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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-04-15 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
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研究论文 | 本文探讨了实验和计算方法对单细胞RNA-seq数据中等位基因特异性表达分析的影响，并开发了一套单细胞ASE计算工具 | 开发了单细胞ASE计算工具，并展示了在单核RNA-Seq中从内含子区域提取更多ASE信息，以及如何通过读长和杂交选择提高检测能力 | NA | 研究实验和计算方法如何影响基于ASE的分析能力，并开发相关计算工具 | 单核RNA-Seq数据，特别是等位基因特异性表达分析 | 自然语言处理 | 帕金森病 | 单核RNA-Seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of unattributed expression patterns in spatial transcriptomics
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71720-5
PMID:41963343
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法，用于恢复空间转录组学中现有分析方法遗漏的未归属表达模式 | RESCUE方法能系统性恢复因细胞分割或细胞类型解卷积而丢失的分子表达，包括脆弱细胞类型、亚细胞结构和细胞外表达等来源 | NA | 开发一种计算工具以改善空间转录组数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组数据，特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据和其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 143 | 2026-04-15 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small-cell lung cancer
2026-Apr-10, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102741
PMID:41966692
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了联合小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境生态位 | 首次在治疗初期的cSCLC肿瘤中整合空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序，揭示了不同组织学成分的单克隆起源及与突变模式的关联，并开发了基于突变的cSCLC检测工具 | 研究样本量有限（仅19个肿瘤），且仅针对治疗初期患者，未涉及治疗后的动态变化 | 探究联合小细胞肺癌的生物学特性、谱系可塑性及肿瘤微环境，以改善诊断和治疗策略 | 19个治疗初期的联合小细胞肺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 19个治疗初期的cSCLC肿瘤 | NA | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2026-04-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-Apr-08, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
|
研究论文 | 提出了一种名为GatorST的新型空间转录组数据分析框架，通过结合图建模与元学习策略来生成具有空间信息的表示 | 首次将基于图的局部空间建模与全局基因表达聚类伪标签相结合，并采用元学习启发的训练策略，有效整合局部与全局空间信息 | 未明确说明框架对特定组织类型或数据质量的敏感性，也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够有效整合空间与转录组信息以提升下游分析性能的通用框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 元学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 145 | 2026-04-15 |
TriPDCL: A Tri-Pathway Prototype-Driven Contrastive Learning Framework for Cross-Modality Single-Cell Integration
2026-Apr-08, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c00436
PMID:41952315
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研究论文 | 本文提出了一种基于原型对比学习的三路径框架TriPDCL，用于解决跨模态单细胞数据整合中的异质性对齐和鲁棒学习挑战 | 通过迭代原型学习更新机制实现异质性信息的有效传递，并利用可学习的原型中心精确构建可靠的正负样本对 | 未在摘要中明确说明 | 解决跨模态单细胞数据整合中的技术批次效应和生物异质性差异问题 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 对比学习框架 | 单细胞多组学数据 | 五个数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 146 | 2026-04-15 |
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01251
PMID:41934404
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研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞测序分析的数据驱动仿生策略，通过顺序递送模拟免疫细胞的纳米颗粒来复制心肌梗死后内源性免疫修复机制 | 利用单细胞RNA测序揭示心肌梗死后免疫细胞动态变化，并据此设计模拟三种巨噬细胞亚型（M2a、M2b、M2c）时空分布的纳米颗粒顺序递送策略 | 未明确说明单细胞测序样本的具体数量、测序平台技术细节以及动物模型验证的局限性 | 开发模拟内源性免疫修复的纳米药物以促进心肌梗死恢复 | 心肌梗死后免疫细胞（特别是巨噬细胞亚型）的动态变化及仿生纳米颗粒 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-04-15 |
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03029-6
PMID:41845065
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于大语言模型的AI代理CellVoyager，它能在Jupyter笔记本环境中自主生成并执行单细胞RNA测序分析 | CellVoyager通过自主分析生物数据，在COVID-19、细胞间通讯和衰老等案例中生成新颖发现，其创意性和科学可靠性获得专家认可 | NA | 开发一个AI代理以自主分析单细胞RNA测序数据，加速计算生物学研究并发现潜在新见解 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | 76项已发表单细胞RNA测序研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-04-15 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征，揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 | 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征，识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 | 研究样本量可能有限，且仅聚焦于早期阶段，未涵盖疾病进展或治疗响应 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变，以改善诊断和治疗 | 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-04-15 |
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151642
PMID:41921794
|
研究论文 | 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白，从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 | 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制，并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床样本中得到验证 | 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 | 心肌细胞、小鼠心脏组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2026-04-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌（MRLC）中的衰老相关基因，并进行了功能验证 | 结合全球疾病负担数据库、孟德尔随机化、多机器学习方法和单细胞RNA测序，首次系统筛选并验证了MRLC中的核心衰老相关基因及其潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型，缺乏临床样本的直接验证 | 探索衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌（MRLC）患者数据及C57BL/6小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、多机器学习方法、分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型）、动物模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、疾病负担数据 | 未明确指定人类样本数量，使用C57BL/6小鼠建立MRLC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-04-15 |
Score Matching for Differential Abundance Testing of Compositional High-Throughput Sequencing Data
2026-Apr, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70534
PMID:41944570
|
研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型，用于处理具有协变量信息的稀疏组成数据，并开发了cosmoDA方法以降低相关特征在差异丰度测试中的假阳性率 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，结合惩罚广义得分匹配开发了cosmoDA方法，能有效估计特征交互并减少相关特征导致的假阳性发现 | 未明确说明模型在极端稀疏数据或大规模数据集上的计算效率限制 | 开发一种针对组成型高通量测序数据的差异丰度测试方法，以准确表征异质群体中的协变量依赖关系 | 单细胞RNA测序数据和微生物扩增子数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | a-b幂交互模型 | 组成型测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微生物扩增子测序 | NA | NA |
| 152 | 2026-04-15 |
Integrated bulk RNA-seq and scRNA-seq identification of a novel "PET-SPI1-MYL9" transcriptional axis in lung adenocarcinoma driven by polyethylene terephthalate exposure
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1-2630
PMID:41969450
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，结合机器学习算法，揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯（PET）暴露通过调控SPI1-MYL9转录轴促进肺腺癌（LUAD）发展的潜在致癌机制 | 首次提出并验证了“PET-SPI1-MYL9”这一新型转录轴，揭示了PET作为一种非基因毒性致癌物的潜在分子通路，为理解空气微塑料在肺腺癌中的作用提供了新框架 | 研究主要基于计算生物学证据，缺乏湿实验验证PET与SPI1的结合及转录抑制机制，需要进一步的实验验证 | 探索PET暴露在肺腺癌中的潜在致癌分子机制 | 肺腺癌（LUAD）及相关基因（如MYL9、SPI1） | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、bulk RNA测序、分子对接、生存分析、多组学数据分析 | 机器学习算法（包括CART、Naïve Bayes、随机森林、支持向量机） | 基因表达数据（RNA-seq）、蛋白质数据库信息、临床生存数据 | 涉及多个独立LUAD数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-04-15 |
CEP170 as a novel molecular link between centrosomal function and cerebral cortical development
2026-Mar-26, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-026-01236-z
PMID:41888776
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研究论文 | 本研究揭示了CEP170作为中心体功能与大脑皮层发育之间的关键分子连接，通过调控神经祖细胞增殖和神经元迁移影响皮层结构 | 首次将CEP170蛋白与大脑皮层发育直接关联，并阐明其通过中心体-微管相互作用调控神经发育的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类大脑发育中的直接证据仍需进一步验证 | 探究CEP170在皮层发育中的功能及其分子机制 | 小鼠胚胎皮层、人类发育中皮层、CEP170基因敲除细胞 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | Western blotting, qPCR, scRNA-seq, 空间转录组学, 子宫内电穿孔, CRISPR/Cas9基因编辑, 流式细胞术, 微管再生实验, 免疫荧光显微镜, 共免疫沉淀 | 基因敲低/敲除模型 | 蛋白质表达数据, 转录组数据, 图像数据 | 未明确具体样本数量，涉及小鼠胚胎皮层组织、人类皮层样本及基因编辑细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-04-15 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomics reveals STAB1 as a novel therapeutic target for ovarian cancer
2026-Mar-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102738
PMID:41865597
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学，结合机器学习算法，识别出STAB1作为卵巢癌的新型治疗靶点 | 采用集成机器学习算法与高分辨率单细胞转录组学相结合的策略，重新定义了STAB1在卵巢癌生态系统中的细胞定位，并验证了其作为“双重检查点”分子的功能 | NA | 解析卵巢癌的免疫抑制肿瘤微环境和内在异质性，以识别稳健的治疗靶点 | 卵巢癌（OC） | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学，批量转录组学 | LASSO, SVM-RFE | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-04-15 |
MeNADP-ME3 Confers Salt and Drought Tolerance in Arabidopsis and Drives Functional Diversification of the NADP-ME Family in Cassava
2026-Mar-20, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48030331
PMID:41899482
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研究论文 | 本研究通过鉴定木薯中的MeNADP-ME基因家族，揭示了其在C3-C4中间型植物中的进化轨迹和功能，特别是MeNADP-ME3在增强抗氧化酶活性和减少氧化损伤方面的作用，为开发抗逆木薯品种提供了遗传资源 | 首次在C3-C4中间型植物木薯中系统研究NADP-ME基因家族，结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析基因表达模式，并验证MeNADP-ME3在盐和干旱胁迫下的功能，揭示了其在光合碳代谢和光呼吸调控中的潜在作用 | 研究主要基于基因表达和功能验证，缺乏对MeNADP-ME3具体分子机制的深入探讨，且样本规模有限，未来需扩大实验验证范围 | 探究木薯中NADP-ME基因家族的进化、表达模式及其在环境适应和胁迫响应中的功能，以开发抗逆木薯品种 | 木薯（Manihot esculenta Crantz）中的MeNADP-ME基因家族，特别是MeNADP-ME3基因 | 植物分子生物学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 共聚焦成像, 蛋白质-蛋白质相互作用预测 | NA | 基因序列数据, 表达谱数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及木薯不同组织和细胞亚群的分析 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-04-15 |
Establishing Area-Specific Brain Organoids Through Transcription Factor-Mediated Patterning
2026-Mar-19, Biology
DOI:10.3390/biology15060488
PMID:41892247
|
研究论文 | 本研究通过转录因子介导的模式化方法，建立了一个具有特定区域特性的大脑类器官平台 | 通过重新分析体内人类皮层转录组数据集，识别出调控区域特异性的候选转录因子，并利用其可诱导过表达，在人类大脑类器官生成过程中实现了对前部和后部皮层特性的可控模拟 | 当前的人类大脑类器官模型仍不完全重现皮层区域多样性，且研究依赖于特定转录因子的过表达，可能无法完全模拟体内复杂的调控网络 | 研究人类大脑皮层区域特异性分化的机制，并建立一个可扩展、可重复的平台来研究人类皮层区域化及神经发育和神经系统疾病的区域特异性机制 | 人类大脑类器官 | 发育生物学与神经科学 | 神经发育障碍与神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、钙成像 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-04-15 |
The Structure, Classification, Functional Diversity and Regulatory Mechanism of Plant C2H2 Transcription Factors
2026-Mar-14, Biology
DOI:10.3390/biology15060471
PMID:41892231
|
综述 | 本文全面综述了植物C2H2型锌指转录因子的结构、分类、功能多样性及其调控机制 | 整合了从低等植物到被子植物的进化动态分析，并详细阐述了C2H2转录因子在花器官形态发生、花粉育性维持、开花时间调控以及生物与非生物胁迫响应中的分子网络 | 当前研究存在功能冗余、假基因化现象以及细胞类型特异性调控等方面的知识空白 | 深入理解植物C2H2转录因子家族的调控网络及相关功能，为作物抗逆育种和品质改良提供参考 | 植物C2H2型锌指转录因子家族 | 生物信息学 | NA | 生物信息学分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序，多组学整合 | NA | NA |
| 158 | 2026-04-15 |
Construction of a SEMA3 family-based model to predict prognosis and molecular subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04808-5
PMID:41792569
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研究论文 | 本研究基于SEMA3基因家族构建了一个预测胰腺导管腺癌预后和分子亚型的模型 | 首次整合多组学数据对SEMA3基因家族在PDAC中进行系统分析，构建了九基因预后特征模型，并结合单细胞和空间转录组学揭示了SEMA3C在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证 | 探究SEMA3基因家族在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子亚型特征 | 胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 多组学数据分析，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Cox回归，LASSO回归 | 基因表达数据，突变数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO公共数据库的多队列胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 159 | 2026-04-15 |
Meningeal Lymphatics Drives Macrophage Clearance via CCL2-CCR2 Axis After Cerebral Ischemia
2026-Feb-28, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48030259
PMID:41899411
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研究论文 | 本研究揭示了脑缺血后脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2轴驱动巨噬细胞清除的新机制 | 首次发现脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2信号轴主动招募巨噬细胞进行缺血后血管周围清除，并提出了VEGF-C增强淋巴功能联合CCL2-CCR2轴调控的协同治疗新策略 | 研究基于小鼠大脑中动脉闭塞模型，临床转化需进一步验证；CCR2抑制剂的长期效应和安全性未评估 | 阐明脑卒中后脑膜淋巴管介导免疫细胞清除的分子机制 | 脑缺血小鼠模型的脑膜巨噬细胞和淋巴管内皮细胞 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，体外共培养，免疫荧光染色，Evans Blue示踪 | 小鼠大脑中动脉闭塞模型 | 单细胞转录组数据，影像数据，行为学数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-04-15 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.702982
PMID:41684943
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了联合小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境特征 | 首次在cSCLC中整合空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序，揭示了肿瘤的单克隆起源、空间异质性及微环境相互作用，并开发了基于突变的诊断工具cSCLC Detector | 样本量相对较小（19例），且仅针对初治肿瘤，未涉及治疗后的动态变化 | 探究联合小细胞肺癌的分子生物学特征、谱系可塑性及肿瘤微环境 | 19例初治联合小细胞肺癌肿瘤样本，涵盖所有主要组织学亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 19例肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |