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当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-11-15 |
Single-cell RNA sequencing in osteosarcoma: applications in diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Nov-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03121-5
PMID:41231422
|
综述 | 本文通过文献综述探讨单细胞RNA测序技术在骨肉瘤诊断、预后和治疗中的应用 | 首次系统综述单细胞RNA测序在骨肉瘤研究中的全面应用，识别了新的细胞亚群和潜在治疗靶点 | 存在单细胞协议的技术偏差和非英语文献的排除，可能影响结果的普适性 | 评估单细胞RNA测序对骨肉瘤发生发展的贡献 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞亚群和分子机制 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 107项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-11-15 |
ScRDAVis: An R shiny application for single-cell transcriptome data analysis and visualization
2025-Nov-13, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013721
PMID:41231930
|
研究论文 | 开发了一个名为ScRDAVis的交互式R Shiny应用程序，用于单细胞转录组数据的分析和可视化 | 首个提供hdWGCNA用于共表达网络和转录因子调控网络分析的GUI平台 | NA | 为无编程经验的生物学家提供易于使用的单细胞数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-11-15 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov-13, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
|
研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 首次构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组，结合单细胞RNA测序揭示了寄生虫无性繁殖阶段的转录异质性和关键调控因子BxAP2-M2的持续表达特征 | 研究主要聚焦于单一巴贝斯虫物种，调控机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探索巴贝斯虫无性繁殖阶段的调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性繁殖阶段 | 寄生虫学 | 巴贝斯虫病 | 比较基因组学, 单细胞RNA测序, 系统发育分析, 伪时间分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-11-15 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov-13, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
|
研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的计算框架，以提升单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建过程中显式稳定文库大小，有效降低组合偏差对共表达网络分析的干扰 | 未明确说明方法在不同单细胞技术平台和样本类型中的普适性验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组合偏差问题，提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据和阿尔茨海默病脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-11-15 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Nov-13, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
|
研究论文 | 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组数据，无需共享基因面板 | 开发了首个无需共享基因面板即可整合成像空间转录组数据的框架，通过最优传输引导的特征传播和批次对齐实现跨平台整合 | NA | 解决空间转录组数据跨平台整合的挑战 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-11-15 |
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2025-Nov-13, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110805
PMID:41233206
|
研究论文 | 本研究通过基因负荷分析和单细胞转录组测序揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础和发育机制 | 整合遗传负荷分析与胚胎单细胞转录组数据，首次系统识别MRKHS的新候选基因并揭示潜在的双基因遗传模式 | MRKHS的遗传病因仍未完全阐明，需要进一步功能验证 | 阐明MRKHS的分子遗传机制和胚胎发育基础 | 727名MRKHS先证者和2504名女性对照个体，人类和小鼠胚胎后肾组织 | 遗传学 | 生殖系统发育异常 | 外显子组测序,基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 727例患者和2504例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-11-15 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2025-Nov-13, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
|
研究论文 | 本研究揭示了活性氧缺陷通过促进小鼠转录本D家族逆转录转座子表达驱动狼疮早期发病的机制 | 首次发现MTD逆转录转座子在组织驻留巨噬细胞中的异常表达与狼疮发病相关，并证明其可作为治疗靶点 | 研究主要基于ROS缺陷的lpr小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明NCF1基因变异导致狼疮的免疫失调机制 | 活性氧缺陷的狼疮易感lpr小鼠的组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮 | bulk RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据 | 狼疮易感lpr小鼠的脾脏、肾脏和颅骨硬脑膜组织 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 148 | 2025-11-15 |
Exploring the mediating role of potential therapeutic genes in the pathogenesis of hypopituitarism through the metabolites from a genomic perspective
2025-Nov-13, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10169-1
PMID:41233666
|
研究论文 | 通过整合基因组数据与代谢物信息，探索潜在治疗基因在垂体功能减退症发病机制中的中介作用 | 首次采用孟德尔随机化方法系统分析基因-代谢物-垂体功能减退症的因果路径，发现UBAC1基因通过1-Methyl-4-imidazoleacetate代谢物介导疾病风险的机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据，缺乏实验验证；中介效应仅解释4.35%的总效应，可能存在其他未发现的机制 | 识别垂体功能减退症的潜在药物靶点并阐明其发病机制 | 垂体功能减退症相关基因和血清/脑脊液代谢物 | 基因组学 | 垂体功能减退症 | 表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位 | 两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化 | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-11-15 |
Glutamine metabolism reprogramming promotes bladder cancer progression via PYCR1: a multi-omics and functional validation study
2025-Nov-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07386-2
PMID:41233804
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证揭示了谷氨酰胺代谢重编程通过PYCR1促进膀胱癌进展的机制 | 首次构建基于谷氨酰胺代谢的预后评分模型GMscore，并发现PYCR1通过P5CS介导的脯氨酸合成和PI3K/AKT/mTOR信号通路调控膀胱癌代谢重编程 | 研究样本量有限，需要更多独立队列验证GMscore的预测效能 | 探索谷氨酰胺代谢在膀胱癌中的临床意义及其对免疫治疗反应的预测价值 | 膀胱癌细胞系、患者样本、异种移植模型 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、随机森林分析、PCA分析 | 预后评分模型GMscore | 代谢组数据、单细胞RNA测序数据、批量转录组数据 | 多个队列的膀胱癌患者样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 150 | 2025-11-15 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02130-6
PMID:41233852
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析，揭示机械刺激相关基因在乳腺癌中的特征并建立预后预测模型 | 首次建立基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型，并在单细胞水平验证机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在乳腺肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, SCISSOR算法, 体外和体内实验 | 预后评分模型, 列线图 | RNA测序数据, 临床数据 | TCGA数据库乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveal cell-specific mechanisms in systemic lupus erythematosus
2025-Nov-13, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf606
PMID:41233983
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和共定位分析，揭示了系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的致病基因 | 首次在14种人类免疫细胞类型中整合sc-eQTL数据与MR和贝叶斯共定位分析，识别细胞特异性致病机制 | 研究主要关注遗传调控机制，未涉及环境因素和其他非遗传因素的影响 | 识别系统性红斑狼疮中细胞特异性的因果基因和潜在治疗靶点 | 14种人类免疫细胞类型的单细胞表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2025-11-15 |
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
PMID:40957419
|
研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结通过TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴促进转移的机制 | 首次发现TNBC中TLR4依赖的FRC-单核细胞轴在TDLNs中形成免疫抑制微环境并促进转移 | 主要基于小鼠模型研究，人类样本验证相对有限 | 探究三阴性乳腺癌肿瘤引流淋巴结中细胞网络重组对转移的影响 | 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类TNBC样本 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学，体外抑制实验 | NA | 转录组数据，空间定位数据 | 小鼠肿瘤模型和人类TNBC样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2025-11-15 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
|
研究论文 | 本研究通过整合小鼠单细胞RNA测序数据与体外实验，揭示了缺氧程度调控少突胶质前体细胞在脑卒中后的动态适应性变化 | 首次发现缺氧程度差异可诱导少突胶质前体细胞分化为不同功能亚型（血管生成型和少突胶质生成型），并提出“氧张力”作为关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索少突胶质前体细胞在缺血性脑卒中后的功能适应性及其在细胞治疗中的应用潜力 | 小鼠少突胶质前体细胞及短暂性大脑中动脉闭塞模型 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，细胞培养，细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-11-15 |
Identification of plasma cell infiltration-related gene signatures as a novel prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01907-5
PMID:41217528
|
研究论文 | 本研究通过识别肾透明细胞癌中浆细胞浸润相关基因，构建了一个新的预后预测模型 | 首次发现9个与浆细胞浸润相关的枢纽基因，并基于这些基因构建了PC评分预后模型 | 研究基于公共数据库和外部队列验证，需要进一步的前瞻性研究验证 | 开发肾透明细胞癌的预后预测模型 | 肾透明细胞癌患者 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞测序，机器学习 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA和ArrayExpress数据库数据及外部验证队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-11-15 |
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01912-8
PMID:41217562
|
研究论文 | 本研究探讨了癌症患者血清肌酸激酶异常现象，发现血小板中的CKB可能是导致CK-MB>CK异常及癌症转移的潜在因素 | 首次揭示血小板来源的CKB与癌症转移的关联，开发了整合CK-BB和线粒体CK亚型的复合指数CK-Sub | 研究主要基于回顾性队列和公共数据库，需要进一步实验验证机制 | 探究癌症患者血清肌酸激酶异常现象的分子机制及其与肿瘤生物学的关联 | 癌症患者（结直肠癌和肺癌）的血清样本、血小板样本及相关公共数据库 | 癌症生物学 | 肺癌, 结直肠癌 | qRT-PCR, RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清CK同工酶电泳 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床实验室数据 | 回顾性癌症队列1651例，配对血清和血小板样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-11-15 |
Single-cell multi-omics of ribosome biogenesis-related genes reveals immune microenvironment in psoriasis and constructs a diagnostic model
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01916-4
PMID:41217566
|
研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据，系统分析了核糖体生物发生相关基因在银屑病中的作用，构建了高精度诊断模型并探索其与免疫微环境的相互作用 | 首次系统整合批量测序和单细胞测序转录组数据来表征银屑病中核糖体生物发生相关基因的分子网络 | NA | 阐明核糖体生物发生相关基因在银屑病中的分子网络，构建诊断模型并研究其与免疫微环境的相互作用 | 银屑病患者转录组数据 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组测序，单细胞测序，加权基因共表达网络分析，机器学习 | 诊断模型 | 转录组数据 | 多中心数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-11-15 |
Tracing the enteric neural crest cell pathway from origin to colonization: insights into Hirschsprung's disease
2025-Nov-11, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11211-w
PMID:41217573
|
综述 | 本文系统综述了肠道神经系统发育过程中肠神经嵴细胞的迁移路径及其在先天性巨结肠症中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学新技术，揭示ENS发育过程中的时空异质性和谱系多样化 | 肠道组织的固有复杂性（包括多样细胞类型、微环境相互作用和多尺度调控网络）仍阻碍机制洞察和精准治疗 | 阐明肠道神经系统发育的分子机制，重点关注肠神经嵴细胞的迁移过程 | 肠神经嵴细胞及其形成的肠道神经系统 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 158 | 2025-11-15 |
Identification and external validation of a prognostic signature based on MAPK-related genes to evaluate survival prognosis and treatment efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01925-3
PMID:41217578
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据构建了一个基于MAPK相关基因的预后特征模型，用于评估肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | 首次结合孟德尔随机化分析和随机生存森林算法构建MAPK相关基因预后模型，并通过单细胞RNA测序揭示其在免疫调节和血管生成中的作用机制 | 模型需要在更多独立队列中进行外部验证，且部分机制仍需进一步实验验证 | 构建稳健的MAPK相关基因特征模型以改善肺腺癌的风险分层和治疗指导 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 随机生存森林算法, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 随机生存森林 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA-LUAD队列和三个独立的GEO队列 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-11-15 |
Tertiary lymphoid organ-associated transcriptomic features predict rejection and outcome in kidney transplantation: integrative analysis and experimental validation
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01899-2
PMID:41217598
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了三级淋巴器官相关转录组特征在肾移植排斥反应和预后预测中的价值 | 首次建立连接TLO特征与临床结果的多组学框架，识别出基于TLO相关基因的生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 研究肾移植中三级淋巴器官的分子特征及其与移植排斥和预后的关联 | 肾移植患者样本和大鼠同种异体移植排斥模型 | 生物信息学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序, 非负矩阵分解, 多组学分析, 机器学习 | ssGSEA, NMF, 多种机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 多个肾移植队列的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-11-15 |
Single-cell hdWGCNA identifies ICI-related-colitis key CD8 + T cells linked to immunotherapy response and prognosis in colon cancer
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03891-4
PMID:41217618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和hdWGCNA分析鉴定与免疫检查点抑制剂相关结肠炎(CIC)相关的关键CD8+T细胞，并探讨其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | 首次使用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)识别CIC相关基因模块，发现CIC关键CD8+T细胞在免疫治疗反应中的重要作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需进一步实验证实 | 探索免疫检查点抑制剂相关结肠炎的免疫学机制及其对结肠癌预后的影响 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和未发生结肠炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 伪时间分析, hdWGCNA | 预后评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和对照患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |