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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-07-10 |
Single-Cell Transcriptomics and Integrated Bioinformatic Analysis Reveal Critical Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics in Osteoarthritis
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/1174568
PMID:41502501
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研究论文 | 使用单细胞转录组学和整合生物信息学分析揭示骨关节炎的关键生物标志物和免疫浸润特征 | 首次通过单细胞RNA测序与整合生物信息学分析结合,识别出骨关节炎中八个不同的软骨细胞亚群,并发现NR4A2、BMP1和AVPR1A等基因具有强诊断潜力,且通过分子对接筛选出贝沙罗汀作为潜在治疗候选药物 | 基于公开数据集,样本来源有限,未进行实验验证;分子对接结果仅提供初步相互作用证据,需进一步体内外实验确认 | 探究骨关节炎的细胞异质性和分子机制,识别生物标志物和治疗靶点 | 骨关节炎患者和正常个体的软骨样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨关节炎和正常个体软骨样本(数据集GSE220243和GSE114007) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2026-07-10 |
JGR-NMF: joint graph-regularized non-negative matrix factorization for spatial domain identification
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20585
PMID:41695707
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研究论文 | 提出联合图正则化非负矩阵分解(JGR-NMF)用于空间域识别,提升准确性和鲁棒性 | 引入自适应邻域图构建策略,结合kNN图与空间邻接矩阵的联合图正则化框架 | 未明确说明局限性 | 提升空间转录组学数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 两个乳腺癌数据集、一个小鼠肾脏数据集和一个小鼠胚胎数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间转录组数据 | 四个数据集(两个乳腺癌、一个小鼠肾脏、一个小鼠胚胎) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2026-07-10 |
The Evolution of Gene Sequencing Technologies: Unveiling Genetic Architecture of Nonsyndromic Orofacial Clefts
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/3754674
PMID:42017915
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综述 | 综述了随着测序技术从Sanger测序到下一代测序及第三代测序,再到表观基因组学、单细胞测序、空间组学和多组学整合的发展,非综合征性口面裂易感基因和位点识别的关键发现 | 系统梳理了测序技术演进如何推动非综合征性口面裂遗传学研究从低通量向高通量转变,从常见经典易感基因到新生突变、罕见变异和复杂基因组结构变异的发现,以及细胞分化轨迹的阐明 | 未来需持续推动测序技术的方法创新、优化研究设计并探索整合多组学方法,以完善基于种族和亚型的遗传数据库 | 总结测序技术发展不同阶段在识别非综合征性口面裂易感基因和位点方面的关键发现 | 非综合征性口面裂 | 自然语言处理 | 儿科疾病 | Sanger测序, 二代测序, 三代测序, 表观基因组学, 单细胞测序, 空间组学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2026-07-10 |
Identification and Validation of Mitophagy-Related Biomarkers in Colorectal Cancer: An Integrated Analysis of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/5579542
PMID:42108926
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,鉴定并验证了结直肠癌中线粒体自噬相关生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,确定了SGCE、ATP8B2和RANGAP1三个具有遗传因果关联的线粒体自噬相关生物标志物 | 未详细说明样本量和验证队列的多样性,可能限制结果的普适性 | 探索线粒体自噬在结直肠癌中的作用并识别相关的生物标志物 | 结直肠癌的基因表达数据和线粒体自噬相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,机器学习,定量PCR | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-07-10 |
Comprehensive Analysis of Macrophage Dynamics, CCBE1, and Their Implications in Colorectal Cancer Microenvironment: Insights Into Tumor Progression and Therapeutic Opportunities
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/2678696
PMID:42381502
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研究论文 | 综合分析结直肠癌微环境中巨噬细胞动态变化、CCBE1及其对肿瘤进展和治疗机会的影响 | 首次揭示CCBE1作为独立预后风险因子,通过促进M2巨噬细胞极化增强肿瘤增殖、迁移和侵袭,为结直肠癌治疗提供新靶点 | 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏体内验证和更大规模临床样本确认 | 阐明M2巨噬细胞在结直肠癌中的具体作用及调控分子,探索CCBE1的预后价值和治疗潜力 | 结直肠癌细胞系及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 4个结直肠癌公开数据集(EMTAB8107、GSE139555、GSE146771、GSE166555) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2026-07-10 |
HRD-Driven Reprogramming of Macrophage Function and Spatial Architecture in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/7364793
PMID:42106020
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了高浆液性卵巢癌中HRD驱动的巨噬细胞功能重编程及空间结构变化 | 首次系统描述了不同HRD亚型(FBI、HRD-Del、HRD-Dup)中巨噬细胞的转录组特征和空间分布差异,并关联了患者生存预后 | NA | 探究同源重组缺陷对高浆液性卵巢癌免疫微环境中巨噬细胞的影响 | 高浆液性卵巢癌患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 166,895个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2026-07-10 |
Single-Cell and Multiomics Characterization of p21 in Cancer Progression and Therapeutic Sensitivity
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5598948
PMID:42415742
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示p21在癌症进展和治疗敏感性中的作用 | 在单细胞分辨率下系统描绘p21在肿瘤微环境中的功能,揭示其作为细胞周期抑制剂之外的免疫调节和治疗敏感性相关表型 | 功能发现需要进一步的临床验证 | 研究CDKN1A(编码p21)在肿瘤微环境中的功能,特别是其在单细胞分辨率下的表达模式和功能 | p21(CDKN1A)在多种癌症类型中的表达和功能 | 生物信息学 | 癌症 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公共数据集中的多种癌症样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公共数据集中使用的单细胞RNA-seq平台 |
| 148 | 2026-07-10 |
Testicular macrophages: core immune regulators and emerging therapeutic targets in spermatogenic dysfunction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1868707
PMID:42416067
|
综述 | 系统综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的核心免疫调节作用及新兴治疗靶点 | 首次全面整合睾丸巨噬细胞的发育起源、功能异质性及其在多种男性生精功能障碍中的机制作用,并系统总结了针对睾丸巨噬细胞的治疗策略 | 现有研究较为分散,缺乏系统性综述与全面整合 | 综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的机制作用及治疗进展 | 睾丸巨噬细胞及其在生精功能障碍中的功能与机制 | 机器学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2026-07-10 |
Immune activation induced by FOLR2+ decidual macrophage deficiency impairs decidualization and angiogenesis in spontaneous abortion
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1852410
PMID:42416064
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和临床验证,发现FOLR2+蜕膜巨噬细胞在复发性流产中减少,导致蜕膜化障碍和血管生成受损,揭示其维持母胎界面免疫耐受和妊娠的关键作用 | 首次鉴定出FOLR2+蜕膜巨噬细胞具有免疫调节、组织驻留和促血管生成特性,并揭示其与蜕膜基质细胞的互作形成正反馈环路维持妊娠,为复发性流产免疫机制提供新见解 | 主要基于体外功能实验,缺乏体内动物模型验证 | 阐明复发性流产中巨噬细胞亚型的异质性和功能机制 | 人类子宫内膜和蜕膜组织中的FOLR2+巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类子宫内膜和蜕膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 150 | 2026-07-10 |
B cell-mediated immune reconstitution after lung transplantation: mechanisms, interventions, and prognostic evaluation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1798139
PMID:42421940
|
综述 | 综述了肺移植后B细胞介导的免疫重建机制、干预措施及预后评估 | 系统总结了B细胞在肺移植不同阶段的特异性扰动,并探讨了单细胞RNA测序和BCR谱分析等新技术用于分层免疫监测和风险预测的潜力 | 未明确指出局限性,但作为综述,可能受限于现有研究数据的完整性和异质性 | 总结肺移植中B细胞生物学、阶段特异性扰动,并探索多组学技术如何支持个性化免疫调节和预后评估 | 肺移植患者中的B细胞动态变化 | 机器学习 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-07-10 |
Integrative single-cell transcriptomics and mendelian randomization identifies BTN3A2 as a shared protective factor in Behçet's disease and inflammatory bowel disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1845143
PMID:42421947
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学与孟德尔随机化分析,发现BTN3A2是白塞病和炎症性肠病的共同保护因子,并提供了这两种疾病链接的实验证据 | 首次通过单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合的方法,识别出BTN3A2作为BD和IBD的共享保护因子,并首次在EAU小鼠模型中观察到类似IBD的结肠病理改变,建立了BD相关眼部炎症与肠道病理之间的直接联系 | 未明确提及局限性 | 探索白塞病与炎症性肠病之间的分子联系和共享治疗靶点 | 白塞病和炎症性肠病患者的外周血单细胞,以及实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化 | 白塞病、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、共定位分析 | NA | 单细胞转录组数据、eQTL数据、GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2026-07-10 |
Functional shifts in immune composition follow lactation stage in human milk
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1850094
PMID:42421962
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研究论文 | 对人类母乳中免疫成分随哺乳阶段的变化进行多模态分析 | 首次通过单细胞RNA测序、高维流式细胞术和可溶性蛋白检测等多模态方法,系统揭示母乳免疫微环境在初乳、过渡乳和成熟乳三个阶段的动态重塑特征 | 需要进一步研究这些阶段相关免疫特征的功能意义及其对新生儿健康的影响 | 探讨母乳免疫微环境是否随哺乳阶段发生变化 | 人类母乳中的免疫细胞、上皮细胞和可溶性免疫介质 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术, 可溶性蛋白检测 | 不适用 | 基因表达数据, 流式细胞术数据, 蛋白质数据 | 纵向队列中配对母体外周血和母乳样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 153 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation-associated gene networks link EMT and ferroptosis to define a PDGFRB-centered prognostic signature in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1846096
PMID:42421957
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研究论文 | 本研究整合了转录组、单细胞和空间数据,构建了基于5基因的膀胱癌预后特征,揭示了液-液相分离、上皮间充质转化和铁死亡之间的调控网络 | 首次构建以PDGFRB为中心、连接液-液相分离基因网络与EMT和铁死亡易感性的膀胱癌预后特征,并通过实验验证PDGFRB的相分离能力及其在细胞增殖、迁移和铁死亡中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究液-液相分离、上皮间充质转化和铁死亡在膀胱癌中的整合作用并开发预后标志物 | 膀胱癌患者样本、T24膀胱癌细胞系、临床标本和小鼠原位模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 蛋白相分离重构 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 临床标本及小鼠原位模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-07-10 |
Single-cell dissection and multi-cohort validation identify a hypoxia-related prognostic signature with experimental verification in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1845179
PMID:42422066
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与多队列转录组数据,构建并验证肺腺癌低氧相关预后模型,并通过体外实验确认关键基因VWA1的功能 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌中低氧信号的细胞异质性,并基于此构建经多队列验证的低氧相关预后模型 | 未提及明确局限性 | 探索肺腺癌中低氧信号的细胞分布及其预后分层价值 | 肺腺癌患者组织样本及细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 预后模型(采用多种算法比较) | 基因表达数据(单细胞及批量转录组) | TCGA训练队列及两个独立外部验证队列 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 来自GEO数据库的单细胞RNA-seq数据及TCGA等批量转录组数据 |
| 155 | 2026-07-10 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies CYP1B1 as a candidate target of orientin in intervertebral disc degeneration-associated low back pain
2026, Frontiers in pain research (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fpain.2026.1870398
PMID:42422480
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,发现CYP1B1是荭草苷治疗椎间盘退变相关腰痛的候选靶点 | 首次结合网络药理学、机器学习、分子动力学模拟和单细胞RNA测序,系统鉴定荭草苷作用于椎间盘退变相关腰痛的核心靶基因CYP1B1 | 研究仅基于公共数据集GSE70362进行预测,缺乏大规模临床样本验证,且分子机制尚未深入探讨 | 探索荭草苷治疗椎间盘退变相关腰痛的核心靶点基因 | 人椎间盘纤维环细胞(IL-1β刺激) | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE70362数据集(具体样本数未提及)及人椎间盘纤维环细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2026-07-10 |
NAD+ metabolic collapse and arrest of epithelial development in Hirschsprung disease
2026, World journal of pediatric surgery
IF:0.8Q4
DOI:10.1136/wjps-2026-001222
PMID:42422596
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究先天性巨结肠症中NAD+代谢崩溃与上皮发育停滞的机制 | 首次在HSCR上皮中发现NAD+生物合成不足与过度消耗共同导致的代谢脆弱性,颠覆了以肠道神经系统为中心的传统疾病模型 | NA | 明确HSCR患者神经节段结肠的上皮状态及其代谢异常 | HSCR患者及非HSCR对照(HSCR相关疾病)的远端结肠组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、图像 | HSCR患者与非HSCR对照的远端结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2026-07-10 |
Intestinal subepithelial myofibroblasts in inflammatory bowel disease: fibroblast heterogeneity, fibrosis, and therapeutic targeting
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1808431
PMID:42422813
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综述 | 综述肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的作用,包括成纤维细胞异质性、纤维化机制及治疗靶点 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展,揭示成纤维细胞异质性与致病性成纤维细胞亚群,并系统总结靶向基质途径的治疗策略 | 作为综述,未提供原始实验数据,且部分新兴治疗策略尚未在临床试验中充分验证 | 全面总结肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的生理和病理作用,探讨纤维化机制及治疗靶点 | 肠上皮下肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间基因表达 |
| 158 | 2026-07-10 |
RBMS3 promotes ferroptosis in colorectal cancer and is suppressed by M2 tumor-associated macrophages via STAT3 activation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1872659
PMID:42422878
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研究论文 | 本文研究了RBMS3在结直肠癌中促进铁死亡的作用,并发现M2型肿瘤相关巨噬细胞通过STAT3激活抑制RBMS3表达 | 首次揭示RBMS3通过铁死亡通路影响结直肠癌预后,并阐明M2巨噬细胞-STAT3-RBMS3轴的免疫调控机制 | 主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列数据 | 探索RBMS3在结直肠癌中的预后价值及其与铁死亡和免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者样本、TCGA泛癌及COAD数据集、HCT116细胞系、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox比例风险模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-COAD队列(约500例)及GEO多个验证数据集(具体样本数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-07-10 |
Piezo1 promotes colitis progression by modulating the Nrf2/NF-κB/NLRP3 signaling pathway
2025-Dec, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117293
PMID:40886854
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研究论文 | 该研究探讨了机械敏感离子通道Piezo1通过调节Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路促进结肠炎进展的机制 | 首次揭示Piezo1通过机械感知特性调控Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路在结肠炎发展中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类IBD患者中验证,Piezo1介导机械信号的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Piezo1在肠道炎症病理生理中的作用及其对Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路的调节机制 | 野生型和Piezo1Lyz2溃疡性结肠炎小鼠模型的结肠组织及巨噬细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠结肠组织样本及巨噬细胞样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-07-10 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 通过对300多名健康成年人进行单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术等多组学分析,揭示了年龄相关的免疫动态变化 | 发现了年龄相关的T细胞亚群非线性转录重编程,且该过程不由系统性炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动,并揭示了记忆T细胞中T2细胞偏向性功能与流感疫苗中高度增强抗原的B细胞反应失调相关 | 未明确提及局限性 | 研究年龄如何影响外周免疫的组成和状态,以及免疫衰老的机制 | 300多名健康成年人(25至90岁),其中96人接受为期2年的纵向季节性流感疫苗接种随访 | 单细胞组学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 300多名健康成年人(16百万以上外周血单核细胞,71个免疫细胞亚群),96人纵向随访 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |