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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-30 |
Resolving intra-tumor heterogeneity and clonal evolution of core-binding factor acute myeloid leukemia patients with single-cell resolution
2025-Oct-28, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00718-4
PMID:41152985
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量DNA测序数据解析核心结合因子急性髓系白血病的肿瘤内异质性和克隆演化 | 开发了将亚克隆体细胞拷贝数变异整合到系统发育树和克隆演化分析的方法,在单细胞水平证明融合基因是白血病发生的最早期事件 | 样本量有限(8例初诊患者和3例化疗后患者) | 解析肿瘤内异质性和克隆演化,识别化疗耐药机制 | 核心结合因子急性髓系白血病患者 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞DNA测序,批量DNA测序 | 系统发育树分析 | DNA测序数据 | 8例初诊患者和3例化疗后患者 | NA | 单细胞DNA测序,批量DNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-30 |
Panmim: a resource of pan-cancer metastasis immune microenvironment
2025-Oct-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06484-5
PMID:41152997
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研究论文 | 开发了一个名为Panmim的整合资源,用于研究转移性肿瘤的免疫微环境 | 构建了首个专注于癌症转移免疫微环境的综合数据库,整合了90个单细胞RNA-seq数据集 | 数据库资源仍需不断扩展和更新,当前仅包含特定类型和部位的转移癌数据 | 研究癌症转移过程中的免疫微环境特征和分子机制 | 转移性癌症的单细胞RNA-seq数据,涵盖14个转移部位和36种原发癌类型 | 生物信息学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 90个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-30 |
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Oct-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115743
PMID:41151481
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 | 首次发现TUBB2B+恶性细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活TNFRSF4+Treg细胞,进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸机制 | 研究样本主要来自特定地区人群,需要更多样本人群验证 | 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与免疫逃逸机制 | 鼻咽癌患者肿瘤微环境中的各类免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化数据 | 488,771个细胞来自82个样本,包含50个单细胞RNA测序样本和183例批量RNA测序患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-30 |
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Oct-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115730
PMID:41151484
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研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 | 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生,抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 | 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 支气管肺发育不良 | 宏基因组学, 16S rRNA测序, 非靶向代谢组学, RNA转录组学, 单细胞RNA测序 | 动物模型, 细胞模型 | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-30 |
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2025-Oct-27, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102573
PMID:41151488
|
研究论文 | 本研究建立了一种基于循环肿瘤细胞(CTC)衍生球体的药物筛选工作流程,用于乳腺癌个性化治疗 | 开发了整合CTC计数和CTC衍生球体药物筛选的临床可行工作流程,克服了组织依赖性类器官模型的局限性 | 样本量相对较小(34例患者),仅13例进行了CTC球体培养和药物筛选 | 建立临床可行的CTC衍生球体药物筛选平台,实现乳腺癌个性化治疗 | 34名新诊断乳腺癌患者,其中13名接受系统治疗和复发的患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控平台、CTC分离、球体培养、药物筛选、空间转录组学 | CTC衍生球体模型 | CTC计数、药物敏感性数据、基因突变谱、空间转录组数据 | 34名乳腺癌患者,其中13名进行了CTC球体培养和药物筛选 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium in situ | Xenium原位分析平台 |
| 146 | 2025-10-30 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Oct-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
|
研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调控肥胖相关性肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | NA | 实验数据 | C57BL/6J小鼠模型和两种人肾小管上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-30 |
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Oct-27, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.09.011
PMID:41151577
|
研究论文 | 本研究开发了一种人类心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用并实现心律失常疾病建模 | 首次创建了整合自体人多能干细胞来源胚胎单核细胞的心脏类器官,生成生理相关的心脏组织驻留巨噬细胞 | 该模型为体外研究平台,仍需进一步验证其在体内环境中的生理相关性 | 研究免疫-心脏相互作用机制及炎症驱动的心律失常疾病建模 | 人类心脏-巨噬细胞组装体模型 | 发育生物学、心脏疾病模型 | 心律失常、心房颤动 | 单细胞转录组学、活体成像、蛋白质组学 | 心脏-巨噬细胞组装体模型 | 基因表达数据、影像数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-30 |
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Oct-27, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.001
PMID:41151578
|
研究论文 | 开发了一种三维分化方法SphereDiff,用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞,并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 | 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDAPs;使用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式;应用跨移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 | 研究主要基于小鼠PD模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的生产效率和移植安全性 | 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、帕金森病模型小鼠 | 再生医学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学, 跨移植单细胞分裂条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 帕金森病模型小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-30 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2025-Oct-27, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
|
研究论文 | 提出一种名为ResidPCA的稳健方法,用于在单细胞测序数据中发现与疾病相关的细胞状态 | ResidPCA方法在检测跨多种细胞类型表达的状态时,比传统PCA准确度高四倍以上,比基于NMF的方法高三倍以上 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病相关细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | ResidPCA | 单细胞测序数据 | NA | NA | scRNA-seq, snATAC-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-30 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2025-Oct-27, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌发展过程中上皮细胞代谢通路失调和细胞通讯变化 | 首次在单细胞水平构建结直肠癌上皮细胞分化轨迹,揭示脂肪酸和胆汁酸代谢通路失调与乳酰化修饰在癌变过程中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大队列验证发现;机制研究主要基于计算推断,需要实验验证 | 探究结直肠癌发展过程中代谢通路重编程和细胞通讯变化机制 | 正常结肠组织、息肉组织和结直肠癌组织中的上皮细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析,细胞通讯分析,调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 包含正常、息肉和肿瘤结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2025-10-30 |
Matrix stiffness drives squamous cell carcinoma progression via a Piezo1-mediated mechanotransduction feedback loop
2025-Oct-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.041
PMID:41151627
|
研究论文 | 本研究揭示了基质硬度通过Piezo1介导的机械转导反馈环路驱动鳞状细胞癌进展的机制 | 首次发现Piezo1-RCC2-YAP轴将机械信号转化为促肿瘤信号,并形成自增强反馈环路 | 样本量相对有限,临床队列仅包含53例皮肤SCC患者 | 研究基质硬度如何通过Piezo1介导的机械转导驱动鳞状细胞癌进展及其临床意义 | 人类皮肤、口腔和肺鳞状细胞癌样本,SCC细胞系,异种移植模型 | 癌症生物学 | 鳞状细胞癌 | 原子力显微镜,空间转录组学,单细胞RNA测序 | 体外可调硬度凝胶模型,异种移植模型 | 组织样本,基因表达数据,临床数据 | 人类SCC样本(皮肤、口腔、肺),皮肤SCC临床队列53例 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-30 |
Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy
2025-Oct-25, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104747
PMID:41151220
|
研究论文 | 本研究探讨KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示CSP中蜕膜细胞KISS1表达下调及其通过PI3K/AKT信号通路影响细胞侵袭迁移的机制 | 样本量有限,未涉及其他潜在信号通路的研究 | 阐明KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠进展过程中对蜕膜细胞侵袭过程的作用 | 剖宫产瘢痕妊娠和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | 单细胞测序分析 | 剖宫产瘢痕妊娠 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, qRTPCR, Western blotting, RNA干扰, RNA-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | CSP和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2025-10-30 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Oct-24, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习,系统识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次整合多组学数据识别FGL1作为AS-CAD的新型生物标志物,并通过单细胞测序解析其细胞来源 | 样本量有限,需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后价值 | AS-CAD患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,机器学习,ELISA,免疫组化,Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,临床数据 | AS-CAD患者组织样本,独立临床队列,多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-30 |
Interrogation of the cellular hierarchies reveals neoplastic evolution and therapeutic vulnerability in craniopharyngioma
2025-Oct-24, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf249
PMID:41159376
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示颅咽管瘤的细胞层级结构和肿瘤演化过程 | 首次在单细胞和空间水平揭示颅咽管瘤的肿瘤编程和演化,识别出PCP和RCC之间的疾病谱系连续性 | 研究样本数量有限,动物模型结果需要进一步临床验证 | 阐明颅咽管瘤的发病机制和肿瘤演化过程 | 颅咽管瘤(包括ACP、PCP亚型)和Rathke裂囊肿 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,离体垂体培养 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-30 |
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011768
PMID:41135951
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 | 首次在单细胞水平系统揭示了CAR-T治疗后肿瘤微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要在动物模型中进行,人类样本中的直接证据仍需进一步确认 | 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境的变化及其对治疗反应的影响 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞/祖细胞人源化小鼠模型 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-30 |
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013025
PMID:41135953
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM28通过调控PARP1稳定性和NAD+代谢重编程促进肾透明细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制驱动免疫逃逸:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及通过NAD+耗竭削弱CD8+ T细胞功能 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索肾透明细胞癌中免疫检查点阻断疗法疗效有限的机制 | 肾透明细胞癌细胞模型、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 | 癌症免疫学 | 肾癌 | 单细胞转录组学、RNA-seq、代谢组学、质谱分析、虚拟筛选 | Geneformer | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE159115数据集 |
| 157 | 2025-10-30 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Oct-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制的关联机制 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2025-10-30 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.25.650540
PMID:40654702
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了13线地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子机制 | 发现视锥细胞不仅来源于早期神经源性祖细胞,还来源于晚期神经源性祖细胞,这一过程由转录因子表达的异时性转变驱动 | 研究仅针对13线地松鼠,未在其他物种中验证 | 探索视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 13线地松鼠视网膜发育过程 | 发育生物学 | 视力障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 159 | 2025-10-30 |
Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion
2025-Oct-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05379
PMID:41141763
|
研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略,用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合,建立了标准化的RNA保存框架,显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证,未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题,建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-30 |
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2025-Oct-21, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
PMID:41130333
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评论 | 提出构建全球眼表生物学图谱的倡议,通过整合多组学技术系统解析眼表组织在健康和疾病状态下的生物学特征 | 首次提出建立全球眼表生物学图谱,采用单细胞和空间组学技术系统解析眼表微环境动态,并制定了临床转化路线图 | NA | 构建全面的眼表生物学图谱,推动精准眼科诊断和治疗 | 眼表组织(角膜、结膜、泪膜装置)及其微环境 | 数字病理 | 眼科疾病 | 单细胞/单核RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |