单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-07-03	Therapeutic implications of cancer-associated fibroblast heterogeneity: insights from single-cell and multi-omics analysis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1580315 PMID:40589759	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析，探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用	识别了四种CAF亚群及其与肿瘤相关信号通路的差异，开发了用于生存预测和免疫治疗敏感性评估的风险评分模型（RiskScore），并验证了核心基因在肿瘤发展中的关键作用	研究可能受限于样本数量和多样性，且实验验证仅在部分基因上进行	探索CAF异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用，为个性化治疗提供理论支持	癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的亚群	肿瘤生物学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学数据分析、siRNA干扰、qPCR、Western blotting	RiskScore模型、Cox和LASSO回归	单细胞RNA测序数据、多组学数据	未明确提及具体样本数量
142	2025-07-03	Cell types and neuronal genetic architecture in the rat CSF-contacting nucleus and the role of 5-HT in this nucleus in mediating morphine addiction through the brain-CSF circuit 2025, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2025.1603486 PMID:40589789	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，并探讨了其在吗啡成瘾中的作用机制	首次系统描绘了脑脊液接触核的单细胞转录组图谱，发现其通过调控5-HT释放参与脑脊液介导的神经调节机制	研究主要基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	阐明脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，探究其在吗啡成瘾中的作用机制	大鼠脑脊液接触核	神经科学	药物成瘾	单细胞RNA测序、化学遗传学技术、UPLC-MS、ELISA	NA	基因表达数据、行为学数据、生化检测数据	单细胞RNA测序数据(登录号CRR790158)
143	2025-07-03	Triple-Negative Breast Cancer on the Rise: Breakthroughs and Beyond 2025, Breast cancer (Dove Medical Press) DOI:10.2147/BCTT.S516125 PMID:40599557	综述	本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）的发病率上升、分子遗传学特征、最新治疗进展及诊断工具的进步	总结了TNBC的最新靶向治疗、免疫检查点抑制剂的应用、PARP抑制剂的使用以及抗体药物偶联物的引入，同时探讨了机器学习成像和空间转录组学等新型诊断工具	作为综述文章，未涉及原始研究数据，主要依赖已有文献的总结和分析	探讨TNBC的发病率、分子机制、治疗进展及诊断技术的发展	三阴性乳腺癌（TNBC）及其患者群体	数字病理学	乳腺癌	机器学习成像、空间转录组学	NA	NA	NA
144	2025-07-03	Identification of anoikis-related subtypes and a risk score prognosis model, the association with TME landscapes and therapeutic responses in hepatocellular carcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1602831 PMID:40599775	研究论文	本研究通过分析肝细胞癌（HCC）中与失巢凋亡相关的基因（ARGs），建立了预后风险评分模型，并探讨了其与肿瘤微环境（TME）和治疗反应的关系	首次在HCC中基于ARGs进行分子分型，并构建了两基因（TTC26和TPX2）预后模型，同时通过单细胞RNA-seq和泛癌分析验证了基因的广泛失调	研究主要基于公共数据集，需要进一步实验验证模型的临床适用性	阐明ARGs在HCC中的预后意义和治疗相关性	肝细胞癌（HCC）患者	肿瘤学	肝细胞癌	WGCNA, LASSO Cox回归, 单细胞RNA-seq	预后风险评分模型	基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据	公共数据集中的HCC患者样本
145	2025-07-03	Single-cell RNA sequencing: new insights for pulmonary endothelial cells 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1576067 PMID:40599812	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肺内皮细胞（PECs）研究中的新见解，包括其在生理和病理条件下的作用	利用scRNA-seq技术揭示了PECs在结构和功能上的显著异质性，及其在肺微环境中的空间定位依赖性	未提及具体的技术限制或样本量不足的问题	探讨scRNA-seq在肺内皮细胞研究中的应用及其对肺病理生理学治疗的推动作用	肺内皮细胞（PECs）	数字病理学	肺病	scRNA-seq	NA	RNA序列数据	NA
146	2025-07-03	Spatial Transcriptomic Analyses of Spermatogenesis 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4698-4_3 PMID:40601269	研究论文	本文介绍了空间转录组技术在精子发生研究中的应用，并提供了使用Curio Biosciences的Seeker（SlideSeq V2）方法的具体步骤	利用空间转录组技术解决了传统转录组方法破坏组织三维结构的局限性，提供了精子发生过程中细胞异质性的空间信息	仅针对小鼠睾丸中的圆形精子细胞进行了示例分析，可能无法全面代表其他生殖细胞类型	探索精子发生过程中的细胞异质性和空间组织	小鼠睾丸组织中的生殖细胞	空间转录组学	NA	空间转录组学（SlideSeq V2）	NA	空间转录组数据	小鼠睾丸组织样本
147	2025-07-03	Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation 2024-12-04, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796 PMID:39630883	研究论文	该研究探讨了心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制，发现特定的NKT细胞与良好的神经预后相关	首次发现多样NKT细胞（dNKT）在心脏骤停后神经保护中的作用，并验证了硫酸酯脂质治疗可改善神经功能	研究结果主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证	探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制及潜在治疗靶点	心脏骤停患者和小鼠模型	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	临床样本数据和小鼠实验数据	大型OHCA患者队列和实验小鼠
148	2025-07-03	Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions 2024-Dec, PRX life DOI:10.1103/prxlife.2.043009 PMID:40585428	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，研究细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	发现细胞表型转变过程中基因调控网络社区间相互作用的动态变化模式，揭示了协调全局基因表达重编程的一般原则	仅分析了五种细胞转变过程，可能需要更多样本来验证发现的普遍性	探究细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	五种不同的细胞转变过程	基因组学	NA	单细胞RNA测序	过渡路径理论框架	基因表达数据	五种细胞转变过程的单细胞RNA测序数据
149	2025-07-03	Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells 2024-11-27, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666 PMID:39602512	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，构建了儿童期狼疮性肾炎(cLN)肾脏组织的单细胞分辨率空间图谱，揭示了肾脏基质与浸润免疫细胞之间的复杂相互作用	首次在单细胞分辨率下结合空间信息解析cLN肾脏组织的细胞互作网络，发现了免疫细胞的特异性定位模式以及空间相关的基因表达模块	样本量较小(8例患者和4例对照)，且单个肾小球转录特征与组织学评分相关性较低	解析儿童期狼疮性肾炎的免疫发病机制	狼疮性肾炎患者的肾脏组织	数字病理学	狼疮性肾炎	空间转录组学	NA	空间转录组数据	8例cLN患者和4例对照个体的肾脏组织样本
150	2025-07-03	Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells 2024-11-20, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn8388 PMID:39565875	研究论文	研究开发了针对ROBO1和ROBO2的单克隆抗体，用于阻断SLIT-ROBO信号通路，以治疗病理性眼血管新生	首次开发出能够阻断ROBO1和ROBO2信号传导的人源单克隆抗体，并证实其通过调节髓系细胞功能来减轻病理性眼血管新生	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发针对病理性眼血管新生的新型治疗策略	ROBO1和ROBO2受体及其信号通路	生物医学	眼科疾病	单克隆抗体开发、单细胞RNA测序	氧诱导视网膜病变(OIR)和激光诱导角膜新生血管(CNV)小鼠模型	基因表达数据、病理学数据	小鼠模型（具体数量未说明）
151	2025-07-03	Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET 2024-Nov-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05821-4 PMID:39548496	研究论文	通过单细胞转录组学分析，将基因表达特征与促性腺激素和催乳素PitNET的临床病理特征联系起来	首次在促性腺激素和催乳素PitNET中鉴定了上皮、内分泌和免疫基因网络的签名，并揭示了肿瘤微环境中特定免疫细胞的富集与肿瘤侵袭性的关系	样本量相对较小（7例促性腺激素和3例催乳素PitNET），且独立队列的134例PitNET样本仅用于验证	探究PitNET肿瘤微环境细胞与肿瘤侵袭性行为之间的关系	促性腺激素和催乳素PitNET	数字病理学	垂体神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、免疫组化	NA	RNA测序数据、免疫组化图像	7例促性腺激素PitNET、3例催乳素PitNET（单细胞测序），独立队列134例PitNET（批量RNA测序）
152	2025-07-03	TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism 2024-Nov-11, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2023-331396 PMID:38697771	研究论文	本研究探讨了TLR8激动剂selgantolimod（SLGN）通过调节Kupffer细胞分化状态和依赖IL-6的机制抑制HBV进入肝细胞的作用	揭示了SLGN通过Kupffer细胞重塑肝内免疫微环境的新机制，并首次证明SLGN能抑制HBV进入肝细胞	研究主要基于体外实验和临床前模型，尚未在人体临床试验中验证所有发现	阐明SLGN在肝脏免疫效应器中的作用机制及其对HBV感染的影响	Kupffer细胞和肝细胞	免疫学	慢性乙型肝炎（CHB）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序	NA	转录组数据、细胞因子数据	使用公开可用的单细胞RNA-seq数据和实验分离的Kupffer细胞
153	2025-07-03	A Paradoxical Tumor Antigen Specific Response in the Liver 2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.19.614002 PMID:39372792	research paper	该研究探讨了肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的反应及其在抗肿瘤免疫中的作用	揭示了肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的高数量但功能耗竭的现象，并发现了SPP1+巨噬细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制	研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据，可能需要更多临床验证	研究肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的反应及其对肿瘤免疫治疗的影响	小鼠肿瘤模型和患者的肝脏转移瘤	免疫学	肝癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学CODEX、高维多组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据	小鼠肿瘤模型和患者样本（具体数量未明确说明）
154	2025-07-03	Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids 2024-09-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01857-1 PMID:39289761	研究论文	研究通过iPSC衍生的脑类器官模型，揭示了C9ORF72基因六核苷酸重复扩增（HRE）导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆（FTD）的早期分子病理和突触功能障碍	首次在3D人脑类器官模型中揭示了C9-ALS/FTD的早期分子病理和突触功能障碍，包括细胞类型丰度和分布的变化	研究样本量有限，且类器官模型可能无法完全模拟人脑的复杂性	理解C9ORF72-HRE导致的ALS和FTD的早期病理机制	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的iPSC衍生的脑类器官	分子病理学	肌萎缩侧索硬化症, 额颞叶痴呆	iPSC衍生技术, 单细胞RNA测序, 膜片钳电生理学	脑类器官模型	分子和细胞数据, 电生理数据	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的脑类器官
155	2025-07-03	Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain 2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN IF:4.1Q1 DOI:10.1503/jpn.240026 PMID:39414359	研究论文	通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，评估了人类死后海马样本中的成人海马神经发生现象	结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，首次在人类死后海马样本中评估成人海马神经发生的存在	样本量小且仅包括男性样本	评估人类成人海马神经发生的存在及其特征	人类死后齿状回（DG）样本	神经科学	NA	空间转录组学, 多重荧光原位杂交	NA	空间转录组数据, 荧光原位杂交图像	婴儿（n = 1, 2岁）, 青少年（n = 1, 16岁）, 年轻成人（n = 2, 平均23.5岁）, 中年（n = 2, 平均42.5岁）, 以及固定冷冻的中年男性DG组织（n = 6, 平均43.5岁）
156	2025-07-03	Microglia-specific IL-10 gene delivery inhibits neuroinflammation and neurodegeneration in a mouse model of Parkinson's disease 2024-08-21, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adm8563 PMID:39167665	研究论文	本研究探讨了在小鼠帕金森病模型中，通过小胶质细胞特异性递送IL-10基因抑制神经炎症和神经退行性变的治疗效果	揭示了IL-10通过诱导小胶质细胞新状态增强吞噬和清除活性，并调节T淋巴细胞分化，为帕金森病治疗提供了新策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证其安全性和有效性	探索通过调节神经炎症来保护多巴胺能神经元的新治疗方法	帕金森病小鼠模型中的小胶质细胞和多巴胺能神经元	神经科学	帕金森病	病毒基因递送技术、单细胞转录组学	小鼠帕金森病模型	基因表达数据、细胞表型数据	多个常用帕金森病小鼠模型
157	2025-07-03	Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice 2024-08-14, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adi6626 PMID:39141700	研究论文	研究发现自然杀伤细胞（NK细胞）通过促进中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）的形成来抑制小鼠模型中的黄斑变性	首次揭示了NK细胞在nvAMD中的保护作用及其通过CCR5和NKG2D的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本数据有限	探究自然杀伤细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性（nvAMD）中的作用机制	自然杀伤细胞（NK细胞）、中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）、小鼠模型和人类样本	免疫学	黄斑变性	Olink蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、基因敲除研究	小鼠模型	蛋白质组数据、RNA测序数据	小鼠模型和有限的人类供体样本
158	2025-07-03	Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19 2024-07-17, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136 PMID:39018367	研究论文	通过比较临床样本和动物模型的单细胞RNA测序数据，揭示了IFN-γ在急性COVID-19后呼吸道后遗症中的关键作用	首次在人类和小鼠模型中比较了呼吸道PASC的单细胞RNA测序数据，并确定了IFN-γ作为免疫异常的关键节点	研究主要基于呼吸道样本，可能无法完全代表其他器官系统的PASC症状	理解SARS-CoV-2感染后急性后遗症(PASC)的病因学	临床PASC样本和小鼠PASC模型	免疫学	COVID-19后遗症	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	临床PASC样本和小鼠模型样本（具体数量未提及）
159	2025-07-03	Validation of an organ mapping antibody panel for cyclical immunofluorescence microscopy on normal human kidneys 2024-Jul-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00426.2023 PMID:38721662	研究论文	本文验证了一种用于正常人类肾脏循环免疫荧光显微镜检查的器官映射抗体组合	采用标准化方法验证抗体组合，用于循环免疫荧光显微镜检查，提供更详细的组织分割和体积评估方法	未提及具体局限性	解决抗体验证标准化不足导致的人类研究不可重复性问题	人类肾脏中的18种主要细胞类型和5种细胞外基质区室	数字病理学	NA	循环免疫荧光显微镜检查(CyCIF)	NA	图像	未提及具体样本数量
160	2025-07-03	Control of goal-directed and inflexible actions by dorsal striatal melanocortin systems, in coordination with the central nucleus of the amygdala 2024-Jul, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102629 PMID:38763506	研究论文	研究揭示了背侧纹状体中表达黑素皮质素-4受体（MC4R）的多巴胺D1受体神经元在控制小鼠基于奖励可能性的行为灵活性中的作用	发现MC4R+神经元通过抑制背侧纹状体中的即刻早期基因水平来调控行为灵活性，并揭示了其与杏仁核中央核的功能性连接	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究背侧纹状体中MC4R在调控目标导向行为和刻板行为中的作用机制	小鼠的背侧纹状体和杏仁核中央核	神经科学	NA	空间转录组学分析、行为实验	NA	基因表达数据、行为数据	NA