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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-30 |
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2025-Oct-21, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
PMID:41130333
|
评论 | 提出构建全球眼表生物学图谱的倡议，通过整合多组学技术系统解析眼表组织在健康和疾病状态下的生物学特征 | 首次提出建立全球眼表生物学图谱，采用单细胞和空间组学技术系统解析眼表微环境动态，并制定了临床转化路线图 | NA | 构建全面的眼表生物学图谱，推动精准眼科诊断和治疗 | 眼表组织（角膜、结膜、泪膜装置）及其微环境 | 数字病理 | 眼科疾病 | 单细胞/单核RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-30 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
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研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移生态位中的克隆动态和IFNγ信号通路的关键作用 | 开发了MetTag单细胞条形码技术，结合时间标记和CRISPR筛选，首次揭示了早期播散肿瘤细胞的IFNγ依赖性生态位适应机制 | 研究主要关注腹膜转移模型，其他转移部位的普适性需要进一步验证 | 解析肿瘤细胞在转移生态位中的克隆动态和分子决定因素 | 播散肿瘤细胞和转移生态位 | 单细胞生物学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9筛选, RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-30 |
Identification of Regulatory RNA-Binding Genes in Spermatogonial Stem Cell Reprogramming to ES-like Cells Using Machine Learning-Integrated Transcriptomic and Network Analysis
2025-Oct-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14201632
PMID:41148847
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和网络分析，结合机器学习方法，揭示了精原干细胞重编程为ES样细胞过程中的关键RNA结合调控基因 | 首次将机器学习与转录组学和网络分析相结合，识别出精原干细胞重编程过程中的关键RNA结合调控基因Ctdsp1、Rest和Stra8 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类细胞中验证 | 探索精原干细胞重编程为多能干细胞的分子机制 | 小鼠精原干细胞及其重编程产生的ES样细胞 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫细胞化学、畸胎瘤实验 | 机器学习集成分析 | 基因表达数据、转录组数据 | 使用GEO数据库多个数据集（GSE43850、GSE38776、GSE149512）的小鼠精原干细胞和胚胎干细胞数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-30 |
PPAR-γ Inhibits Chronic Apical Periodontitis by Facilitating Macrophage Efferocytosis
2025-Oct-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010157
PMID:41155449
|
研究论文 | 本研究阐明PPAR-γ通过促进巨噬细胞胞葬作用抑制慢性根尖周炎发展的机制 | 首次揭示PPAR-γ在慢性根尖周炎中调控巨噬细胞胞葬功能的作用机制 | NA | 探究PPAR-γ在慢性根尖周炎发病过程中对巨噬细胞胞葬作用的调控功能 | 临床标本、大鼠根尖周病变模型、体外CAP炎症环境模型 | 病理学研究 | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,组织染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-30 |
The Interplay Between lncRNAs-microRNAs Network Dysregulation and Cellular Hallmarks of Thyroid Cancer
2025-Oct-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203373
PMID:41154428
|
综述 | 本文综述了长链非编码RNA和微小RNA网络失调与甲状腺癌细胞特征之间的相互作用关系 | 系统总结了lncRNAs通过ceRNA机制、信号通路调控和表观遗传改变影响甲状腺癌特征的机制，并提出了靶向lncRNAs的治疗策略 | NA | 探讨lncRNAs和microRNAs网络失调在甲状腺癌发生发展中的作用机制 | 甲状腺癌中的长链非编码RNA和微小RNA | 分子生物学 | 甲状腺癌 | RNA干扰、反义寡核苷酸、CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
PMID:41142990
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群，并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-30 |
OmniCellX: A Versatile and Comprehensive Browser-Based Tool for Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025-Oct-17, Biology
DOI:10.3390/biology14101437
PMID:41154840
|
研究论文 | 介绍OmniCellX——一款基于浏览器的单细胞RNA测序分析工具 | 开发了基于Docker安装的双模式操作工具，整合了完整的单细胞分析流程并支持百万级细胞数据的处理 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，解决可访问性、可扩展性和可用性方面的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 支持数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-30 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analysis Identifies Macrophage-Related Gene Signatures Predictive of Hepatocellular Carcinoma in Cirrhosis
2025-Oct-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101213
PMID:41153430
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据，识别与肝硬化和肝细胞癌进展相关的巨噬细胞基因特征，并构建机器学习预测模型 | 首次整合单细胞和批量转录组数据识别巨噬细胞相关基因特征，并建立机器学习模型用于肝硬化患者向肝癌转化的风险预测 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证模型的泛化能力 | 开发基于巨噬细胞相关基因特征的早期肝癌风险预测模型 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Lasso回归, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-30 |
Determining the Biological Features of Aggressive Meningioma Growth with Transcriptomic Profiling
2025-Oct-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203324
PMID:41154381
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示侵袭性脑膜瘤生长的生物学特征 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq数据解析脑膜瘤的细胞组成和肿瘤微环境变化，发现代谢重编程、离子转运紊乱等新机制 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 识别与脑膜瘤分级相关的基因表达特征并评估其功能相关性 | 脑膜瘤组织样本 | 生物信息学 | 脑膜瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组化 | NA | 转录组数据 | 60例脑膜瘤样本（19例脑膜上皮型，11例纤维型，18例非典型型，12例间变型） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-30 |
Kdm7aa Orchestrates an Immunomodulatory Cardiomyocyte Program to Enable Zebrafish Heart Regeneration
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010044
PMID:41155336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现组蛋白去甲基化酶Kdm7aa在斑马鱼心脏再生过程中协调免疫调节性心肌细胞程序 | 首次发现Kdm7aa作为再生诱导的表观遗传调控因子，连接组蛋白去甲基化与趋化因子信号通路 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用仍需验证 | 阐明斑马鱼心脏再生的分子机制，探索促进哺乳动物心脏修复的潜在治疗策略 | 斑马鱼心室心肌细胞，新生小鼠和成年小鼠及人类心脏组织 | 发育生物学，再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas9基因编辑，bulk RNA测序，药理学抑制 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-30 |
Transcriptomic Signatures in IgA Nephropathy: From Renal Tissue to Precision Risk Stratification
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010055
PMID:41155346
|
综述 | 本文综述了转录组学在IgA肾病分子特征解析和精准风险分层中的应用进展 | 首次整合了bulk RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学和无创转录组特征，将分子特征直接与临床风险分层和精准治疗联系起来 | 存在标准化、队列规模和临床部署方面的挑战 | 探讨转录组学在IgA肾病分子特征解析和患者风险分层中的应用 | IgA肾病患者的肾脏组织、尿液和血液样本 | 数字病理 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、基因表达谱分析 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2025-10-30 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程，用于探索结肠癌肿瘤微环境中金属-基因相互作用 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅基于单个样本的初步概念验证研究，需要更大患者队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属依赖性信号传导及其与基因表达的关联 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像, 空间转录组学, 多模态整合分析 | 空间相关分析 | 元素成像数据, 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织病理学特征 | 1例结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像, 空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-30 |
Immunometabolic Dysregulation in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing: Perspectives on Subtypes and Potential Therapeutic Targets
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209996
PMID:41155287
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞急性淋巴细胞白血病中的免疫代谢失调，识别亚型特征和潜在治疗靶点 | 首次在B-ALL中系统描绘免疫代谢失调特征，开发基于代谢特征的机器学习分型模型，识别关键转录因子和靶向药物 | 样本量有限（17例患者和13例对照），需要更大规模验证 | 阐明B-ALL的免疫代谢失调机制并识别潜在治疗靶点 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和健康对照的骨髓样本 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 17例B-ALL患者和13例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
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研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析，发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例)，空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本，包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术，空间转录组学，RNA测序 | CAF算法，空间分析，Cox回归分析 | 多通道图像数据，单细胞数据，RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例，验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |
| 155 | 2025-10-30 |
RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Analyses of Tilapia Head Kidney in Response to Streptococcus agalactiae and Aeromonas hydrophila
2025-Oct-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15202951
PMID:41153878
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学和单细胞RNA测序技术分析罗非鱼头肾对不同病原菌的免疫应答机制 | 首次在罗非鱼中应用单细胞RNA测序技术揭示非特异性细胞毒性细胞和单核/巨噬细胞对不同病原菌的差异化免疫应答 | 研究仅关注头肾组织，未涉及其他免疫器官；病原菌种类有限 | 探究罗非鱼对不同病原菌的免疫应答机制 | 罗非鱼头肾组织 | 转录组学 | 细菌感染 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-30 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2025-Oct-10, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
|
研究论文 | 本研究探索EED226通过靶向关键免疫基因抑制中华半滑舌鳎脾细胞中LPS诱导的免疫反应 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能，发现跨物种保守的EED靶向治疗潜力 | 研究局限于中华半滑舌鳎这一特定鱼种，未验证其他硬骨鱼类的适用性 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫应答中的调控作用 | 中华半滑舌鳎脾细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,转录组分析,定量RT-PCR,系统发育分析 | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-30 |
Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
PMID:41142910
|
研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-30 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和机制模型的混合建模方法，通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合，通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题，需要克服这一挑战 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学，仿真推断，多模态Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型，线性稀疏回归模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2025-10-30 |
Cold Exposure Induces Swine Brown Adipocytes to Display an Island-like Distribution with Atypical Characteristics
2025-Oct-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209871
PMID:41155166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪体内存在棕色脂肪细胞，并揭示其在冷暴露条件下呈现岛状分布的非典型特征 | 首次在猪体内鉴定出棕色脂肪细胞，发现其岛状分布模式和不同于典型棕色脂肪细胞的分子特征 | UCP2/3蛋白含量未显著增加，需重复实验以提高蛋白表达水平 | 确认猪体内棕色脂肪细胞的存在及其在冷暴露条件下的特征 | 猪脂肪组织、小鼠棕色脂肪组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, 染色质可及性分析, ceRNA网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-30 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-Oct-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过CD4+ T细胞特异性PKCλ/ι条件性敲除小鼠模型，揭示了该蛋白在血吸虫感染诱导肝纤维化中的免疫调节机制 | 首次证明PKCλ/ι缺失通过抑制Tfh细胞分化、促进Tfr功能并激活IL-10产生型Breg细胞来减轻肝纤维化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导肝纤维化中的免疫调节作用 | 日本血吸虫感染的小鼠模型 | 免疫学 | 肝纤维化 | 流式细胞术, RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 野生型和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |