单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32188 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-11-05 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在糖尿病研究中的最新应用趋势，特别是在人类胰岛单细胞和免疫细胞表征方面的突破 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的应用现状和发展趋势 | 糖尿病相关的分子通路、人类胰岛细胞和免疫细胞 | 自然语言处理 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-11-05 |
Comprehensive single-cell analysis reveals mast cells' roles in cancer immunity
2025-Nov, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03590-y
PMID:41073552
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对癌症免疫的影响 | 首次在15种实体瘤中系统鉴定出10种肥大细胞状态，发现具有抗原呈递功能的C7-HLA-DR簇可增强免疫治疗效果 | 研究样本量相对有限（264名患者），未涉及所有癌症类型 | 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对免疫治疗的影响 | 15种实体瘤中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 264名患者的385个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-11-05 |
Vemurafenib Activates PSMB9 to Induce Ferroptosis via Free Iron Accumulation and Inhibits Melanoma Progression
2025-Nov, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70577
PMID:41183120
|
研究论文 | 本研究揭示了威罗菲尼通过激活PSMB9诱导铁死亡并抑制黑色素瘤进展的新机制 | 首次发现威罗菲尼通过靶向PSMB9调节游离铁水平诱导铁死亡的抗黑色素瘤机制 | NA | 探索威罗菲尼在黑色素瘤治疗中的作用机制 | 黑色素瘤细胞 | 生物医学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学分析,网络药理学,功能实验 | NA | 转录组数据,实验数据 | TCGA数据库数据及体外实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-11-05 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Nov-01, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用和分子机制 | 首次结合遗传学证据和网络毒理学方法，提出MEP通过非雌激素受体依赖机制促进乳腺癌发生的新假说 | 研究主要基于遗传关联和计算预测，需要后续实验验证 | 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用和分子机制 | 乳腺癌患者和甲基对羟基苯甲酸酯暴露人群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 转录组分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组, 分子对接 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 尿液MEP硫酸盐数据n=8285, FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 145 | 2025-11-05 |
Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications
2025-Nov-01, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946
PMID:41183744
|
综述 | 本文系统回顾了胰腺导管腺癌的分子、代谢和组织学亚型分类方法及其临床意义 | 整合单细胞转录组学、空间转录组学和深度学习技术，揭示PDAC肿瘤异质性和亚型可塑性 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证 | 建立胰腺导管腺癌的多层次亚型分类体系以指导精准医疗 | 胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-11-05 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
|
研究论文 | 通过重新分析Slide-tags数据发现隐藏的细胞-磁珠网络，实现无需参考的空间重建 | 发现Slide-tags数据中意外形成的空间信息细胞-磁珠网络，将其重新定义为基于网络的测序成像方法 | NA | 开发无需预索引阵列的空间组织重建方法 | Slide-tags空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 网络优化模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码磁珠阵列的空间条形码标记技术 |
| 147 | 2025-11-05 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
|
研究论文 | 本研究探讨小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在淀粉样蛋白小鼠脑中招募CD8+ T细胞的作用 | 首次揭示在APP/PS1小鼠模型中，小胶质细胞通过CXCL16-CXCR6轴参与CD8+ T细胞脑部招募的机制，并发现PLX5622敏感的小胶质细胞在此过程中并非必需 | 研究主要基于小鼠模型，未来需要体内分析进一步解析CD8+ T细胞招募机制 | 阐明阿尔茨海默病中CD8+ T细胞脑部招募的分子机制 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠的脑组织及细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，体外细胞实验 | NA | 基因表达数据，细胞计数数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集，永生化和原代小鼠细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-11-05 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，未涵盖更长期的适应过程 | 探究橡胶树对水分胁迫的分子适应机制，为提升其抗旱性提供理论基础 | 橡胶树幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | 非疾病研究（植物胁迫响应） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 149 | 2025-11-05 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
|
研究论文 | 本研究全面分析了33种癌症类型中镁稳态的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的意义 | 首次在泛癌水平系统研究镁稳态，结合批量组学分析和单细胞测序验证，提出镁稳态评分作为预后生物标志物 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在多种癌症类型中的作用机制 | 33种癌症类型的肿瘤样本和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 批量组学分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量组学分析 | NA | NA |
| 150 | 2025-11-05 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
|
综述 | 本文全面回顾了空间转录组学反卷积的二十种计算方法，分析其方法论基础和技术特点 | 首次系统对比分析二十种空间转录组反卷积算法的方法论基础、计算原理和处理范式 | NA | 为研究人员提供空间转录组反卷积计算方法的全面理解和实践指导 | 空间转录组反卷积计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-11-05 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
|
研究论文 | 通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，识别出UBE2H作为结直肠癌奥沙利铂耐药性的生物标志物 | 首次通过多组学整合分析揭示UBE2H与奥沙利铂耐药性的关联，并发现其与免疫耗竭和增殖性未分化细胞的联系 | 研究主要基于细胞系和公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 识别结直肠癌奥沙利铂耐药性的预测生物标志物 | 结直肠癌细胞系和公共数据库中的结直肠癌样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据集和五个GEO数据集中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 152 | 2025-11-05 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
|
研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 采用VampPrior和循环一致性约束，解决了现有方法在整合跨系统数据集时过度去除生物信号的问题 | NA | 开发能够有效整合跨系统单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2025-11-05 |
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Oct-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116498
PMID:41171758
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼NPS突变细胞在野生型胚胎中的命运，揭示了NPS在发育重编程和分化中的关键作用 | 发现部分细胞能够绕过短暂全能性阶段直接获得中间发育状态，揭示了NPS在协调核质重编程中的新机制 | 研究仅限于斑马鱼胚胎模型，未在其他物种中验证 | 探究NPS因子在发育重编程和细胞分化过程中的功能 | 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2025-11-05 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Oct-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示健康成年人年龄相关的免疫动态变化 | 首次在300多名健康成年人中建立单细胞RNA测序数据集，揭示T细胞亚群中稳健的非线性转录重编程现象 | 样本主要来自健康成年人，未涵盖疾病状态或更广泛的年龄范围 | 理解年龄对免疫系统动态变化的影响 | 300多名25至90岁健康成年人的外周免疫细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据,流式细胞数据 | 300多名健康成年人，其中96人进行为期2年的纵向追踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-11-05 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞选择性丢失和GZMK⁺CD8⁺ T细胞的作用机制 | 首次发现PRR4⁺CST3⁺WFDC2⁻浆黏液腺泡细胞在干燥综合征中的选择性丢失，并揭示了GZMK⁺CD8⁺ T细胞通过亚细胞溶解效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号的新途径 | 研究样本仅限于人类小唾液腺，需要进一步验证在其他外分泌腺中的普遍性 | 探索干燥综合征中不同细胞类型的复杂相互作用及其在疾病病理中的作用 | 人类小唾液腺组织、患者来源的原代上皮细胞和自体T细胞 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞转录组学、空间转录组学、空间免疫表型分析、体外细胞实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间定位数据 | 人类小唾液腺样本（包括非干燥综合征和干燥综合征患者） | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 156 | 2025-11-05 |
Integrating bulk and single-cell transcriptome to identify novel gene markers for germinal center B cells (GCB) subtype of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Oct-22, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06517-5
PMID:41120675
|
研究论文 | 本研究开发了一个包含19个基因对的定性特征(19-GPS)，用于区分弥漫性大B细胞淋巴瘤的GCB亚型与非GCB亚型 | 基于基因相对表达顺序(REO)开发稳定的定性特征，克服批次效应和样本质量变异的影响 | NA | 识别GCB亚型DLBCL的新型基因标志物 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(GCB亚型) | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 四个独立数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-11-05 |
egal-1 and microtubules promote regeneration polarity in planarians
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204668
PMID:41099308
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了涡虫头部与尾部再生极性决定的新机制 | 首次发现Egal-1和微管系统共同调控涡虫纵向肌肉纤维中notum基因的不对称表达，从而决定再生极性 | 对纵向肌肉纤维内具体分子机制的理解仍不完整 | 探究涡虫头部与尾部再生极性决定的分子机制 | 涡虫（planarians）及其纵向肌肉细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA干扰，药物处理 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-11-05 |
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119251
PMID:41110307
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 | 首次通过整合多组学数据构建环境-基因相互作用网络，识别出3个因果枢纽基因并与34种高风险污染物建立关联 | NA | 探究环境污染物暴露与膀胱癌发生之间的分子机制 | 膀胱癌相关分子机制和环境污染物 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个膀胱癌队列数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-11-05 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-Oct, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
|
研究论文 | 开发了专门用于植物单细胞水平lncRNA研究的综合数据库GreenCells | 首个专门针对植物lncRNA的单细胞分析数据库，填补了现有数据库主要关注蛋白质编码基因的空白 | NA | 研究植物长链非编码RNA在单细胞水平的表达和功能 | 8种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含2177个lncRNA标记基因和68,869个蛋白质编码标记基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-11-05 |
PMEPA1-Mediated Treg Cell Impairment Promotes Endometrial Stromal Invasion via Excessive PI3K/AKT Signaling in Endometriosis
2025-Oct, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-025-00125-0
PMID:41100035
|
研究论文 | 本研究揭示了PMEPA1通过过度激活PI3K/AKT信号通路损害调节性T细胞功能，从而促进子宫内膜异位症中子宫内膜基质细胞的侵袭能力 | 首次阐明PMEPA1在调节性T细胞中的具体作用机制及其通过PI3K/AKT信号通路影响子宫内膜异位症病理过程的分子机制 | 样本量较小（仅3例患者进行单细胞测序），需要更大规模研究验证 | 探究PMEPA1调控调节性T细胞功能及其在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的卵巢异位病灶和正常在位子宫内膜组织、外周血单核细胞来源的原代人调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 3例子宫内膜异位症患者的配对异位卵巢病灶和在位子宫内膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |