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当前共找到 40374 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-06-13
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈合不良的微环境,发现CTGF-LRP1通路在成纤维细胞功能障碍中的作用 首次在单细胞水平揭示剖宫产切口憩室(Niche)形成中LRP1缺陷导致成纤维细胞细胞外基质合成能力下降的机制,并验证重组人CTGF促进子宫肌层再生的治疗潜力 未提及具体限制,可能包括样本量有限(仅三个组织来源)及动物模型与人体差异的潜在影响 阐明剖宫产切口愈合不良的发病机制,特别是细胞和分子层面的缺陷 剖宫产切口组织(邻近肌层组织、愈合良好瘢痕组织、切口憩室组织),以及大鼠子宫瘢痕模型 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3组组织样本共135,793个细胞(邻近组48,587个、对照组47,653个、憩室组39,553个),30例愈合不良与30例愈合良好的组织染色 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
142 2026-06-13
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 GeneExt是一个利用单细胞RNA测序数据改进基因注释的工具,用于增强非模式物种的基因表达定量分析 首次提出利用单细胞RNA-seq数据来精修非模式物种的基因注释,特别是解决3'端注释不准确导致的定量问题 仅适用于3'端捕获的scRNA-seq方法,且主要针对非模式物种,在模式物种中的效果可能有限 改进非模式物种的基因注释,提升单细胞基因表达定量准确性 8个非模式生物的单细胞图谱数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 8个单细胞图谱数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
143 2026-06-13
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 揭示STING通路在年龄相关性黄斑变性中通过极化细胞因子分泌(IFN-β和IL-17A)促进感光细胞死亡和脉络膜破坏的机制 首次发现STING通路在AMD中具有双相、阶段依赖的功能(健康组织中起保护作用,早期AMD中驱动致病性炎症),并证明了通过空间组织化的炎症同时调控AMD多种病理过程的机制 NA 阐明STING通路在年龄相关性黄斑变性免疫介导的视网膜退化中的作用机制 人眼组织、患者来源的iPSC-RPE细胞、人视网膜类器官、Cryba1条件敲除小鼠模型、Il17a敲入小鼠模型、AAV2介导的IFN-β过表达模型、Cryba1/Sting双杂合小鼠 数字病理学 老年性疾病 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的基因过表达 NA 图像 人眼组织样本(数量未明确)、患者来源iPSC-RPE细胞系、小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
144 2026-06-13
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为CellRefiner的基于物理模型的方法,通过整合单细胞数据集与空间数据集,从非单细胞分辨率的空间转录组数据中重建单细胞分辨率 将细胞建模为受力的粒子,通过空间邻近约束、基因表达相似性和配体-受体相互作用优化细胞位置,实现空间转录组数据中单细胞分辨率的重建 未明确讨论对于大规模数据集的计算效率或潜在的系统性偏差 开发一种方法,从非单细胞分辨率的空间转录组数据中重建单细胞分辨率,以支持需要单个细胞分辨率和空间信息的下游分析 模拟和真实的空间转录组数据集,包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据,以及小鼠皮层和淋巴结组织 计算生物学 NA 空间转录组学 物理模型 基因表达数据和空间坐标数据 未明确说明具体样本数量,涉及模拟数据集和多个真实数据集(Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台,以及其他平台如MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap
145 2026-06-13
Extracellular vesicles conjugated with c(RGDyk) peptide targeting integrin αVβ3 repair optic nerve injury through YAP/TAZ and Smad2/3 signaling
2026-Feb-25, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过将间充质干细胞来源的细胞外囊泡与整合素αVβ3拮抗剂c(RGDyk)肽偶联,增强了其靶向性和修复功能,并研究了YAP/TAZ和Smad2/3信号通路在视神经损伤修复中的作用机制 首次利用c(RGDyk)肽修饰细胞外囊泡,靶向整合素αVβ3,通过单细胞RNA-seq分析揭示了YAP/TAZ和Smad2/3信号通路在视神经损伤修复中的调控机制 研究局限于体外和动物模型,尚未在人体临床试验中验证其疗效和安全性 开发增强型细胞外囊泡疗法,用于修复视神经损伤 间充质干细胞来源的细胞外囊泡修饰c(RGDyk)肽靶向整合素αVβ3 数字病理学 视神经损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 R28细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
146 2026-06-13
Canonical human blood dendritic cells are distinguished by robust E-selectin binding
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 人类血液树突状细胞通过E-选择素结合的特征被区分 揭示了所有人类血液树突状细胞亚群均具有强E-选择素结合能力的统一特征,重新定义了该类免疫细胞的组织招募分子基础 单细胞RNA测序无法提供树突状细胞sLeX表达的关键化学酶效应物信息 探究人类血液树突状细胞与E-选择素结合的能力及其分子机制 人类血液树突状细胞 免疫学 NA 多参数流式细胞术, 生化分析, 转录本测量, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
147 2026-06-13
TWEAK is increased in ulcerative colitis and contributes to fibroblast-mediated monocyte activation via heterologous non-canonical NF-kB/STAT3 signaling
2026-Feb-05, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 研究揭示TWEAK在溃疡性结肠炎中升高,并通过非经典NF-κB/STAT3信号通路促进成纤维细胞介导的单核细胞活化 首次发现TWEAK处理的炎症成纤维细胞诱导的转录程序模拟UC早期单核/巨噬细胞中间体,并鉴定NIK激酶在成纤维细胞-单核细胞通讯中的关键作用 未详细说明体内验证实验和临床转化的具体障碍 阐明溃疡性结肠炎中成纤维细胞与单核细胞相互作用的机制及其失调机制 TWEAK处理的结肠成纤维细胞、UC患者和健康供体的组织样本、单细胞转录组数据 数字病理学 溃疡性结肠炎 共培养模型、单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据、组织样本 UC患者和健康供体的结肠活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA 公共单细胞转录组数据
148 2026-06-13
Stereo-cell deciphers the spatial and functional heterogeneity of polyploid hepatocytes
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 使用Stereo-cell空间分辨单细胞测序技术解析多倍体肝细胞的空间和功能异质性 开发了SCIPI技术流程,可精确识别6种核心肝细胞亚型,并揭示多倍体化增强肝细胞代谢活性 仅基于标题和摘要,未提及具体局限性 解析肝细胞倍性亚型间的转录组和功能异质性 小鼠肝细胞(二倍体、四倍体、八倍体等倍性亚型) 单细胞转录组学 NA 空间分辨单细胞测序(Stereo-cell)、成像倍性鉴定(SCIPI) NA 单细胞转录组数据(基因表达谱) 未明确提及样本数量 NA 空间分辨单细胞RNA测序 Stereo-cell 基于明场细胞轮廓识别、DAPI核面积和数量定量、UMI条形码单细胞转录组学的成像倍性鉴定技术
149 2026-06-13
7-Ketocholesterol promotes T cell migration through Ca2+-NFATc1 pathway-mediated F-actin polymerization and proinflammatory cytokine production in oral lichen planus
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过代谢组学和单细胞RNA测序发现,7-酮胆固醇通过Ca2+-NFATc1通路促进口腔扁平苔藓中T细胞的F-肌动蛋白聚合和促炎细胞因子产生,从而增强T细胞迁移 首次揭示7-酮胆固醇在口腔扁平苔藓T细胞迁移中的促进作用及其通过Ca2+-NFATc1通路的分子机制 研究主要基于体外实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型验证 阐明氧化固醇(特别是7-酮胆固醇)在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 口腔扁平苔藓患者血浆中的氧化固醇、组织驻留T细胞以及外周T细胞 生物信息学, 分子生物学 口腔扁平苔藓 代谢组学, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, qRT-PCR, Transwell迁移实验 NA 基因表达数据, 代谢物数据 口腔扁平苔藓患者血浆和组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
150 2026-06-13
Decoding the role of RPL38 in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学方法解码RPL38在肺腺癌中的作用 首次结合多组学分析(包括泛癌队列和空间转录组学)系统揭示RPL38在肺腺癌中的肿瘤促进功能及免疫抑制微环境关联 未提及具体局限性 阐明RPL38在肺腺癌发展中的功能和临床意义 肺腺癌细胞系及皮下异种移植模型 机器学习 肺癌 RNA-seq、空间转录组学 NA 转录组数据(TCGA数据库)、空间转录组数据 TCGA-LUAD队列(样本数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
151 2026-06-13
Increased secreted PLA2 in epithelial cells promotes the progression of chronic non-atrophic gastritis to chronic atrophic gastritis through the TGF-β signaling
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究上皮细胞中分泌型磷脂酶A2通过TGF-β信号促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展的机制 首次发现PLA2G10在慢性胃炎进展中的关键作用,并揭示其通过TGF-β信号通路调控炎症反应 未提及明确局限性 探究PLA2G10是否通过TGF-β信号促进CNAG向CAG的进展 人胃黏膜上皮细胞(GES-1)和SD大鼠 数字病理学 胃炎 RNA微阵列, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 图像 SD大鼠(CNAG模型)和GES-1细胞系 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
152 2026-06-13
Integrating computational engines to identify TSPAN6 as a migrasome-associated target for immunotherapy sensitization
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合计算引擎鉴定TSPAN6为迁移体相关免疫治疗增敏靶点 首次发现迁移体相关蛋白TSPAN6在免疫治疗耐药中的关键作用,并通过大规模多组学数据、空间转录组学和药物筛选验证其作为治疗靶点的潜力 未明确 鉴定调控癌症免疫治疗的迁移体相关靶点 TSPAN6蛋白及其在免疫治疗中作用的机制 机器学习 癌症 空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据、临床样本数据 来自17种肿瘤类型5957名患者,以及44名癌症患者的配对血清样本 NA 空间转录组学 NA NA
153 2026-06-13
Single-cell sequencing reveals reversible glial remodeling in the visual cortex during visual deprivation and recovery
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示视觉剥夺与恢复过程中视觉皮层胶质细胞的可逆重塑动态变化 首次在单细胞水平上系统描绘了视觉剥夺与恢复过程中非神经元细胞(尤其是小胶质细胞和少突胶质细胞)的转录组动态变化,并揭示小胶质细胞-少突胶质细胞轴在皮层可塑性中的关键作用 基于豚鼠模型,结果向人类转化的普适性尚需验证;仅观察了短期恢复(1周),长期恢复效应未涉及 阐明视觉剥夺(形觉剥夺性近视)及恢复过程中视觉皮层非神经元细胞的动态变化及其功能角色 豚鼠初级视觉皮层中的非神经元细胞(小胶质细胞和少突胶质细胞) 数字病理学 近视 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3组豚鼠:正常对照组、形觉剥夺组(单眼剥夺5周)、恢复组(剥夺4周+恢复1周) NA 单细胞RNA测序 NA NA
154 2026-06-13
Identification of FTO as a key m6A demethylase linking immune dysregulation to sepsis pathogenesis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过综合生物信息学和实验分析,鉴定FTO作为关键m6A去甲基化酶,连接免疫失调与脓毒症发病机制 利用多种机器学习算法共识特征选择方法,首次鉴定FTO作为脓毒症的潜在诊断生物标志物,并揭示其在巨噬细胞极化和中性粒细胞炎症反应中的调控作用 未提及 鉴定脓毒症的潜在诊断生物标志物并阐明其分子机制 脓毒症患者与健康对照的转录组数据集、单细胞RNA测序数据、体外巨噬细胞和中性粒细胞模型 机器学习 脓毒症 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, 机器学习算法 转录组数据, 单细胞转录组数据 5个公开数据集(GSE13904, GSE26440, GSE28750, GSE95233, GSE57065),包含脓毒症和健康对照样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
155 2026-06-13
ScRNA-seq reveals dynamic macrophage heterogeneity in chronic liver disease progression and prognostic biomarkers KLF2/SPP1 in HCC
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序解析慢性肝病进展过程中巨噬细胞的动态异质性,并鉴定HCC预后生物标志物KLF2/SPP1 首次构建涵盖健康肝脏、MASH、肝硬化和HCC的单细胞分辨率全阶段细胞图谱,揭示巨噬细胞亚型在慢性肝病进展中的动态变化及转录特征,并鉴定SPP1和KLF2作为HCC的预后生物标志物 部分发现(如巨噬细胞与T细胞的空间相互作用)未在体外或体内直接验证功能性抑制作用或耗竭 解析慢性肝病进展过程中各阶段的免疫和转录特征,并鉴定预后生物标志物 健康肝脏、MASH、肝硬化及HCC患者的单细胞RNA测序数据 机器学习和生物信息学 肝癌, 非酒精性脂肪性肝炎, 肝硬化 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 NA 单细胞转录组数据, 临床基因表达数据 整合多来源单细胞RNA测序数据集(具体数量未提供)及TCGA-LIHC临床数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
156 2026-06-13
Identification of MTURN as a trained immunity-related biomarker for heart failure via integrative transcriptomic machine learning analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合转录组学和机器学习分析,识别MTURN作为心力衰竭训练免疫相关生物标志物,并经过实验验证 首次将训练免疫与心力衰竭生物标志物联系起来,利用多队列转录组数据、单细胞RNA-seq和机器学习方法筛选出MTURN,并验证其与PIEZO1介导的心脏重塑的潜在关联 未明确提及局限性 鉴定心力衰竭的训练免疫相关生物标志物,以改善诊断和个性化治疗 心力衰竭患者和THP-1衍生巨噬细胞训练免疫模型 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析,加权基因共表达网络分析 机器学习算法 基因表达数据 五个独立心力衰竭队列和一个训练免疫模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
157 2026-06-13
<em>IGHG1, HLA-DOB, </em>and <em>GABBR1</em>: Genetic Insights into Rheumatoid Arthritis Using Mendelian Randomisation and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP
研究论文 利用孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示类风湿性关节炎的关键基因IGHG1、HLA-DOB和GABBR1 首次通过整合差异基因表达分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别出GABBR1作为与类风湿性关节炎发病相关的新基因,该基因编码G蛋白偶联受体,在免疫调节和炎症中发挥复杂作用 未提及明确的研究局限性 利用基因组和单细胞转录组数据识别与类风湿性关节炎相关的关键基因,探索其在疾病发病机制中的作用,并提出新的治疗靶点 类风湿性关节炎患者和健康对照组的基因表达谱 机器学习 类风湿性关节炎 RNA-seq,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 基于公共数据库的差异表达基因和单细胞RNA测序数据,未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
158 2026-06-13
Identification of programmed cell death-related subtypes reveals immune heterogeneity and therapeutic divergence in colon cancer
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 通过整合12种程序性细胞死亡通路,利用非负矩阵分解对结肠腺癌患者进行亚型分类,并揭示其免疫异质性和治疗差异 首次将程序性细胞死亡通路整合用于结肠癌亚型分类,并发现PCDS3亚型与肿瘤微环境重塑和治疗耐药的新关联,识别出MDK-SDC2轴作为潜在治疗靶点 仅依赖于转录组数据,缺乏蛋白水平的验证;亚型分类的临床适用性需进一步前瞻性研究确认;药物重定位结果缺乏体内实验验证 揭示程序性细胞死亡通路在结肠癌肿瘤微环境异质性和治疗反应中的作用 结肠腺癌患者的肿瘤组织样本及转录组、单细胞和空间转录组数据 机器学习 结肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 非负矩阵分解 转录组数据 1140名结肠腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
159 2026-06-13
CEBPB-high dormant tumor cells drive immune evasion via S100A8 orchestrated tumor-associated macrophages reprogramming
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究揭示了三阴性乳腺癌中CEBPB高表达的休眠肿瘤细胞通过S100A8介导肿瘤相关巨噬细胞重编程驱动免疫逃逸的机制 首次阐明休眠肿瘤细胞通过CEBPB-S100A8轴调控巨噬细胞极化形成免疫抑制微环境,并证明靶向该轴可克服免疫检查点阻断治疗耐药 未提及 探究三阴性乳腺癌中休眠肿瘤细胞对免疫检查点阻断治疗耐药的分子机制 三阴性乳腺癌休眠肿瘤细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞和CD8+ T细胞 机器学习和数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、RNA测序、染色质免疫共沉淀测序、流式细胞术、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、染色质免疫共沉淀数据 公共单细胞RNA测序数据及体内/体外实验样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
160 2026-06-13
The B-cell-autoantibody axis in lung cancer immunity
2026, Theranostics IF:12.4Q1
综述 本文整合单细胞RNA测序和空间转录组学证据,系统剖析了非小细胞肺癌中B细胞-自身抗体轴的时空动态,并探讨了靶向该轴以克服免疫检查点抑制剂耐药性的临床转化前景 不同于以往仅列举B细胞丰度的综述,本文通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了三级淋巴结构成熟状态对B细胞功能可塑性的调控机制,并系统阐明了自身抗体通过补体激活和抗体依赖性细胞介导的细胞毒性作用双向调控肿瘤免疫微环境 仅整合现有证据,未提供原始实验数据验证所提出的机制模型 系统阐明非小细胞肺癌中B细胞-自身抗体轴的免疫调控机制及其在免疫检查点抑制剂耐药中的临床转化潜力 肿瘤浸润B淋巴细胞、三级淋巴结构、自身抗体、肿瘤免疫微环境 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'端测序平台用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组分析
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