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当前共找到 38003 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-04-01 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了BAP1突变型葡萄膜黑色素瘤中ITGB2-ICAM1轴通过维持缺氧和细胞外基质相关特征促进肝转移的机制 | 首次在BAP1突变型葡萄膜黑色素瘤中鉴定出ITGB2-ICAM1轴的关键作用，并利用免疫活性小鼠肝转移模型验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于单细胞测序数据和动物模型，尚未在临床患者中进行验证 | 探究BAP1缺陷驱动葡萄膜黑色素瘤转移的分子机制 | BAP1突变型与非突变型葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 包含原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤的scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-04-01 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-05-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成高质量空间转录组数据的方法，并提供了针对先前石蜡包埋样本的详细指南 | 开发了一种针对硬组织（如骨）的空间转录组学方法，解决了在切片处理过程中保持RNA质量和组织形态的挑战 | NA | 开发适用于骨组织的空间转录组学方法，以分析细胞基因表达与组织学背景的关系 | 骨组织样本，包括新鲜样本和先前石蜡包埋的样本，如骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2026-04-01 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，首次在人类视网膜发育中鉴定出睫状缘区的短暂性早期视网膜祖细胞，并揭示了其转录和染色质可及性变化 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的阶段，未涉及后期发育或成熟视网膜 | 探究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的起源、分化和时空分布 | 人类视网膜发育过程中的细胞，特别是睫状缘区的视网膜祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类早期眼样本，涵盖至妊娠中期 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 144 | 2026-04-01 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588111
PMID:38617255
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研究论文 | 本文详细比较了Seurat和Scanpy在单细胞RNA测序分析中的算法差异及其对结果的影响 | 首次量化评估了Seurat和Scanpy软件包在单细胞RNA-seq分析中的输出差异，并发现其差异程度相当于减少5%的测序数据或20%的细胞数量 | 研究主要关注Seurat和Scanpy两个主流工具，未涵盖其他单细胞分析软件包 | 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本差异对分析结果的影响 | 单细胞RNA测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-04-01 |
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00880-z
PMID:38055116
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研究论文 | 本研究评估了SUMOylation抑制剂在肝细胞癌临床前模型中的抗肿瘤效果及其对免疫微环境的重塑作用 | 首次结合单细胞RNA测序和质谱流式技术，揭示SUMOylation抑制剂通过调节肠道菌群重塑免疫微环境，激活抗肿瘤免疫 | 研究仅限于临床前小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发治疗肝细胞癌的新型小分子疗法，改善免疫检查点抑制剂疗效 | 肝细胞癌临床前小鼠模型（包括皮下和原位模型）及患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 临床前小鼠模型及患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 146 | 2026-04-01 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 本研究探讨了套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的机制，并发现mTOR信号通路上调是耐药的关键因素，通过mTORC1抑制剂temsirolimus可克服耐药性 | 首次在套细胞淋巴瘤中系统研究PRMT5抑制剂耐药机制，结合患者来源异种移植模型和细胞系模型，通过单细胞RNA测序揭示mTOR信号通路在耐药中的核心作用，并验证了联合靶向治疗的协同效应 | 研究主要基于体外细胞系和PDX模型，缺乏大规模临床样本验证；耐药机制可能涉及其他未被发现的通路；长期联合治疗的安全性和有效性需进一步评估 | 探究套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的分子机制，并寻找克服耐药性的治疗策略 | 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 套细胞淋巴瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8个细胞系（4个敏感，4个原发耐药），4个耐药细胞系，PDX模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-04-01 |
A time-resolved meta-analysis of consensus gene expression profiles during human T-cell activation
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03120-7
PMID:38098113
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研究论文 | 本文通过时间分辨的元分析，识别并验证了人类T细胞激活过程中的共识基因表达特征 | 首次描述了跨T细胞群体的时间分辨基因表达模式，并开发了用于稳健评估T细胞激活的共识生物标志物特征 | NA | 分析不同T细胞群体在激活过程中的时间模式，以开发T细胞激活的共识基因特征 | 人类T细胞 | 自然语言处理 | NA | 元分析，基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2026-04-01 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究探讨了波形蛋白（VIM）在胶质瘤进展中的作用，特别是其对氧化磷酸化抑制的抵抗性 | 首次全面解析VIM在胶质瘤中的表达模式、与患者生存的负相关、DNA甲基化状态、免疫浸润关联以及维持氧化磷酸化抑制抵抗性的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 揭示VIM在胶质瘤进展和氧化磷酸化抑制抵抗中的作用，为胶质瘤治疗提供新的治疗靶点 | 胶质瘤患者数据、胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | RNA测序、单细胞测序、免疫浸润分析、基因集富集分析、DNA甲基化分析、细胞敲低和过表达实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、甲基化数据 | 来自TCGA、HPA、CGGA、TISCH2等数据库的胶质瘤患者和正常样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-04-01 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究揭示了在肝细胞癌中，TGF-β通过激活p-p38诱导CD8+ T细胞耗竭，但同时通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴启动细胞内在的“自我拯救”机制，以缓解耗竭状态 | 首次描述了肝细胞癌中CD8+ T细胞通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴进行“自我拯救”以对抗耗竭的新机制，并发现通过TAK-981放大该信号可改善T细胞功能 | 该“自我拯救”行为对TGF-β刺激具有时间和剂量限制，且易被更强的抑制信号所掩盖 | 探究TGF-β对肝细胞癌中浸润CD8+ T细胞的调控作用及分子机制 | 肝细胞癌中浸润的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、免疫组化、RNA-seq、单细胞RNA-seq、ATAC-seq、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-04-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular characteristics of high-grade and metastatic bladder cancer
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00820-x
PMID:37170046
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征 | 首次在单细胞水平上比较了膀胱癌的原发肿瘤和淋巴结转移样本，揭示了恶性细胞在转移过程中的突变和表型变化，并发现了iCAF和TAM在T细胞耗竭及肿瘤微环境形成中的早期作用 | 样本量有限，仅分析了少数患者的组织样本，且未进行功能验证实验 | 探究高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征，以寻找潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者的癌旁正常组织、原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 50,158个细胞，来自多个组织样本（具体患者数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-04-01 |
Unsupervised removal of systematic background noise from droplet-based single-cell experiments using CellBender
2023-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01943-7
PMID:37550580
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度生成模型的工具CellBender，用于无监督去除液滴式单细胞实验中的系统性背景噪声 | 提出了一种基于液滴式检测噪声生成现象学的深度生成模型，能准确区分含细胞与无细胞液滴，学习背景噪声特征，并以端到端方式提供无噪声量化 | NA | 去除液滴式单细胞实验中的系统性背景噪声，以提高数据质量 | 液滴式单细胞实验数据，包括scRNA-seq、snRNA-seq和CITE-seq | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、CITE-seq | 深度生成模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 152 | 2026-04-01 |
Protocol for multi-modal single-cell RNA sequencing on M. tuberculosis-infected mouse lungs
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102102
PMID:36853694
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研究论文 | 本文介绍了一种用于结核分枝杆菌感染小鼠肺组织的多模态单细胞RNA测序实验方案 | 开发了能够同时获取感染细胞的转录组、表面标志物表达和细菌表型的多模态单细胞RNA测序技术 | NA | 阐明不同免疫细胞在控制或促进结核分枝杆菌感染中的作用机制 | 结核分枝杆菌感染的小鼠肺组织巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-04-01 |
Lineage plasticity enables low-ER luminal tumors to evolve and gain basal-like traits
2023-03-01, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01621-8
PMID:36859337
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研究论文 | 本研究揭示了低雌激素受体（ER）表达的管腔型乳腺肿瘤可通过谱系可塑性演化并获得基底样特征 | 首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序证明低ER管腔肿瘤可通过谱系可塑性演化出基底样特征，并发现SOX10是这一过程的关键驱动因子 | 研究主要基于MMTV-PyMT小鼠模型，人类肿瘤中的验证尚需进一步研究 | 探究低ER管腔型乳腺肿瘤如何演化并获得基底样特征的分子机制 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型及乳腺肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | MMTV-PyMT小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-04-01 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 本研究通过建立结直肠癌患者来源类器官模型，并利用单细胞RNA测序技术，在单细胞分辨率下揭示了奥沙利铂耐药的机制 | 首次结合患者来源类器官模型与单细胞RNA测序技术，在单细胞水平系统解析结直肠癌对奥沙利铂的耐药机制，并识别出关键的耐药相关基因和转录因子 | 研究仅基于两株患者来源类器官模型，样本量较小，且耐药机制的体内验证和临床转化潜力有待进一步研究 | 研究结直肠癌对奥沙利铂化疗耐药的分子机制，以寻找潜在的治疗靶点 | 结直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两株患者来源类器官（分别来自奥沙利铂耐药和初治患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-04-01 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
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综述 | 本文综述了胰腺导管化生（PDM）的分子信号机制及其作为早期胰腺癌检测和干预新兴生物标志物的研究进展 | 整合了基因工程小鼠模型、细胞谱系追踪和单细胞测序等新技术，揭示了PDM形成和演化的新细胞与分子机制，并强调了PDM相关生物标志物在早期胰腺癌筛查中的转化潜力 | NA | 探讨PDM的生物学机制及其在胰腺癌早期检测和干预中的临床意义 | 胰腺导管化生（PDM）及其与胰腺上皮内瘤变（PanIN）和胰腺导管腺癌（PDA）的关联 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、细胞谱系追踪、基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-04-01 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序分析，构建了一个用于胶质母细胞瘤患者的综合预后模型 | 结合TCGA和CGGA数据库的转录组数据与单细胞测序，识别出7个新的预后标志基因，并构建了包含遗传特征、年龄、IDH突变状态及治疗信息的综合预后模型，尤其在老年患者中表现良好 | 模型主要基于回顾性数据库分析，需要前瞻性临床研究进一步验证其普适性和临床应用价值 | 揭示胶质母细胞瘤的潜在预后标志基因，阐明其功能，并构建有效的预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序, 实时PCR | 预后风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-04-01 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
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研究论文 | 本研究探讨了1p/19q共缺失状态在IDH突变低级别胶质瘤中与肿瘤相关巨噬细胞浸润的关联 | 首次揭示了1p/19q共缺失状态通过M-CSF和TGFβ1信号通路影响IDH突变胶质瘤中TAM表型和浸润的机制 | 研究主要基于TCGA数据库和单细胞测序数据，样本量有限，且动物模型结果需进一步验证 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或流行率 | IDH突变的低级别胶质瘤患者样本和胶质瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫染色图像 | 230个TCGA数据库样本及IDH突变LGG单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2026-04-01 |
Variance-adjusted Mahalanobis (VAM): a fast and accurate method for cell-specific gene set scoring
2020-09-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa582
PMID:32633778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Variance-adjusted Mahalanobis (VAM)的新方法，用于单细胞RNA测序数据中的基因集评分，以提高细胞特异性通路分析的准确性和计算效率 | VAM方法首次支持细胞水平的基因集推断，通过整合Seurat框架，能有效处理单细胞RNA测序数据中的技术噪声、稀疏性和大样本量，并提供快速的gamma近似分布用于统计推断 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能依赖于模拟和真实数据的验证范围 | 开发一种快速且准确的细胞特异性基因集评分方法，以改善单细胞RNA测序数据的统计分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵和通路水平聚合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Variance-adjusted Mahalanobis (VAM) 方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-04-01 |
Single-cell RNA-seq identifies unique transcriptional landscapes of human nucleus pulposus and annulus fibrosus cells
2020-09-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-72261-7
PMID:32943704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了健康人类椎间盘髓核和纤维环细胞的独特转录组景观，并鉴定了差异表达基因和关键转录因子 | 首次在单细胞水平上定义了健康人类椎间盘髓核和纤维环的转录组图谱，识别了2,196个差异表达基因，并确定了FOXM1和KDM4E作为各自细胞类型的特征转录因子 | 研究仅基于非退行性腰椎间盘样本，可能无法完全代表疾病状态或其他椎间盘区域 | 阐明健康人类椎间盘髓核和纤维环细胞的分子通路和转录网络，以理解椎间盘疾病的潜在机制 | 人类椎间盘髓核和纤维环细胞 | 数字病理学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 非退行性腰椎间盘样本中的原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-04-01 |
scIGANs: single-cell RNA-seq imputation using generative adversarial networks
2020-09-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa506
PMID:32588900
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成对抗网络（GANs）的单细胞RNA测序数据插补方法scIGANs，用于解决scRNA-seq数据中的dropout问题 | 使用生成细胞而非观察细胞进行插补，避免了传统方法的过平滑问题，并平衡了主要和稀有细胞群体的性能 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据插补方法，以增强下游分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GANs） | RNA测序数据 | 超过100,000个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |