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当前共找到 40432 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-06-13
A single-cell solution to a transplant mystery
2026-05-08, Med (New York, N.Y.)
评论 本文介绍了一个通过定制单细胞测序解决年轻女性异基因造血干细胞移植后出现骨髓增生异常肿瘤的诊断谜团的案例,常规诊断无法确定突变克隆的来源,而结合转录组分析与靶向U2AF1富集最终明确了克隆起源并指导第二次移植,达到缓解 利用单细胞测序结合靶向基因富集解决传统方法无法区分的克隆来源问题,展示了单细胞技术在移植后诊断中的创新应用 本文为Backstory形式,未详细讨论该方法是否适用于所有类似病例或存在潜在局限性 解决移植后骨髓增生异常肿瘤的克隆来源诊断问题 一名异基因造血干细胞移植后出现骨髓增生异常肿瘤的年轻女性患者 医疗诊断 骨髓增生异常肿瘤 单细胞测序 NA 测序数据 1名患者(个案) NA 单细胞RNA测序 NA 结合转录组分析与靶向U2AF1富集的单细胞测序方法
142 2026-06-13
scHILL: deciphering individual-level immune cell heterogeneity with single-cell RNA sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了scHILL框架,结合掩码自编码器与多层感知机,利用单细胞RNA测序数据解析个体水平的免疫细胞异质性 首次整合掩码自编码器与多层感知机,通过数据增强实现自监督特征学习,克服样本量限制,量化个体水平细胞和基因的功能重要性 未提及具体局限性 开发通用框架以解析单细胞RNA测序数据中的个体水平免疫细胞异质性,推动个性化医疗 来自感染性疾病、自身免疫性疾病和癌症的多个数据集中的个体免疫细胞 机器学习 感染性疾病, 自身免疫性疾病, 癌症 单细胞RNA测序 掩码自编码器, 多层感知机 单细胞基因表达数据 多个数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
143 2026-06-13
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-May, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
research paper 开发了一个Python包mosna,用于分析空间组学数据并与临床或生物学数据整合,以揭示细胞相互作用模式或组织架构 mosna包与所有空间组学技术兼容,提供了一个分析流程,其中每一步计算的特征可以与临床数据整合,同时能够训练机器学习模型并识别最具预测能力的变量 仅适用于二元条件如生物治疗或患者反应状态,以及生存数据 使对空间组学数据的理性分析(包括多种算法并整合不同条件如临床数据)更加容易访问 空间解析的蛋白质组学数据集和空间转录组学数据集,包含对免疫治疗的二元反应或生存数据 digital pathology cancer spatial omics, MERFISH, seqFISH, Xenium, CODEX, MIBI-TOF, 10x Visium, Slide-seq, Stereo-seq machine learning models image, text 两个空间解析的蛋白质组学数据集和一个包含对免疫治疗反应或生存数据的空间转录组学数据集 10x Genomics spatial transcriptomics, proteomics 10x Visium NA
144 2026-06-13
Fatty acid binding protein 4 (FABP4): a key player in neuroinflammation and neuropathic pain
2026-May, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究通过小鼠模型和单细胞RNA测序,发现脂肪酸结合蛋白4通过驱动巨噬细胞介导的神经炎症,在神经病理性疼痛中发挥关键作用 首次揭示FABP4通过NF-κB通路促进巨噬细胞促炎极化,驱动神经炎症和神经病理性疼痛的新机制,并验证了药物抑制FABP4的镇痛潜力 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;FABP4抑制剂的长期疗效和安全性需进一步评估 阐明FABP4在神经病理性疼痛中的作用及其分子机制 野生型和FABP4基因敲除小鼠,坐骨神经挤压伤模型 神经科学 神经病理性疼痛 单细胞RNA测序、组织学分析 NA 基因表达数据、组织图像 涉及野生型和基因敲除小鼠的坐骨神经损伤模型,具体样本数未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
145 2026-06-13
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma at single-cell resolution with spatial insights: From mechanisms to clinical translation
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 系统总结了基于单细胞RNA测序技术揭示胰腺导管腺癌在细胞异质性、肿瘤微环境、免疫逃逸、转移进展和治疗耐药等方面的最新研究进展 整合单细胞和空间多组学方法构建胰腺导管腺癌肿瘤微环境图谱,从单细胞和空间维度理解胰腺导管腺癌生物学机制 该综述主要基于现有文献总结,可能受限于现有单细胞RNA测序技术的分辨率、样本量和数据整合方法的局限性 系统梳理单细胞RNA测序技术在胰腺导管腺癌研究中的应用,探讨其从机制到临床转化的潜力 胰腺导管腺癌的细胞组成、肿瘤微环境、免疫逃逸、转移进展和治疗耐药机制 机器学习和数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、空间多组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 综述性文章,无具体样本量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
146 2026-06-13
Spatial transcriptomics characterisation of radionecrotic changes in glioblastoma patients
2026-May-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 利用空间转录组学表征胶质母细胞瘤患者的放射性坏死变化 首次利用Xenium平台生成进行性胶质母细胞瘤和伴有放射性坏死变化的脑组织的综合空间单细胞转录组图谱,揭示了放射性坏死组织中肿瘤细胞下调EGFR表达且不显示增殖标志物,并发现边界相关巨噬细胞浸润并可能促进胶质增生 NA 区分胶质母细胞瘤进展与放射性坏死变化,揭示其空间转录组学差异 9名胶质母细胞瘤患者(10个样本),接受标准治疗后需要进行第二次手术切除的组织 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 NA 空间单细胞转录组数据 10个样本(来自9名患者) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium平台 Xenium空间单细胞转录组平台
147 2026-06-13
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-May, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 综述了衰老和癌症中细胞内及器官间通信的局部和全局空间视角,重点探讨了配体-受体相互作用和空间转录组学在该领域的应用 首次系统性地从空间视角整合了衰老与癌症转移中细胞内和器官间通信的配体-受体相互作用,并评估了相关的计算推断工具 未详细讨论验证特定配体-受体相互作用的实验方法,且对新兴空间组学技术(如多模态成像)的覆盖可能不全面 揭示衰老和癌症中细胞间通信失调如何重塑组织微环境,并探索靶向配体-受体相互作用的潜在治疗策略 衰老和癌症转移中的细胞间通信,包括局部肿瘤微环境和远端器官相互作用 数字病理学 癌症,老年病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 文本,图像 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
148 2026-06-13
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出了一种名为DyGFormer的半监督模型,通过结合阻力距离偏差的Transformer结构,用于单细胞空间转录组学中的细胞类型鉴定 首次将基于阻力距离的相对位置偏差引入Transformer,并结合邻居交互历史编码器和三元组度量的监督信号,实现输入依赖的细胞间连接权重学习 未明确说明局限性,但可能包括对空间先验的依赖以及跨平台泛化能力的进一步验证需求 开发一种半监督细胞类型鉴定方法,以应对单细胞空间转录组学中的测序噪声、跨平台异质性和有限标注预算等挑战 单细胞空间转录组学数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH)中的细胞类型 机器学习 癌症 单细胞空间转录组学 Transformer 空间表达数据 多个跨组织和平台的数据集 NanoString 单细胞空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager, MERFISH NA
149 2026-06-13
Single-Cell Analysis Identified a Recurrent Malignant-Associated Transcriptional State in Colorectal Cancer
2026-May, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过对四名日本结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织进行单细胞RNA测序,鉴定出一个常见的恶性相关转录状态,其特征为长非编码RNA KCNQ1OT1高表达和RASSF6低表达 首次在单细胞水平上鉴定出日本结直肠癌患者中一个复发性恶性相关转录状态,并揭示该状态中KCNQ1OT1高表达和RASSF6低表达的特征,这在传统批量分析中难以发现 样本量较小(仅四名患者),可能无法完全代表日本人群的异质性;RASSF6的临床意义在东西方队列中存在差异,需进一步验证 利用单细胞转录组学技术解析结直肠癌的分子异质性,并鉴定与恶性相关的细胞状态 四名日本结直肠癌患者的肿瘤组织和邻近正常组织中的细胞群体 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 4名患者的肿瘤组织和邻近正常组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
150 2026-06-13
TRAP5 Inhibition Targeting Scar-Associated Macrophages Ameliorates Acute Kidney Injury to Chronic Kidney Disease Transition
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
research paper 使用小鼠模型结合单细胞RNA测序,研究TRAP5阳性瘢痕相关巨噬细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变中的作用,并验证TRAP5抑制的治疗潜力 首次发现并鉴定TRAP5阳性瘢痕相关巨噬细胞是急性肾损伤向慢性肾病转变的关键致病效应细胞,并证明靶向TRAP5可有效阻止该转变 主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;具体分子机制尚需进一步阐明 阐明急性肾损伤向慢性肾病转变的细胞机制并探索新的治疗靶点 小鼠肾脏巨噬细胞,人类慢性肾病活检组织 machine learning chronic kidney disease single-cell RNA sequencing, immunofluorescence NA single-cell transcriptome 3组小鼠(对照组、急性期、重塑期)共39,345个细胞,涵盖18个细胞簇;多种小鼠模型和人类活检样本 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' sequencing
151 2026-06-13
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出基于动态图卷积网络(DGCNN)的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE 首次将动态图卷积网络应用于多切片空间转录组数据对齐,能自适应更新节点嵌入以捕捉不同切片间的空间分布差异 未提及具体计算资源需求或大规模数据集的扩展性评估 多切片空间转录组数据的对齐与增强方法开发 空间转录组多切片数据 机器学习 未明确指定疾病范畴 空间转录组学 动态图卷积神经网络(DGCNN) 空间转录组数据 未明确样本量信息 NA 空间转录组学 NA NA
152 2026-06-13
ZBP1 Drives CD8+ T cell-mediated anti-tumor immunity in head and neck squamous cell carcinoma
2026-May, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究鉴定ZBP1为头颈鳞状细胞癌中重编程免疫抑制微环境的关键免疫调节因子,能驱动CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫 首次发现ZBP1通过重塑趋化因子信号网络和效应T细胞区室,将免疫“冷”肿瘤转化为免疫活性微环境,并作为双功能调节因子同步协调淋巴细胞募集和髓系抑制 研究主要基于体外模型和临床样本分析,缺乏体内多模型验证及基于人类HNSCC的泛癌验证,且ZBP1调控免疫微环境的具体分子机制尚需进一步阐明 探究ZBP1在头颈鳞状细胞癌免疫抑制微环境重编程中的作用及其分子机制 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本、SCC-7/MOC2小鼠肿瘤模型 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 RNA-seq、多标免疫荧光、流式细胞术、单细胞转录组测序 多模型综合分析 转录组数据、空间蛋白数据、单细胞数据 92例头颈鳞状细胞癌标本 NA 单细胞转录组学 NA NA
153 2026-06-13
The intestinal microbiota impacts nutritional immunity and resistance to Acinetobacter baumannii pneumonia
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究抗生素治疗导致肠道微生物群失调,增加肺部对鲍曼不动杆菌肺炎的易感性,并揭示其通过影响营养免疫机制的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示抗生素引起的肠道微生物群失调通过削弱吞噬细胞营养免疫途径(如脂钙蛋白-2和钙卫蛋白)来加重肺部感染 未提及具体限制,但可能包括基于小鼠模型的推广性和人类患者队列的样本大小 探究抗生素治疗与肠道微生物群破坏对鲍曼不动杆菌肺炎易感性的机制关联 住院患者队列和鼠模型中的肠道微生物群、肺部和免疫细胞 机器学习 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 住院患者队列和鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
154 2026-06-13
Depletion of macrophages during early postnatal development leads to disrupted tooth root development and altered Gli1⁺ MSC trajectory
2026-Apr-26, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 研究揭示巨噬细胞在小鼠出生后牙根发育中通过TGF-β信号调控Gli1⁺间充质干细胞命运的关键作用 首次明确巨噬细胞作为牙根发育微环境关键组分,通过旁分泌TGF-β调控Gli1⁺ MSCs的骨/牙本质分化,揭示了免疫-间充质互作的新机制 未涉及人类样本验证,且巨噬细胞耗竭实验可能影响其他免疫细胞功能 探究巨噬细胞在牙根发育过程中的功能及其分子机制 出生后小鼠磨牙及牙根组织中的巨噬细胞与Gli1⁺间充质干细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序、氯膦酸盐脂质体介导的巨噬细胞耗竭、体外共培养 NA 单细胞测序数据、组织学图像 小鼠模型,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'测序平台
155 2026-06-13
PW1+ cells give rise to cardiac adipocytes during development and myofibroblasts following injury
2026-Apr-25, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 该研究利用遗传谱系追踪等方法,揭示PW1+细胞在心脏发育过程中分化为心脏脂肪细胞,在心肌梗死后分化为肌成纤维细胞 首次证明PW1+细胞具有祖细胞特性,能够在不同生理条件下分化为心脏脂肪细胞和肌成纤维细胞,为心脏脂肪生成和纤维化提供新见解 未提及具体局限性,但可能包括体外实验与体内环境的差异、仅使用小鼠模型等 探究PW1+细胞在心脏中是否具有干细胞特性,并评估其在发育和损伤后的分化潜能 PW1+细胞在小鼠心脏中的命运和功能 细胞生物学 心肌梗死 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用Pw1pCreER/m+;R26-tdT和Pw1p2A-CreER/m+;R26-tdT小鼠模型,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
156 2026-06-13
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出SEAGALL方法,利用几何感知图注意力网络解释单细胞染色质状态和基因表达 融合几何正则化自编码器与可解释图注意力网络,量化分子特征对细胞表型的影响,从多组学数据中提取特异且稳定的基因特征 未提及具体限制 开发深度学习方法解释单细胞测序数据中分子特征对细胞身份的影响 单细胞染色质状态和基因表达数据 机器学习 NA 单细胞测序 几何正则化自编码器、图注意力网络 单细胞数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
157 2026-06-13
TNF-α blockade mitigates immune checkpoint-related nephritis in a humanized mouse model
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究利用人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型,评估了免疫检查点抑制剂单独或联合促炎细胞因子对肾脏的影响,并测试了选择性TNF-α阻断能否预防ICI相关的急性间质性肾炎 首次在人源化小鼠模型中复制了ICI急性间质性肾炎的关键特征,并验证了TNF-α阻断剂对肾脏的保护作用 未提及具体局限性 探究TNF-α阻断剂在预防免疫检查点抑制剂相关肾炎中的潜在作用 人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠样本,按对照组、ICI组、ICI-细胞因子组和ICI-阻断组分为4组 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
158 2026-06-13
AKAP12-LMOD1 signaling defines stromal CAF activation and epithelial junction loss in colorectal cancer
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究定义了AKAP12-LMOD1信号在结直肠癌中作为区室依赖的基质程序,连接ACTA2阳性基质与间隙连接特征、纤维化和M2样巨噬细胞极化,而上皮区室则与紧密连接特征相关 首次发现AKAP12-LMOD1轴在结直肠癌肿瘤微环境中呈现区室依赖的表达模式,并阐明其在癌症相关成纤维细胞(CAF)激活和上皮连接丢失中的双重作用机制 研究主要基于体外共培养模型,缺乏体内动物模型验证;功能验证限于CAF-巨噬细胞非接触共培养系统,未涉及其他免疫细胞类型的相互作用 阐明AKAP12-LMOD1信号在结直肠癌上皮-基质相互作用中的区室依赖作用机制 结直肠癌肿瘤组织和匹配正常组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 图像 结直肠癌肿瘤组织和匹配正常组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学平台
159 2026-06-13
Spatial profiling of chronic liver disease: a pilot spatial case series
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过空间转录组学对慢性肝病的空间组织进行初步病例系列研究 首次利用基于测序的空间转录组学,在保留组织学背景的情况下,系统比较酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎三种主要病因的肝脏空间结构,并开发了能原位检测肝炎病毒RNA的工作流程 样本量较小,仅8个组织样本,4例通过质量控制,且HBV样本未纳入核心分析,结果可能缺乏普适性 探究不同病因慢性肝病的空间组织特征及其共享的假小叶功能结构 慢性肝病患者的肝脏组织样本,包括酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎 数字病理学 慢性肝病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 8个肝脏组织样本,4例通过质量控制 NA 空间转录组学 NA 基于测序的空间转录组学方法,包含肝炎病毒RNA原位检测工作流程
160 2026-06-13
The ZNF737-CXCL10 axis drives immune exclusion and resistance to anti-PD-1 therapy in bladder cancer
2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文系统性地鉴定了ZNF737转录因子在膀胱癌中驱动免疫排斥和抗PD-1治疗耐药的关键作用与机制 首次发现ZNF737通过直接转录抑制趋化因子CXCL10,导致CD8+ T细胞募集受损和抗原特异性细胞毒性降低,从而塑造免疫排斥肿瘤微环境 研究主要基于体外实验和人源化小鼠模型,尚未在更大规模临床队列中验证ZNF737作为治疗靶点的可行性 揭示膀胱癌中肿瘤内在分子驱动因子及免疫排斥微环境的表观遗传调控机制 膀胱癌患者肿瘤组织样本、BLCA细胞系、HLA匹配的人源化小鼠模型 数字病理学 膀胱癌 NGS, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, MHC-I限制性细胞毒性检测 NA 图像, 文本 多个独立患者队列(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq分析
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