单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38102 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-04-04
CX3CR1 identifies a potent effector CD8+ T cell subset associated with anti-PD-1 therapeutic efficacy in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等多维方法,揭示了CX3CR1+CD8+T细胞作为结直肠癌中预测预后和免疫治疗反应的关键效应亚群 首次将CX3CR1+CD8+T细胞鉴定为具有强细胞毒性和低耗竭特征的Temra样终末效应亚群,并证明其富集是结直肠癌患者总生存期的独立预测因子,同时揭示了ETS1、PRDM1和STAT1驱动的调控网络在抗PD-1治疗中的作用机制 研究主要基于结直肠癌样本,结果在其他癌症类型中的普适性尚未验证;虽然结合了临床数据和动物模型,但样本量可能有限,且调控网络的具体分子机制仍需进一步功能验证 解码肿瘤浸润CD8+T细胞的异质性,识别真正驱动肿瘤控制的效应亚群,以优化结直肠癌患者分层和治疗策略 结直肠癌患者肿瘤组织中的CD8+T细胞,特别是CX3CR1+CD8+T细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫组化(mIHC),SCENIC分析 NA 单细胞转录组数据,组织图像数据,临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
142 2026-04-04
Prognostic biomarkers related to PANoptosis in esophageal cancer and their immune microenvironment: multi-omics analysis and therapeutic significance
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析探索食管癌中PANoptosis相关的预后生物标志物及其免疫微环境机制 首次在食管癌中系统研究PANoptosis相关基因,并构建诊断和预后模型,揭示CCT6A通过促进TAM-SPP1分化抑制PANoptosis的新机制 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要更多临床样本验证模型和机制的普适性 探索食管癌中PANoptosis相关的预后生物标志物及其潜在机制 食管鳞状细胞癌(ESCA) 生物信息学 食管癌 转录组测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq),加权基因共表达网络分析(WGCNA),差异表达分析,Cox回归,机器学习模型,基因免疫浸润分析,功能富集分析,免疫评估,药物敏感性分析,分子对接,免疫组织化学 机器学习模型(未指定具体类型),Cox回归模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 来自TCGA和GEO数据库的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
143 2026-04-04
Comprehensive Bioinformatics Analysis and Experimental Verification RNF186 Is a Recurrence Signature Gene of Hepatocellular Carcinoma that Promotes Cell Proliferation
2026, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过整合分析原发性和复发性肝细胞癌的单细胞RNA测序数据,鉴定出与复发相关的基因,并构建了一个用于预测生存结局和免疫治疗反应性的预后模型 首次在单细胞分辨率下识别肝细胞癌复发相关基因,并构建了整合临床变量的LASSO-Cox回归预后模型,同时通过实验验证了RNF186通过SESN2依赖性方式促进肝癌细胞增殖的新机制 样本量相对较小(共18个样本),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列进行验证 识别肝细胞癌复发相关的基因特征,并开发预测生存结局和免疫治疗反应性的预后模型 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归模型 单细胞RNA测序数据 12个原发性HCC样本和6个复发性HCC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
144 2026-04-04
Multi-omics integration identifies PGAP3 as a tumor-intrinsic factor associated with CD8+ T-cell exclusion in prostate cancer
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,鉴定出PGAP3是前列腺癌中与CD8+ T细胞排斥相关的肿瘤内在因子 首次通过整合全转录组孟德尔随机化、多队列测序和空间转录组学数据,将PGAP3鉴定为与前列腺癌免疫逃避相关的肿瘤内在基因,并揭示了其与代谢重编程和CD8+ T细胞低浸润的关联 研究主要在体外细胞系中进行功能验证,未来需要在免疫活性系统中进行机制研究 鉴定驱动前列腺癌免疫逃避的肿瘤细胞内在程序 前列腺癌 数字病理学 前列腺癌 全转录组孟德尔随机化,多队列批量RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫分析 NA 基因组关联研究数据,表达数量性状位点数据,RNA测序数据,空间转录组数据 多队列测序数据,C4-2和DU145细胞系 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
145 2026-04-04
Molecular modulation of cell migration via chitosan-based hydrogels: Toward smart biomaterial for wound regeneration
2026 Jan-Dec, Journal of applied biomaterials & functional materials IF:3.1Q3
综述 本文综述了壳聚糖基水凝胶通过调控生化和生物物理信号来协调细胞迁移,以促进伤口再生的设计原理与应用 系统分析了通过可逆共价键和超分子组装精确调控水凝胶粘弹性以影响YAP/TAZ核定位及下游信号通路,从而差异促进角质形成细胞迁移、成纤维细胞增殖和内皮血管生成,并提出了结合单细胞转录组学、先进成像和AI建模的转化路线图 文中指出的关键挑战包括体内机械与分子影响的定量解耦、改性壳聚糖衍生物的长期生物相容性,以及高通量筛选数据向临床转化的困难 开发用于伤口再生的下一代个性化智能生物材料 壳聚糖基水凝胶及其对细胞迁移的分子调控 生物材料与组织工程 伤口愈合(糖尿病足溃疡、烧伤) 单细胞转录组学、先进成像、AI建模 AI驱动建模 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
146 2026-04-04
Investigating the Role of TNFSF12 in Thyroid Cancer Progression via Single-Cell RNA Sequencing and Integrated Multiomics Analyses
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和整合多组学分析,探讨了TNFSF12在甲状腺癌进展中的作用 识别了肿瘤特异性髓系亚群和疾病相关共表达模块,并通过孟德尔随机化验证了MERTK和MSR1作为遗传风险因素,同时发现TNFSF12具有保护作用但功能上促进癌细胞增殖、侵袭和迁移 未明确说明样本量大小,且功能验证仅限于甲状腺癌细胞系,可能缺乏体内模型验证 识别并验证驱动甲状腺癌进展的关键髓系来源基因 甲状腺癌组织和甲状腺癌细胞系 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、CCK-8、集落形成、Transwell实验、微生物相关性分析、分子对接 NA RNA测序数据、功能实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
147 2026-04-04
Sclerotic GVHD and scleroderma share dysregulated gene expression that is ameliorated by EREG therapeutic antibody
2025-Dec-25, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究开发了一种全人源抗EREG中和抗体,用于治疗硬皮病和硬化性移植物抗宿主病,通过单细胞转录组学和空间转录组学分析揭示了其抗纤维化机制 首次开发了高亲和力和特异性的全人源抗EREG中和抗体,并发现其通过抑制EREG驱动的TNC产生,减少炎症和纤维化生物标志物 研究样本量有限,且主要基于小鼠模型和患者皮肤外植体,需要进一步临床试验验证 研究抗EREG抗体在治疗免疫驱动的纤维化皮肤疾病(如硬皮病和硬化性GVHD)中的疗效和机制 硬皮病(系统性硬化症)、局限性硬皮病(硬斑病)和硬化性移植物抗宿主病患者的皮肤组织 数字病理学 硬皮病 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据,蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
148 2026-04-04
Hybrid identity and distinct methylation profiles of incomplete intestinal metaplasia in the stomach
2025-Dec-05, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学、DNA甲基化分析和单细胞RNA测序,揭示了胃不完全肠化生的分子特征及其与胃癌的关联 首次使用空间转录组学结合定制谱系富集面板,揭示了不完全肠化生的混合谱系特征及其与胃癌的分子相似性 样本量有限,且主要基于组织样本和类器官模型,需要进一步在更大队列中验证 阐明不完全肠化生的分子身份、分化潜能和致癌相关性 胃肠化生组织和胃癌组织 空间转录组学 胃癌 空间转录组学, DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 甲基化数据, 染色质可及性数据 未明确指定样本数量,但包括GIM和GC组织样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 定制谱系富集面板用于空间转录组学分析
149 2026-04-04
NOTCH3 drives fatty acid oxidation and ferroptosis resistance in aggressive meningiomas
2025-Dec, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2
研究论文 本研究揭示了NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中通过驱动脂肪酸氧化和铁死亡抵抗来促进肿瘤恶性行为的机制 首次在脑膜瘤中探索了NOTCH3激活的代谢表型,并建立了NOTCH3信号传导、脂质代谢重编程和铁死亡逃逸之间的联系 研究主要基于细胞系模型,需要进一步在体内模型和临床样本中验证 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢作用及其与铁死亡抵抗的关系 人类脑膜瘤细胞系(包括CH157-MN细胞模型)和患者来源的原代脑膜瘤细胞系 单细胞组学 脑膜瘤 单细胞RNA测序,非靶向代谢组学,脂质组学,bulk RNA测序,功能性代谢测定 NA 单细胞RNA测序数据,代谢组学数据,脂质组学数据,bulk RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及NOTCH3+人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
150 2026-04-04
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology IF:0.7Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了先天性膈疝肺中上皮-间质祖细胞状态的改变,导致基质沉积、组织炎症和上皮细胞过渡状态 首次在先天性膈疝模型中利用单细胞RNA测序技术系统性地分析了间质祖细胞的异常状态及其对上皮-间质转化动态的破坏作用 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类样本中验证,且样本量相对有限 探究先天性膈疝肺发育异常的分子机制,特别是上皮-间质祖细胞状态改变对肺发育的影响 正常和先天性膈疝胎鼠肺组织(E17、E19、E21时间点) 单细胞组学 先天性膈疝 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 正常和CDH胎鼠肺组织(E17、E19、E21三个发育阶段) NA 单细胞RNA-seq NA NA
151 2026-04-04
Single-Cell Analysis of L-Myc Expressing Neural Stem Cells and Their Extracellular Vesicles Revealed Distinct Progenitor Populations With Neurogenic Potential
2025-Nov, Journal of extracellular biology
研究论文 本研究通过单细胞分析,表征了表达L-MYC基因的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,揭示了它们具有神经保护潜力,并探讨了在化疗诱导的神经毒性模型中的应用 首次对表达L-MYC的神经干细胞系及其细胞外囊泡进行单细胞转录组和蛋白质组学表征,揭示了它们在神经保护方面的差异和潜力 研究未能成功挽救少突胶质祖细胞,表明需要重复或补充性干预来恢复少突胶质细胞群 表征治疗相关的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,以促进脑修复和对抗化疗诱导的神经毒性 人类胎儿神经干细胞系LMNSC01和LMNSC02,以及它们释放的细胞外囊泡 单细胞分析 神经毒性 单细胞RNA测序,单细胞外囊泡纳米显微镜技术,蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,显微镜图像 两个人类胎儿神经干细胞系(LMNSC01和LMNSC02)及其细胞外囊泡 NA 单细胞RNA-seq NA NA
152 2026-04-04
EGFR-STAT1 pathway drives fibrosis initiation in fibroinflammatory skin diseases
2025-Oct-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序图谱揭示了EGFR-STAT1信号通路在驱动纤维炎症性皮肤病中纤维化起始的关键作用 首次发现STAT1在成纤维细胞中的非干扰素依赖性功能,即通过EGFR-JAK非依赖性途径直接激活纤维化基因表达,并确定了活化的角质形成细胞分泌的高亲和力EGFR配体是该通路的触发因素 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,人类样本的临床验证和长期治疗效果评估尚需进一步研究 探究慢性炎症性皮肤病中决定纤维化发生的信号通路 七种炎症性皮肤病及其健康对照的皮肤组织样本 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多种炎症性皮肤病及健康对照的皮肤组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
153 2026-04-04
Identifying spatially variable genes by projecting to morphologically relevant curves
2025-Sep-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于谱图理论的方法,用于在空间转录组学数据中识别空间可变基因,通过将二维空间坐标投影到一维曲线上来反映组织形态 引入谱图理论来近似样本空间坐标的一维曲线,并开发广义加性模型直接建模基因计数,无需标准化或正态假设,同时能准确估计基因表达模式和空间位点 NA 识别空间转录组学数据中的空间可变基因 空间转录组学数据,包括小鼠黏膜和多样本数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学 广义加性模型 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 Slide-seq, MERFISH NA
154 2026-04-04
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-08, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究利用MERFISH空间转录组技术结合深度学习,揭示了人类胎儿大脑皮层分层和区域特化的时空发育图谱 首次在空间单细胞分辨率下系统描绘人类胎儿皮层发育,发现皮层区域特化存在连续渐变和离散突变两种模式,挑战了传统梯度过渡理论 研究仅聚焦胎儿发育阶段,未涵盖出生后皮层成熟过程;技术层面MERFISH检测基因数量有限 解析人类大脑皮层分层结构和区域特化的时空发育机制 人类胎儿大脑皮层组织 空间转录组学 NA MERFISH(多重错误鲁棒荧光原位杂交),单核RNA测序 深度学习(用于细胞核分割) 空间转录组数据,单细胞基因表达数据 超过1800万个单细胞,涵盖7个发育时间点和8个皮层区域 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA MERFISH技术结合深度学习细胞核分割
155 2026-04-04
Cigarette Tar Enhanced ECs Pyroptosis via CAMKII/Drp1/mtDNA: Novel Insight Into the Mechanism of Plaque Erosion
2025-Aug, JACC. Basic to translational science
研究论文 本研究揭示了吸烟通过诱导内皮细胞焦亡促进斑块侵蚀的新机制 首次发现香烟焦油通过CAMKII/Drp1/mtDNA通路增强内皮细胞焦亡,为斑块侵蚀机制提供新见解 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床验证尚需进一步研究 探究吸烟导致斑块侵蚀的分子机制 载脂蛋白E基因敲除小鼠、人冠状动脉内皮细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
156 2026-04-04
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 提出了首个无需参考框架、利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补的方法 未在摘要中明确说明 解决空间转录组数据分析中的高噪声和基因测量缺失问题 空间转录组数据 空间转录组学 衰老相关疾病 空间转录组学 深度学习框架、基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
157 2026-04-04
Intrinsic immunosuppressive features of monocytes suppress CAR-T19 through IL-1 pathway modulation in mantle cell lymphoma
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
研究论文 本研究揭示了单核细胞通过IL-1通路调节抑制CAR-T19的内在免疫抑制特征,在套细胞淋巴瘤中 首次将IL-1受体拮抗剂识别为M2样巨噬细胞抑制CAR-T19的介质,并作为增强CAR-T19疗效的潜在靶点 研究主要基于临床前模型和ZUMA-2试验样本,需进一步验证在更广泛患者群体中的适用性 探索CAR-T19在套细胞淋巴瘤中失效的机制,并寻找增强其疗效的潜在靶点 套细胞淋巴瘤患者、CAR-T19产品、单核细胞和巨噬细胞 免疫学 套细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、临床样本数据 ZUMA-2试验的临床样本及临床前模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
158 2026-04-04
Association of Obesity and Innate Immune Markers With Resistance to Biologic Therapy in Psoriasis
2025-Jun-01, JAMA dermatology IF:11.5Q1
研究论文 本研究通过横断面分析,探讨了肥胖和表皮先天免疫标志物与银屑病患者对生物制剂治疗产生抵抗的关联 首次结合临床因素(肥胖)和空间转录组学分析,揭示了表皮先天免疫反应失调和中性粒细胞活性增强是导致生物制剂疗效难以持续的新机制 研究为横断面设计,样本量相对较小(87例患者),且来自单一医疗中心,可能限制结果的普遍适用性 阐明影响重度银屑病患者对生物制剂治疗产生持续反应的炎症微环境因素 年龄≥18岁、患有斑块型重度银屑病(PASI>10,BSA>10)且对传统系统治疗无效后接受生物制剂治疗至少24个月的患者 数字病理学 银屑病 空间转录组学,免疫荧光分析 NA 转录组数据,蛋白质表达数据 87名患者(平均年龄42.2岁,24名女性,63名男性) NA 空间转录组学 NA NA
159 2026-04-04
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序方法,定义了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)中IL-17和CSF-1的致病性基因表达特征,旨在为患者分层和靶向治疗选择提供依据 利用单细胞测序技术在小鼠模型中“逆向工程”出IL-17和CSF-1的时间动态基因特征,并成功在cGVHD患者的相关单核细胞群体中验证了这些特征 研究基于临床前模型推导特征,并在患者中进行回顾性验证,仍需前瞻性临床研究进一步评估其预测价值;特征仅在70%的确诊患者和50%的后续发病患者中检测到 定义cGVHD中IL-17和CSF-1的致病性基因表达特征,以促进靶向治疗的患者选择和识别高风险个体进行预防性治疗 慢性移植物抗宿主病(cGVHD)患者和小鼠模型 单细胞测序 慢性移植物抗宿主病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2026-04-04
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究是一项随机II期临床试验,旨在比较帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性 首次在体能状态差(ECOG PS 2)的晚期NSCLC患者中,直接比较帕博利珠单抗单药与联合极低剂量化疗的疗效,并探索了基于血液的生物标志物,包括使用流式细胞术和单细胞测序分析免疫细胞 样本量较小(共43例患者),研究为II期试验,需要更大规模的III期试验验证结果;生物标志物分析为可选项目,样本量有限 确定帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的最佳治疗方案 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 NA 肺癌 流式细胞术,单细胞测序 NA 临床数据,血液样本数据 43例患者(每组20例可评估疗效),其中20例提供了可选血液样本用于生物标志物分析 NA 单细胞测序 NA NA
回到顶部