单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-09-28	Machine Learning Identifies Shared Regulatory Mechanisms of Genes Associated with Ferroptosis in Major Depressive Disorder and Inflammatory Bowel Disease 2025-Sep-19, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16091111 PMID:41010056	研究论文	通过机器学习方法识别重度抑郁症和炎症性肠病中与铁死亡相关基因的共同调控机制及潜在治疗策略	首次系统研究铁死亡相关基因在肠脑轴疾病中的共同作用机制，并利用多种机器学习算法识别关键生物标志物RPL8	研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证	探讨铁死亡相关基因在MDD和IBD中的分子作用及潜在治疗策略	重度抑郁症和炎症性肠病患者样本数据	机器学习	精神疾病和消化系统疾病	机器学习算法、单细胞测序分析、分子对接、分子动力学模拟	四种不同的机器学习算法	基因表达数据	疾病样本与正常对照样本的比较分析
142	2025-09-28	Monitoring the Biological Impact and Therapeutic Potential of Intermittent Fasting in Oncology: Assessing Strategies and Clinical Translational Challenges 2025-Sep-18, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics15182369 PMID:41008741	综述	本文评估间歇性禁食在肿瘤学中的生物影响监测策略及临床转化挑战	提出整合机制性监测与临床反应监测的双层框架，推动个体化肿瘤治疗	现有监测工具多限于临床前研究，缺乏大规模随机试验验证	评估间歇性禁食在肿瘤治疗中的生物监测策略与临床转化路径	肿瘤患者及间歇性禁食的生物学效应	肿瘤学	肿瘤	单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、ctDNA检测	NA	文献数据	NA
143	2025-09-28	Diversity, Functional Complexity, and Translational Potential of Glial Cells in the Central Nervous System 2025-Sep-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26189080 PMID:41009644	综述	本文系统综述中枢神经系统中胶质细胞功能复杂性的最新研究进展及其转化潜力	整合高分辨率活体成像、单细胞转录组学和基因编辑平台等前沿技术，重新定义胶质细胞在神经退行性疾病中的功能机制	NA	弥合基础神经科学与临床应用之间的差距，为下一代中枢神经系统疗法提供框架	中枢神经系统中的各类胶质细胞（星形胶质细胞、NG2胶质细胞、小胶质细胞）	神经科学	神经退行性疾病	高分辨率活体成像、单细胞转录组学、基因编辑	NA	分子机制数据、成像数据、转录组数据	NA
144	2025-09-28	Single-cell analysis of heterogeneity and molecular changes in cultured corneal epithelial stem cells during serial passage 2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxaf041 PMID:40574692	研究论文	利用单细胞转录组学分析长期传代培养中角膜上皮干细胞群体的异质性和分子变化	首次通过单细胞分辨率揭示角膜缘干细胞在长期培养中存在三个功能各异的祖细胞亚群，并发现小分子RepSox可部分维持干细胞特性	研究仅限于体外培养模型，未验证体内功能；分子机制有待深入解析	探究长期传代培养中角膜缘干细胞特性丧失的分子机制	体外培养的人角膜缘干细胞	单细胞组学	角膜疾病	单细胞转录组测序	NA	单细胞基因表达数据	22,708个细胞
145	2025-09-28	Consistent self-organized emergence of hyaline cartilage in human induced pluripotent stem cell-derived multi-tissue organoids 2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxaf043 PMID:40577622	研究论文	开发了一种利用人多能干细胞生成透明软骨的简化多组织类器官方案	建立了无需异源成分和饲养层的简单培养方案，通过多组织类器官实现透明软骨的稳定生成	NA	建立稳定生成透明软骨的标准化培养方案	人诱导多能干细胞衍生的多组织类器官	组织工程	软骨相关疾病	RNA测序、生物信息学分析、组织学检测、免疫组化、单细胞RNA测序	多组织类器官模型	基因表达数据、组织学图像数据	NA
146	2025-09-28	Single-Cell Transcriptomics in Inherited Retinal Dystrophies: Current Findings and Emerging Perspectives 2025-Sep-16, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16091088 PMID:41010033	综述	本文综述单细胞转录组学在遗传性视网膜营养不良研究中的应用现状与前景	通过单细胞分辨率揭示疾病进程中特定细胞簇的基因表达变化，识别光感受器细胞死亡前的早期分子改变	NA	探讨单细胞转录组技术如何增强对疾病机制的理解并促进新治疗靶点的发现	遗传性视网膜营养不良患者的视网膜细胞	单细胞组学	遗传性视网膜营养不良	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
147	2025-09-28	A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer 2025-Sep-15, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015 PMID:40957419	研究论文	本研究揭示了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结通过TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴促进转移的免疫抑制机制	首次发现TLR4依赖的FRC-单核细胞轴在TDLNs中形成免疫抑制微环境，并证明局部TLR4抑制联合αPD-1疗法可增强抗肿瘤免疫	机制研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展	探究三阴性乳腺癌肿瘤引流淋巴结的免疫微环境重组及其在转移中的作用	三阴性乳腺癌小鼠模型和人类TNBC样本	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	空间转录组学、体外共培养实验	小鼠肿瘤模型	基因表达数据、免疫组织化学数据	小鼠模型和人类TNBC样本（具体数量未明确说明）
148	2025-09-28	Investigating Germ Cell Transition Genes in Breast Cancer: Exploring the Genesis of Cancer Testis-Associated Markers 2025-Sep-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26188958 PMID:41009526	研究论文	本研究探讨乳腺癌中与男性生殖细胞发育相关基因的表达特征及其在肿瘤发生中的作用	首次系统性地通过生物信息学分析和实验验证揭示乳腺癌肿瘤基质细胞是生殖细胞相关基因的主要来源	样本量较小（28例肿瘤样本），需要更大规模研究验证	探索乳腺癌中生殖细胞过渡基因的表达模式及其与肿瘤发生的关系	乳腺癌组织样本和已发表的基因组数据集	癌症生物学	乳腺癌	定量RT-PCR、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、生物信息学分析	NA	基因表达数据、单细胞测序数据	28例乳腺癌组织样本，结合已发表数据集分析
149	2025-09-28	Rat Glioma 101.8 Tissue Strain: Molecular and Morphological Features 2025-Sep-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26188992 PMID:41009560	研究论文	本研究通过多组学方法表征了大鼠胶质瘤101.8组织移植株的分子和形态学特征	首次结合MRI、IHC、scRNA-seq和qPCR-RT技术系统解析该移植株的细胞组成和遗传特征	动物模型与人类肿瘤存在固有差异，研究结果需进一步临床验证	建立符合2021年CNS肿瘤新分类标准的代表性胶质瘤动物模型	大鼠胶质瘤101.8组织移植株及其肿瘤微环境	实验神经肿瘤学	胶质瘤	MRI、IHC、scRNA-seq、qPCR-RT	动物肿瘤模型	分子生物学数据、影像学数据	特定大鼠胶质瘤移植株（未明确具体样本数量）
150	2025-09-28	Development and Validation of a Centrosome Amplification-Related Prognostic Model in Pancreatic Cancer: Multi-Omics Guided Risk Stratification and Tumor Microenvironment 2025-Sep-12, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17182983 PMID:41008826	研究论文	开发并验证胰腺癌中心体扩增相关预后模型，通过多组学分析揭示其与肿瘤微环境的关联	首次整合单细胞测序和空间转录组学解析中心体扩增在胰腺癌中的时空动态及免疫微环境重编程机制	研究样本来源有限（TCGA/GEO数据库），需进一步扩大临床验证	构建胰腺癌中心体扩增相关预后模型并解析其分子机制	胰腺腺癌患者组织样本及多组学数据	数字病理	胰腺癌	单细胞测序、空间转录组学、PCR、多组学分析	Cox回归模型（LASSO惩罚回归）	基因组数据、转录组数据、临床数据	TCGA和GEO数据库胰腺癌样本（具体数量未明确）及患者组织样本PCR验证
151	2025-09-28	Dual Therapeutic Impact of AXL Inhibitor AB-329: Chemotherapy Sensitization and Immune Microenvironment Reprogramming in TNBC 2025-Sep-12, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26188896 PMID:41009462	研究论文	本研究探讨选择性AXL激酶抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌临床前模型中的抗肿瘤功效和免疫调节潜力	首次揭示AB-329具有化疗增敏和肿瘤免疫微环境重塑的双重治疗作用	研究基于临床前模型，尚未进行人体临床试验验证	评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的治疗潜力	三阴性乳腺癌（TNBC）临床前模型	肿瘤免疫治疗	三阴性乳腺癌	转录组分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、免疫细胞浸润数据	小鼠同种异体移植模型和人源化小鼠模型
152	2025-09-28	Identification of Key Genes Related to Both Lipid Metabolism Disorders and Inflammation in MAFLD 2025-Sep-09, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13092211 PMID:41007773	研究论文	通过整合分析识别与MAFLD中脂质代谢紊乱和炎症相关的关键基因	首次通过机器学习结合单细胞测序技术系统鉴定同时关联脂质代谢和炎症的MAFLD关键基因	研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证基因功能机制	识别连接代谢功能障碍和炎症的MAFLD关键致病基因	MAFLD患者基因表达数据和MAFLD小鼠模型	生物信息学	代谢相关脂肪性肝病	机器学习、单细胞RNA测序、实时PCR	诊断列线图	基因表达数据	两个公共数据集（GSE135251和GSE89632）及小鼠验证实验
153	2025-09-28	Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse 2025-Sep-09, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17182943 PMID:41008788	研究论文	本研究通过对比TSK小鼠与野生型小鼠的肿瘤形成能力，揭示了TSK小鼠微环境对癌症进展的促进作用	首次将TSK小鼠作为系统性硬化症相关癌症研究的模型，并发现其微环境中中性粒细胞/淋巴细胞比率升高及促纤维化细胞亚群富集	研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证	探究TSK小鼠改变的微环境对癌症进展的影响	TSK小鼠和野生型小鼠，使用乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系	癌症生物学	系统性硬化症及相关癌症	皮下/腹腔注射肿瘤细胞、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	小鼠疾病模型	RNA测序数据	使用三种癌症细胞系在TSK和WT小鼠中进行肿瘤形成实验
154	2025-09-28	Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Structures and Plasma Cells in PDAC with and Without Lymph Node Metastasis 2025-Sep-09, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17182949 PMID:41008793	研究论文	本研究通过多色免疫荧光和人工智能图像分析探讨胰腺导管腺癌中三级淋巴结构与浆细胞的异质性及其与淋巴结转移的关系	首次发现N0期PDAC中存在IgG浆细胞相关免疫热点，并提出IgG浆细胞与最近肿瘤细胞之间的距离作为新的预后生物标志物	研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究尚不深入	探究三级淋巴结构异质性在胰腺癌淋巴结转移中的作用机制	胰腺导管腺癌患者组织样本	数字病理学	胰腺癌	多色免疫荧光染色、AI病理图像分析、单细胞RNA测序、TCGA数据库分析	基于AI的图像分析模型	病理图像、基因表达数据	未明确样本数量，包含N0和N1/2期PDAC患者组织样本及三个单细胞RNA测序数据集
155	2025-09-28	Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development 2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.09.03.674033 PMID:40950081	研究论文	通过单细胞RNA测序和组学方法比较小鼠与人类肠道间质发育的异同	首次开展跨物种单细胞水平肠道间质细胞发育的系统性对比研究	未探讨物种特异性基因功能差异的生物学机制	解析哺乳动物肠道间质细胞发育的进化保守性与物种特异性	小鼠和人类胚胎期肠道间质细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq, FISH, 免疫荧光	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	小鼠和人类胚胎肠道组织样本（具体数量未明确）
156	2025-09-28	Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials 2025-Sep, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123275 PMID:40138961	研究论文	开发了一种导电心脏芯片模型，用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应	首次将导电水凝胶支架与微流控芯片结合，构建具有原生心肌电导特性的3D心脏芯片模型	未明确说明模型在长期稳定性和药物测试验证方面的局限性	开发仿生心脏组织模型并研究电传导对心脏发育的影响	人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏成纤维细胞	组织工程	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微流控技术	3D心脏芯片模型	基因表达数据、功能分析数据	使用hiPSC来源的细胞构建工程化心脏组织，并与已发表成人心脏数据集进行比较
157	2025-09-28	Single cell transcription revealing key transcription factors in embryonic kidney development 2025-Sep, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05307-x PMID:40392427	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示胚胎肾脏发育过程中肾祖细胞分化的关键转录因子	利用单细胞RNA测序技术首次在肾祖细胞中发现明显亚群并鉴定出调控分化的关键转录因子	需要进一步研究验证发现结果及其治疗潜力	探索肾脏发育过程中肾祖细胞分化的分子机制	胚胎肾脏发育过程中的肾祖细胞及其分化的肾小管上皮细胞和足细胞	单细胞组学	肾脏发育疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确样本数量
158	2025-09-28	FemXpress: Systematic Analysis of X Chromosome Inactivation Heterogeneity in Female Single-Cell RNA-Seq Samples 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504754 PMID:40583143	研究论文	开发了一种名为FemXpress的计算工具，用于分析女性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活异质性	首次提出不依赖亲本基因组信息即可基于X连锁SNPs对单细胞进行X染色体失活起源分类的计算方法	NA	开发分析X染色体失活异质性的计算工具	女性单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	单细胞RNA测序数据	食蟹猴多组织样本、胚胎和结肠肿瘤数据集
159	2025-09-28	Tracing and Capturing the Epiblast Pluripotency of Sheep Preimplantation Embryos 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417764 PMID:40586282	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析建立了绵羊形成态和始发态多能干细胞，并揭示了绵羊胚胎发育过程中的多能性调控机制	首次在绵羊中成功捕获形成态和始发态多能干细胞，并进行了跨物种（小鼠、猪、绵羊）早期胚胎发育比较分析	NA	研究绵羊着床前胚胎上胚层多能性的变化规律和调控机制	绵羊着床前胚胎（E1-E14天）	发育生物学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	绵羊胚胎发育E1至E14天的单细胞样本
160	2025-09-28	Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417843 PMID:40586758	研究论文	本研究通过整合转录组和代谢组学分析，揭示MYC作为贝赫切特葡萄膜炎潜在治疗靶点	首次结合代谢组学和单细胞RNA测序技术揭示MYC通过调控糖酵解通路驱动T细胞异常反应的机制	研究样本量有限，机制验证主要依赖小鼠模型	探索贝赫切特葡萄膜炎的代谢特征并寻找潜在治疗靶点	贝赫切特葡萄膜炎患者和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型	生物医学研究	自身免疫性葡萄膜炎	非靶向代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	代谢组数据、单细胞转录组数据	贝赫切特葡萄膜炎患者与健康对照组的临床样本及EAU小鼠模型