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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-11-01 |
Advances in Epigenomic Sequencing and Their Applications in Cancer Diagnostics
2025-Oct-27, Precision chemistry
DOI:10.1021/prechem.5c00014
PMID:41170156
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综述 | 概述表观基因组测序技术进展及其在癌症诊断中的应用 | 系统整合了单细胞测序与空间工具在癌症诊断中的多组学技术融合应用 | 讨论了当前技术向常规临床诊断转化面临的挑战和限制 | 推动表观基因组测序技术在精准医学中的发展和临床应用 | 癌症表观基因组特征(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性) | 生物医学 | 癌症 | 表观基因组测序、单细胞测序、空间转录组学、多组学技术 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、bulk测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-11-01 |
Qingre huazhuo tang regulates IgA nephropathy through immune checkpoints and ferroptosis
2025-Oct, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2024.11.005
PMID:41169938
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞测序和实验验证,探讨清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡途径调节IgA肾病的机制 | 首次将网络药理学、单细胞测序与实验验证相结合,系统阐明清热化浊汤治疗IgA肾病的新机制——通过免疫检查点和铁死亡途径发挥作用 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步深入验证 | 验证清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | IgA肾病患者的足细胞 | 网络药理学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 实验验证 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-11-01 |
Kell and Kx blood group systems: an update
2025-Sep-01, Immunohematology
|
综述 | 更新自2015年以来Kell和Kx血型系统的最新研究进展,包括新发现的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性的关系 | 首次报道婴儿McLeod综合征诊断,发现大量新抗原和等位基因(截至2025年Kell系统已有38种抗原),强调分子诊断在解决血清学模糊性和神经退行性疾病诊断中的作用 | NA | 总结Kell和Kx血型系统的最新研究进展和临床应用 | Kell和Kx血型系统的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性和疾病的关系 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞测序、多组学分析、基因编辑、细胞治疗 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 144 | 2025-11-01 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveals ACACA as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker across cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599223
PMID:41169354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,揭示ACACA作为跨癌种潜在预后和免疫治疗生物标志物 | 首次在多癌种水平系统研究ACACA的转录组、蛋白质组和免疫学特征,并通过单细胞测序解析其在肿瘤微环境中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于肺癌和肉瘤细胞系 | 探索ACACA在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力 | 多种癌症类型(重点关注肺癌和肉瘤) | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,临床数据 | 来自TCGA、CPTAC、HPA和GEO数据库的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-11-01 |
ADAM8 in macrophages exacerbates sepsis-induced cardiomyopathy by impeding efferocytosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654688
PMID:41169382
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研究论文 | 本研究揭示了ADAM8在巨噬细胞中通过阻碍胞葬作用加剧脓毒症诱发的心肌病 | 首次发现ADAM8在脓毒症心肌病心脏巨噬细胞中显著上调,并阐明其通过调控MerTK/sMer通路影响巨噬细胞胞葬功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究ADAM8在脓毒症诱发心肌病中的具体作用机制 | 小鼠脓毒症模型(LPS诱导和CLP模型)、巨噬细胞特异性ADAM8敲除小鼠、RAW264.7细胞系 | 分子病理学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞转录组测序, RNA转录组测序, 免疫荧光, 慢病毒敲低 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞图像 | 未明确样本数量,使用多种小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-11-01 |
Multi-omics analysis and evidence of IL1R1 as a potential biomarker for diabetes-associated intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1692185
PMID:41169383
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定IL1R1作为糖尿病相关椎间盘退变的潜在生物标志物 | 首次通过整合生物信息学和单细胞测序揭示IL1R1在糖尿病相关椎间盘退变中的关键作用,并构建了诊断模型和调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索2型糖尿病与椎间盘退变之间的共享分子机制 | 人类T2DM和IDD转录组数据集、糖尿病小鼠髓核组织 | 生物信息学 | 糖尿病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习 | LASSO,随机森林,人工神经网络 | 基因表达数据,单细胞数据 | 人类转录组数据集和糖尿病小鼠髓核组织 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-11-01 |
Comprehensive analyses of single-cell and bulk RNA-seq reveal the biological and prognostic roles of BMP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686938
PMID:41169612
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq分析揭示BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和预后作用 | 首次系统分析BMP4在胰腺癌中的表达模式、预后价值及其在肿瘤代谢中的非经典信号通路作用 | BMP4对免疫细胞浸润的影响有限,其预后作用主要独立于免疫调节机制 | 探讨BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和临床预后价值 | 胰腺腺癌患者样本和正常胰腺组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 列线图预测模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-11-01 |
Deconvolution and phylogeny inference of diverse variant types integrating bulk DNA-seq with single-cell RNA-seq
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf234
PMID:41169710
|
研究论文 | 提出TUSV-int框架,整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据进行克隆谱系树重建 | 首次将bulk DNA-seq与scRNA-seq整合到统一的去卷积和系统发育推断框架中,同时支持SNV、CNA和SV多种变异类型 | scDNA-seq数据成本高且技术挑战大,限制了在大规模队列中的常规应用 | 改进癌症克隆谱系树重建,解决结构变异和局部拷贝数变异检测难题 | 癌症基因组变异,包括单核苷酸变异、拷贝数改变和结构变异 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 整数线性规划(ILP) | 系统发育推断模型 | DNA测序数据,RNA测序数据 | 已发表的乳腺癌数据集 | NA | bulk DNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-11-01 |
Opportunities and challenges in the application of spatiotemporal transcriptomics in plant research
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1684057
PMID:41169728
|
综述 | 探讨时空转录组学技术在植物研究中的应用机遇与挑战 | 系统阐述将空间转录组学这一前沿技术应用于植物研究领域的创新价值 | NA | 分析空间转录组学在植物研究中的技术优势与发展前景 | 植物组织与细胞 | 空间转录组学 | NA | 高通量转录组学, 高分辨率组织成像 | NA | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 150 | 2025-11-01 |
Research advances of the establishment and characterization of Helicobacter pylori infection animal models
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1683366
PMID:41170432
|
综述 | 本文综述了幽门螺杆菌感染动物模型的建立与表征方法研究进展 | 系统整合了动物模型建立的关键要素,并探讨了空间转录组学在该领域的潜在应用 | 未开展原始实验研究,主要基于现有文献进行总结分析 | 为建立稳定可重复的幽门螺杆菌感染动物模型提供实践参考 | 幽门螺杆菌感染动物模型 | 病理学 | 幽门螺杆菌感染相关疾病 | 空间转录组学, 侵入性和非侵入性检测技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-31 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际包含四个不同细胞谱系,并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞(tDC)这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型,人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞(包括树突状细胞和巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序,谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2025-10-31 |
Pan-cancer neural regulation pattern with implications for patient stratification and immunotherapy
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102732
PMID:41147013
|
研究论文 | 通过整合多组学数据系统描绘了泛癌神经调控模式及其对患者分层和免疫治疗的临床意义 | 首次系统性描绘泛癌神经-肿瘤相互作用全景图,发现神经信号与临床特征的相关性并构建神经癌症亚型分类 | 基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证神经调控机制 | 探究神经系统与癌症相互作用的调控模式及其在免疫治疗中的临床应用价值 | 10,000+ TCGA批量转录组、239个泛癌空间转录组、115个批量检查点抑制剂治疗转录组和120,000+单细胞转录组 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | 配体-受体相互作用网络分析 | 转录组数据, 空间转录组数据 | >10,000 TCGA样本 + 239空间样本 + 115治疗样本 + >120,000单细胞 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-31 |
Single-Cell RNA-Seq Revealed the Immune Microenvironment Reprogramming by Dexmedetomidine Treatment in Ischemic Stroke
2025-Dec, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05237-1
PMID:40751033
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了右美托咪定通过HK2介导的小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态,从而在缺血性脑卒中发挥神经保护作用的机制 | 首次采用多组学方法系统阐明右美托咪定通过HK2调控小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态的神经保护机制 | 研究主要基于小鼠MCAO模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究右美托咪定在缺血性脑卒中中的神经保护作用机制 | 大脑中动脉闭塞模型小鼠和小胶质细胞 | 单细胞组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | MCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-31 |
Beyond gut and neural mechanisms: A multi-organ system perspective on insecticide resistance
2025-Dec, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106701
PMID:41162084
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综述 | 本文从多器官系统视角探讨杀虫剂抗性的形成机制,突破传统孤立研究的局限 | 提出将杀虫剂抗性视为多器官协同作用的系统现象,强调器官间信号传导和补偿机制的重要性 | 在解析器官间通讯、识别组织特异性抗性标记物及开发现场诊断方法方面仍存在挑战 | 探索多器官系统在塑造杀虫剂抗性中的作用机制 | 昆虫的脂肪体代谢、循环运输、跨代效应、呼吸调节、马氏管排泄和内分泌调节等生理系统 | 系统生物学 | NA | 多组学技术、单细胞RNA测序、先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-31 |
Caloric Restriction Substantially Improves Glucose Regulation in Mice With Hnf1a-Deficient Beta-Cells
2025-Dec, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70121
PMID:41165340
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研究论文 | 本研究探讨饮食对HNF1A突变胰岛β细胞的影响,发现热量限制显著改善Hnf1a缺陷β细胞的血糖调节 | 首次系统研究饮食因素对HNF1A-MODY疾病发生发展的影响,揭示了Hnf1a缺陷β细胞对饮食线索的高度敏感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅使用体外干细胞胰岛,样本规模有限 | 探索环境因素(特别是饮食)对HNF1A-MODY发病和进展的影响机制 | 转基因小鼠(Hnf1a突变β细胞)和人类干细胞胰岛(HNF1AP291fsinsC杂合突变) | 代谢疾病研究 | 单基因糖尿病(HNF1A-MODY) | 免疫荧光、蛋白质组学、bulk转录组学、单细胞转录组学 | 转基因小鼠模型、干细胞胰岛模型 | 生理测试数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 转基因小鼠暴露于四种不同饮食方案,人类干细胞胰岛及其同基因对照 | NA | 单细胞转录组学, bulk转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-31 |
Eupatilin ameliorates spinal cord injury by inhibiting damage-associated microglia and optimizing the regenerative microenvironment
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113687
PMID:41146716
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现损伤相关小胶质细胞在急性脊髓损伤中的关键作用,并证实黄岑素能促进其向稳态小胶质细胞转化 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据识别急性脊髓损伤特异性损伤相关小胶质细胞亚群,并发现黄岑素促进其向有益表型转化的新功能 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,尚未在更大型动物或临床样本中验证 | 探索脊髓损伤中小胶质细胞的动态变化及黄岑素的治疗机制 | C57BL/6小鼠脊髓挫伤模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-10-31 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习技术,开发了一个多模态框架来预测非小细胞肺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习相结合,通过堆叠集成学习方法识别树突状细胞亚型与免疫治疗应答的关联 | 样本量相对有限,需要在更大规模队列中验证模型的泛化能力 | 预测非小细胞肺癌患者对PD-1抑制剂免疫治疗的应答 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和影像数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 影像组学, 深度学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习 | 转录组数据, 临床数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Nov-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统阐明开心散通过抑制前驱活性、恢复星形胶质细胞线粒体代谢和重塑神经-星形胶质细胞相互作用网络来增强突触可塑性的抗抑郁机制 | 研究仅针对大鼠下丘脑区域,未涉及其他脑区;样本数量相对有限 | 探究开心散改善抑郁症状的分子机制 | 慢性不可预见轻度应激诱导的抑郁模型大鼠 | 单细胞转录组学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,行为学实验,分子生物学实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | 45,482个下丘脑细胞,来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-31 |
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24342
PMID:40855979
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研究论文 | 本研究探讨新型脂肪因子CRISPLD2在调节脂肪组织纤维化和改善胰岛素敏感性方面的功能 | 首次发现CRISPLD2能够改变脂肪细胞大小并改善胰岛素敏感性,同时揭示其通过调节胶原转录和纤维化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床意义尚需进一步验证 | 探索CRISPLD2脂肪因子在脂肪组织结构和功能调节中的作用机制 | 脂肪特异性过表达CRISPLD2的小鼠模型和3T3-L1脂肪细胞 | 分子生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | 脂肪特异性CRISPLD2过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-10-31 |
Targeting MAT2A synergistically induces DNA damage in osteosarcoma cells through EZH2-mediated H3K27me3 modification
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.09.007
PMID:41146859
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研究论文 | 本研究通过靶向MAT2A与EZH2抑制联合治疗,协同诱导骨肉瘤细胞DNA损伤并抑制肿瘤生长 | 首次发现MAT2A抑制与EZH2抑制在骨肉瘤治疗中的协同作用机制,通过代谢与表观遗传双重干预策略 | NA | 探索代谢与表观遗传联合干预在骨肉瘤治疗中的潜在价值 | 骨肉瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,高通量化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |