本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-29 |
CD70-Targeting CAR-NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-Risk Multiple Myeloma Models
2025-Oct-27, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
PMID:41144785
|
研究论文 | 本研究开发了靶向CD70的CAR-NK细胞疗法,可克服BCMA下调并在高危多发性骨髓瘤模型中提高生存率 | 首次证明CD70在高危多发性骨髓瘤中高表达且与不良预后相关,并开发了包含CD27和IL-15的CAR-NK细胞疗法 | 临床前研究阶段,需通过临床试验进一步验证疗效和安全性 | 开发针对高危多发性骨髓瘤的新型免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞模型 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | CAR-NK细胞, CAR-T细胞 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-29 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2025-Oct-27, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析识别出糖尿病多发性神经病变的潜在药物靶点 | 首次将TNFRSF14确定为糖尿病多发性神经病变的潜在治疗靶点,并通过单细胞测序揭示其致病机制 | NA | 识别糖尿病多发性神经病变的新药靶点以提高治疗效果 | 糖尿病多发性神经病变患者及相关蛋白质 | 生物医学 | 糖尿病多发性神经病变 | 血浆蛋白质组学, 单细胞测序, 遗传分析 | NA | 蛋白质组数据, 遗传数据, 临床数据 | 大型前瞻性队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-29 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架,用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明具体限制 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞水平的剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-29 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,发现Hmox1可作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的潜在生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别脓毒症相关急性肾损伤的特异性生物标志物 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-29 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究探讨SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次揭示SPP1+巨噬细胞的极化改变通过JAK2/STAT3通路促进结直肠癌进展的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏临床样本验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞极化对结直肠癌进展的影响及其分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠结直肠癌模型 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞分选、CCK-8检测、TUNEL染色、Western blot、免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-29 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Oct-27, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
|
研究论文 | 开发了CytoTRACE 2深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架,在多种平台和组织中优于先前方法,能够详细绘制单细胞分化图谱 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能,即细胞分化为其他细胞类型的能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-29 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
|
研究论文 | 本研究通过多模态数据分析发现肿瘤内浆细胞可作为预测胃癌患者预后和新辅助免疫治疗反应性的生物标志物 | 建立了基于MZB1阳性评分(MPS)的新型mTLS标志物分类策略,首次揭示mTLS是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点 | 胃镜活检组织样本大小存在固有局限性,需要进一步验证 | 开发能够准确预测胃癌免疫治疗个体反应性的生物标志物 | 晚期胃癌患者组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-29 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
|
研究论文 | 本研究揭示了KIAA1429通过m6A甲基化调控Lrp4 mRNA稳定性抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的新机制 | 首次发现KIAA1429通过m6A修饰稳定Lrp4 mRNA并抑制NF-κB信号通路来抑制破骨细胞分化的新机制 | NA | 探究KIAA1429在骨质疏松和破骨细胞分化中的生物学功能及潜在机制 | 骨质疏松患者样本和卵巢切除小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-29 |
MX1 is a novel crucial prognostic and therapeutic target inducing chemoresistance in right-sided colon cancer: insights from machine learning-based multi-omics analysis
2025-Oct-27, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00840-8
PMID:41146251
|
研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析,发现MX1是右侧结肠癌化疗耐药和预后的关键新型标志物 | 首次将MX1鉴定为右侧结肠癌的关键预后和治疗靶点,揭示了其通过VEGFA-VEGFR2通路促进血管生成和化疗耐药的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞系,缺乏体内动物模型验证 | 识别和表征与右侧结肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 右侧结肠癌患者和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 机器学习算法, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化, CCK-8, transwell迁移实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床样本数据 | TCGA数据集和四个GEO数据集,加上临床样本和两种CRC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-29 |
Integrative metaprogram analysis reveals transcriptional dysregulation of oxidative stress response in granulosa cells from polycystic ovary syndrome
2025-Oct-27, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01811-2
PMID:41146316
|
研究论文 | 通过整合元程序分析揭示多囊卵巢综合征颗粒细胞中氧化应激反应的转录失调 | 采用整合性元程序分析框架,结合单细胞和bulk RNA测序方法,首次系统识别颗粒细胞中的转录程序并发现GPX3作为连接氧化应激与代谢功能障碍的关键调控基因 | 研究依赖于公共数据集和实验室生成数据的整合,样本来源可能存在异质性 | 探究多囊卵巢综合征的分子机制,特别关注氧化应激相关通路 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列, 非负矩阵分解, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析 | NA | RNA测序数据, 微阵列数据 | 包含GSE240688单细胞数据集、实验室bulk RNA-seq数据集和GSE34526验证微阵列数据集,以及193个GTEx卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-29 |
CSF1R and macrophage infiltration: Integrated magnetic resonance imaging radiomics and deep learning-driven models for the preoperative assessment of glioma
2025-Oct-27, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003827
PMID:41146428
|
研究论文 | 本研究开发了基于磁共振影像组学和深度学习的CSF1R预测模型,用于术前评估胶质瘤 | 首次整合传统影像组学特征和深度学习特征构建CSF1R预测模型,并系统验证其与巨噬细胞浸润的关联 | 样本量相对有限,特别是单细胞测序样本较少(n=2),需要更大规模验证 | 开发非侵入性术前预测胶质瘤CSF1R水平的影像学方法 | 胶质瘤患者 | 医学影像分析 | 胶质瘤 | 磁共振成像、影像组学、深度学习、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 支持向量机、随机森林、朴素贝叶斯等12种机器学习分类器 | 磁共振图像、基因表达数据、免疫组化数据、单细胞测序数据 | 477例患者(训练集64例,内部测试38例,外部验证101例,生存分析255例,免疫组化16例,单细胞测序2例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-29 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2025-Oct-27, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
|
研究论文 | 开发了能够可靠代表肿瘤中观察到的癌症相关成纤维细胞表型的共培养模型,并利用单细胞转录组学分析CAF亚型异质性 | 建立了能够模拟肿瘤微环境中CAF表型的可转化共培养模型系统,并首次系统评估了CRISPR扰动对不同CAF亚型的特异性影响 | 研究主要基于胰腺癌患者的CAF细胞系,模型系统的可转化性仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚型异质性及其对CRISPR扰动的特异性响应 | 胰腺癌患者来源的原代CAF和永生化肿瘤细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | 共培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | 胰腺癌患者来源的CAF细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2025-10-29 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Oct-25, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf248
PMID:41137658
|
研究论文 | 开发了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调节 | 首次将人血浆样培养基与稳定同位素示踪技术结合,在体外模型中保留了肿瘤微环境的完整性 | 体外模型仍无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫系统的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪, 空间转录组学 | 体外培养模型 | 代谢组数据, 转录组数据 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-29 |
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Oct-25, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyaf362
PMID:41138165
|
研究论文 | 评估ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤中的临床活性和转化研究 | 首次在临床研究中验证IDH1抑制剂联合PD-1抗体在mIDH1实体瘤中的免疫调节作用 | 样本量较小(n=15),临床获益有限 | 评估ivosidenib联合nivolumab在mIDH1晚期实体瘤中的初步疗效和安全性 | 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 药效学、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 临床数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 15例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-29 |
Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model
2025-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
PMID:41139200
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据,揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值,并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-29 |
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Oct-25, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
PMID:41145025
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在严重牙周病中的调控机制,重点关注NF-κB信号通路的作用 | 发现NF-κB信号通路在牙周病中性粒细胞异常功能中的关键调控作用,并证实其抑制剂可降低炎症因子表达 | NA | 探索严重牙周病中中性粒细胞的调控机制 | 牙周病中的中性粒细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA转录组分析, 实时PCR, 免疫共染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-10-29 |
Mapping Satellite Glial Cell Heterogeneity Reveals Distinct Spatial Organization and Implies Functional Diversity in the Dorsal Root Ganglion
2025-Oct-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511569
PMID:41134052
|
研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性,并揭示了四种不同亚型的空间分布和功能多样性 | 首次在背根神经节中原位表征卫星胶质细胞异质性,识别并验证了四种功能不同的SGC亚型及其空间分布 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能多样性 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,原位杂交,先进成像技术 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2025-10-29 |
ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer
2025-Oct-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
PMID:41136949
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达,与DNA损伤反应和免疫调节相关,是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因,鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员,并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用,特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本,包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序,Western blotting,集落形成实验 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,临床数据 | 超过10,000个样本,涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-29 |
Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes
2025-Oct-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
PMID:41137173
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者,揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究,开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限,仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-29 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育转变及与宿主细胞的相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术,系统解析疟原虫-按蚊相互作用网络,发现疟原虫偏好与中肠祖细胞互作的关键现象 | 部分发育阶段的生物学过程仍难以完全解析,需进一步验证 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育转变机制及宿主-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞,包含野外来源寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |