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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-04-21 |
PTEN restrains SHH medulloblastma growth through cell autonomous and nonautonomous mechanisms
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667996
PMID:40766638
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研究论文 | 本研究探讨PTEN基因在SHH亚型髓母细胞瘤中通过细胞自主和非自主机制抑制肿瘤生长的作用 | 揭示了PTEN缺失通过促进细胞增殖、增强祖细胞状态以及减少巨噬细胞浸润和细胞毒性,加速SHH髓母细胞瘤生长的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者中的直接验证尚需进一步研究 | 探究PTEN基因在SHH髓母细胞瘤生长中的调控机制及其对疾病预后的影响 | SHH亚型髓母细胞瘤小鼠模型及小脑颗粒细胞前体细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-04-21 |
Single-cell transcriptomic and chromatin dynamics of the human brain in PTSD
2025-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09083-y
PMID:40533550
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质动态分析,揭示了创伤后应激障碍(PTSD)在人脑前额叶皮层中的细胞特异性分子调控机制 | 首次在超过两百万个细胞核中,以细胞类型特异性方式整合遗传、转录组和表观遗传数据,系统解析PTSD的调控机制,并利用空间转录组学验证关键基因 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态下的动态变化;样本量虽大,但疾病异质性可能影响结果普适性 | 探究PTSD在人脑前额叶皮层中的细胞特异性分子基础与调控网络 | 111个人类死后大脑的背外侧前额叶皮层细胞核 | 单细胞组学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞转录组测序、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据、空间转录组数据 | 超过两百万个细胞核,来自111个人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2026-04-21 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
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综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术:空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学,及其在癌症研究中的应用 | 聚焦于空间分辨率的代谢组学技术,结合单细胞转录组学和蛋白质组学等成熟方法,推动癌症代谢研究的新发现 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于技术讨论,缺乏实证研究细节 | 探讨解码癌症代谢的空间分辨率技术,以支持癌症细胞适应性和治疗抵抗的研究 | 癌症细胞及其代谢途径、代谢物 | 代谢组学 | 癌症 | 代谢组学、质谱分析 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 细胞器代谢组学 | NA | NA |
| 144 | 2026-04-21 |
Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08941-z
PMID:40307555
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学方法,揭示了水稻根部组织如何通过细胞特异性转录响应适应土壤压力 | 首次在单细胞分辨率下展示了根部组织如何响应土壤异质性和压实压力,并识别了由韧皮部细胞释放的脱落酸调控的细胞壁重塑和屏障形成机制 | 研究主要基于水稻模型,可能无法完全代表其他植物物种的响应机制 | 探究根部组织在单细胞尺度上如何适应不同土壤条件和压力 | 水稻根部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 145 | 2026-04-21 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析,揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性,特别是CXCL13+ Tex细胞在疾病进展中的作用 | 首次在肝硬化中系统鉴定出八个CD8+ T细胞亚型,并明确了CXCL13+ Tex细胞作为终末耗竭亚型与疾病严重程度及肝癌预后不良的相关性 | 研究主要基于测序数据分析,缺乏体内功能验证实验来直接证明CXCL13+ Tex细胞的因果作用 | 阐明肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的分子机制 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 转录组测序, 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 谱系追踪, 差异分析 | RNA-seq数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-04-21 |
PDGF-BB overexpressing dental pulp stem cells improve angiogenesis in dental pulp regeneration
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1578410
PMID:40343206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现人牙髓中PDGF(+)间充质子集具有增强的血管生成特征,并通过过表达PDGF-BB的牙髓干细胞改善牙髓再生中的血管生成 | 首次利用单细胞RNA测序识别牙髓中具有血管生成潜能的PDGF(+)间充质子集,并通过基因工程过表达PDGF-BB增强牙髓干细胞的血管生成能力 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 改善牙髓再生中的血管生成,以克服牙髓组织营养供应受限的挑战 | 人牙髓样本、牙髓干细胞(DPSCs)、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、大鼠肾脏包膜移植模型 | 数字病理学 | 牙髓疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化、慢病毒载体转导 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及人牙髓样本和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-04-21 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies CCR6-Driven Immune Landscape Changes in RM1 Prostate Cancer Bone Metastasis
2025 Jan-Dec, DNA and cell biology reports
DOI:10.1089/dcbr.2025.0001
PMID:42004296
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了CCR6缺陷如何影响RM1前列腺癌骨转移模型中骨髓免疫细胞的通讯与景观变化 | 首次在RM1前列腺癌骨转移模型中,通过单细胞RNA测序揭示了CCR6缺陷驱动的免疫微环境重塑,包括巨噬细胞、调节性T细胞和髓源性抑制细胞样细胞的信号增强,以及CCL、TGFb、MIF和CXCL通路的改变,这些发现与人类去势抵抗性前列腺癌骨转移的观察一致 | 研究基于小鼠模型,虽然人类数据集验证了部分免疫相互作用的保守性,但直接临床转化仍需进一步验证 | 研究CCR6在前列腺癌骨转移免疫微环境中的作用,以探索免疫治疗新靶点 | RM1前列腺癌骨转移模型中的骨髓免疫细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 野生型和CCR6敲除的C57BL/6小鼠,注射RM1-BoM3细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-04-21 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和碱基化学测序技术在单细胞RNA-seq中准确测序通过同聚物引物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次系统评估Element Aviti平台的亲和碱基化学测序技术,证明其能准确测序通过传统上难以处理的胸腺嘧啶同聚物区域,并开发了改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比,配对端比对并未一致提高读段映射率,且未排除其他新兴平台可能具有类似性能 | 改进单细胞RNA-seq文库的特征分析,特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA-seq, 配对端测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术 |
| 149 | 2026-04-20 |
A Dynamic Change of Microglial States Occurs During the Transition From Photoreceptor Degeneration to Regeneration in Zebrafish pde6c Mutants
2026-Jun, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70158
PMID:41995141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了斑马鱼pde6c突变体中视网膜小胶质细胞在光感受器退化到再生过渡期间的动态状态变化 | 首次在斑马鱼慢性光感受器退化模型中,利用scRNA-seq技术系统描绘了小胶质细胞在神经元退化和再生过程中的功能状态异质性和动态转变 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果向人类神经退行性疾病的直接转化需谨慎;样本时间点有限,可能未覆盖所有动态变化阶段 | 探究小胶质细胞功能状态在神经元退化和再生过程中的调控机制 | 斑马鱼pde6c突变体视网膜中的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型同胞和pde6c突变体斑马鱼视网膜样本(5 dpf和4 wpf时间点) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-04-20 |
Multimodal transcriptomics identifies metallothionein as a novel pathway in primary sclerosing cholangitis
2026-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001432
PMID:40560681
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研究论文 | 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在原发性硬化性胆管炎(PSC)肝脏样本中识别出金属硫蛋白作为新的疾病通路 | 首次在PSC肝脏中通过多模态转录组学技术定位金属硫蛋白通路至特定微解剖区域,并发现其与APOE+肝细胞亚型相关 | 样本量相对有限(23例PSC和7例疾病对照),且主要基于移植肝脏样本,可能无法完全代表早期疾病阶段 | 识别PSC的潜在疾病通路并定位至特定肝脏微解剖区域 | 原发性硬化性胆管炎(PSC)患者和疾病对照的肝脏移植样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 23例PSC和7例疾病对照肝脏样本,共分析76,664个空间转录组学点和91,891个单核 | NA | 空间转录组学, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2026-04-20 |
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70108
PMID:41732956
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研究论文 | 本研究通过分析牙周肉芽组织中的细菌组和细胞谱,探索其生物学本质和转化潜力 | 首次结合16S rRNA测序、单细胞测序和组织学评估,比较了不同来源牙周肉芽组织的细菌组和细胞谱特征 | 样本量相对有限(49例),且未来需要更多转化研究来验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞来源的潜力 | 探索牙周肉芽组织的生物学本质及其在牙周再生中的转化潜力 | 牙周肉芽组织样本,包括来自骨缺损、拔牙窝和牙根表面的组织 | 数字病理 | 牙周病 | 16S rRNA测序, 单细胞测序 | NA | 序列数据, 组织学图像 | 49例严重牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-04-20 |
Unmasking FCGR2B as a high-grade serous ovarian cancer specific marker of immune suppression and tumor progression through multi-omics mining
2026-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102748
PMID:41934917
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了FCGR2B作为高级别浆液性卵巢癌特异性免疫抑制和肿瘤进展标志物的作用 | 首次构建了上皮性卵巢癌亚型特异的蛋白质-免疫-EOC调控图谱,并利用孟德尔随机化框架识别了FCGR2B在HGSOC中的关键因果作用 | 研究主要基于遗传学关联和体外分析,需要进一步的体内功能验证和临床试验来确认FCGR2B作为治疗靶点的潜力 | 阐明血浆蛋白如何通过影响免疫细胞特征来促进上皮性卵巢癌的发病机制 | 上皮性卵巢癌患者,特别是高级别浆液性卵巢癌亚型 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,转录组分析,药物-基因相关性分析 | 孟德尔随机化框架 | 基因组关联研究数据,血浆蛋白质组学数据,免疫细胞特征数据,单细胞RNA-seq数据,免疫荧光图像数据 | 两个EOC队列的亚型分层GWAS数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2026-04-20 |
Developmental neurotoxicity of thyroid hormone system-disrupting chemicals: a systems-level exploration using multi-omics approach
2026-May, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04303-4
PMID:41654649
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨甲状腺激素系统干扰化学物对发育期神经毒性的影响 | 采用多组学整合分析揭示不同作用模式的THSDCs在脑部引发的分子层面扰动 | 研究仅针对两种THSDCs,且样本局限于大鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 探究甲状腺激素系统干扰化学物对孕期和哺乳期脑发育的影响机制 | 怀孕大鼠及其后代 | 多组学分析 | 发育性神经毒性 | 蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物、空间转录组数据 | 怀孕大鼠及其后代 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2026-04-20 |
Dynamics of Spinal Fluid Immune Cell Alterations Following Cladribine Tablet Treatment in Multiple Sclerosis
2026-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200565
PMID:41990287
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法,分析了口服克拉屈滨片治疗多发性硬化症患者脑脊液和血液中免疫细胞的动态变化 | 首次利用单细胞测序技术,在单中心IV期临床试验中,系统研究了克拉屈滨治疗对多发性硬化症患者脑脊液和血液中免疫细胞组成及T细胞和B细胞克隆性的影响 | 样本量较小(13名患者,34个样本),且仅来自单一研究中心,可能限制结果的普遍性 | 探究克拉屈滨治疗多发性硬化症的机制,特别是其对脑脊液内区室化炎症的影响 | 多发性硬化症患者的脑脊液和血液样本 | 单细胞测序 | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、T和B淋巴细胞受体库数据 | 13名复发型多发性硬化症患者的34个样本(包括治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-04-20 |
Integrating optogenetic fMRI and spatial transcriptomics to reveal circuit-specific gene signatures in fronto- and hippo-thalamic networks
2026-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71923-w
PMID:42000729
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研究论文 | 本研究通过整合光遗传功能磁共振成像和空间转录组学,揭示了前额叶-丘脑和海马-丘脑网络中电路特异性基因签名 | 首次在同一小鼠中同时进行清醒状态下的光遗传功能磁共振成像和空间转录组学,实现了神经活动与基因表达的耦合分析 | 研究仅在小鼠模型中进行,结果可能无法直接推广到人类 | 阐明微观分子结构如何塑造宏观脑网络组织,并揭示区域特异性神经血管耦合的基因基础 | 小鼠的前额叶-丘脑和海马-丘脑网络 | 神经科学 | NA | 光遗传功能磁共振成像,空间转录组学 | GLM,PCA | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 157 | 2026-04-20 |
Causal inference of glucocorticoid signaling in non-small cell lung cancer: integrating Mendelian randomization, single-cell transcriptomics, and imaging data
2026-Apr-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01421-1
PMID:42000855
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞转录组学和影像数据,系统阐明了糖皮质激素相关基因与非小细胞肺癌之间的潜在因果关系 | 首次系统性地揭示了糖皮质激素相关基因通过调节M2巨噬细胞功能介导非小细胞肺癌风险的潜在因果机制 | 未明确说明样本量大小及具体数据来源细节 | 探究糖皮质激素相关基因与非小细胞肺癌之间的因果关系及其潜在机制 | 非小细胞肺癌患者组织、细胞系及临床影像数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组学、影像组学特征提取 | nnU-Net、Cox比例风险模型 | 转录组数据、单细胞数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-04-20 |
Single-cell transcriptomic landscape highlights epithelial-fibroblast interactions and CD44-mediated malignant traits in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Apr-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01431-z
PMID:42000946
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了喉鳞状细胞癌中上皮细胞与成纤维细胞的异质性及其相互作用,并识别了CD44在转移中的关键驱动作用 | 首次在喉鳞状细胞癌中利用单细胞转录组学全面描绘了上皮细胞和成纤维细胞的异质性,并揭示了CD44通过成纤维细胞-上皮相互作用促进转移的新机制 | 样本量较小(仅3名患者),且未涉及更广泛的临床队列验证 | 探究喉鳞状细胞癌中上皮细胞与成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用 | 喉鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、邻近非肿瘤组织和转移淋巴结 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名患者的9个匹配样本(包括原发肿瘤、邻近非肿瘤组织和转移淋巴结) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-04-20 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-Apr-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10193-0
PMID:42000969
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了后纵韧带骨化症(OPLL)的细胞异质性及其免疫微环境 | 首次构建了OPLL的单细胞转录组图谱,揭示了软骨细胞谱系从炎症/反应状态向骨化程序转变的轨迹,并识别了关键的免疫-基质相互作用通路 | 样本量较小(仅来自人类患者的手术切除病变),且为探索性研究,需要进一步验证 | 阐明OPLL的细胞异质性和发病机制 | 人类患者手术切除的颈椎OPLL病变组织 | 数字病理学 | 后纵韧带骨化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 4,683个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-04-20 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析B7家族免疫检查点分子在胆囊癌中的表达,揭示了肿瘤细胞异质性,并构建了一个基于机器学习的术后风险分层模型 | 首次在单细胞分辨率下系统研究B7家族分子(CD276、VTCN1、HHLA2)在胆囊癌中的表达异质性及其功能,并开发了一个整合多变量的梯度提升机模型用于术后预后预测 | 样本量相对有限(7个肿瘤用于单细胞测序,188例患者用于生存分析),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性验证 | 阐明胆囊癌细胞的生物学异质性,并改进术后风险分层 | 胆囊癌患者肿瘤样本及细胞系 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序,机器学习生存分析 | 梯度提升机,非负矩阵分解 | 单细胞RNA测序数据,临床病理数据 | 7个原发性肿瘤用于单细胞测序,188例手术治疗的胆囊癌患者用于生存建模 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |