌的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺癌对雄激素剥夺疗法(ADT)抵抗的细胞机制 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学, 荟萃分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1591 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing In Pediatric Sepsis: γδ T Cell Exhibits A Differentiation To γδT17 Subtype Along With Significantly Enhanced Cell Communication With Neutrophils
2025-Sep-02, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000547934
PMID:40931501
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿科脓毒症患者γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 首次在儿科脓毒症中发现γδ T细胞向γδT17亚型分化,并揭示中性粒细胞通过RETN-CAP1结合增强与γδ T细胞的通讯 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 阐明儿科脓毒症中γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 儿科脓毒症患者外周血单个核细胞中的γδ T细胞 | 单细胞测序分析 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 伪时序分析,细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 儿科脓毒症患者PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1592 | 2025-10-05 |
An Organ-on-Chip Platform for Strain-Controlled, Tissue-Specific Compression of Cartilage and Mineralized Osteochondral Interface to Study Mechanical Overloading in Osteoarthritis
2025-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501588
PMID:40556597
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研究论文 | 开发了一种用于研究骨关节炎机械过载的骨软骨单元芯片平台 | 首次在芯片上实现应变控制、组织特异性压缩的骨软骨界面模型,模拟体内应变梯度 | 该模型仍为体外微组织系统,无法完全模拟完整关节的复杂生物力学环境 | 研究机械过载在骨关节炎发生发展中的分子机制 | 人源复合透明软骨-矿化软骨下骨微组织 | 组织工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1593 | 2025-10-05 |
Senescent Microglia Mediate Neuroinflammation-Induced Cognitive Dysfunction by Selective Elimination of Excitatory Synapses in the Hippocampal CA1
2025-Sep, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70167
PMID:40624910
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研究论文 | 本研究揭示了衰老小胶质细胞通过选择性清除海马CA1区兴奋性突触介导神经炎症诱导的认知功能障碍的机制 | 首次发现衰老小胶质细胞通过过度吞噬兴奋性突触导致神经炎症相关认知功能障碍,并证明使用senolytic药物ABT-737可逆转这一过程 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中验证;观察期较短,长期效果未知 | 阐明衰老小胶质细胞在神经炎症诱导认知功能障碍中的具体作用机制 | C57BL/6J小鼠的海马CA1区小胶质细胞和锥体神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,高尔基染色,全细胞膜片钳记录,Western blotting,免疫荧光 | 小鼠神经炎症模型 | 基因表达数据,电生理记录,行为学数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1594 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the Glycolysis-related gene GPRC5A as a potential biomarker for gastric cancer by machine learning
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147059
PMID:40865843
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,通过机器学习识别糖酵解相关基因GPRC5A作为胃癌潜在生物标志物 | 开发了基于四分位距的糖酵解活性评估新方法,解决了以往评分方法分辨率不足和稳健性有限的问题 | NA | 识别胃癌糖酵解代谢相关生物标志物,为早期诊断和靶向治疗提供支持 | 胃癌细胞和组织 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
1595 | 2025-10-05 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了光敏性自身免疫疾病中角质形成细胞-成纤维细胞-髓系细胞的炎症级联反应机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞在光敏性自身免疫中的核心作用,并阐明其通过角质形成细胞-成纤维细胞轴被招募至真皮-表皮连接处的空间协调机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明紫外线B暴露引发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤组织及体外细胞模型 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学(seqFISH+), 体外建模 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量,包括患者皮肤组织和体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | seqFISH+空间转录组技术 |
1596 | 2025-10-05 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Unveils Spatially Resolved Gene Modules and Fatty Acid Metabolism Dysregulation in Human Skin Aging
2025-Aug-23, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.011
PMID:40850650
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研究论文 | 通过高分辨率空间转录组技术揭示人类皮肤衰老过程中空间分辨的基因模块和脂肪酸代谢失调 | 首次利用高分辨率空间转录组技术构建人类眼睑皮肤衰老图谱,发现表皮脂肪酸合成减少是皮肤衰老的新特征 | 研究主要聚焦于眼睑皮肤,其他皮肤区域的变化可能有所不同 | 解析人类皮肤衰老的分子机制和空间特征 | 人类眼睑皮肤组织、原代人角质形成细胞、重建全层皮肤模型(T-Skin) | 空间转录组学 | 皮肤衰老 | 空间增强分辨率组学测序、多重FISH | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1597 | 2025-10-05 |
Integrated spatial and functional metabolic profiling identified the thick ascending limb as a mitochondrial vulnerability hub in acute kidney injury
2025-Aug-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.07.021
PMID:40850621
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研究论文 | 本研究通过整合空间和功能代谢分析,发现肾小管粗升支是急性肾损伤中的线粒体脆弱性枢纽 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和同位素示踪成像技术,系统揭示了肾小管粗升支在急性肾损伤中的特殊代谢脆弱性 | 研究主要基于动物模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群研究中进一步验证 | 探索急性肾损伤的代谢机制和肾脏能量代谢的空间分布特征 | 小鼠模型和人类肾移植患者的肾脏组织 | 空间生物学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 同位素示踪成像 | NA | 转录组数据, 图像数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类肾移植患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1598 | 2025-10-05 |
FAHD1-mediated pyruvate metabolism in hepatocellular carcinoma: Multi-omics and causal genetic evidence
2025-Aug-14, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100494
PMID:40814172
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了FAHD1在肝细胞癌中调控丙酮酸代谢的因果机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 首次整合单细胞转录组学、空间定位和遗传因果推断方法,识别出丙酮酸高活性上皮亚群及其与肿瘤核心区域的代谢分区特征,发现FAHD1作为丙酮酸代谢的因果驱动因子 | 研究主要基于观察性数据和体外模型验证,需要进一步的体内实验和临床试验确认FAHD1靶向治疗的临床价值 | 探索肝细胞癌中丙酮酸代谢的因果调控机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的上皮细胞亚群、癌症相关成纤维细胞及其相互作用 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、孟德尔随机化分析、分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1599 | 2025-10-05 |
Inhibition of astrocyte signaling leads to sex-specific changes in microglia phenotypes in a diet-based model of cerebral small vessel disease
2025-Aug-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03523-2
PMID:40783543
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研究论文 | 本研究通过饮食诱导的高同型半胱氨酸血症小鼠模型,探讨星形胶质细胞信号对微胶质细胞表型的性别特异性影响 | 首次揭示星形胶质细胞通过CN/NFAT信号通路对微胶质细胞表型调控存在性别二态性 | 样本量较小,需要更多生物学重复和更严格的统计分析来验证结果 | 研究星形胶质细胞信号在高同型半胱氨酸血症诱导的脑小血管病中对微胶质细胞表型的调控作用 | 7-8周龄雄性和雌性C57BL/6J小鼠 | 神经科学 | 脑小血管病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,Western blot | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 未明确具体数量的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1600 | 2025-10-05 |
Analysis of individual patient pathway coordination in a cross-species single-cell kidney atlas
2025-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02285-0
PMID:40775269
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研究论文 | 本研究构建了一个跨物种单细胞肾脏图谱,并开发了CellSpectra计算工具用于分析个体患者通路基因表达协调性变化 | 开发了CellSpectra计算工具,能够量化细胞功能间基因表达协调性变化,并创建了包含140个样本、超过100万个细胞的跨物种单细胞肾脏图谱 | NA | 推动单细胞方法在临床精准医学中的应用,解决个体患者细胞类型特异性分子变化识别和跨物种差异的挑战 | 人类和啮齿类动物的肾脏细胞 | 单细胞分析 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | CellSpectra计算工具 | 单细胞基因表达数据 | 140个样本,超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |